MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002488	GGT	2	6	229802	229807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836827
3502	NC_002488	GAG	2	6	229842	229847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836827
3503	NC_002488	TAC	2	6	229905	229910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836827
3504	NC_002488	CAG	2	6	229998	230003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836827
3505	NC_002488	CAG	2	6	230049	230054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836827
3506	NC_002488	CGC	2	6	230193	230198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836827
3507	NC_002488	TAC	2	6	230238	230243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836827
3508	NC_002488	GTG	2	6	230254	230259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836827
3509	NC_002488	AGG	2	6	230377	230382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836827
3510	NC_002488	AGG	2	6	230386	230391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836827
3511	NC_002488	CCG	2	6	230402	230407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836827
3512	NC_002488	CATC	2	8	230558	230565	25 %	25 %	0 %	50 %	15836827
3513	NC_002488	CG	3	6	230578	230583	0 %	0 %	50 %	50 %	15836827
3514	NC_002488	ACA	2	6	230608	230613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836827
3515	NC_002488	TGAG	2	8	230620	230627	25 %	25 %	50 %	0 %	15836827
3516	NC_002488	ATG	2	6	230770	230775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836827
3517	NC_002488	ACT	2	6	230868	230873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836827
3518	NC_002488	TGC	2	6	231380	231385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161378177
3519	NC_002488	CGT	2	6	231387	231392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161378177
3520	NC_002488	GCCAG	2	10	231476	231485	20 %	0 %	40 %	40 %	161378177
3521	NC_002488	ATC	2	6	231507	231512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161378177
3522	NC_002488	TGG	2	6	231620	231625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161378177
3523	NC_002488	TGA	2	6	231766	231771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378177
3524	NC_002488	CGA	2	6	231776	231781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378177
3525	NC_002488	ATG	2	6	231868	231873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378177
3526	NC_002488	ATT	2	6	231903	231908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161378177
3527	NC_002488	CGGT	2	8	231935	231942	0 %	25 %	50 %	25 %	161378177
3528	NC_002488	TGG	2	6	231986	231991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161378177
3529	NC_002488	CGG	2	6	232057	232062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161378177
3530	NC_002488	ACCG	2	8	232063	232070	25 %	0 %	25 %	50 %	161378177
3531	NC_002488	GGGT	2	8	232084	232091	0 %	25 %	75 %	0 %	161378177
3532	NC_002488	GGA	2	6	232097	232102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161378177
3533	NC_002488	CGTGG	2	10	232122	232131	0 %	20 %	60 %	20 %	161378177
3534	NC_002488	TG	3	6	232143	232148	0 %	50 %	50 %	0 %	161378177
3535	NC_002488	GGC	2	6	232275	232280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161378177
3536	NC_002488	TAC	2	6	232362	232367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161378177
3537	NC_002488	TGCG	2	8	232387	232394	0 %	25 %	50 %	25 %	161378177
3538	NC_002488	T	7	7	232412	232418	0 %	100 %	0 %	0 %	161378177
3539	NC_002488	TTCT	2	8	232430	232437	0 %	75 %	0 %	25 %	161378177
3540	NC_002488	TTC	2	6	232634	232639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836829
3541	NC_002488	CCGG	2	8	232670	232677	0 %	0 %	50 %	50 %	15836829
3542	NC_002488	TAT	2	6	232747	232752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836829
3543	NC_002488	ATG	2	6	232790	232795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836829
3544	NC_002488	ATC	2	6	232797	232802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836829
3545	NC_002488	GCG	2	6	232809	232814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836829
3546	NC_002488	CTG	2	6	232827	232832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836829
3547	NC_002488	TGCGCG	2	12	232899	232910	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15836829
3548	NC_002488	ATG	2	6	232966	232971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836829
3549	NC_002488	TGT	2	6	233074	233079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836830
3550	NC_002488	GGC	2	6	233156	233161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836830
3551	NC_002488	CGA	2	6	233167	233172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836830
3552	NC_002488	CAG	2	6	233183	233188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836830
3553	NC_002488	TGA	2	6	233190	233195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836830
3554	NC_002488	AGG	2	6	233238	233243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836830
3555	NC_002488	TTGG	2	8	233365	233372	0 %	50 %	50 %	0 %	15836830
3556	NC_002488	TGGG	2	8	233379	233386	0 %	25 %	75 %	0 %	15836830
3557	NC_002488	GAG	2	6	233486	233491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836830
3558	NC_002488	ACA	2	6	233550	233555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836830
3559	NC_002488	TGA	3	9	233572	233580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836830
3560	NC_002488	GTT	2	6	233608	233613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836830
3561	NC_002488	ATT	2	6	233634	233639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836830
3562	NC_002488	GTG	2	6	233700	233705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836830
3563	NC_002488	GAC	2	6	233722	233727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836830
3564	NC_002488	GAT	2	6	233786	233791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836830
