MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004556	AGG	2	6	387755	387760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198229
6002	NC_004556	GGT	2	6	387766	387771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198229
6003	NC_004556	GGT	2	6	387789	387794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198229
6004	NC_004556	TTC	2	6	387870	387875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198229
6005	NC_004556	GCGTT	2	10	387925	387934	0 %	40 %	40 %	20 %	28198229
6006	NC_004556	GTT	2	6	387972	387977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198229
6007	NC_004556	GATTCT	2	12	387990	388001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28198229
6008	NC_004556	TGC	2	6	388002	388007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198229
6009	NC_004556	GCA	2	6	388023	388028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198229
6010	NC_004556	GGA	2	6	388041	388046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198229
6011	NC_004556	TTGGGG	2	12	388082	388093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198229
6012	NC_004556	GTT	2	6	388104	388109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198229
6013	NC_004556	TTG	2	6	388120	388125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198229
6014	NC_004556	GGCAG	2	10	388161	388170	20 %	0 %	60 %	20 %	28198229
6015	NC_004556	TGCGGT	2	12	388190	388201	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28198229
6016	NC_004556	GCG	2	6	388215	388220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198229
6017	NC_004556	TTG	2	6	388256	388261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198229
6018	NC_004556	TGC	2	6	388298	388303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198229
6019	NC_004556	TGG	2	6	388394	388399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198229
6020	NC_004556	TGG	2	6	388415	388420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198229
6021	NC_004556	GTT	2	6	388464	388469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198229
6022	NC_004556	TGGT	2	8	388493	388500	0 %	50 %	50 %	0 %	28198229
6023	NC_004556	GTT	2	6	389036	389041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198230
6024	NC_004556	GGT	2	6	389047	389052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198230
6025	NC_004556	AT	3	6	389080	389085	50 %	50 %	0 %	0 %	28198230
6026	NC_004556	GCG	2	6	389101	389106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198230
6027	NC_004556	CAGGTA	2	12	389146	389157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28198230
6028	NC_004556	TGG	2	6	389267	389272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198230
6029	NC_004556	GACTGC	2	12	389284	389295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28198230
6030	NC_004556	AGT	2	6	389297	389302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198230
6031	NC_004556	TGG	2	6	389319	389324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198230
6032	NC_004556	CCAT	2	8	389402	389409	25 %	25 %	0 %	50 %	28198230
6033	NC_004556	GCC	2	6	389410	389415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198230
6034	NC_004556	GCG	2	6	389440	389445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198230
6035	NC_004556	GTT	2	6	389457	389462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198230
6036	NC_004556	CGGC	2	8	389475	389482	0 %	0 %	50 %	50 %	28198230
6037	NC_004556	CATTGA	2	12	389550	389561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28198230
6038	NC_004556	CAG	2	6	389608	389613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198230
6039	NC_004556	GTC	2	6	389758	389763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198230
6040	NC_004556	TGTT	2	8	390241	390248	0 %	75 %	25 %	0 %	28198231
6041	NC_004556	TTG	2	6	390253	390258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198231
6042	NC_004556	GTT	2	6	390267	390272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198231
6043	NC_004556	TGA	2	6	390327	390332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198231
6044	NC_004556	CAG	3	9	390355	390363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198231
6045	NC_004556	GTG	2	6	390399	390404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198231
6046	NC_004556	GTG	2	6	390461	390466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198231
6047	NC_004556	GAT	2	6	390523	390528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198231
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6051	NC_004556	TGGT	2	8	390728	390735	0 %	50 %	50 %	0 %	28198232
6052	NC_004556	TCCT	2	8	390748	390755	0 %	50 %	0 %	50 %	28198232
6053	NC_004556	TA	3	6	390846	390851	50 %	50 %	0 %	0 %	28198232
6054	NC_004556	TCA	2	6	390860	390865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198232
6055	NC_004556	GT	3	6	390924	390929	0 %	50 %	50 %	0 %	28198232
6056	NC_004556	GAG	2	6	390964	390969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198232
6057	NC_004556	GT	3	6	391083	391088	0 %	50 %	50 %	0 %	28198232
6058	NC_004556	GGC	2	6	391094	391099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198232
6059	NC_004556	GGGA	2	8	391210	391217	25 %	0 %	75 %	0 %	28198232
6060	NC_004556	TTGGT	2	10	391229	391238	0 %	60 %	40 %	0 %	28198232
6061	NC_004556	ATG	2	6	391266	391271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198232
6062	NC_004556	GTT	2	6	391371	391376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198232
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6065	NC_004556	CTT	2	6	392561	392566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198233
6066	NC_004556	TTG	2	6	392589	392594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198233
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6070	NC_004556	GAG	2	6	392632	392637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198233
6071	NC_004556	GCT	2	6	392658	392663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198233
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6091	NC_004556	CGA	2	6	394148	394153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198234
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6093	NC_004556	CGA	2	6	394166	394171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198234
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6104	NC_004556	AGC	2	6	394563	394568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198234
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6118	NC_004556	G	7	7	395599	395605	0 %	0 %	100 %	0 %	28198234
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6122	NC_004556	GCAT	2	8	395856	395863	25 %	25 %	25 %	25 %	28198234
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6494	NC_004556	GTAA	2	8	420205	420212	50 %	25 %	25 %	0 %	28198247
6495	NC_004556	TTC	2	6	420331	420336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28198248
6496	NC_004556	AGT	2	6	420444	420449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198248
6497	NC_004556	C	6	6	420473	420478	0 %	0 %	0 %	100 %	28198248
6498	NC_004556	CTC	2	6	420559	420564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28198248
6499	NC_004556	T	6	6	420615	420620	0 %	100 %	0 %	0 %	28198248
6500	NC_004556	TGA	2	6	420637	420642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198248

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