MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 111185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_003919	CGGC	2	8	186266	186273	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4003	NC_003919	GGC	2	6	186312	186317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
4004	NC_003919	GCG	2	6	186368	186373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
4005	NC_003919	GGT	2	6	186381	186386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
4006	NC_003919	GC	3	6	186412	186417	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4007	NC_003919	CGG	2	6	186422	186427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
4008	NC_003919	GC	3	6	186472	186477	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4009	NC_003919	GCG	2	6	186499	186504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
4010	NC_003919	TGG	2	6	186506	186511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
4011	NC_003919	GTG	2	6	186513	186518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
4012	NC_003919	GC	3	6	186523	186528	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4013	NC_003919	TGG	2	6	186555	186560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
4014	NC_003919	GCA	2	6	186579	186584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748512
4015	NC_003919	CG	4	8	186615	186622	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4016	NC_003919	GGT	2	6	186642	186647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
4017	NC_003919	GCA	2	6	186687	186692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748512
4018	NC_003919	GCG	2	6	186715	186720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
4019	NC_003919	TGG	2	6	186736	186741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
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4021	NC_003919	GC	3	6	186783	186788	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4022	NC_003919	GC	3	6	186834	186839	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4023	NC_003919	AGC	2	6	186851	186856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748512
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4029	NC_003919	GCT	2	6	187110	187115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748512
4030	NC_003919	TGG	2	6	187133	187138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512
4031	NC_003919	GC	3	6	187219	187224	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
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4034	NC_003919	TG	3	6	187360	187365	0 %	50 %	50 %	0 %	77748512
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4036	NC_003919	TGCG	2	8	187457	187464	0 %	25 %	50 %	25 %	77748512
4037	NC_003919	GC	3	6	187482	187487	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
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4043	NC_003919	TCA	2	6	187919	187924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77748512
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4045	NC_003919	GCC	2	6	187971	187976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748512
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4047	NC_003919	CGG	2	6	188027	188032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
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4050	NC_003919	GC	3	6	188189	188194	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4051	NC_003919	ACC	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748512
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4053	NC_003919	AAG	2	6	188278	188283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77748512
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4055	NC_003919	CCGTTC	2	12	188419	188430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77748512
4056	NC_003919	CGGC	2	8	188457	188464	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
4057	NC_003919	TC	3	6	188481	188486	0 %	50 %	0 %	50 %	77748512
4058	NC_003919	GAT	2	6	188508	188513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77748512
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4061	NC_003919	CCGC	2	8	188634	188641	0 %	0 %	25 %	75 %	77748512
4062	NC_003919	TTC	2	6	188644	188649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77748512
4063	NC_003919	CCGCG	2	10	188712	188721	0 %	0 %	40 %	60 %	77748512
4064	NC_003919	CCA	2	6	188726	188731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748512
4065	NC_003919	GC	3	6	188835	188840	0 %	0 %	50 %	50 %	77748512
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4084	NC_003919	GC	3	6	189908	189913	0 %	0 %	50 %	50 %	21240929
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4091	NC_003919	GC	3	6	190285	190290	0 %	0 %	50 %	50 %	21240929
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4099	NC_003919	TCGA	2	8	190479	190486	25 %	25 %	25 %	25 %	21240929
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4107	NC_003919	CAT	2	6	190820	190825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240929
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4110	NC_003919	GCC	2	6	190877	190882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240929
4111	NC_003919	TGC	2	6	190978	190983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240929
4112	NC_003919	CGA	2	6	190994	190999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240929
4113	NC_003919	CTG	2	6	191010	191015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240929
4114	NC_003919	ACG	2	6	191066	191071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240929
4115	NC_003919	CG	3	6	191114	191119	0 %	0 %	50 %	50 %	21240929
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4119	NC_003919	TGC	2	6	191203	191208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240929
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4121	NC_003919	AGC	2	6	191254	191259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240929
4122	NC_003919	TGGCGC	2	12	191260	191271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21240929
4123	NC_003919	TGCGC	2	10	191348	191357	0 %	20 %	40 %	40 %	21240929
4124	NC_003919	GCG	2	6	191364	191369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240929
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4355	NC_003919	ACA	2	6	201063	201068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240936
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4358	NC_003919	GC	3	6	201269	201274	0 %	0 %	50 %	50 %	21240936
4359	NC_003919	CGCTGC	2	12	201331	201342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21240936
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4363	NC_003919	TGC	2	6	201613	201618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240937
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4368	NC_003919	TGA	2	6	201742	201747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240937
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4494	NC_003919	CA	3	6	206842	206847	50 %	0 %	0 %	50 %	21240941
4495	NC_003919	CAG	2	6	206849	206854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240941
4496	NC_003919	CCG	2	6	206932	206937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240941
4497	NC_003919	ACG	2	6	207099	207104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240942
4498	NC_003919	GAC	2	6	207143	207148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240942
4499	NC_003919	GCGCC	2	10	207195	207204	0 %	0 %	40 %	60 %	21240942
4500	NC_003919	CAGA	2	8	207229	207236	50 %	0 %	25 %	25 %	21240942

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