3565	NC_002488	CTG	2	6	233826	233831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836830
3566	NC_002488	TCC	2	6	233923	233928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836830
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3568	NC_002488	TGA	2	6	234001	234006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836830
3569	NC_002488	CGGT	2	8	234021	234028	0 %	25 %	50 %	25 %	15836830
3570	NC_002488	GCGTG	2	10	234184	234193	0 %	20 %	60 %	20 %	15836830
3571	NC_002488	ACC	2	6	234257	234262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836830
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3573	NC_002488	GTG	2	6	234387	234392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836830
3574	NC_002488	GTG	2	6	234401	234406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836830
3575	NC_002488	TTTC	2	8	234408	234415	0 %	75 %	0 %	25 %	15836830
3576	NC_002488	TTG	2	6	234491	234496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836830
3577	NC_002488	GTCG	2	8	234565	234572	0 %	25 %	50 %	25 %	15836830
3578	NC_002488	GAG	2	6	234617	234622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836830
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3582	NC_002488	GTTGAT	2	12	234971	234982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15836831
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3585	NC_002488	G	8	8	235158	235165	0 %	0 %	100 %	0 %	15836831
3586	NC_002488	ATA	2	6	235204	235209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836831
3587	NC_002488	ATG	3	9	235210	235218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836831
3588	NC_002488	T	6	6	235367	235372	0 %	100 %	0 %	0 %	15836831
3589	NC_002488	TTC	2	6	235431	235436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836831
3590	NC_002488	GCT	2	6	235466	235471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836831
3591	NC_002488	CTGG	2	8	235497	235504	0 %	25 %	50 %	25 %	15836831
3592	NC_002488	TTG	2	6	235506	235511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836831
3593	NC_002488	CAT	2	6	235538	235543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836831
3594	NC_002488	ATCA	2	8	235617	235624	50 %	25 %	0 %	25 %	15836831
3595	NC_002488	CGG	2	6	235648	235653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836831
3596	NC_002488	TTCT	2	8	235659	235666	0 %	75 %	0 %	25 %	15836831
3597	NC_002488	TTGTAC	2	12	235680	235691	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15836831
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3602	NC_002488	GCGGT	2	10	236310	236319	0 %	20 %	60 %	20 %	15836832
3603	NC_002488	TTG	2	6	236327	236332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836832
3604	NC_002488	GTT	2	6	236395	236400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836832
3605	NC_002488	CGC	2	6	236423	236428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836832
3606	NC_002488	ATT	2	6	236462	236467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836832
3607	NC_002488	TGA	2	6	236494	236499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836832
3608	NC_002488	GT	3	6	236537	236542	0 %	50 %	50 %	0 %	15836832
3609	NC_002488	TAC	2	6	236606	236611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836832
3610	NC_002488	TGG	2	6	236644	236649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836832
3611	NC_002488	TGA	2	6	236673	236678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836832
3612	NC_002488	GATT	2	8	236679	236686	25 %	50 %	25 %	0 %	15836832
3613	NC_002488	TGC	2	6	236727	236732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836832
3614	NC_002488	GTGCG	2	10	236733	236742	0 %	20 %	60 %	20 %	15836832
3615	NC_002488	TTG	2	6	236810	236815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836832
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3617	NC_002488	TC	3	6	236863	236868	0 %	50 %	0 %	50 %	15836832
3618	NC_002488	TGAT	2	8	236913	236920	25 %	50 %	25 %	0 %	15836832
3619	NC_002488	GTT	2	6	236923	236928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836832
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3621	NC_002488	GCG	2	6	236974	236979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836832
3622	NC_002488	TTG	2	6	237059	237064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836832
3623	NC_002488	AGG	2	6	237123	237128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836832
3624	NC_002488	CGT	2	6	237134	237139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836832
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3734	NC_002488	GCTG	2	8	244191	244198	0 %	25 %	50 %	25 %	15836838
3735	NC_002488	AAC	2	6	244207	244212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836838
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3737	NC_002488	A	6	6	244268	244273	100 %	0 %	0 %	0 %	15836838
3738	NC_002488	A	7	7	244288	244294	100 %	0 %	0 %	0 %	15836838
3739	NC_002488	CAA	2	6	244305	244310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836838
3740	NC_002488	A	6	6	244309	244314	100 %	0 %	0 %	0 %	15836838
3741	NC_002488	CGG	2	6	244328	244333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836838
3742	NC_002488	CGTG	2	8	244344	244351	0 %	25 %	50 %	25 %	15836838
3743	NC_002488	ATC	2	6	244425	244430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836839
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3745	NC_002488	GAA	2	6	244466	244471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836839
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3990	NC_002488	AC	3	6	259166	259171	50 %	0 %	0 %	50 %	15836849
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3993	NC_002488	CGA	2	6	259358	259363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836849
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