MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 3861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003919	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	21240775
2	NC_003919	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	21240775
3	NC_003919	GTGGA	2	10	4012	4021	20 %	20 %	60 %	0 %	21240777
4	NC_003919	TGCGC	2	10	4135	4144	0 %	20 %	40 %	40 %	21240777
5	NC_003919	GGCGC	2	10	5607	5616	0 %	0 %	60 %	40 %	21240778
6	NC_003919	GAGCG	2	10	8155	8164	20 %	0 %	60 %	20 %	21240779
7	NC_003919	CGGCC	2	10	8206	8215	0 %	0 %	40 %	60 %	21240779
8	NC_003919	CACTG	2	10	11087	11096	20 %	20 %	20 %	40 %	21240782
9	NC_003919	GCGCC	2	10	14725	14734	0 %	0 %	40 %	60 %	21240787
10	NC_003919	GCACC	2	10	14753	14762	20 %	0 %	20 %	60 %	21240787
11	NC_003919	CAGCG	2	10	15734	15743	20 %	0 %	40 %	40 %	21240788
12	NC_003919	AGAGC	2	10	17059	17068	40 %	0 %	40 %	20 %	21240789
13	NC_003919	CAAGT	2	10	17319	17328	40 %	20 %	20 %	20 %	21240789
14	NC_003919	CCGCT	2	10	19214	19223	0 %	20 %	20 %	60 %	21240791
15	NC_003919	GGTCG	2	10	20506	20515	0 %	20 %	60 %	20 %	21240793
16	NC_003919	CTGCC	2	10	23138	23147	0 %	20 %	20 %	60 %	21240796
17	NC_003919	TGCGC	2	10	26661	26670	0 %	20 %	40 %	40 %	21240798
18	NC_003919	CGTGC	2	10	30952	30961	0 %	20 %	40 %	40 %	21240802
19	NC_003919	CTGCG	2	10	31542	31551	0 %	20 %	40 %	40 %	21240802
20	NC_003919	CGGCG	2	10	34556	34565	0 %	0 %	60 %	40 %	21240804
21	NC_003919	CCAGC	2	10	34674	34683	20 %	0 %	20 %	60 %	21240804
22	NC_003919	TGCGC	2	10	36570	36579	0 %	20 %	40 %	40 %	21240805
23	NC_003919	GCCGC	2	10	36667	36676	0 %	0 %	40 %	60 %	21240805
24	NC_003919	CGCAG	2	10	41642	41651	20 %	0 %	40 %	40 %	21240807
25	NC_003919	CACCG	2	10	41751	41760	20 %	0 %	20 %	60 %	21240807
26	NC_003919	CGCTG	2	10	42950	42959	0 %	20 %	40 %	40 %	21240807
27	NC_003919	ACACC	2	10	43307	43316	40 %	0 %	0 %	60 %	21240807
28	NC_003919	GCGCA	2	10	46647	46656	20 %	0 %	40 %	40 %	21240811
29	NC_003919	CGGCG	2	10	47024	47033	0 %	0 %	60 %	40 %	21240811
30	NC_003919	AGCGC	2	10	48774	48783	20 %	0 %	40 %	40 %	21240813
31	NC_003919	ATGCA	2	10	49155	49164	40 %	20 %	20 %	20 %	21240813
32	NC_003919	TTGCC	2	10	50633	50642	0 %	40 %	20 %	40 %	21240815
33	NC_003919	CAGTT	2	10	51223	51232	20 %	40 %	20 %	20 %	21240815
34	NC_003919	TCGCT	2	10	51522	51531	0 %	40 %	20 %	40 %	21240816
35	NC_003919	TCTGC	2	10	52928	52937	0 %	40 %	20 %	40 %	21240817
36	NC_003919	CGGTC	2	10	54729	54738	0 %	20 %	40 %	40 %	21240818
37	NC_003919	GCGTC	2	10	55042	55051	0 %	20 %	40 %	40 %	21240818
38	NC_003919	GCGCG	2	10	55700	55709	0 %	0 %	60 %	40 %	21240819
39	NC_003919	GCCAC	2	10	56064	56073	20 %	0 %	20 %	60 %	21240819
40	NC_003919	GCCAG	2	10	56522	56531	20 %	0 %	40 %	40 %	77748501
41	NC_003919	ACCAG	2	10	59236	59245	40 %	0 %	20 %	40 %	21240822
42	NC_003919	GGCCA	2	10	59810	59819	20 %	0 %	40 %	40 %	21240823
43	NC_003919	CACCG	2	10	62465	62474	20 %	0 %	20 %	60 %	21240825
44	NC_003919	AGATC	2	10	63289	63298	40 %	20 %	20 %	20 %	21240825
45	NC_003919	GCGCA	2	10	63501	63510	20 %	0 %	40 %	40 %	21240825
46	NC_003919	GGCCG	2	10	64284	64293	0 %	0 %	60 %	40 %	21240826
