MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 5447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	CTCG	2	8	503	510	0 %	25 %	25 %	50 %	28197946
2	NC_004556	TTCG	2	8	663	670	0 %	50 %	25 %	25 %	28197946
3	NC_004556	ATTG	2	8	757	764	25 %	50 %	25 %	0 %	28197946
4	NC_004556	CGAT	2	8	939	946	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
5	NC_004556	CTGA	2	8	1310	1317	25 %	25 %	25 %	25 %	28197946
6	NC_004556	ATTG	2	8	2451	2458	25 %	50 %	25 %	0 %	28197947
7	NC_004556	TTTC	2	8	3206	3213	0 %	75 %	0 %	25 %	28197948
8	NC_004556	TAAT	2	8	3388	3395	50 %	50 %	0 %	0 %	28197948
9	NC_004556	AGAA	2	8	3661	3668	75 %	0 %	25 %	0 %	28197948
10	NC_004556	ATGG	2	8	3829	3836	25 %	25 %	50 %	0 %	28197948
11	NC_004556	TTGA	2	8	3855	3862	25 %	50 %	25 %	0 %	28197948
12	NC_004556	TTTA	2	8	3866	3873	25 %	75 %	0 %	0 %	28197948
13	NC_004556	AGAA	2	8	4517	4524	75 %	0 %	25 %	0 %	28197949
14	NC_004556	GATA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	28197949
15	NC_004556	GTCT	2	8	4976	4983	0 %	50 %	25 %	25 %	28197950
16	NC_004556	TCCT	2	8	5355	5362	0 %	50 %	0 %	50 %	28197950
17	NC_004556	AGTT	2	8	5378	5385	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
18	NC_004556	TGAT	2	8	5386	5393	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
19	NC_004556	ATTG	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	28197950
20	NC_004556	CAAT	2	8	6912	6919	50 %	25 %	0 %	25 %	28197950
21	NC_004556	CAGT	2	8	7436	7443	25 %	25 %	25 %	25 %	28197951
22	NC_004556	ATTG	2	8	7492	7499	25 %	50 %	25 %	0 %	28197951
23	NC_004556	TTTG	2	8	7732	7739	0 %	75 %	25 %	0 %	28197951
24	NC_004556	GACT	2	8	8650	8657	25 %	25 %	25 %	25 %	28197952
25	NC_004556	TGGC	2	8	9245	9252	0 %	25 %	50 %	25 %	28197953
26	NC_004556	ATCA	2	8	9476	9483	50 %	25 %	0 %	25 %	28197953
27	NC_004556	AGCA	2	8	9653	9660	50 %	0 %	25 %	25 %	28197953
28	NC_004556	AAAG	2	8	9682	9689	75 %	0 %	25 %	0 %	28197953
29	NC_004556	TGTC	2	8	11206	11213	0 %	50 %	25 %	25 %	28197954
30	NC_004556	GAAA	2	8	11299	11306	75 %	0 %	25 %	0 %	28197954
31	NC_004556	CGGA	2	8	11798	11805	25 %	0 %	50 %	25 %	28197955
32	NC_004556	TGGC	2	8	12033	12040	0 %	25 %	50 %	25 %	28197955
33	NC_004556	CCAA	3	12	12982	12993	50 %	0 %	0 %	50 %	28197957
34	NC_004556	TCTA	2	8	14489	14496	25 %	50 %	0 %	25 %	28197958
35	NC_004556	GTAC	2	8	14644	14651	25 %	25 %	25 %	25 %	28197958
36	NC_004556	TGTA	2	8	15177	15184	25 %	50 %	25 %	0 %	28197958
37	NC_004556	CAAC	2	8	15356	15363	50 %	0 %	0 %	50 %	28197958
38	NC_004556	GGTG	2	8	15879	15886	0 %	25 %	75 %	0 %	28197958
39	NC_004556	CACC	2	8	16134	16141	25 %	0 %	0 %	75 %	28197958
40	NC_004556	CTGG	2	8	17273	17280	0 %	25 %	50 %	25 %	28197960
41	NC_004556	GCGT	2	8	17716	17723	0 %	25 %	50 %	25 %	28197960
42	NC_004556	GGCG	2	8	17801	17808	0 %	0 %	75 %	25 %	28197960
43	NC_004556	CTAT	2	8	17902	17909	25 %	50 %	0 %	25 %	28197960
44	NC_004556	CTGG	2	8	17920	17927	0 %	25 %	50 %	25 %	28197960
45	NC_004556	ATTG	2	8	21020	21027	25 %	50 %	25 %	0 %	28197961
46	NC_004556	GTCT	2	8	21639	21646	0 %	50 %	25 %	25 %	77747623
47	NC_004556	GAGC	2	8	21661	21668	25 %	0 %	50 %	25 %	77747623
