MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004556	CCA	2	6	112578	112583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198026
1502	NC_004556	AGG	2	6	112604	112609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198026
1503	NC_004556	ACG	2	6	112660	112665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198026
1504	NC_004556	CTG	2	6	112690	112695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198026
1505	NC_004556	ACGC	2	8	112793	112800	25 %	0 %	25 %	50 %	28198026
1506	NC_004556	GAA	2	6	112810	112815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198026
1507	NC_004556	TAC	2	6	112843	112848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198026
1508	NC_004556	GC	3	6	112857	112862	0 %	0 %	50 %	50 %	28198026
1509	NC_004556	CAA	2	6	112863	112868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198026
1510	NC_004556	GAT	2	6	112872	112877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198026
1511	NC_004556	CG	3	6	112895	112900	0 %	0 %	50 %	50 %	28198026
1512	NC_004556	GGAT	2	8	112940	112947	25 %	25 %	50 %	0 %	28198026
1513	NC_004556	GCA	2	6	112950	112955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198026
1514	NC_004556	GCC	2	6	113034	113039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198026
1515	NC_004556	TCC	2	6	113175	113180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198026
1516	NC_004556	AAG	2	6	113189	113194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198026
1517	NC_004556	TAC	2	6	113200	113205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198026
1518	NC_004556	GCA	2	6	113207	113212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198026
1519	NC_004556	CTT	2	6	113223	113228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198026
1520	NC_004556	CGG	3	9	113237	113245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198026
1521	NC_004556	AATC	2	8	113267	113274	50 %	25 %	0 %	25 %	28198026
1522	NC_004556	TTC	2	6	113280	113285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198026
1523	NC_004556	CGG	2	6	113288	113293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198026
1524	NC_004556	TCA	2	6	113358	113363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198026
1525	NC_004556	CTG	2	6	113371	113376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198026
1526	NC_004556	GGC	2	6	113548	113553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198027
1527	NC_004556	TGT	2	6	113598	113603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198027
1528	NC_004556	AC	3	6	113685	113690	50 %	0 %	0 %	50 %	28198027
1529	NC_004556	T	6	6	113695	113700	0 %	100 %	0 %	0 %	28198027
1530	NC_004556	TGA	2	6	113706	113711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198027
1531	NC_004556	GCG	2	6	113734	113739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198027
1532	NC_004556	GTG	2	6	113819	113824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198027
1533	NC_004556	CAG	2	6	113829	113834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198027
1534	NC_004556	TG	3	6	114015	114020	0 %	50 %	50 %	0 %	28198027
1535	NC_004556	GTT	2	6	114180	114185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198027
1536	NC_004556	TTGT	2	8	115537	115544	0 %	75 %	25 %	0 %	28198028
1537	NC_004556	TTG	2	6	115551	115556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198028
1538	NC_004556	GTG	2	6	115608	115613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198028
1539	NC_004556	CGG	2	6	115636	115641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198028
1540	NC_004556	CGAG	2	8	115685	115692	25 %	0 %	50 %	25 %	28198028
1541	NC_004556	GTTC	2	8	115717	115724	0 %	50 %	25 %	25 %	28198028
1542	NC_004556	TGG	2	6	115737	115742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198028
1543	NC_004556	TGA	3	9	115831	115839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198028
1544	NC_004556	TGGC	2	8	115840	115847	0 %	25 %	50 %	25 %	28198028
1545	NC_004556	GTT	2	6	115861	115866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198028
1546	NC_004556	GCAG	2	8	115987	115994	25 %	0 %	50 %	25 %	28198028
1547	NC_004556	GT	3	6	116114	116119	0 %	50 %	50 %	0 %	28198028
1548	NC_004556	AGC	2	6	116126	116131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198028
1549	NC_004556	GGT	2	6	116150	116155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198028
1550	NC_004556	CG	3	6	116177	116182	0 %	0 %	50 %	50 %	28198028
1551	NC_004556	TTG	2	6	116183	116188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198028
1552	NC_004556	TGC	3	9	116197	116205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198028
1553	NC_004556	GCT	3	9	116221	116229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198028
1554	NC_004556	TCAC	2	8	116304	116311	25 %	25 %	0 %	50 %	28198028
1555	NC_004556	GTC	2	6	116322	116327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198028
1556	NC_004556	CAT	2	6	116399	116404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198028
1557	NC_004556	GGC	3	9	116425	116433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198028
1558	NC_004556	ATGG	2	8	116492	116499	25 %	25 %	50 %	0 %	28198028
1559	NC_004556	GCT	2	6	116528	116533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198028
1560	NC_004556	CAG	2	6	117033	117038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198029
1561	NC_004556	CAA	2	6	117059	117064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198029
1562	NC_004556	CG	3	6	117104	117109	0 %	0 %	50 %	50 %	28198029
1563	NC_004556	CG	3	6	117132	117137	0 %	0 %	50 %	50 %	28198029
1564	NC_004556	GCA	2	6	117140	117145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198029
1565	NC_004556	GAT	2	6	117173	117178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198029
1566	NC_004556	CGC	2	6	117180	117185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198029
1567	NC_004556	GTG	2	6	117339	117344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198029
