MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC64

Total Repeats: 1174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003922	ATT	2	6	28413	28418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21264259
502	NC_003922	CGG	2	6	28422	28427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
503	NC_003922	CGA	2	6	28429	28434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
504	NC_003922	CTA	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264259
505	NC_003922	CAAGGC	2	12	28466	28477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
506	NC_003922	GCTTG	2	10	28486	28495	0 %	40 %	40 %	20 %	21264259
507	NC_003922	GCT	2	6	28528	28533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
508	NC_003922	CGGC	2	8	28537	28544	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
509	NC_003922	GAC	2	6	28567	28572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
510	NC_003922	CGAC	2	8	28581	28588	25 %	0 %	25 %	50 %	21264259
511	NC_003922	AAG	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264259
512	NC_003922	TTG	2	6	28653	28658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264259
513	NC_003922	CG	3	6	28701	28706	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
514	NC_003922	GAA	2	6	28741	28746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264259
515	NC_003922	GC	3	6	28870	28875	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
516	NC_003922	GC	3	6	28888	28893	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
517	NC_003922	GCA	2	6	28921	28926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
518	NC_003922	A	6	6	29208	29213	100 %	0 %	0 %	0 %	21264259
519	NC_003922	AGGC	2	8	29271	29278	25 %	0 %	50 %	25 %	21264259
520	NC_003922	CGG	2	6	29287	29292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
521	NC_003922	CGA	2	6	29334	29339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
522	NC_003922	GC	3	6	29348	29353	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
523	NC_003922	CGT	2	6	29371	29376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
524	NC_003922	ACC	2	6	29391	29396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
525	NC_003922	CACCGC	2	12	29434	29445	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	21264259
526	NC_003922	TCG	2	6	29505	29510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
527	NC_003922	TCG	2	6	29579	29584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
528	NC_003922	GCA	2	6	29638	29643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
529	NC_003922	CAG	2	6	29682	29687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
530	NC_003922	CGG	2	6	29781	29786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
531	NC_003922	CCG	2	6	29787	29792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264259
532	NC_003922	TCG	2	6	29874	29879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
533	NC_003922	TCA	2	6	29937	29942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264259
534	NC_003922	TACCG	2	10	29969	29978	20 %	20 %	20 %	40 %	21264259
535	NC_003922	ATC	2	6	30092	30097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264259
536	NC_003922	CGT	2	6	30115	30120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264259
537	NC_003922	CAG	2	6	30242	30247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
538	NC_003922	TCGC	2	8	30347	30354	0 %	25 %	25 %	50 %	21264259
539	NC_003922	CCGA	2	8	30386	30393	25 %	0 %	25 %	50 %	21264259
540	NC_003922	CGC	2	6	30482	30487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264259
541	NC_003922	ACC	3	9	30725	30733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
542	NC_003922	ACC	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
543	NC_003922	GC	3	6	30781	30786	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
544	NC_003922	CGG	2	6	30880	30885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264259
545	NC_003922	AGC	2	6	30909	30914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
546	NC_003922	CGGC	3	12	30919	30930	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
547	NC_003922	CG	3	6	30932	30937	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
548	NC_003922	CGA	2	6	30948	30953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
549	NC_003922	GC	3	6	30999	31004	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
550	NC_003922	CAC	2	6	31054	31059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264259
551	NC_003922	CG	3	6	31150	31155	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
552	NC_003922	GAC	2	6	31168	31173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
553	NC_003922	GCGCC	2	10	31207	31216	0 %	0 %	40 %	60 %	21264259
554	NC_003922	CAG	2	6	31268	31273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
555	NC_003922	CAG	2	6	31280	31285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
556	NC_003922	AGC	2	6	31290	31295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264259
557	NC_003922	GTC	2	6	31389	31394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264260
558	NC_003922	CCA	2	6	31437	31442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264260
559	NC_003922	ACCT	2	8	31474	31481	25 %	25 %	0 %	50 %	21264260
560	NC_003922	CCA	2	6	31509	31514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264260
561	NC_003922	GCA	2	6	31569	31574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264260
562	NC_003922	GCG	2	6	31575	31580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264260
563	NC_003922	GCA	2	6	31605	31610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264260
564	NC_003922	GGT	2	6	31618	31623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264260
565	NC_003922	GT	3	6	31622	31627	0 %	50 %	50 %	0 %	21264260
