MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 111185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003919	GCC	2	6	207251	207256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240942
4502	NC_003919	GCA	2	6	207381	207386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240942
4503	NC_003919	GC	3	6	207458	207463	0 %	0 %	50 %	50 %	21240942
4504	NC_003919	AGC	2	6	207474	207479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240942
4505	NC_003919	AACG	2	8	207530	207537	50 %	0 %	25 %	25 %	21240942
4506	NC_003919	GTC	2	6	207574	207579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240942
4507	NC_003919	GCC	2	6	207634	207639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240942
4508	NC_003919	CCG	2	6	207652	207657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240942
4509	NC_003919	TATTTC	2	12	207668	207679	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21240942
4510	NC_003919	CGA	2	6	207691	207696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240942
4511	NC_003919	AAC	2	6	207752	207757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240942
4512	NC_003919	GGT	2	6	207763	207768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240942
4513	NC_003919	CGC	2	6	207771	207776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240942
4514	NC_003919	TCCA	2	8	207782	207789	25 %	25 %	0 %	50 %	21240942
4515	NC_003919	GCG	2	6	207834	207839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240942
4516	NC_003919	CATG	2	8	207859	207866	25 %	25 %	25 %	25 %	21240942
4517	NC_003919	GCC	2	6	208191	208196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240943
4518	NC_003919	CGAAG	2	10	208220	208229	40 %	0 %	40 %	20 %	21240943
4519	NC_003919	GCC	2	6	208243	208248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240943
4520	NC_003919	CAT	2	6	208298	208303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240943
4521	NC_003919	CGA	2	6	208304	208309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240943
4522	NC_003919	CGG	2	6	208325	208330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240943
4523	NC_003919	CAA	2	6	208346	208351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240943
4524	NC_003919	GAC	2	6	208404	208409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240943
4525	NC_003919	CTT	2	6	208436	208441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240943
4526	NC_003919	ATC	2	6	208491	208496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240943
4527	NC_003919	ACC	2	6	208617	208622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240943
4528	NC_003919	ACA	2	6	208654	208659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240943
4529	NC_003919	CGA	2	6	208676	208681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240943
4530	NC_003919	CAA	2	6	208688	208693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240943
4531	NC_003919	CG	3	6	208718	208723	0 %	0 %	50 %	50 %	21240943
4532	NC_003919	GCCG	2	8	208733	208740	0 %	0 %	50 %	50 %	21240943
4533	NC_003919	GGC	2	6	208746	208751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240943
4534	NC_003919	CAG	2	6	208769	208774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240943
4535	NC_003919	ATC	2	6	208800	208805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240943
4536	NC_003919	CGG	2	6	208814	208819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240943
4537	NC_003919	CTGG	2	8	208820	208827	0 %	25 %	50 %	25 %	21240943
4538	NC_003919	ATGA	2	8	209104	209111	50 %	25 %	25 %	0 %	21240944
4539	NC_003919	GCC	2	6	209122	209127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240944
4540	NC_003919	GCA	2	6	209145	209150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4541	NC_003919	ACG	2	6	209156	209161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4542	NC_003919	ACC	2	6	209216	209221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240944
4543	NC_003919	TCG	2	6	209246	209251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4544	NC_003919	CTG	3	9	209257	209265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4545	NC_003919	TCG	3	9	209285	209293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4546	NC_003919	GAT	2	6	209319	209324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240944
4547	NC_003919	CCGA	2	8	209371	209378	25 %	0 %	25 %	50 %	21240944
4548	NC_003919	CAA	2	6	209400	209405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240944
4549	NC_003919	GCG	2	6	209492	209497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240944
4550	NC_003919	GCA	2	6	209535	209540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4551	NC_003919	GC	3	6	209604	209609	0 %	0 %	50 %	50 %	21240944
4552	NC_003919	CGG	2	6	209640	209645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240944
4553	NC_003919	CAG	2	6	209656	209661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4554	NC_003919	CTT	2	6	209664	209669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240944
4555	NC_003919	TCG	2	6	209702	209707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4556	NC_003919	GCT	3	9	209731	209739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240944
4557	NC_003919	CCG	3	9	210185	210193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240945
4558	NC_003919	GC	3	6	210207	210212	0 %	0 %	50 %	50 %	21240945
4559	NC_003919	CTG	2	6	210235	210240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240945
4560	NC_003919	GGCG	2	8	210289	210296	0 %	0 %	75 %	25 %	21240945
4561	NC_003919	CGA	2	6	210428	210433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240945
4562	NC_003919	CGC	2	6	210465	210470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240945