48	NC_004556	ATCA	2	8	21893	21900	50 %	25 %	0 %	25 %	77747623
49	NC_004556	TGGC	2	8	21936	21943	0 %	25 %	50 %	25 %	77747623
50	NC_004556	ATTG	2	8	21953	21960	25 %	50 %	25 %	0 %	77747623
51	NC_004556	CCAA	2	8	22376	22383	50 %	0 %	0 %	50 %	77747623
52	NC_004556	AGTT	2	8	24015	24022	25 %	50 %	25 %	0 %	28197963
53	NC_004556	TATG	2	8	24303	24310	25 %	50 %	25 %	0 %	28197963
54	NC_004556	GCAA	2	8	24440	24447	50 %	0 %	25 %	25 %	28197964
55	NC_004556	TATT	2	8	24492	24499	25 %	75 %	0 %	0 %	28197964
56	NC_004556	TCTG	2	8	25269	25276	0 %	50 %	25 %	25 %	28197965
57	NC_004556	CACT	2	8	25467	25474	25 %	25 %	0 %	50 %	28197965
58	NC_004556	ACAG	2	8	25879	25886	50 %	0 %	25 %	25 %	28197966
59	NC_004556	TTAA	2	8	26434	26441	50 %	50 %	0 %	0 %	28197966
60	NC_004556	TTGA	2	8	27332	27339	25 %	50 %	25 %	0 %	28197967
61	NC_004556	TGAA	2	8	27672	27679	50 %	25 %	25 %	0 %	28197967
62	NC_004556	TGCC	2	8	27739	27746	0 %	25 %	25 %	50 %	28197967
63	NC_004556	CAAC	2	8	28104	28111	50 %	0 %	0 %	50 %	28197967
64	NC_004556	TGCC	2	8	28149	28156	0 %	25 %	25 %	50 %	28197967
65	NC_004556	GCGG	2	8	28252	28259	0 %	0 %	75 %	25 %	28197967
66	NC_004556	AGCC	2	8	28297	28304	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
67	NC_004556	TACC	2	8	28396	28403	25 %	25 %	0 %	50 %	28197967
68	NC_004556	ATTA	2	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	28197967
69	NC_004556	GACC	2	8	29062	29069	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
70	NC_004556	CCAG	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	28197967
71	NC_004556	GCGT	2	8	29518	29525	0 %	25 %	50 %	25 %	28197967
72	NC_004556	AGTG	2	8	30977	30984	25 %	25 %	50 %	0 %	28197969
73	NC_004556	GCCA	2	8	31396	31403	25 %	0 %	25 %	50 %	28197969
74	NC_004556	TATT	2	8	32927	32934	25 %	75 %	0 %	0 %	28197970
75	NC_004556	ACGC	2	8	33737	33744	25 %	0 %	25 %	50 %	28197970
76	NC_004556	TGCG	2	8	33790	33797	0 %	25 %	50 %	25 %	28197970
77	NC_004556	GTTT	2	8	35717	35724	0 %	75 %	25 %	0 %	28197972
78	NC_004556	CGTG	2	8	35730	35737	0 %	25 %	50 %	25 %	28197972
79	NC_004556	GTGA	2	8	35976	35983	25 %	25 %	50 %	0 %	28197972
80	NC_004556	GCAG	2	8	36483	36490	25 %	0 %	50 %	25 %	28197974
81	NC_004556	GGTG	2	8	36611	36618	0 %	25 %	75 %	0 %	28197974
82	NC_004556	CAGG	2	8	36626	36633	25 %	0 %	50 %	25 %	28197974
83	NC_004556	TTCT	2	8	37102	37109	0 %	75 %	0 %	25 %	28197974
84	NC_004556	GTTG	2	8	37362	37369	0 %	50 %	50 %	0 %	28197974
85	NC_004556	GGGT	2	8	37386	37393	0 %	25 %	75 %	0 %	28197974
86	NC_004556	GTGC	2	8	38184	38191	0 %	25 %	50 %	25 %	28197975
87	NC_004556	AGTG	2	8	38599	38606	25 %	25 %	50 %	0 %	28197975
88	NC_004556	TGTC	2	8	39201	39208	0 %	50 %	25 %	25 %	28197976
89	NC_004556	TTGA	2	8	39736	39743	25 %	50 %	25 %	0 %	28197976
90	NC_004556	GCTT	2	8	39893	39900	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
91	NC_004556	CAGC	2	8	40091	40098	25 %	0 %	25 %	50 %	28197977
92	NC_004556	GCGG	2	8	40265	40272	0 %	0 %	75 %	25 %	28197977
93	NC_004556	CGTT	2	8	40428	40435	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
94	NC_004556	TCAT	2	8	40450	40457	25 %	50 %	0 %	25 %	28197977
