MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004556	GAA	2	6	33522	33527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28197970
502	NC_004556	ATC	2	6	33660	33665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197970
503	NC_004556	CCG	2	6	33684	33689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197970
504	NC_004556	ACGC	2	8	33737	33744	25 %	0 %	25 %	50 %	28197970
505	NC_004556	TGCG	2	8	33790	33797	0 %	25 %	50 %	25 %	28197970
506	NC_004556	CGA	2	6	33911	33916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197970
507	NC_004556	AGT	2	6	33936	33941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197970
508	NC_004556	TG	3	6	33951	33956	0 %	50 %	50 %	0 %	28197970
509	NC_004556	ATT	2	6	34905	34910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197971
510	NC_004556	T	6	6	34909	34914	0 %	100 %	0 %	0 %	28197971
511	NC_004556	GTA	3	9	34935	34943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197971
512	NC_004556	TGG	2	6	34966	34971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197971
513	NC_004556	TTA	2	6	34994	34999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197971
514	NC_004556	GAT	2	6	35011	35016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197971
515	NC_004556	ATG	3	9	35033	35041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197971
516	NC_004556	TGA	2	6	35058	35063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197971
517	NC_004556	ACG	2	6	35081	35086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197971
518	NC_004556	CCT	2	6	35094	35099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28197971
519	NC_004556	CTG	2	6	35103	35108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197971
520	NC_004556	GTG	2	6	35181	35186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197971
521	NC_004556	AAT	2	6	35188	35193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28197971
522	NC_004556	TGC	2	6	35227	35232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197971
523	NC_004556	CAC	2	6	35239	35244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28197971
524	NC_004556	ATT	2	6	35637	35642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197972
525	NC_004556	GTA	2	6	35662	35667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197972
526	NC_004556	GTTT	2	8	35717	35724	0 %	75 %	25 %	0 %	28197972
527	NC_004556	CGTG	2	8	35730	35737	0 %	25 %	50 %	25 %	28197972
528	NC_004556	AAC	2	6	35821	35826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197972
529	NC_004556	GT	3	6	35830	35835	0 %	50 %	50 %	0 %	28197972
530	NC_004556	TGC	2	6	35836	35841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197972
531	NC_004556	GTT	2	6	35898	35903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197972
532	NC_004556	ACT	2	6	35909	35914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197972
533	NC_004556	GCT	2	6	35969	35974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197972
534	NC_004556	GTGA	2	8	35976	35983	25 %	25 %	50 %	0 %	28197972
535	NC_004556	TG	3	6	36066	36071	0 %	50 %	50 %	0 %	28197973
536	NC_004556	TTG	2	6	36072	36077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197973
537	NC_004556	AG	3	6	36093	36098	50 %	0 %	50 %	0 %	28197973
538	NC_004556	T	6	6	36188	36193	0 %	100 %	0 %	0 %	28197973
539	NC_004556	TGA	2	6	36247	36252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197973
540	NC_004556	AGT	2	6	36273	36278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197974
541	NC_004556	TCT	2	6	36312	36317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197974
542	NC_004556	CGA	2	6	36347	36352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197974
543	NC_004556	GGT	2	6	36423	36428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197974
544	NC_004556	GTTGGT	2	12	36444	36455	0 %	50 %	50 %	0 %	28197974
545	NC_004556	TG	3	6	36464	36469	0 %	50 %	50 %	0 %	28197974
546	NC_004556	GCAG	2	8	36483	36490	25 %	0 %	50 %	25 %	28197974
547	NC_004556	AT	3	6	36498	36503	50 %	50 %	0 %	0 %	28197974
548	NC_004556	TGTTTG	2	12	36530	36541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197974
549	NC_004556	GTT	2	6	36550	36555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197974
550	NC_004556	GGTG	2	8	36611	36618	0 %	25 %	75 %	0 %	28197974
551	NC_004556	CAGG	2	8	36626	36633	25 %	0 %	50 %	25 %	28197974
552	NC_004556	TCA	2	6	36683	36688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197974
553	NC_004556	TGC	2	6	36711	36716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197974
554	NC_004556	TGG	2	6	36807	36812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197974
555	NC_004556	CCG	2	6	36835	36840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197974
556	NC_004556	GCC	2	6	36853	36858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197974
557	NC_004556	ACA	2	6	36872	36877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197974
