MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 111185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003919	TGG	4	12	49113	49124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240813
1002	NC_003919	ATGCA	2	10	49155	49164	40 %	20 %	20 %	20 %	21240813
1003	NC_003919	GTG	2	6	49178	49183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240813
1004	NC_003919	CAC	2	6	49201	49206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240813
1005	NC_003919	GAT	2	6	49217	49222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240813
1006	NC_003919	GGC	2	6	49301	49306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240813
1007	NC_003919	AGC	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240813
1008	NC_003919	TGC	2	6	49359	49364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240813
1009	NC_003919	GTGC	2	8	49439	49446	0 %	25 %	50 %	25 %	21240813
1010	NC_003919	GGC	2	6	49551	49556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240814
1011	NC_003919	CGA	2	6	49635	49640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240814
1012	NC_003919	TGA	2	6	49646	49651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240814
1013	NC_003919	CGCA	2	8	49753	49760	25 %	0 %	25 %	50 %	21240814
1014	NC_003919	GC	3	6	49776	49781	0 %	0 %	50 %	50 %	21240814
1015	NC_003919	CG	3	6	49852	49857	0 %	0 %	50 %	50 %	21240814
1016	NC_003919	GCCG	2	8	49878	49885	0 %	0 %	50 %	50 %	21240814
1017	NC_003919	T	6	6	49892	49897	0 %	100 %	0 %	0 %	21240814
1018	NC_003919	ATGG	2	8	49942	49949	25 %	25 %	50 %	0 %	21240814
1019	NC_003919	CGC	2	6	49981	49986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240814
1020	NC_003919	GAG	2	6	50023	50028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240814
1021	NC_003919	CAT	2	6	50151	50156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240815
1022	NC_003919	GGC	2	6	50217	50222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240815
1023	NC_003919	CTG	2	6	50278	50283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240815
1024	NC_003919	CAG	2	6	50284	50289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240815
1025	NC_003919	CGGC	2	8	50419	50426	0 %	0 %	50 %	50 %	21240815
1026	NC_003919	CCTG	2	8	50451	50458	0 %	25 %	25 %	50 %	21240815
1027	NC_003919	CG	3	6	50575	50580	0 %	0 %	50 %	50 %	21240815
1028	NC_003919	CGG	2	6	50611	50616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240815
1029	NC_003919	CGC	2	6	50622	50627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240815
1030	NC_003919	TTGCC	2	10	50633	50642	0 %	40 %	20 %	40 %	21240815
1031	NC_003919	GGC	2	6	50670	50675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240815
1032	NC_003919	TGC	2	6	50679	50684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240815
1033	NC_003919	GAA	2	6	50784	50789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240815
1034	NC_003919	CGC	2	6	50826	50831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240815
1035	NC_003919	GTGC	2	8	50833	50840	0 %	25 %	50 %	25 %	21240815
1036	NC_003919	GC	3	6	50896	50901	0 %	0 %	50 %	50 %	21240815
1037	NC_003919	GCCT	2	8	50960	50967	0 %	25 %	25 %	50 %	21240815
1038	NC_003919	TGG	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240815
1039	NC_003919	CGT	2	6	51077	51082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240815
1040	NC_003919	GCC	2	6	51097	51102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240815
1041	NC_003919	CGA	2	6	51168	51173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240815
1042	NC_003919	CG	3	6	51192	51197	0 %	0 %	50 %	50 %	21240815
1043	NC_003919	GC	3	6	51213	51218	0 %	0 %	50 %	50 %	21240815
1044	NC_003919	CAGTT	2	10	51223	51232	20 %	40 %	20 %	20 %	21240815
1045	NC_003919	CCT	2	6	51295	51300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240816
1046	NC_003919	CGC	2	6	51301	51306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240816
1047	NC_003919	TGC	2	6	51313	51318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1048	NC_003919	GTG	2	6	51366	51371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240816
1049	NC_003919	GGT	2	6	51416	51421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240816
1050	NC_003919	TCGCT	2	10	51522	51531	0 %	40 %	20 %	40 %	21240816
1051	NC_003919	TGC	2	6	51532	51537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1052	NC_003919	CGC	2	6	51558	51563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240816
1053	NC_003919	CGT	2	6	51675	51680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1054	NC_003919	TCG	2	6	51736	51741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1055	NC_003919	CCA	2	6	51763	51768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240816
1056	NC_003919	GC	3	6	51854	51859	0 %	0 %	50 %	50 %	21240816
1057	NC_003919	TCG	2	6	51901	51906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1058	NC_003919	CTG	2	6	51939	51944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1059	NC_003919	GC	4	8	52000	52007	0 %	0 %	50 %	50 %	21240816
1060	NC_003919	CAG	2	6	52014	52019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240816
1061	NC_003919	GGC	2	6	52160	52165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240816
1062	NC_003919	ATGC	2	8	52167	52174	25 %	25 %	25 %	25 %	21240816
1063	NC_003919	TGG	3	9	52243	52251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240816
1064	NC_003919	CTAT	2	8	52289	52296	25 %	50 %	0 %	25 %	21240816
1065	NC_003919	AGG	2	6	52330	52335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240816
1066	NC_003919	CGC	2	6	52388	52393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240816
