MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002488	ATC	2	6	101986	101991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836709
1502	NC_002488	TGCG	2	8	102011	102018	0 %	25 %	50 %	25 %	15836709
1503	NC_002488	GCG	2	6	102025	102030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836709
1504	NC_002488	GGT	2	6	102058	102063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836709
1505	NC_002488	GGC	2	6	102092	102097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836709
1506	NC_002488	CAC	2	6	102111	102116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836709
1507	NC_002488	CCA	2	6	102241	102246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836709
1508	NC_002488	CTC	2	6	102276	102281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836709
1509	NC_002488	GCGTA	2	10	102301	102310	20 %	20 %	40 %	20 %	15836709
1510	NC_002488	AGC	2	6	102391	102396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836709
1511	NC_002488	CGC	2	6	102443	102448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836709
1512	NC_002488	CCA	2	6	102525	102530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836709
1513	NC_002488	ACGCC	2	10	102594	102603	20 %	0 %	20 %	60 %	15836709
1514	NC_002488	GT	3	6	102609	102614	0 %	50 %	50 %	0 %	15836709
1515	NC_002488	CCG	2	6	102651	102656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836709
1516	NC_002488	ATGC	2	8	102867	102874	25 %	25 %	25 %	25 %	15836710
1517	NC_002488	ATGC	2	8	102899	102906	25 %	25 %	25 %	25 %	15836710
1518	NC_002488	GC	3	6	102932	102937	0 %	0 %	50 %	50 %	15836710
1519	NC_002488	TGT	2	6	102952	102957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836710
1520	NC_002488	TTA	2	6	102960	102965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836710
1521	NC_002488	CAG	2	6	103054	103059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836710
1522	NC_002488	TCGG	2	8	103095	103102	0 %	25 %	50 %	25 %	15836710
1523	NC_002488	TGC	3	9	103112	103120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836710
1524	NC_002488	CAA	2	6	103143	103148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836710
1525	NC_002488	TCA	2	6	103168	103173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836710
1526	NC_002488	CCA	2	6	103174	103179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836710
1527	NC_002488	GTGC	2	8	103203	103210	0 %	25 %	50 %	25 %	15836710
1528	NC_002488	G	6	6	103216	103221	0 %	0 %	100 %	0 %	15836710
1529	NC_002488	CGTT	2	8	103398	103405	0 %	50 %	25 %	25 %	15836710
1530	NC_002488	TCA	2	6	103432	103437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836710
1531	NC_002488	GCGT	2	8	103439	103446	0 %	25 %	50 %	25 %	15836710
1532	NC_002488	GT	4	8	103458	103465	0 %	50 %	50 %	0 %	15836710
1533	NC_002488	GGC	2	6	103466	103471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836710
1534	NC_002488	CAC	2	6	103564	103569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836710
1535	NC_002488	GAG	2	6	103656	103661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836710
1536	NC_002488	ATC	2	6	103668	103673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836710
1537	NC_002488	CG	3	6	103682	103687	0 %	0 %	50 %	50 %	15836710
1538	NC_002488	TAC	2	6	103690	103695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836710
1539	NC_002488	TGT	2	6	103717	103722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836710
1540	NC_002488	CAC	2	6	103726	103731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836710
1541	NC_002488	GCAA	2	8	103798	103805	50 %	0 %	25 %	25 %	15836710
1542	NC_002488	TGG	2	6	103898	103903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836710
1543	NC_002488	AGCC	2	8	103939	103946	25 %	0 %	25 %	50 %	15836710
1544	NC_002488	GCG	2	6	104003	104008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836710
1545	NC_002488	TGCCGA	2	12	104039	104050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15836710
1546	NC_002488	CAAG	2	8	104089	104096	50 %	0 %	25 %	25 %	15836710
1547	NC_002488	GTG	2	6	104143	104148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836710
1548	NC_002488	GC	3	6	104154	104159	0 %	0 %	50 %	50 %	15836710
1549	NC_002488	TGTC	2	8	104197	104204	0 %	50 %	25 %	25 %	15836710
1550	NC_002488	TTTG	2	8	104643	104650	0 %	75 %	25 %	0 %	15836711
1551	NC_002488	CGC	2	6	104689	104694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836711
1552	NC_002488	CAG	2	6	104711	104716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836711
1553	NC_002488	GGC	2	6	104863	104868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836711
