MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 111185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003919	CG	4	8	231166	231173	0 %	0 %	50 %	50 %	21240962
5002	NC_003919	CGA	2	6	231192	231197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240962
5003	NC_003919	CCCAG	2	10	231243	231252	20 %	0 %	20 %	60 %	21240962
5004	NC_003919	GAT	2	6	231271	231276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240962
5005	NC_003919	GCC	2	6	231462	231467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5006	NC_003919	CAC	2	6	231470	231475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748518
5007	NC_003919	CAG	2	6	231506	231511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5008	NC_003919	CG	3	6	231520	231525	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5009	NC_003919	CAG	2	6	231635	231640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5010	NC_003919	TTC	2	6	231692	231697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77748518
5011	NC_003919	GCC	2	6	231722	231727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5012	NC_003919	CAG	2	6	231749	231754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5013	NC_003919	TCTT	2	8	231813	231820	0 %	75 %	0 %	25 %	77748518
5014	NC_003919	CGG	2	6	231830	231835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5015	NC_003919	TGC	2	6	231876	231881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5016	NC_003919	TGC	2	6	231988	231993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5017	NC_003919	GC	4	8	231997	232004	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5018	NC_003919	GT	3	6	232013	232018	0 %	50 %	50 %	0 %	77748518
5019	NC_003919	GGC	2	6	232058	232063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5020	NC_003919	ACGCG	3	15	232084	232098	20 %	0 %	40 %	40 %	77748518
5021	NC_003919	TCG	2	6	232131	232136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5022	NC_003919	GCG	2	6	232141	232146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5023	NC_003919	CGGC	2	8	232147	232154	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5024	NC_003919	TGC	2	6	232177	232182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5025	NC_003919	GC	3	6	232207	232212	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5026	NC_003919	CCG	2	6	232324	232329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5027	NC_003919	GATC	2	8	232333	232340	25 %	25 %	25 %	25 %	77748518
5028	NC_003919	GCC	2	6	232341	232346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5029	NC_003919	CTG	2	6	232367	232372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5030	NC_003919	CG	3	6	232406	232411	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5031	NC_003919	TGC	2	6	232446	232451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5032	NC_003919	CAA	2	6	232529	232534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77748518
5033	NC_003919	ACC	2	6	232544	232549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748518
5034	NC_003919	GAT	2	6	232571	232576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77748518
5035	NC_003919	GTG	2	6	232608	232613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748518
5036	NC_003919	CAC	2	6	232646	232651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748518
5037	NC_003919	AAT	2	6	232687	232692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77748518
5038	NC_003919	ACC	3	9	232698	232706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748518
5039	NC_003919	CGG	2	6	232765	232770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5040	NC_003919	CGC	2	6	232804	232809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5041	NC_003919	AGC	2	6	232878	232883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5042	NC_003919	GC	3	6	232882	232887	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5043	NC_003919	CAC	2	6	232895	232900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748518
5044	NC_003919	GCC	2	6	232907	232912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5045	NC_003919	GTG	2	6	232950	232955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77748518
5046	NC_003919	GGC	2	6	232962	232967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5047	NC_003919	CAG	2	6	232982	232987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5048	NC_003919	CGC	2	6	233001	233006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5049	NC_003919	GCG	2	6	233017	233022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5050	NC_003919	AAT	2	6	233071	233076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77748518
5051	NC_003919	TTG	2	6	233079	233084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77748518
5052	NC_003919	CGC	2	6	233170	233175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5053	NC_003919	ATC	2	6	233199	233204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77748518
5054	NC_003919	GATC	2	8	233218	233225	25 %	25 %	25 %	25 %	77748518
5055	NC_003919	GCGACG	2	12	233240	233251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	77748518
5056	NC_003919	TGC	3	9	233313	233321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5057	NC_003919	GTCGC	2	10	233372	233381	0 %	20 %	40 %	40 %	77748518
5058	NC_003919	GTC	2	6	233399	233404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
5059	NC_003919	ACC	2	6	233409	233414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77748518
5060	NC_003919	GC	3	6	233436	233441	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5061	NC_003919	CCG	2	6	233490	233495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
5062	NC_003919	GCG	2	6	233547	233552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77748518
5063	NC_003919	TGCC	2	8	233639	233646	0 %	25 %	25 %	50 %	77748518
5064	NC_003919	CGC	2	6	233665	233670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77748518
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5069	NC_003919	GC	4	8	233818	233825	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
5070	NC_003919	CATC	2	8	233851	233858	25 %	25 %	0 %	50 %	77748518
5071	NC_003919	GCT	2	6	233869	233874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77748518
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5089	NC_003919	CCGG	2	8	234585	234592	0 %	0 %	50 %	50 %	77748518
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5110	NC_003919	CGA	2	6	235460	235465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240964
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5493	NC_003919	TTC	2	6	251272	251277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240978
5494	NC_003919	CTT	2	6	251319	251324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240978
5495	NC_003919	GAA	2	6	251338	251343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240978
5496	NC_003919	ACG	2	6	251369	251374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240978
5497	NC_003919	GGC	2	6	251407	251412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240978
5498	NC_003919	CCG	2	6	251425	251430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240978
5499	NC_003919	GC	3	6	251451	251456	0 %	0 %	50 %	50 %	21240978
5500	NC_003919	CAC	3	9	251503	251511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240978

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