4563	NC_003919	GC	3	6	210472	210477	0 %	0 %	50 %	50 %	21240945
4564	NC_003919	CG	3	6	210513	210518	0 %	0 %	50 %	50 %	21240945
4565	NC_003919	GC	3	6	210536	210541	0 %	0 %	50 %	50 %	21240945
4566	NC_003919	GCA	2	6	210576	210581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240945
4567	NC_003919	GATC	2	8	210609	210616	25 %	25 %	25 %	25 %	21240945
4568	NC_003919	CG	3	6	210643	210648	0 %	0 %	50 %	50 %	21240945
4569	NC_003919	GCGG	2	8	210657	210664	0 %	0 %	75 %	25 %	21240945
4570	NC_003919	GCCT	2	8	210745	210752	0 %	25 %	25 %	50 %	21240945
4571	NC_003919	GGT	2	6	210753	210758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240945
4572	NC_003919	TGC	2	6	210822	210827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240945
4573	NC_003919	TGC	2	6	210849	210854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240945
4574	NC_003919	CGTC	2	8	210862	210869	0 %	25 %	25 %	50 %	21240945
4575	NC_003919	CG	3	6	210894	210899	0 %	0 %	50 %	50 %	21240945
4576	NC_003919	CGG	2	6	210918	210923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240945
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4580	NC_003919	GTT	2	6	211119	211124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240945
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4582	NC_003919	GCA	2	6	211152	211157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240945
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4587	NC_003919	CG	3	6	211750	211755	0 %	0 %	50 %	50 %	21240946
4588	NC_003919	GCC	2	6	211806	211811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240946
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4590	NC_003919	GCC	2	6	211890	211895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240946
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4593	NC_003919	GGCC	2	8	212057	212064	0 %	0 %	50 %	50 %	21240946
4594	NC_003919	GCC	2	6	212106	212111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240946
4595	NC_003919	GTGG	2	8	212136	212143	0 %	25 %	75 %	0 %	21240946
4596	NC_003919	GCT	2	6	212166	212171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240946
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4601	NC_003919	CGG	2	6	212399	212404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240946
4602	NC_003919	GCA	2	6	212451	212456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240946
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4604	NC_003919	ACGC	2	8	212522	212529	25 %	0 %	25 %	50 %	21240946
4605	NC_003919	TGT	2	6	212588	212593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240946
4606	NC_003919	TGCGC	2	10	212613	212622	0 %	20 %	40 %	40 %	21240946
4607	NC_003919	GCAGG	2	10	212631	212640	20 %	0 %	60 %	20 %	21240946
4608	NC_003919	TGCG	2	8	212660	212667	0 %	25 %	50 %	25 %	21240946
4609	NC_003919	CTG	2	6	212668	212673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240946
4610	NC_003919	GCA	2	6	212682	212687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240946
4611	NC_003919	TTG	2	6	212719	212724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240946
4612	NC_003919	CGG	2	6	212744	212749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240946
4613	NC_003919	GCG	2	6	212841	212846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240946
4614	NC_003919	CGG	2	6	212867	212872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240946
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4619	NC_003919	GC	3	6	213241	213246	0 %	0 %	50 %	50 %	21240947
4620	NC_003919	GCG	2	6	213259	213264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240947
4621	NC_003919	GTA	2	6	213265	213270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240947
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4623	NC_003919	CGGT	2	8	213299	213306	0 %	25 %	50 %	25 %	21240947
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4874	NC_003919	TGC	2	6	225518	225523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240957
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4978	NC_003919	GC	3	6	229654	229659	0 %	0 %	50 %	50 %	77748517
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4982	NC_003919	GCCTGC	2	12	229821	229832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77748517
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4985	NC_003919	CCGG	2	8	230217	230224	0 %	0 %	50 %	50 %	21240961
4986	NC_003919	CGT	2	6	230242	230247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240961
4987	NC_003919	GCA	2	6	230248	230253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240961
4988	NC_003919	GC	3	6	230269	230274	0 %	0 %	50 %	50 %	21240961
4989	NC_003919	GC	3	6	230309	230314	0 %	0 %	50 %	50 %	21240961
4990	NC_003919	GCACC	2	10	230434	230443	20 %	0 %	20 %	60 %	21240961
4991	NC_003919	ACA	2	6	230467	230472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240961
4992	NC_003919	GCG	2	6	230488	230493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240961
4993	NC_003919	GCA	2	6	230542	230547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240961
4994	NC_003919	GCACT	2	10	230557	230566	20 %	20 %	20 %	40 %	21240961
4995	NC_003919	TCGG	2	8	230574	230581	0 %	25 %	50 %	25 %	21240961
4996	NC_003919	CTG	2	6	230592	230597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240961
4997	NC_003919	TGC	2	6	230637	230642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240961
4998	NC_003919	CTT	2	6	230743	230748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240962
4999	NC_003919	TGT	3	9	230970	230978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240962
5000	NC_003919	TGG	2	6	231007	231012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240962

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