MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 40729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_004556	ATGC	2	8	304673	304680	25 %	25 %	25 %	25 %	28198164
4503	NC_004556	GAA	2	6	304693	304698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198164
4504	NC_004556	GAA	2	6	304727	304732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198164
4505	NC_004556	TGT	2	6	304761	304766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198164
4506	NC_004556	TGT	2	6	304807	304812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198164
4507	NC_004556	AACT	2	8	304840	304847	50 %	25 %	0 %	25 %	28198164
4508	NC_004556	TGG	2	6	304856	304861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198164
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4510	NC_004556	ACA	2	6	304941	304946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198164
4511	NC_004556	GAA	2	6	305044	305049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28198164
4512	NC_004556	GTT	2	6	305089	305094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198164
4513	NC_004556	GC	3	6	305104	305109	0 %	0 %	50 %	50 %	28198164
4514	NC_004556	TGG	2	6	305110	305115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198164
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4518	NC_004556	GCCT	2	8	305393	305400	0 %	25 %	25 %	50 %	28198164
4519	NC_004556	CAC	2	6	305477	305482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198164
4520	NC_004556	GGC	2	6	305510	305515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198164
4521	NC_004556	GCG	2	6	305663	305668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198164
4522	NC_004556	TTG	2	6	305792	305797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198164
4523	NC_004556	CGG	2	6	305904	305909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198164
4524	NC_004556	GCG	2	6	305918	305923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198164
4525	NC_004556	CCGT	2	8	305931	305938	0 %	25 %	25 %	50 %	28198164
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4530	NC_004556	CATG	2	8	306234	306241	25 %	25 %	25 %	25 %	28198164
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4541	NC_004556	T	6	6	307771	307776	0 %	100 %	0 %	0 %	28198165
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4555	NC_004556	AAAGG	2	10	315769	315778	60 %	0 %	40 %	0 %	28198168
4556	NC_004556	T	6	6	315852	315857	0 %	100 %	0 %	0 %	28198168
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4593	NC_004556	TA	3	6	318021	318026	50 %	50 %	0 %	0 %	28198171
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4602	NC_004556	TGA	2	6	318331	318336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198172
4603	NC_004556	TGG	2	6	318440	318445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198172
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4605	NC_004556	CCG	2	6	318525	318530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198172
4606	NC_004556	TTGCAG	2	12	318558	318569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28198172
4607	NC_004556	CTTT	2	8	318672	318679	0 %	75 %	0 %	25 %	28198173
4608	NC_004556	GTG	2	6	318736	318741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198173
4609	NC_004556	GTG	2	6	318770	318775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198173
4610	NC_004556	GCAG	2	8	318957	318964	25 %	0 %	50 %	25 %	28198173
4611	NC_004556	ATG	2	6	318967	318972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198173
4612	NC_004556	GTT	2	6	319060	319065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198173
4613	NC_004556	ATG	2	6	319075	319080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198173
4614	NC_004556	TCG	2	6	319090	319095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198173
4615	NC_004556	GACG	2	8	319103	319110	25 %	0 %	50 %	25 %	28198173
4616	NC_004556	ATTTG	2	10	319145	319154	20 %	60 %	20 %	0 %	28198173
4617	NC_004556	ACG	2	6	319270	319275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198173
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4621	NC_004556	AATC	2	8	319628	319635	50 %	25 %	0 %	25 %	28198174
4622	NC_004556	GAT	2	6	319669	319674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198174
4623	NC_004556	TACG	2	8	319691	319698	25 %	25 %	25 %	25 %	28198174
4624	NC_004556	TGT	2	6	319839	319844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198174
4625	NC_004556	GAG	2	6	319862	319867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198174
4626	NC_004556	GATG	2	8	319870	319877	25 %	25 %	50 %	0 %	28198174
4627	NC_004556	GCG	2	6	319893	319898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28198174
4628	NC_004556	CTA	2	6	319915	319920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198174
4629	NC_004556	GGT	2	6	319928	319933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198174
4630	NC_004556	GT	3	6	319932	319937	0 %	50 %	50 %	0 %	28198174
4631	NC_004556	CGC	2	6	320014	320019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198174
4632	NC_004556	CGA	2	6	320080	320085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198174
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4634	NC_004556	GGTGTG	2	12	320135	320146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198174
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4636	NC_004556	ATG	2	6	320247	320252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198174
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4638	NC_004556	CAT	2	6	320341	320346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28198174
4639	NC_004556	GT	3	6	320353	320358	0 %	50 %	50 %	0 %	28198174
4640	NC_004556	GAC	2	6	320438	320443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28198174
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4644	NC_004556	TGT	2	6	320659	320664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198174
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4646	NC_004556	TTG	2	6	320836	320841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198175
4647	NC_004556	GTTG	2	8	320876	320883	0 %	50 %	50 %	0 %	28198175
4648	NC_004556	CGC	2	6	320898	320903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198175
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4650	NC_004556	GCC	2	6	320987	320992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28198175
4651	NC_004556	GTT	2	6	321020	321025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198175
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4653	NC_004556	CTG	2	6	321095	321100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28198175
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4656	NC_004556	GAT	2	6	321159	321164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198175
4657	NC_004556	GTT	2	6	321216	321221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198175
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4661	NC_004556	GTG	2	6	321593	321598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198176
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4668	NC_004556	CAA	2	6	321910	321915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28198176
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4677	NC_004556	G	7	7	322231	322237	0 %	0 %	100 %	0 %	28198176
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4679	NC_004556	TGA	2	6	322249	322254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198176
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4682	NC_004556	T	6	6	322295	322300	0 %	100 %	0 %	0 %	28198176
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4684	NC_004556	GGCCA	2	10	322382	322391	20 %	0 %	40 %	40 %	28198176
4685	NC_004556	GGA	2	6	322396	322401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28198176
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4690	NC_004556	AGCGT	2	10	322859	322868	20 %	20 %	40 %	20 %	28198177
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4698	NC_004556	CGGT	2	8	323201	323208	0 %	25 %	50 %	25 %	28198177
4699	NC_004556	CGATG	2	10	323283	323292	20 %	20 %	40 %	20 %	28198177
4700	NC_004556	TACG	2	8	323333	323340	25 %	25 %	25 %	25 %	28198177
4701	NC_004556	GTTG	2	8	323372	323379	0 %	50 %	50 %	0 %	28198177
4702	NC_004556	TGATCG	2	12	323382	323393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28198177
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4708	NC_004556	TTG	2	6	323578	323583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198177
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4735	NC_004556	TGTGG	2	10	324941	324950	0 %	40 %	60 %	0 %	28198178
4736	NC_004556	ATGT	2	8	324993	325000	25 %	50 %	25 %	0 %	28198178
4737	NC_004556	GTT	2	6	325103	325108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28198178
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4743	NC_004556	GCTTT	2	10	325324	325333	0 %	60 %	20 %	20 %	28198178
4744	NC_004556	TGA	2	6	325342	325347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28198178
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4994	NC_004556	CAC	2	6	337888	337893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28198189
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4997	NC_004556	ACTG	2	8	338000	338007	25 %	25 %	25 %	25 %	28198189
4998	NC_004556	GGCA	2	8	338035	338042	25 %	0 %	50 %	25 %	28198189
4999	NC_004556	TGG	2	6	338065	338070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28198189
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