1568	NC_004556	TTG	2	6	117345	117350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198029
1569	NC_004556	GT	3	6	117355	117360	0 %	50 %	50 %	0 %	28198029
1570	NC_004556	TCT	2	6	117361	117366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198029
1571	NC_004556	TGG	2	6	117484	117489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198029
1572	NC_004556	TGA	3	9	117497	117505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198029
1573	NC_004556	TTG	2	6	117519	117524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198029
1574	NC_004556	TGAGG	2	10	117581	117590	20 %	20 %	60 %	0 %	28198029
1575	NC_004556	TGC	2	6	117631	117636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198029
1576	NC_004556	TGGA	2	8	117829	117836	25 %	25 %	50 %	0 %	28198030
1577	NC_004556	GGT	2	6	117988	117993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198030
1578	NC_004556	TCT	2	6	118033	118038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198030
1579	NC_004556	AGA	2	6	118079	118084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198030
1580	NC_004556	CAG	2	6	118094	118099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198030
1581	NC_004556	TGA	2	6	118161	118166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198030
1582	NC_004556	TGT	3	9	118169	118177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198030
1583	NC_004556	TCGA	2	8	118237	118244	25 %	25 %	25 %	25 %	28198030
1584	NC_004556	TGA	2	6	118337	118342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198030
1585	NC_004556	ATG	2	6	118432	118437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198030
1586	NC_004556	GTT	2	6	118570	118575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198030
1587	NC_004556	ATTG	2	8	118653	118660	25 %	50 %	25 %	0 %	28198030
1588	NC_004556	GTTG	2	8	118680	118687	0 %	50 %	50 %	0 %	28198030
1589	NC_004556	TGG	2	6	118713	118718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198030
1590	NC_004556	CCGA	2	8	118819	118826	25 %	0 %	25 %	50 %	28198030
1591	NC_004556	TACC	2	8	119370	119377	25 %	25 %	0 %	50 %	28198031
1592	NC_004556	TGC	2	6	119573	119578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1593	NC_004556	GGT	2	6	119588	119593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198031
1594	NC_004556	GGTT	2	8	119614	119621	0 %	50 %	50 %	0 %	28198031
1595	NC_004556	TCA	2	6	119632	119637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198031
1596	NC_004556	CTTT	2	8	119640	119647	0 %	75 %	0 %	25 %	28198031
1597	NC_004556	ATT	2	6	119676	119681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198031
1598	NC_004556	AAG	2	6	119684	119689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198031
1599	NC_004556	C	6	6	119738	119743	0 %	0 %	0 %	100 %	28198031
1600	NC_004556	TGG	2	6	119805	119810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198031
1601	NC_004556	TCT	2	6	119922	119927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198031
1602	NC_004556	G	6	6	119951	119956	0 %	0 %	100 %	0 %	28198031
1603	NC_004556	CCT	2	6	119957	119962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198031
1604	NC_004556	TG	3	6	120068	120073	0 %	50 %	50 %	0 %	28198031
1605	NC_004556	GGC	2	6	120100	120105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198031
1606	NC_004556	GCA	2	6	120112	120117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1607	NC_004556	AC	3	6	120121	120126	50 %	0 %	0 %	50 %	28198031
1608	NC_004556	GATT	2	8	120136	120143	25 %	50 %	25 %	0 %	28198031
1609	NC_004556	GCC	2	6	120167	120172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198031
1610	NC_004556	CTG	2	6	120180	120185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1611	NC_004556	CGTG	2	8	120233	120240	0 %	25 %	50 %	25 %	28198031
1612	NC_004556	TCG	2	6	120252	120257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1613	NC_004556	ATC	2	6	120305	120310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198031
1614	NC_004556	TTC	2	6	120356	120361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198031
1615	NC_004556	AAC	2	6	120362	120367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198031
1616	NC_004556	GC	4	8	120674	120681	0 %	0 %	50 %	50 %	28198031
1617	NC_004556	GTG	2	6	120699	120704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198031
1618	NC_004556	CTG	2	6	120714	120719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1619	NC_004556	AGC	2	6	120762	120767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1620	NC_004556	GTT	2	6	120796	120801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198031
1621	NC_004556	GTCG	2	8	120829	120836	0 %	25 %	50 %	25 %	28198031
1622	NC_004556	TGA	2	6	120838	120843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198031
1623	NC_004556	GACC	2	8	120856	120863	25 %	0 %	25 %	50 %	28198031
1624	NC_004556	TGG	2	6	120886	120891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198031
1625	NC_004556	TGT	2	6	121026	121031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198031
1626	NC_004556	GC	3	6	121101	121106	0 %	0 %	50 %	50 %	28198031
1627	NC_004556	GTG	2	6	121130	121135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198031
1628	NC_004556	GTGC	2	8	121244	121251	0 %	25 %	50 %	25 %	28198031
1629	NC_004556	ATC	2	6	121254	121259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198031
1630	NC_004556	TGA	2	6	121263	121268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198031
1631	NC_004556	GA	3	6	121323	121328	50 %	0 %	50 %	0 %	28198031
1632	NC_004556	GTA	2	6	121349	121354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198031
1633	NC_004556	GGT	2	6	121382	121387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198031
1634	NC_004556	GTTT	2	8	121416	121423	0 %	75 %	25 %	0 %	28198031
1635	NC_004556	CGT	2	6	121460	121465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1636	NC_004556	TGGC	2	8	121533	121540	0 %	25 %	50 %	25 %	28198031
