MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002488	CAG	2	6	259775	259780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836849
4002	NC_002488	GTT	2	6	259807	259812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836849
4003	NC_002488	TGA	2	6	259847	259852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836849
4004	NC_002488	ATT	2	6	259887	259892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836849
4005	NC_002488	AGC	2	6	259954	259959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836850
4006	NC_002488	GCT	2	6	259994	259999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836850
4007	NC_002488	TGT	2	6	260005	260010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836850
4008	NC_002488	GT	3	6	260051	260056	0 %	50 %	50 %	0 %	15836850
4009	NC_002488	CATA	2	8	260091	260098	50 %	25 %	0 %	25 %	15836850
4010	NC_002488	GT	4	8	260135	260142	0 %	50 %	50 %	0 %	15836851
4011	NC_002488	TCC	2	6	260156	260161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836851
4012	NC_002488	ATT	2	6	260179	260184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836851
4013	NC_002488	AGC	2	6	260265	260270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836851
4014	NC_002488	ATC	2	6	260322	260327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836852
4015	NC_002488	TTG	2	6	260338	260343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836852
4016	NC_002488	AGG	2	6	260361	260366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836852
4017	NC_002488	GTT	2	6	260389	260394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836852
4018	NC_002488	TG	3	6	260478	260483	0 %	50 %	50 %	0 %	15836852
4019	NC_002488	TGT	2	6	260532	260537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836852
4020	NC_002488	TGG	2	6	260554	260559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836852
4021	NC_002488	GC	3	6	260615	260620	0 %	0 %	50 %	50 %	15836852
4022	NC_002488	CAGA	2	8	260756	260763	50 %	0 %	25 %	25 %	15836853
4023	NC_002488	TG	3	6	260817	260822	0 %	50 %	50 %	0 %	15836853
4024	NC_002488	CTG	2	6	261005	261010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836853
4025	NC_002488	ATT	2	6	261057	261062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836853
4026	NC_002488	GT	3	6	261158	261163	0 %	50 %	50 %	0 %	15836854
4027	NC_002488	AGT	2	6	261171	261176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836854
4028	NC_002488	TGG	2	6	261216	261221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836854
4029	NC_002488	G	7	7	261241	261247	0 %	0 %	100 %	0 %	15836854
4030	NC_002488	GTT	3	9	261283	261291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836854
4031	NC_002488	TTG	2	6	261303	261308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836854
4032	NC_002488	TTG	2	6	261315	261320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836854
4033	NC_002488	TGC	2	6	261333	261338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836854
4034	NC_002488	GAA	2	6	261358	261363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836854
4035	NC_002488	ACTT	2	8	261404	261411	25 %	50 %	0 %	25 %	15836854
4036	NC_002488	TGGTG	2	10	261710	261719	0 %	40 %	60 %	0 %	15836855
4037	NC_002488	TTG	3	9	261731	261739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836855
4038	NC_002488	TGC	2	6	261752	261757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836855
4039	NC_002488	GT	3	6	261761	261766	0 %	50 %	50 %	0 %	15836855
4040	NC_002488	TGCT	2	8	261800	261807	0 %	50 %	25 %	25 %	15836855
4041	NC_002488	TGG	2	6	261827	261832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836855
4042	NC_002488	GCA	2	6	261886	261891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836855
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4044	NC_002488	TG	3	6	261937	261942	0 %	50 %	50 %	0 %	15836855
4045	NC_002488	GGC	2	6	261947	261952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836855
4046	NC_002488	GCT	2	6	261969	261974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836855
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4050	NC_002488	TTA	2	6	262069	262074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836855
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4052	NC_002488	TGG	2	6	262106	262111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836855
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4054	NC_002488	TGT	2	6	262187	262192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836855
4055	NC_002488	GC	3	6	262238	262243	0 %	0 %	50 %	50 %	15836855
4056	NC_002488	CTG	2	6	262285	262290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836855
4057	NC_002488	AGC	2	6	262403	262408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836855
4058	NC_002488	T	6	6	262424	262429	0 %	100 %	0 %	0 %	15836855
4059	NC_002488	GTT	2	6	262444	262449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836855
4060	NC_002488	TTA	2	6	262462	262467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836855
4061	NC_002488	GCG	2	6	262482	262487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836855
4062	NC_002488	CGT	2	6	262496	262501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836855
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4064	NC_002488	CAT	2	6	262733	262738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836856
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4067	NC_002488	TGGTT	2	10	262869	262878	0 %	60 %	40 %	0 %	15836857
