MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004556	GGC	2	6	243706	243711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198121
3502	NC_004556	TGA	2	6	243758	243763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198121
3503	NC_004556	CCG	2	6	243764	243769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198121
3504	NC_004556	TGC	2	6	243777	243782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3505	NC_004556	AGC	2	6	243797	243802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3506	NC_004556	GCC	2	6	243805	243810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198121
3507	NC_004556	GAG	2	6	243844	243849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198121
3508	NC_004556	TTG	2	6	243950	243955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198121
3509	NC_004556	AGG	2	6	244010	244015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198121
3510	NC_004556	TGC	2	6	244089	244094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3511	NC_004556	GCT	2	6	244132	244137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3512	NC_004556	TCG	2	6	244145	244150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3513	NC_004556	TGC	2	6	244200	244205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3514	NC_004556	GCA	2	6	244346	244351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3515	NC_004556	GGCTGG	2	12	244415	244426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	28198122
3516	NC_004556	GCT	2	6	244478	244483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3517	NC_004556	CGC	2	6	244494	244499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198122
3518	NC_004556	AAG	2	6	244579	244584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
3519	NC_004556	CAA	2	6	244604	244609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198122
3520	NC_004556	C	6	6	244656	244661	0 %	0 %	0 %	100 %	28198122
3521	NC_004556	ACC	2	6	244688	244693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198122
3522	NC_004556	GCTG	2	8	244700	244707	0 %	25 %	50 %	25 %	28198122
3523	NC_004556	GAA	2	6	244740	244745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
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3525	NC_004556	GAG	2	6	244806	244811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
3526	NC_004556	GAA	3	9	244830	244838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
3527	NC_004556	AGA	2	6	244858	244863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198122
3528	NC_004556	GAG	2	6	244881	244886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
3529	NC_004556	GAG	2	6	244941	244946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
3530	NC_004556	CTG	2	6	244984	244989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3531	NC_004556	TGG	2	6	245030	245035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
3532	NC_004556	GAT	2	6	245082	245087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198122
3533	NC_004556	GCT	2	6	245124	245129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3534	NC_004556	AC	3	6	245152	245157	50 %	0 %	0 %	50 %	28198122
3535	NC_004556	AGG	2	6	245165	245170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198122
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3537	NC_004556	GTG	2	6	245259	245264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
3538	NC_004556	GTG	2	6	245329	245334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
3539	NC_004556	GTT	2	6	245348	245353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
3540	NC_004556	AGC	2	6	245448	245453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3541	NC_004556	TCG	2	6	245579	245584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3542	NC_004556	TGG	2	6	245609	245614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
3543	NC_004556	CGC	2	6	245690	245695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198122
3544	NC_004556	GC	5	10	245708	245717	0 %	0 %	50 %	50 %	28198122
3545	NC_004556	TGC	2	6	245753	245758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3546	NC_004556	GAT	2	6	245760	245765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198122
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3549	NC_004556	GGC	2	6	245807	245812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198122
3550	NC_004556	CTG	2	6	245857	245862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3551	NC_004556	A	6	6	245876	245881	100 %	0 %	0 %	0 %	28198122
3552	NC_004556	GTT	2	6	245885	245890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
3553	NC_004556	CGT	2	6	245900	245905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3554	NC_004556	TGG	2	6	245918	245923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198122
3555	NC_004556	GTT	2	6	245975	245980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
3556	NC_004556	GCA	2	6	246104	246109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3557	NC_004556	GTGC	2	8	246162	246169	0 %	25 %	50 %	25 %	28198122
3558	NC_004556	ACCA	2	8	246190	246197	50 %	0 %	0 %	50 %	28198122
3559	NC_004556	TGC	2	6	246200	246205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
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3561	NC_004556	GAT	2	6	246279	246284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198122
3562	NC_004556	GCA	2	6	246308	246313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3563	NC_004556	CTG	2	6	246352	246357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198122
3564	NC_004556	TTG	2	6	246420	246425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198122
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3572	NC_004556	CCG	2	6	247176	247181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198123
3573	NC_004556	GAT	2	6	247417	247422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198123
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3589	NC_004556	ATTG	2	8	247941	247948	25 %	50 %	25 %	0 %	28198124
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3593	NC_004556	T	7	7	248081	248087	0 %	100 %	0 %	0 %	28198124
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3601	NC_004556	TCGA	2	8	248687	248694	25 %	25 %	25 %	25 %	28198125
3602	NC_004556	AAGA	2	8	248813	248820	75 %	0 %	25 %	0 %	28198125
3603	NC_004556	CAT	2	6	248822	248827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198125
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3605	NC_004556	TAA	2	6	248884	248889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28198125
3606	NC_004556	AACG	2	8	248897	248904	50 %	0 %	25 %	25 %	28198125
3607	NC_004556	GTT	2	6	248911	248916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198125
3608	NC_004556	CAT	2	6	249076	249081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198126
3609	NC_004556	GATG	2	8	249195	249202	25 %	25 %	50 %	0 %	28198126
3610	NC_004556	TGT	2	6	249222	249227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198126
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3613	NC_004556	CTT	2	6	249321	249326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198126
3614	NC_004556	GATT	2	8	249371	249378	25 %	50 %	25 %	0 %	28198126
3615	NC_004556	TCCG	2	8	249389	249396	0 %	25 %	25 %	50 %	28198126
3616	NC_004556	CTGG	2	8	249511	249518	0 %	25 %	50 %	25 %	28198126
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3621	NC_004556	A	6	6	249604	249609	100 %	0 %	0 %	0 %	28198126
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3623	NC_004556	GAA	2	6	249685	249690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198126
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3991	NC_004556	GCA	2	6	271160	271165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198141
3992	NC_004556	GAC	2	6	271287	271292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198141
3993	NC_004556	CAG	2	6	271332	271337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198141
3994	NC_004556	G	6	6	271386	271391	0 %	0 %	100 %	0 %	28198141
3995	NC_004556	TGGC	2	8	271510	271517	0 %	25 %	50 %	25 %	28198141
3996	NC_004556	CCA	2	6	271531	271536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198141
3997	NC_004556	ATCA	2	8	271593	271600	50 %	25 %	0 %	25 %	28198141
3998	NC_004556	GCT	2	6	271690	271695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198141
3999	NC_004556	GCC	2	6	271708	271713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198141
4000	NC_004556	CGATGC	2	12	271718	271729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28198141

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