MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004556	GGCGT	2	10	210791	210800	0 %	20 %	60 %	20 %	28198096
3002	NC_004556	TTG	2	6	210801	210806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198096
3003	NC_004556	CAAT	2	8	210822	210829	50 %	25 %	0 %	25 %	28198096
3004	NC_004556	CTT	2	6	210877	210882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198096
3005	NC_004556	CGT	2	6	210886	210891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3006	NC_004556	TTC	2	6	210915	210920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198096
3007	NC_004556	TCG	2	6	210933	210938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3008	NC_004556	AGTG	2	8	210965	210972	25 %	25 %	50 %	0 %	28198096
3009	NC_004556	AGC	2	6	211050	211055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3010	NC_004556	TCC	2	6	211065	211070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198096
3011	NC_004556	CTG	2	6	211096	211101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3012	NC_004556	CGAC	2	8	211215	211222	25 %	0 %	25 %	50 %	28198096
3013	NC_004556	CAC	2	6	211229	211234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198096
3014	NC_004556	TGAC	2	8	211269	211276	25 %	25 %	25 %	25 %	28198096
3015	NC_004556	TGCG	2	8	211294	211301	0 %	25 %	50 %	25 %	28198096
3016	NC_004556	TCA	2	6	211317	211322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198096
3017	NC_004556	ACA	2	6	211393	211398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198096
3018	NC_004556	TGT	2	6	211494	211499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198096
3019	NC_004556	TGAA	2	8	211509	211516	50 %	25 %	25 %	0 %	28198096
3020	NC_004556	TGA	2	6	211555	211560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198096
3021	NC_004556	TCG	2	6	211689	211694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3022	NC_004556	TGC	2	6	211805	211810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3023	NC_004556	GGA	2	6	211820	211825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198096
3024	NC_004556	TGT	2	6	211836	211841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198096
3025	NC_004556	ATC	2	6	211868	211873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198096
3026	NC_004556	CG	3	6	211900	211905	0 %	0 %	50 %	50 %	28198096
3027	NC_004556	CGT	2	6	211945	211950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3028	NC_004556	ATTG	2	8	211999	212006	25 %	50 %	25 %	0 %	28198096
3029	NC_004556	TTC	2	6	212012	212017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198096
3030	NC_004556	TGG	2	6	212172	212177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198096
3031	NC_004556	CTC	2	6	212206	212211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198096
3032	NC_004556	G	6	6	212307	212312	0 %	0 %	100 %	0 %	28198096
3033	NC_004556	GAG	2	6	212330	212335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198096
3034	NC_004556	GTT	2	6	212405	212410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198096
3035	NC_004556	CTG	2	6	212454	212459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096
3036	NC_004556	TCAA	2	8	212873	212880	50 %	25 %	0 %	25 %	28198097
3037	NC_004556	GAT	2	6	212936	212941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198097
3038	NC_004556	CCAGT	2	10	212978	212987	20 %	20 %	20 %	40 %	28198097
3039	NC_004556	TGG	2	6	213026	213031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198097
3040	NC_004556	TCG	2	6	213051	213056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198097
3041	NC_004556	GGC	2	6	213109	213114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198097
3042	NC_004556	GGC	2	6	213182	213187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198097
3043	NC_004556	TCG	2	6	213276	213281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198097
3044	NC_004556	TGG	2	6	213282	213287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198097
3045	NC_004556	CTG	2	6	213292	213297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198097
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3048	NC_004556	GATCG	2	10	213617	213626	20 %	20 %	40 %	20 %	28198097
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3054	NC_004556	GT	3	6	214406	214411	0 %	50 %	50 %	0 %	28198098
3055	NC_004556	GT	3	6	214418	214423	0 %	50 %	50 %	0 %	28198098
3056	NC_004556	GCG	2	6	214446	214451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198098
3057	NC_004556	GAT	2	6	214468	214473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198098
3058	NC_004556	TCG	2	6	214533	214538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198098
3059	NC_004556	TGC	2	6	214626	214631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198098
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3124	NC_004556	CAC	2	6	219267	219272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198103
3125	NC_004556	TTGG	2	8	219277	219284	0 %	50 %	50 %	0 %	28198103
3126	NC_004556	GGA	2	6	219327	219332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198103
3127	NC_004556	CTG	2	6	219380	219385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198103
3128	NC_004556	TGCT	2	8	219410	219417	0 %	50 %	25 %	25 %	28198103
3129	NC_004556	TGT	2	6	219441	219446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198103
3130	NC_004556	TGC	2	6	219462	219467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198103
3131	NC_004556	AT	3	6	219551	219556	50 %	50 %	0 %	0 %	28198103
3132	NC_004556	GGA	2	6	219717	219722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198104
3133	NC_004556	GTTG	2	8	219759	219766	0 %	50 %	50 %	0 %	28198104
3134	NC_004556	TGC	3	9	219801	219809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198104
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3143	NC_004556	ATTG	2	8	220236	220243	25 %	50 %	25 %	0 %	28198104
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3236	NC_004556	TGGCGT	2	12	227945	227956	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28198109
3237	NC_004556	AGCC	2	8	227990	227997	25 %	0 %	25 %	50 %	28198109
3238	NC_004556	GT	3	6	228001	228006	0 %	50 %	50 %	0 %	28198109
3239	NC_004556	AAAC	2	8	228040	228047	75 %	0 %	0 %	25 %	28198109