47	NC_003919	CCAAG	2	10	64952	64961	40 %	0 %	20 %	40 %	21240826
48	NC_003919	GCCGC	2	10	66643	66652	0 %	0 %	40 %	60 %	21240828
49	NC_003919	GGCCC	2	10	67531	67540	0 %	0 %	40 %	60 %	21240829
50	NC_003919	CCAGC	2	10	68752	68761	20 %	0 %	20 %	60 %	21240830
51	NC_003919	AGCAC	2	10	69360	69369	40 %	0 %	20 %	40 %	21240830
52	NC_003919	CAGCG	2	10	70089	70098	20 %	0 %	40 %	40 %	21240831
53	NC_003919	CTGCC	2	10	71301	71310	0 %	20 %	20 %	60 %	21240831
54	NC_003919	AAGCC	2	10	71832	71841	40 %	0 %	20 %	40 %	21240832
55	NC_003919	GCCAG	2	10	72323	72332	20 %	0 %	40 %	40 %	21240833
56	NC_003919	CACGG	2	10	73491	73500	20 %	0 %	40 %	40 %	21240833
57	NC_003919	CAGCT	2	10	74788	74797	20 %	20 %	20 %	40 %	21240834
58	NC_003919	GCGCA	2	10	77452	77461	20 %	0 %	40 %	40 %	21240837
59	NC_003919	AGCCG	2	10	77626	77635	20 %	0 %	40 %	40 %	21240838
60	NC_003919	CAGAT	2	10	78722	78731	40 %	20 %	20 %	20 %	21240840
61	NC_003919	TGCCC	2	10	79038	79047	0 %	20 %	20 %	60 %	21240840
62	NC_003919	GTTGC	2	10	80383	80392	0 %	40 %	40 %	20 %	21240842
63	NC_003919	CGTGG	2	10	82144	82153	0 %	20 %	60 %	20 %	21240843
64	NC_003919	CTGTG	2	10	84662	84671	0 %	40 %	40 %	20 %	21240845
65	NC_003919	CACCT	2	10	84765	84774	20 %	20 %	0 %	60 %	21240845
66	NC_003919	CGCTG	2	10	84912	84921	0 %	20 %	40 %	40 %	21240845
67	NC_003919	GCACG	2	10	85203	85212	20 %	0 %	40 %	40 %	21240845
68	NC_003919	TCTGC	2	10	87165	87174	0 %	40 %	20 %	40 %	21240847
69	NC_003919	CCAGG	2	10	88097	88106	20 %	0 %	40 %	40 %	77748503
70	NC_003919	CGGGT	2	10	89190	89199	0 %	20 %	60 %	20 %	77748503
71	NC_003919	CGGGC	2	10	89917	89926	0 %	0 %	60 %	40 %	77748503
72	NC_003919	GCGCA	2	10	90185	90194	20 %	0 %	40 %	40 %	77748503
73	NC_003919	GGCGT	2	10	91644	91653	0 %	20 %	60 %	20 %	21240849
74	NC_003919	GCCGA	2	10	92076	92085	20 %	0 %	40 %	40 %	21240850
75	NC_003919	CGGCG	2	10	92553	92562	0 %	0 %	60 %	40 %	21240850
76	NC_003919	GCGCC	3	15	93269	93283	0 %	0 %	40 %	60 %	21240850
77	NC_003919	CCTGC	2	10	95873	95882	0 %	20 %	20 %	60 %	77748504
78	NC_003919	TGGTG	2	10	97974	97983	0 %	40 %	60 %	0 %	21240852
79	NC_003919	GGCAC	2	10	99685	99694	20 %	0 %	40 %	40 %	21240854
80	NC_003919	GGCCG	2	10	100785	100794	0 %	0 %	60 %	40 %	21240856
81	NC_003919	CCGCA	2	10	103819	103828	20 %	0 %	20 %	60 %	21240859
82	NC_003919	GCCCA	2	10	105953	105962	20 %	0 %	20 %	60 %	21240862
83	NC_003919	GATCC	2	10	106480	106489	20 %	20 %	20 %	40 %	21240863
84	NC_003919	TGAAA	2	10	108852	108861	60 %	20 %	20 %	0 %	21240866
85	NC_003919	GTTGC	2	10	109744	109753	0 %	40 %	40 %	20 %	21240867
86	NC_003919	TGCCG	2	10	110944	110953	0 %	20 %	40 %	40 %	21240868
87	NC_003919	CTGGC	2	10	112622	112631	0 %	20 %	40 %	40 %	21240870
88	NC_003919	AAGTC	2	10	113976	113985	40 %	20 %	20 %	20 %	21240871
89	NC_003919	CGGCG	2	10	120028	120037	0 %	0 %	60 %	40 %	21240878
90	NC_003919	GTCCA	2	10	120377	120386	20 %	20 %	20 %	40 %	21240879
91	NC_003919	ACCAC	2	10	120606	120615	40 %	0 %	0 %	60 %	21240879
92	NC_003919	GCGTG	2	10	122396	122405	0 %	20 %	60 %	20 %	21240881
93	NC_003919	CGGCG	2	10	124194	124203	0 %	0 %	60 %	40 %	21240881
94	NC_003919	GCGCC	3	15	124563	124577	0 %	0 %	40 %	60 %	21240881