1067	NC_003919	GC	3	6	52528	52533	0 %	0 %	50 %	50 %	21240817
1068	NC_003919	CTG	2	6	52542	52547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1069	NC_003919	CGT	2	6	52628	52633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1070	NC_003919	GCTT	2	8	52645	52652	0 %	50 %	25 %	25 %	21240817
1071	NC_003919	GTCG	2	8	52668	52675	0 %	25 %	50 %	25 %	21240817
1072	NC_003919	GCT	2	6	52712	52717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1073	NC_003919	CGC	3	9	52718	52726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240817
1074	NC_003919	CGA	2	6	52789	52794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1075	NC_003919	TGG	2	6	52795	52800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240817
1076	NC_003919	GCG	2	6	52915	52920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240817
1077	NC_003919	TCTGC	2	10	52928	52937	0 %	40 %	20 %	40 %	21240817
1078	NC_003919	TGG	2	6	53038	53043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240817
1079	NC_003919	CAG	2	6	53052	53057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1080	NC_003919	TGG	2	6	53108	53113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240817
1081	NC_003919	CTG	2	6	53129	53134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1082	NC_003919	CTG	2	6	53225	53230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1083	NC_003919	CTG	2	6	53240	53245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1084	NC_003919	CCTG	2	8	53281	53288	0 %	25 %	25 %	50 %	21240817
1085	NC_003919	GAG	2	6	53289	53294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240817
1086	NC_003919	TGG	2	6	53311	53316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240817
1087	NC_003919	CG	3	6	53347	53352	0 %	0 %	50 %	50 %	21240817
1088	NC_003919	AGG	2	6	53359	53364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240817
1089	NC_003919	AGCG	2	8	53399	53406	25 %	0 %	50 %	25 %	21240817
1090	NC_003919	CTGGCC	2	12	53418	53429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21240817
1091	NC_003919	GCC	2	6	53494	53499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240817
1092	NC_003919	GCA	2	6	53521	53526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1093	NC_003919	GCG	2	6	53541	53546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240817
1094	NC_003919	CCG	2	6	53548	53553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240817
1095	NC_003919	TCG	2	6	53668	53673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240817
1096	NC_003919	GCG	2	6	53791	53796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240817
1097	NC_003919	CAT	2	6	53882	53887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240817
1098	NC_003919	CCCG	2	8	53978	53985	0 %	0 %	25 %	75 %	21240818
1099	NC_003919	ATC	2	6	53989	53994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240818
1100	NC_003919	ACG	2	6	54068	54073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240818
1101	NC_003919	TTC	2	6	54091	54096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240818
1102	NC_003919	TGT	2	6	54173	54178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240818
1103	NC_003919	TGG	3	9	54218	54226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240818
1104	NC_003919	GCC	2	6	54265	54270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240818
1105	NC_003919	GCA	2	6	54326	54331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240818
1106	NC_003919	GAA	2	6	54337	54342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240818
1107	NC_003919	GATC	2	8	54357	54364	25 %	25 %	25 %	25 %	21240818
1108	NC_003919	CGCATC	2	12	54439	54450	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21240818
1109	NC_003919	GGC	2	6	54541	54546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240818
1110	NC_003919	GGC	2	6	54696	54701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240818
1111	NC_003919	CG	3	6	54702	54707	0 %	0 %	50 %	50 %	21240818
1112	NC_003919	TGC	2	6	54716	54721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240818
1113	NC_003919	CGGTC	2	10	54729	54738	0 %	20 %	40 %	40 %	21240818
1114	NC_003919	GGC	2	6	54796	54801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240818
1115	NC_003919	GAA	2	6	54808	54813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240818
1116	NC_003919	TGC	2	6	54842	54847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240818
1117	NC_003919	CGG	2	6	54882	54887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240818
1118	NC_003919	GCC	2	6	54931	54936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240818
1119	NC_003919	CTG	2	6	54943	54948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240818
1120	NC_003919	GCGTC	2	10	55042	55051	0 %	20 %	40 %	40 %	21240818
1121	NC_003919	GCA	2	6	55059	55064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240818
1122	NC_003919	GGC	2	6	55071	55076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240818
1123	NC_003919	GTG	2	6	55198	55203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240819
1124	NC_003919	CAG	2	6	55210	55215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240819
1125	NC_003919	CAG	2	6	55285	55290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240819
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1127	NC_003919	GCA	2	6	55335	55340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240819
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1378	NC_003919	CAGC	2	8	64577	64584	25 %	0 %	25 %	50 %	21240826
1379	NC_003919	CCG	2	6	64597	64602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240826
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