566	NC_003922	CAT	2	6	31714	31719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264260
567	NC_003922	CCAT	2	8	31729	31736	25 %	25 %	0 %	50 %	21264261
568	NC_003922	GCA	2	6	31795	31800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264261
569	NC_003922	GAC	2	6	31802	31807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264261
570	NC_003922	CGG	2	6	31813	31818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264261
571	NC_003922	GCC	2	6	31838	31843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264261
572	NC_003922	GT	3	6	31844	31849	0 %	50 %	50 %	0 %	21264261
573	NC_003922	AAG	2	6	32027	32032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264262
574	NC_003922	CCG	2	6	32033	32038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264262
575	NC_003922	TGG	2	6	32075	32080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21264262
576	NC_003922	TCG	2	6	32090	32095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264262
577	NC_003922	CGT	2	6	32127	32132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264262
578	NC_003922	CAG	2	6	32172	32177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264262
579	NC_003922	GCC	2	6	32182	32187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264262
580	NC_003922	TCA	2	6	32226	32231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264262
581	NC_003922	GAA	2	6	32299	32304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264262
582	NC_003922	CGG	2	6	32364	32369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264262
583	NC_003922	CGG	2	6	32424	32429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264262
584	NC_003922	TCT	2	6	32587	32592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21264263
585	NC_003922	GCA	2	6	32635	32640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264263
586	NC_003922	TCTCG	2	10	32674	32683	0 %	40 %	20 %	40 %	21264263
587	NC_003922	ATC	2	6	32754	32759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21264263
588	NC_003922	GCGA	2	8	32778	32785	25 %	0 %	50 %	25 %	21264263
589	NC_003922	CCGCT	2	10	32861	32870	0 %	20 %	20 %	60 %	21264263
590	NC_003922	TTG	2	6	32873	32878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264263
591	NC_003922	GTT	2	6	32945	32950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264263
592	NC_003922	CTG	2	6	33109	33114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264264
593	NC_003922	CTCG	2	8	33174	33181	0 %	25 %	25 %	50 %	21264264
594	NC_003922	CTGGAC	2	12	33226	33237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21264264
595	NC_003922	CGAC	2	8	33273	33280	25 %	0 %	25 %	50 %	21264264
596	NC_003922	TCCG	2	8	33298	33305	0 %	25 %	25 %	50 %	21264264
597	NC_003922	CAG	2	6	33363	33368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264264
598	NC_003922	GGCA	2	8	33400	33407	25 %	0 %	50 %	25 %	21264264
599	NC_003922	GCC	2	6	33425	33430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264264
600	NC_003922	CG	3	6	33495	33500	0 %	0 %	50 %	50 %	21264264
601	NC_003922	AGT	2	6	33513	33518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264264
602	NC_003922	GC	3	6	33572	33577	0 %	0 %	50 %	50 %	21264264
603	NC_003922	GGC	2	6	33774	33779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21264264
604	NC_003922	ACG	2	6	33785	33790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264264
605	NC_003922	ACG	2	6	33810	33815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264264
606	NC_003922	CAC	2	6	33826	33831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21264264
607	NC_003922	CAGC	2	8	33873	33880	25 %	0 %	25 %	50 %	21264264
608	NC_003922	GCC	2	6	33950	33955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264264
609	NC_003922	GAT	2	6	33983	33988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264265
610	NC_003922	CAA	2	6	34033	34038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21264265
611	NC_003922	CGC	2	6	34047	34052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264265
612	NC_003922	CG	4	8	34057	34064	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
613	NC_003922	CG	3	6	34075	34080	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
614	NC_003922	TG	3	6	34088	34093	0 %	50 %	50 %	0 %	21264265
615	NC_003922	CGGC	2	8	34129	34136	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
616	NC_003922	TCG	2	6	34150	34155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21264265
617	NC_003922	ATG	2	6	34227	34232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264265
618	NC_003922	GC	3	6	34310	34315	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
619	NC_003922	CGCA	2	8	34326	34333	25 %	0 %	25 %	50 %	21264265
620	NC_003922	CG	3	6	34511	34516	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
621	NC_003922	GAA	2	6	34675	34680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21264265
622	NC_003922	GA	3	6	34752	34757	50 %	0 %	50 %	0 %	21264265
623	NC_003922	CGA	2	6	34814	34819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21264265
624	NC_003922	GTA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21264265
625	NC_003922	TCTT	2	8	34872	34879	0 %	75 %	0 %	25 %	21264265
626	NC_003922	TTG	2	6	34902	34907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21264265
627	NC_003922	AGG	2	6	34972	34977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21264265
628	NC_003922	CGC	2	6	35024	35029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21264266
629	NC_003922	CG	3	6	35099	35104	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
630	NC_003922	GCCG	2	8	35106	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
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884	NC_003922	CGATG	2	10	48851	48860	20 %	20 %	40 %	20 %	21264284
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