MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 111185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003919	CTG	2	6	159122	159127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3502	NC_003919	TGG	2	6	159135	159140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240909
3503	NC_003919	GCC	2	6	159160	159165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240909
3504	NC_003919	TGC	3	9	159174	159182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3505	NC_003919	TTG	2	6	159245	159250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240909
3506	NC_003919	GC	3	6	159323	159328	0 %	0 %	50 %	50 %	21240909
3507	NC_003919	CTG	2	6	159356	159361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3508	NC_003919	CG	3	6	159368	159373	0 %	0 %	50 %	50 %	21240909
3509	NC_003919	GC	3	6	159389	159394	0 %	0 %	50 %	50 %	21240909
3510	NC_003919	GC	3	6	159416	159421	0 %	0 %	50 %	50 %	21240909
3511	NC_003919	CGA	2	6	159508	159513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3512	NC_003919	GGT	2	6	159520	159525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240909
3513	NC_003919	CTG	2	6	159545	159550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3514	NC_003919	GTG	2	6	159566	159571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240909
3515	NC_003919	CGA	2	6	159583	159588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3516	NC_003919	GCC	2	6	159626	159631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240909
3517	NC_003919	CGTG	2	8	159673	159680	0 %	25 %	50 %	25 %	21240909
3518	NC_003919	GC	3	6	159689	159694	0 %	0 %	50 %	50 %	21240909
3519	NC_003919	GCT	3	9	159703	159711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3520	NC_003919	ATGCCG	2	12	159750	159761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3521	NC_003919	CGA	2	6	159817	159822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240909
3522	NC_003919	GCC	2	6	159825	159830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240909
3523	NC_003919	GCAT	2	8	159930	159937	25 %	25 %	25 %	25 %	21240909
3524	NC_003919	CGT	2	6	159967	159972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
3525	NC_003919	CGA	2	6	159984	159989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240910
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3527	NC_003919	GC	3	6	160014	160019	0 %	0 %	50 %	50 %	21240910
3528	NC_003919	TGC	2	6	160022	160027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
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3530	NC_003919	GGT	2	6	160044	160049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240910
3531	NC_003919	CGA	2	6	160059	160064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240910
3532	NC_003919	CTG	2	6	160075	160080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
3533	NC_003919	GTG	2	6	160108	160113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240910
3534	NC_003919	GC	3	6	160167	160172	0 %	0 %	50 %	50 %	21240910
3535	NC_003919	TGC	3	9	160193	160201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
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3537	NC_003919	CGA	2	6	160212	160217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240910
3538	NC_003919	CTG	2	6	160225	160230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
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3540	NC_003919	CGC	2	6	160275	160280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240910
3541	NC_003919	CGC	2	6	160314	160319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240910
3542	NC_003919	CTG	2	6	160330	160335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
3543	NC_003919	GC	3	6	160359	160364	0 %	0 %	50 %	50 %	21240910
3544	NC_003919	CAG	2	6	160384	160389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240910
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3546	NC_003919	AGCG	2	8	160408	160415	25 %	0 %	50 %	25 %	21240910
3547	NC_003919	CTG	2	6	160435	160440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240910
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3552	NC_003919	GTCAG	2	10	160865	160874	20 %	20 %	40 %	20 %	21240911
3553	NC_003919	CACG	2	8	160884	160891	25 %	0 %	25 %	50 %	21240911
3554	NC_003919	CGG	2	6	160901	160906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240911
3555	NC_003919	GCC	2	6	160915	160920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240911
3556	NC_003919	CTG	2	6	160943	160948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240911
3557	NC_003919	TCG	2	6	160991	160996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240911
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3559	NC_003919	GC	3	6	161018	161023	0 %	0 %	50 %	50 %	21240911
3560	NC_003919	CGT	2	6	161103	161108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240911
3561	NC_003919	CGA	2	6	161325	161330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240911
3562	NC_003919	CGAT	2	8	161439	161446	25 %	25 %	25 %	25 %	21240911
3563	NC_003919	CAG	2	6	161459	161464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240911
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3565	NC_003919	CTG	2	6	161477	161482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240911
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3569	NC_003919	CAAC	2	8	161673	161680	50 %	0 %	0 %	50 %	21240912
3570	NC_003919	TCG	2	6	161685	161690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240912
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3588	NC_003919	CCGT	2	8	162958	162965	0 %	25 %	25 %	50 %	21240914
3589	NC_003919	GGC	2	6	162971	162976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240914
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3592	NC_003919	GAT	2	6	163169	163174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240914
3593	NC_003919	CCATTC	2	12	163184	163195	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21240914
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3599	NC_003919	CAG	2	6	163556	163561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240914
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3602	NC_003919	ACCA	2	8	163791	163798	50 %	0 %	0 %	50 %	21240914
3603	NC_003919	GGC	2	6	163805	163810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240914
3604	NC_003919	TGC	2	6	163852	163857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240914
3605	NC_003919	CCT	2	6	163981	163986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240914
3606	NC_003919	TCA	2	6	164002	164007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240914
3607	NC_003919	GGT	2	6	164018	164023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240914
3608	NC_003919	CGTG	2	8	164034	164041	0 %	25 %	50 %	25 %	21240914
3609	NC_003919	GATCA	2	10	164045	164054	40 %	20 %	20 %	20 %	21240914
3610	NC_003919	GCCC	2	8	164066	164073	0 %	0 %	25 %	75 %	21240914
3611	NC_003919	AGC	2	6	164121	164126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240914
3612	NC_003919	CCA	2	6	164179	164184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240914
3613	NC_003919	GTT	2	6	164206	164211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240914
3614	NC_003919	GC	3	6	164231	164236	0 %	0 %	50 %	50 %	21240914
3615	NC_003919	AGC	3	9	164247	164255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240914
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3617	NC_003919	CAG	2	6	164276	164281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240914
3618	NC_003919	GCA	2	6	164286	164291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240914
3619	NC_003919	GCG	2	6	164292	164297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240914
3620	NC_003919	GC	3	6	164334	164339	0 %	0 %	50 %	50 %	21240914
3621	NC_003919	GCGG	2	8	164407	164414	0 %	0 %	75 %	25 %	21240914
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3865	NC_003919	A	6	6	176079	176084	100 %	0 %	0 %	0 %	21240919
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3991	NC_003919	GTCT	2	8	185140	185147	0 %	50 %	25 %	25 %	21240927
3992	NC_003919	GCA	2	6	185196	185201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240927
3993	NC_003919	CTT	2	6	185245	185250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240927
3994	NC_003919	GGC	2	6	185277	185282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240927
3995	NC_003919	CCA	2	6	185292	185297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240927
3996	NC_003919	CGC	2	6	185302	185307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240927
3997	NC_003919	AGC	2	6	186170	186175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748512
3998	NC_003919	GGC	2	6	186183	186188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748512
3999	NC_003919	GGCT	2	8	186195	186202	0 %	25 %	50 %	25 %	77748512
4000	NC_003919	GTG	2	6	186211	186216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748512

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