3240	NC_004556	GCA	2	6	228061	228066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198109
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3242	NC_004556	ATTA	2	8	228122	228129	50 %	50 %	0 %	0 %	28198109
3243	NC_004556	GCA	2	6	228142	228147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198109
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3246	NC_004556	TGC	2	6	228415	228420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198109
3247	NC_004556	GAT	2	6	228466	228471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198109
3248	NC_004556	CTG	2	6	228474	228479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198109
3249	NC_004556	TGC	2	6	228507	228512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198109
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3253	NC_004556	TAC	2	6	228632	228637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198109
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3255	NC_004556	CAG	2	6	228776	228781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198109
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3277	NC_004556	GGGT	2	8	230809	230816	0 %	25 %	75 %	0 %	28198110
3278	NC_004556	GGA	2	6	230822	230827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198110
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3285	NC_004556	TTCT	2	8	231155	231162	0 %	75 %	0 %	25 %	28198110
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3326	NC_004556	GTCG	2	8	233290	233297	0 %	25 %	50 %	25 %	28198112
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3362	NC_004556	GTGCG	2	10	235458	235467	0 %	20 %	60 %	20 %	28198114
3363	NC_004556	AGC	2	6	235471	235476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198114
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3365	NC_004556	GTTT	2	8	235560	235567	0 %	75 %	25 %	0 %	28198114
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3367	NC_004556	TGAT	2	8	235638	235645	25 %	50 %	25 %	0 %	28198114
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3369	NC_004556	GTG	2	6	235689	235694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198114
3370	NC_004556	GCG	2	6	235699	235704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198114
3371	NC_004556	TTG	2	6	235784	235789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198114
3372	NC_004556	AGG	2	6	235848	235853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198114
3373	NC_004556	CGT	2	6	235859	235864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198114
3374	NC_004556	CAT	2	6	235886	235891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198114
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3376	NC_004556	GTT	2	6	235945	235950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198114
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3382	NC_004556	GTTGG	2	10	236233	236242	0 %	40 %	60 %	0 %	28198115
3383	NC_004556	TGC	2	6	236286	236291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198115
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3385	NC_004556	TTG	2	6	236425	236430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198115
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3390	NC_004556	TGC	2	6	236616	236621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198115
3391	NC_004556	AT	3	6	236742	236747	50 %	50 %	0 %	0 %	28198116
3392	NC_004556	ATG	2	6	236827	236832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198116
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3398	NC_004556	TGC	2	6	237061	237066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198116
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3400	NC_004556	GT	3	6	237150	237155	0 %	50 %	50 %	0 %	28198116
3401	NC_004556	GTG	2	6	237217	237222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198116
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3444	NC_004556	TAG	2	6	239299	239304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198119
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3464	NC_004556	ATTG	2	8	240185	240192	25 %	50 %	25 %	0 %	28198119
3465	NC_004556	GT	3	6	240208	240213	0 %	50 %	50 %	0 %	28198119
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3479	NC_004556	TGT	2	6	242536	242541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198120
3480	NC_004556	CTTG	2	8	242542	242549	0 %	50 %	25 %	25 %	28198120
3481	NC_004556	GCTG	2	8	242563	242570	0 %	25 %	50 %	25 %	28198120
3482	NC_004556	GC	3	6	242616	242621	0 %	0 %	50 %	50 %	28198120
3483	NC_004556	A	6	6	242640	242645	100 %	0 %	0 %	0 %	28198120
3484	NC_004556	A	7	7	242660	242666	100 %	0 %	0 %	0 %	28198120
3485	NC_004556	GCA	2	6	242676	242681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198120
3486	NC_004556	A	6	6	242681	242686	100 %	0 %	0 %	0 %	28198120
3487	NC_004556	CGG	2	6	242700	242705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198120
3488	NC_004556	CGTG	2	8	242716	242723	0 %	25 %	50 %	25 %	28198120
3489	NC_004556	ATC	2	6	242797	242802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198121
3490	NC_004556	CGG	2	6	242831	242836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198121
3491	NC_004556	GAA	2	6	242838	242843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198121
3492	NC_004556	CGAT	2	8	242879	242886	25 %	25 %	25 %	25 %	28198121
3493	NC_004556	CCG	2	6	242913	242918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198121
3494	NC_004556	TGA	2	6	242934	242939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198121
3495	NC_004556	TGA	2	6	242988	242993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198121
3496	NC_004556	CAG	2	6	243115	243120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198121
3497	NC_004556	GTT	2	6	243121	243126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198121
3498	NC_004556	ATTGT	2	10	243562	243571	20 %	60 %	20 %	0 %	28198121
3499	NC_004556	TTG	2	6	243635	243640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198121
3500	NC_004556	GAG	2	6	243643	243648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198121

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