558	NC_004556	TGC	2	6	36884	36889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197974
559	NC_004556	GTT	2	6	36945	36950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197974
560	NC_004556	TGC	2	6	36993	36998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197974
561	NC_004556	TTG	2	6	37039	37044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197974
562	NC_004556	GTTTG	2	10	37057	37066	0 %	60 %	40 %	0 %	28197974
563	NC_004556	GGT	2	6	37077	37082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197974
564	NC_004556	GTT	2	6	37092	37097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197974
565	NC_004556	TTCT	2	8	37102	37109	0 %	75 %	0 %	25 %	28197974
566	NC_004556	GTG	2	6	37218	37223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197974
567	NC_004556	GTTG	2	8	37362	37369	0 %	50 %	50 %	0 %	28197974
568	NC_004556	GGGT	2	8	37386	37393	0 %	25 %	75 %	0 %	28197974
569	NC_004556	CGG	2	6	37421	37426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197974
570	NC_004556	TTG	3	9	37480	37488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197974
571	NC_004556	GCT	2	6	37489	37494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197974
572	NC_004556	GCC	2	6	37497	37502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197974
573	NC_004556	TGC	2	6	37512	37517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197974
574	NC_004556	AGG	2	6	38107	38112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197975
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576	NC_004556	TGCGC	2	10	38294	38303	0 %	20 %	40 %	40 %	28197975
577	NC_004556	CGG	2	6	38361	38366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28197975
578	NC_004556	TTC	2	6	38379	38384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28197975
579	NC_004556	TGA	2	6	38444	38449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28197975
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581	NC_004556	AGTG	2	8	38599	38606	25 %	25 %	50 %	0 %	28197975
582	NC_004556	TGTC	2	8	39201	39208	0 %	50 %	25 %	25 %	28197976
583	NC_004556	GCC	2	6	39220	39225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28197976
584	NC_004556	CAA	2	6	39386	39391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28197976
585	NC_004556	ATT	2	6	39518	39523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28197976
586	NC_004556	CAG	2	6	39529	39534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197976
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588	NC_004556	ATC	2	6	39609	39614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28197976
589	NC_004556	TTGA	2	8	39736	39743	25 %	50 %	25 %	0 %	28197976
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591	NC_004556	GCT	2	6	39833	39838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197977
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593	NC_004556	GCTT	2	8	39893	39900	0 %	50 %	25 %	25 %	28197977
594	NC_004556	TGC	2	6	39914	39919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197977
595	NC_004556	CA	3	6	39925	39930	50 %	0 %	0 %	50 %	28197977
596	NC_004556	CAGC	2	8	40091	40098	25 %	0 %	25 %	50 %	28197977
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598	NC_004556	GCA	2	6	40169	40174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197977
599	NC_004556	TGG	2	6	40199	40204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28197977
600	NC_004556	AGC	2	6	40252	40257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197977
601	NC_004556	GCGG	2	8	40265	40272	0 %	0 %	75 %	25 %	28197977
602	NC_004556	G	6	6	40323	40328	0 %	0 %	100 %	0 %	28197977
603	NC_004556	GAG	2	6	40386	40391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197977
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605	NC_004556	TCAT	2	8	40450	40457	25 %	50 %	0 %	25 %	28197977
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613	NC_004556	TGCGT	2	10	40820	40829	0 %	40 %	40 %	20 %	28197977
614	NC_004556	AGC	2	6	40909	40914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28197977
615	NC_004556	GT	3	6	40987	40992	0 %	50 %	50 %	0 %	28197977
616	NC_004556	TGC	2	6	40997	41002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197977
617	NC_004556	GTC	2	6	41014	41019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28197977
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619	NC_004556	TTG	2	6	41037	41042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28197977
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621	NC_004556	T	6	6	41088	41093	0 %	100 %	0 %	0 %	28197977
622	NC_004556	CT	3	6	41094	41099	0 %	50 %	0 %	50 %	28197977
623	NC_004556	AGTG	2	8	41108	41115	25 %	25 %	50 %	0 %	28197977
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627	NC_004556	GGA	2	6	41246	41251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28197977
628	NC_004556	TC	3	6	41259	41264	0 %	50 %	0 %	50 %	28197977
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