95	NC_004556	AGTG	2	8	41108	41115	25 %	25 %	50 %	0 %	28197977
96	NC_004556	GGGT	2	8	41204	41211	0 %	25 %	75 %	0 %	28197977
97	NC_004556	GTCG	2	8	41424	41431	0 %	25 %	50 %	25 %	28197977
98	NC_004556	GTGC	2	8	41871	41878	0 %	25 %	50 %	25 %	28197977
99	NC_004556	GTCG	2	8	42663	42670	0 %	25 %	50 %	25 %	28197977
100	NC_004556	CAAG	2	8	42914	42921	50 %	0 %	25 %	25 %	28197977
101	NC_004556	TTGC	2	8	43371	43378	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
102	NC_004556	TTGA	2	8	44184	44191	25 %	50 %	25 %	0 %	77747624
103	NC_004556	GGAG	2	8	44426	44433	25 %	0 %	75 %	0 %	77747624
104	NC_004556	TCCA	2	8	46137	46144	25 %	25 %	0 %	50 %	28197980
105	NC_004556	ACCA	2	8	46644	46651	50 %	0 %	0 %	50 %	28197981
106	NC_004556	TTCG	2	8	47356	47363	0 %	50 %	25 %	25 %	28197981
107	NC_004556	TGGT	2	8	47376	47383	0 %	50 %	50 %	0 %	28197981
108	NC_004556	GGCG	2	8	47782	47789	0 %	0 %	75 %	25 %	28197981
109	NC_004556	GGGA	2	8	48383	48390	25 %	0 %	75 %	0 %	28197981
110	NC_004556	TGGG	2	8	48636	48643	0 %	25 %	75 %	0 %	28197981
111	NC_004556	ATCC	2	8	50346	50353	25 %	25 %	0 %	50 %	28197982
112	NC_004556	GGTG	2	8	50523	50530	0 %	25 %	75 %	0 %	28197982
113	NC_004556	GATG	2	8	50990	50997	25 %	25 %	50 %	0 %	28197982
114	NC_004556	ATTG	2	8	51099	51106	25 %	50 %	25 %	0 %	28197982
115	NC_004556	GATG	2	8	51242	51249	25 %	25 %	50 %	0 %	28197982
116	NC_004556	AGTG	2	8	53111	53118	25 %	25 %	50 %	0 %	28197983
117	NC_004556	AATA	2	8	53415	53422	75 %	25 %	0 %	0 %	28197983
118	NC_004556	ATTG	2	8	53810	53817	25 %	50 %	25 %	0 %	28197984
119	NC_004556	TGTT	2	8	54949	54956	0 %	75 %	25 %	0 %	28197985
120	NC_004556	TTGA	2	8	55130	55137	25 %	50 %	25 %	0 %	28197985
121	NC_004556	GCAA	2	8	55454	55461	50 %	0 %	25 %	25 %	28197985
122	NC_004556	AATT	2	8	55631	55638	50 %	50 %	0 %	0 %	28197985
123	NC_004556	GGTT	2	8	55703	55710	0 %	50 %	50 %	0 %	28197985
124	NC_004556	GAAT	2	8	57016	57023	50 %	25 %	25 %	0 %	28197986
125	NC_004556	GCAC	2	8	57081	57088	25 %	0 %	25 %	50 %	28197986
126	NC_004556	GGCA	2	8	57102	57109	25 %	0 %	50 %	25 %	28197986
127	NC_004556	GTCA	2	8	57563	57570	25 %	25 %	25 %	25 %	28197986
128	NC_004556	ACAA	2	8	59370	59377	75 %	0 %	0 %	25 %	28197988
129	NC_004556	GTGC	2	8	59584	59591	0 %	25 %	50 %	25 %	28197988
130	NC_004556	GACT	2	8	59871	59878	25 %	25 %	25 %	25 %	28197988
131	NC_004556	TGCT	2	8	71624	71631	0 %	50 %	25 %	25 %	28197991
132	NC_004556	TTGT	2	8	71987	71994	0 %	75 %	25 %	0 %	28197991
133	NC_004556	GCCA	2	8	72392	72399	25 %	0 %	25 %	50 %	28197992
134	NC_004556	ACAA	2	8	72496	72503	75 %	0 %	0 %	25 %	28197992
135	NC_004556	TCAG	2	8	72577	72584	25 %	25 %	25 %	25 %	28197992
136	NC_004556	GTGA	2	8	72746	72753	25 %	25 %	50 %	0 %	28197992
137	NC_004556	AGCA	2	8	72771	72778	50 %	0 %	25 %	25 %	28197992
138	NC_004556	TAAA	2	8	72830	72837	75 %	25 %	0 %	0 %	28197992
139	NC_004556	AGAA	2	8	72870	72877	75 %	0 %	25 %	0 %	28197992
140	NC_004556	TTGA	2	8	73316	73323	25 %	50 %	25 %	0 %	28197993
141	NC_004556	TGGT	2	8	73512	73519	0 %	50 %	50 %	0 %	28197993
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