1637	NC_004556	GTA	2	6	121548	121553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198031
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1639	NC_004556	AGT	2	6	121699	121704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198031
1640	NC_004556	CGC	2	6	121705	121710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198031
1641	NC_004556	CGG	2	6	121807	121812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198031
1642	NC_004556	CTG	2	6	121830	121835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198031
1643	NC_004556	GCG	2	6	121941	121946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198031
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1645	NC_004556	CTGAA	2	10	122009	122018	40 %	20 %	20 %	20 %	28198031
1646	NC_004556	TCG	2	6	122170	122175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198032
1647	NC_004556	TGA	2	6	122190	122195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198032
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1652	NC_004556	CTG	2	6	123560	123565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198033
1653	NC_004556	GCC	2	6	123576	123581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198033
1654	NC_004556	TCG	2	6	123595	123600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198033
1655	NC_004556	GC	3	6	123606	123611	0 %	0 %	50 %	50 %	28198033
1656	NC_004556	GCA	2	6	123649	123654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198033
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1661	NC_004556	ACTG	2	8	124016	124023	25 %	25 %	25 %	25 %	28198033
1662	NC_004556	CCT	2	6	124136	124141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198033
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1665	NC_004556	ACC	2	6	124201	124206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198033
1666	NC_004556	CGG	2	6	124234	124239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198033
1667	NC_004556	ATC	2	6	124248	124253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198033
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1670	NC_004556	TCT	2	6	124378	124383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198033
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1722	NC_004556	CGT	2	6	127746	127751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198036
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1728	NC_004556	CTAT	2	8	128073	128080	25 %	50 %	0 %	25 %	28198036
1729	NC_004556	GGCC	2	8	128145	128152	0 %	0 %	50 %	50 %	28198036
1730	NC_004556	ATT	2	6	128167	128172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28198036
1731	NC_004556	GCC	2	6	128184	128189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198036
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1734	NC_004556	A	7	7	128272	128278	100 %	0 %	0 %	0 %	28198036
1735	NC_004556	ACA	2	6	128291	128296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198036
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1738	NC_004556	CGC	2	6	128368	128373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198036
1739	NC_004556	ATACCT	2	12	128426	128437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198036
1740	NC_004556	CTG	2	6	128440	128445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198036
1741	NC_004556	CAC	2	6	128451	128456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198036
1742	NC_004556	ACTGG	2	10	128468	128477	20 %	20 %	40 %	20 %	28198036
1743	NC_004556	ATG	2	6	128645	128650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198036
1744	NC_004556	C	6	6	128756	128761	0 %	0 %	0 %	100 %	28198036
1745	NC_004556	GCCA	2	8	128899	128906	25 %	0 %	25 %	50 %	28198036
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1747	NC_004556	CGG	2	6	128954	128959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198036
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1871	NC_004556	CCG	2	6	135436	135441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198042
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1973	NC_004556	TCT	2	6	139973	139978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198046
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1983	NC_004556	TACCGT	2	12	140541	140552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28198046
1984	NC_004556	TGG	2	6	140578	140583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198046
1985	NC_004556	CGA	2	6	140755	140760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198046
1986	NC_004556	CAC	2	6	140768	140773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198046
1987	NC_004556	TGG	2	6	140779	140784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198046
1988	NC_004556	GCG	2	6	140847	140852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198046
1989	NC_004556	AGCA	2	8	140890	140897	50 %	0 %	25 %	25 %	28198046
1990	NC_004556	TGGG	2	8	140921	140928	0 %	25 %	75 %	0 %	28198046
1991	NC_004556	TCG	2	6	140940	140945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198046
1992	NC_004556	TCA	2	6	140948	140953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198046
1993	NC_004556	GTT	2	6	140957	140962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198046
1994	NC_004556	CGG	2	6	141049	141054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198046
1995	NC_004556	GTG	2	6	141105	141110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198046
1996	NC_004556	GC	5	10	141164	141173	0 %	0 %	50 %	50 %	28198046
1997	NC_004556	TGTTTG	2	12	141184	141195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198046
1998	NC_004556	AC	3	6	141281	141286	50 %	0 %	0 %	50 %	28198046
1999	NC_004556	GTT	2	6	141299	141304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198046
2000	NC_004556	AAT	2	6	141379	141384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28198046

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