95	NC_003919	CATTG	2	10	126442	126451	20 %	40 %	20 %	20 %	21240883
96	NC_003919	TGGCC	2	10	128282	128291	0 %	20 %	40 %	40 %	21240884
97	NC_003919	TCCAG	2	10	129342	129351	20 %	20 %	20 %	40 %	21240885
98	NC_003919	CGCAG	2	10	129421	129430	20 %	0 %	40 %	40 %	21240885
99	NC_003919	GCCAG	2	10	131587	131596	20 %	0 %	40 %	40 %	21240888
100	NC_003919	TGCGG	2	10	132237	132246	0 %	20 %	60 %	20 %	21240888
101	NC_003919	GCGCG	2	10	133529	133538	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
102	NC_003919	GCGCG	2	10	134006	134015	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
103	NC_003919	CGGGC	2	10	134625	134634	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
104	NC_003919	GGCGC	2	10	135369	135378	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
105	NC_003919	CGGCG	2	10	135759	135768	0 %	0 %	60 %	40 %	21240889
106	NC_003919	CGGCG	2	10	136301	136310	0 %	0 %	60 %	40 %	21240890
107	NC_003919	GCGCA	2	10	137703	137712	20 %	0 %	40 %	40 %	21240891
108	NC_003919	GGCAC	2	10	137909	137918	20 %	0 %	40 %	40 %	21240892
109	NC_003919	GCGCG	2	10	140420	140429	0 %	0 %	60 %	40 %	21240894
110	NC_003919	AGCCC	2	10	142097	142106	20 %	0 %	20 %	60 %	21240895
111	NC_003919	TGACC	2	10	143460	143469	20 %	20 %	20 %	40 %	21240896
112	NC_003919	GGCAC	2	10	145417	145426	20 %	0 %	40 %	40 %	21240897
113	NC_003919	GCCGC	2	10	146012	146021	0 %	0 %	40 %	60 %	21240898
114	NC_003919	GATGC	2	10	146137	146146	20 %	20 %	40 %	20 %	21240898
115	NC_003919	CAGCG	2	10	149439	149448	20 %	0 %	40 %	40 %	77748509
116	NC_003919	CACCG	2	10	149625	149634	20 %	0 %	20 %	60 %	77748509
117	NC_003919	GCCCG	2	10	150599	150608	0 %	0 %	40 %	60 %	77748509
118	NC_003919	GCAGA	2	10	152540	152549	40 %	0 %	40 %	20 %	77748510
119	NC_003919	TGGCG	2	10	154628	154637	0 %	20 %	60 %	20 %	21240905
120	NC_003919	GACTG	2	10	154828	154837	20 %	20 %	40 %	20 %	21240905
121	NC_003919	GTCAG	2	10	160865	160874	20 %	20 %	40 %	20 %	21240911
122	NC_003919	TCGCC	2	10	161839	161848	0 %	20 %	20 %	60 %	21240912
123	NC_003919	AGCGC	2	10	163159	163168	20 %	0 %	40 %	40 %	21240914
124	NC_003919	GATCA	2	10	164045	164054	40 %	20 %	20 %	20 %	21240914
125	NC_003919	CGCTG	2	10	164857	164866	0 %	20 %	40 %	40 %	21240914
126	NC_003919	GCGCG	2	10	165187	165196	0 %	0 %	60 %	40 %	21240914
127	NC_003919	ATGGC	2	10	165642	165651	20 %	20 %	40 %	20 %	21240914
128	NC_003919	CACCG	2	10	165740	165749	20 %	0 %	20 %	60 %	21240914
129	NC_003919	GGCCT	2	10	166549	166558	0 %	20 %	40 %	40 %	21240915
130	NC_003919	ATGGC	2	10	167998	168007	20 %	20 %	40 %	20 %	21240916
131	NC_003919	CGACC	2	10	170844	170853	20 %	0 %	20 %	60 %	21240918
132	NC_003919	GGCCA	2	10	173750	173759	20 %	0 %	40 %	40 %	21240919
133	NC_003919	GTTGC	2	10	179805	179814	0 %	40 %	40 %	20 %	21240922
134	NC_003919	GTTTT	2	10	181966	181975	0 %	80 %	20 %	0 %	21240923
135	NC_003919	TGGAA	2	10	182734	182743	40 %	20 %	40 %	0 %	21240924
136	NC_003919	CGCTG	2	10	183623	183632	0 %	20 %	40 %	40 %	21240925
137	NC_003919	CCGCG	2	10	188712	188721	0 %	0 %	40 %	60 %	77748512
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