MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_004556	GTCGGT	2	12	176863	176874	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28198069
2503	NC_004556	TGC	2	6	176883	176888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198069
2504	NC_004556	TCC	2	6	176984	176989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198069
2505	NC_004556	GGA	2	6	177007	177012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198069
2506	NC_004556	TTGT	2	8	177070	177077	0 %	75 %	25 %	0 %	28198069
2507	NC_004556	GTC	2	6	177083	177088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198069
2508	NC_004556	CCT	2	6	177117	177122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198069
2509	NC_004556	ACT	2	6	177148	177153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198069
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2512	NC_004556	CAT	2	6	177434	177439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198070
2513	NC_004556	GCCA	2	8	177475	177482	25 %	0 %	25 %	50 %	28198070
2514	NC_004556	AAC	2	6	177501	177506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198070
2515	NC_004556	CAA	2	6	177551	177556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198070
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2518	NC_004556	A	6	6	177585	177590	100 %	0 %	0 %	0 %	28198070
2519	NC_004556	AGC	2	6	177645	177650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198070
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2521	NC_004556	CGG	2	6	177668	177673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198070
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2524	NC_004556	CAT	2	6	177734	177739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198070
2525	NC_004556	TGC	2	6	177749	177754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198070
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2530	NC_004556	A	6	6	177941	177946	100 %	0 %	0 %	0 %	28198070
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2532	NC_004556	A	6	6	177966	177971	100 %	0 %	0 %	0 %	28198070
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2542	NC_004556	ATTT	2	8	178658	178665	25 %	75 %	0 %	0 %	77747633
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2547	NC_004556	CGTG	2	8	178998	179005	0 %	25 %	50 %	25 %	77747633
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2549	NC_004556	AGT	2	6	179088	179093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747633
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2553	NC_004556	GTT	2	6	179304	179309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77747633
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2555	NC_004556	CTG	2	6	179369	179374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77747633
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2563	NC_004556	TTC	2	6	179650	179655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77747633
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2565	NC_004556	TGCT	2	8	179705	179712	0 %	50 %	25 %	25 %	77747633
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2572	NC_004556	TAG	2	6	180149	180154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77747633
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2587	NC_004556	GCCA	2	8	181344	181351	25 %	0 %	25 %	50 %	28198072
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2607	NC_004556	CTG	2	6	182994	182999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198073
2608	NC_004556	T	6	6	183002	183007	0 %	100 %	0 %	0 %	28198073
2609	NC_004556	TAC	2	6	183041	183046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198073
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2615	NC_004556	CA	3	6	183464	183469	50 %	0 %	0 %	50 %	28198073
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2620	NC_004556	CTT	2	6	183758	183763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198073
2621	NC_004556	CG	3	6	183769	183774	0 %	0 %	50 %	50 %	28198073
2622	NC_004556	GATT	2	8	183798	183805	25 %	50 %	25 %	0 %	28198073
2623	NC_004556	GAATGC	2	12	183888	183899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28198074
2624	NC_004556	CGA	2	6	183921	183926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198074
2625	NC_004556	CAT	2	6	183939	183944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198074
2626	NC_004556	GCT	2	6	183973	183978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198074
2627	NC_004556	TCTA	2	8	184003	184010	25 %	50 %	0 %	25 %	28198074
2628	NC_004556	TTAC	2	8	184027	184034	25 %	50 %	0 %	25 %	28198074
2629	NC_004556	TTG	2	6	184063	184068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198074
2630	NC_004556	TTG	2	6	184153	184158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198074
2631	NC_004556	GAGTG	2	10	184248	184257	20 %	20 %	60 %	0 %	28198074
2632	NC_004556	CTT	2	6	184269	184274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198074
2633	NC_004556	GTTG	2	8	184322	184329	0 %	50 %	50 %	0 %	28198074
2634	NC_004556	GCTT	2	8	184358	184365	0 %	50 %	25 %	25 %	28198074
2635	NC_004556	GTTG	2	8	184382	184389	0 %	50 %	50 %	0 %	28198074
2636	NC_004556	CGG	2	6	184395	184400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198074
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2649	NC_004556	CGG	2	6	185045	185050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198075
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2657	NC_004556	CGA	2	6	185438	185443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198075
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2674	NC_004556	TGC	2	6	186490	186495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198076
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2733	NC_004556	TGCGA	2	10	192069	192078	20 %	20 %	40 %	20 %	28198080
2734	NC_004556	GCG	2	6	192087	192092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198080
2735	NC_004556	GC	5	10	192151	192160	0 %	0 %	50 %	50 %	28198080
2736	NC_004556	ACGT	2	8	192209	192216	25 %	25 %	25 %	25 %	28198080
2737	NC_004556	GCG	2	6	192267	192272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198080
2738	NC_004556	TCG	2	6	192321	192326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198080
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2740	NC_004556	TGA	2	6	192498	192503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198080
2741	NC_004556	TCA	2	6	192507	192512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198080
2742	NC_004556	GTC	2	6	192861	192866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198081
2743	NC_004556	GAT	3	9	192909	192917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198081
2744	NC_004556	CGAC	2	8	192919	192926	25 %	0 %	25 %	50 %	28198081
2745	NC_004556	AGC	2	6	192949	192954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198081
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2747	NC_004556	AAC	2	6	193023	193028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198081
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2993	NC_004556	T	6	6	210395	210400	0 %	100 %	0 %	0 %	28198096
2994	NC_004556	CG	3	6	210407	210412	0 %	0 %	50 %	50 %	28198096
2995	NC_004556	CCG	2	6	210444	210449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198096
2996	NC_004556	TTC	2	6	210516	210521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198096
2997	NC_004556	GC	3	6	210563	210568	0 %	0 %	50 %	50 %	28198096
2998	NC_004556	GAG	2	6	210659	210664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198096
2999	NC_004556	GCG	2	6	210665	210670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198096
3000	NC_004556	GTC	2	6	210743	210748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198096

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