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4071	NC_002488	T	6	6	263011	263016	0 %	100 %	0 %	0 %	15836857
4072	NC_002488	CT	3	6	263104	263109	0 %	50 %	0 %	50 %	15836857
4073	NC_002488	CGA	2	6	263135	263140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836857
4074	NC_002488	TCTG	2	8	263269	263276	0 %	50 %	25 %	25 %	15836857
4075	NC_002488	GAG	2	6	263287	263292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836857
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4077	NC_002488	GC	3	6	263335	263340	0 %	0 %	50 %	50 %	15836857
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4080	NC_002488	GCTC	2	8	263423	263430	0 %	25 %	25 %	50 %	15836857
4081	NC_002488	ACC	2	6	263476	263481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836857
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4083	NC_002488	GCA	2	6	263594	263599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836857
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4088	NC_002488	GCG	2	6	263848	263853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836857
4089	NC_002488	TTC	2	6	263886	263891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836857
4090	NC_002488	CCA	2	6	263988	263993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836857
4091	NC_002488	TGG	2	6	264029	264034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836857
4092	NC_002488	CGG	2	6	264079	264084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836857
4093	NC_002488	TGG	2	6	264090	264095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836857
4094	NC_002488	CTT	2	6	264149	264154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836857
4095	NC_002488	GCA	2	6	264179	264184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836857
4096	NC_002488	TCG	2	6	264187	264192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836857
4097	NC_002488	TCG	2	6	264196	264201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836857
4098	NC_002488	ATCA	2	8	264252	264259	50 %	25 %	0 %	25 %	15836857
4099	NC_002488	CCCGG	2	10	264260	264269	0 %	0 %	40 %	60 %	15836857
4100	NC_002488	CGA	2	6	264275	264280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836857
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4103	NC_002488	GCA	2	6	264370	264375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836857
4104	NC_002488	GGGT	2	8	264416	264423	0 %	25 %	75 %	0 %	15836857
4105	NC_002488	CGC	2	6	264561	264566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836857
4106	NC_002488	CAG	2	6	264645	264650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836857
4107	NC_002488	GGAT	2	8	264660	264667	25 %	25 %	50 %	0 %	15836857
4108	NC_002488	TTG	2	6	264996	265001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836858
4109	NC_002488	TTGA	2	8	265088	265095	25 %	50 %	25 %	0 %	15836858
4110	NC_002488	GAT	2	6	265181	265186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836858
4111	NC_002488	GTTC	2	8	265210	265217	0 %	50 %	25 %	25 %	15836858
4112	NC_002488	GCA	2	6	265239	265244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836858
4113	NC_002488	GGCCAC	2	12	265318	265329	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15836858
4114	NC_002488	CCA	2	6	265333	265338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836858
4115	NC_002488	TGG	2	6	265441	265446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836858
4116	NC_002488	GCC	2	6	265451	265456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836858
4117	NC_002488	ATG	2	6	265474	265479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836858
4118	NC_002488	TGG	2	6	265489	265494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836858
4119	NC_002488	ACG	2	6	265497	265502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836858
4120	NC_002488	TGA	2	6	265528	265533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836858
4121	NC_002488	GCC	2	6	265620	265625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836858
4122	NC_002488	ACG	2	6	265626	265631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836858
4123	NC_002488	GTT	2	6	265682	265687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836858
4124	NC_002488	GCG	2	6	265701	265706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836858
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4133	NC_002488	TG	3	6	266033	266038	0 %	50 %	50 %	0 %	15836859
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4240	NC_002488	GCG	2	6	271537	271542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836864
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4492	NC_002488	CTT	2	6	288192	288197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836882
4493	NC_002488	CAG	2	6	288274	288279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836882
4494	NC_002488	GTG	2	6	288301	288306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836882
4495	NC_002488	TTC	2	6	288307	288312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836882
4496	NC_002488	TGAG	2	8	288330	288337	25 %	25 %	50 %	0 %	15836882
4497	NC_002488	CCACG	2	10	288363	288372	20 %	0 %	20 %	60 %	15836882
4498	NC_002488	CCAG	2	8	288435	288442	25 %	0 %	25 %	50 %	15836882
4499	NC_002488	GTT	3	9	288447	288455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836882
4500	NC_002488	GTA	2	6	288489	288494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836882

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