1554	NC_002488	CAC	2	6	104900	104905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836711
1555	NC_002488	TTG	2	6	105114	105119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836711
1556	NC_002488	TGG	2	6	105152	105157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836711
1557	NC_002488	ATT	2	6	105259	105264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836711
1558	NC_002488	AAC	2	6	105413	105418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836711
1559	NC_002488	TTGC	2	8	105446	105453	0 %	50 %	25 %	25 %	15836711
1560	NC_002488	GGT	2	6	105479	105484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836711
1561	NC_002488	CTG	2	6	105521	105526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836711
1562	NC_002488	ATG	2	6	105762	105767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836711
1563	NC_002488	GCAA	2	8	105835	105842	50 %	0 %	25 %	25 %	15836711
1564	NC_002488	ACTG	2	8	105874	105881	25 %	25 %	25 %	25 %	15836711
1565	NC_002488	CGTC	2	8	105889	105896	0 %	25 %	25 %	50 %	15836711
1566	NC_002488	GCG	2	6	105920	105925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836711
1567	NC_002488	GTT	2	6	105943	105948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836711
1568	NC_002488	GTG	3	9	106217	106225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836712
1569	NC_002488	AAG	2	6	106228	106233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836712
1570	NC_002488	ATC	2	6	106249	106254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836712
1571	NC_002488	CG	3	6	106337	106342	0 %	0 %	50 %	50 %	15836712
1572	NC_002488	GCTT	2	8	106412	106419	0 %	50 %	25 %	25 %	15836712
1573	NC_002488	AATG	2	8	106454	106461	50 %	25 %	25 %	0 %	15836712
1574	NC_002488	TGA	2	6	106497	106502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836713
1575	NC_002488	GGT	2	6	106541	106546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836713
1576	NC_002488	GTG	2	6	106557	106562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836713
1577	NC_002488	TTA	2	6	106622	106627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836713
1578	NC_002488	CGA	2	6	106792	106797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836713
1579	NC_002488	AC	3	6	106831	106836	50 %	0 %	0 %	50 %	15836713
1580	NC_002488	ATG	2	6	106890	106895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836713
1581	NC_002488	GCGAGC	2	12	106911	106922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15836713
1582	NC_002488	TTG	2	6	106983	106988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836713
1583	NC_002488	GT	3	6	107165	107170	0 %	50 %	50 %	0 %	15836714
1584	NC_002488	GAT	2	6	107268	107273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836714
1585	NC_002488	GGT	3	9	107283	107291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836714
1586	NC_002488	TGCC	2	8	107324	107331	0 %	25 %	25 %	50 %	15836714
1587	NC_002488	GCA	2	6	107346	107351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836714
1588	NC_002488	CTG	2	6	107397	107402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836714
1589	NC_002488	CG	3	6	107412	107417	0 %	0 %	50 %	50 %	15836714
1590	NC_002488	TGC	2	6	107431	107436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836714
1591	NC_002488	GAT	2	6	107441	107446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836714
1592	NC_002488	AGG	2	6	107587	107592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836714
1593	NC_002488	ACG	2	6	107602	107607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836714
1594	NC_002488	CAG	2	6	107754	107759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836714
1595	NC_002488	GCT	2	6	107762	107767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836714
1596	NC_002488	GCG	2	6	107780	107785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836714
1597	NC_002488	TGA	2	6	107837	107842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836714
1598	NC_002488	CA	3	6	107852	107857	50 %	0 %	0 %	50 %	15836714
1599	NC_002488	ATT	2	6	108092	108097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836715
1600	NC_002488	AAG	2	6	108180	108185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836715
1601	NC_002488	AG	3	6	108191	108196	50 %	0 %	50 %	0 %	15836715
1602	NC_002488	CCA	2	6	108228	108233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836715
1603	NC_002488	GT	3	6	108297	108302	0 %	50 %	50 %	0 %	15836715
1604	NC_002488	CAT	2	6	108319	108324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836715
1605	NC_002488	GC	3	6	108358	108363	0 %	0 %	50 %	50 %	15836715
1606	NC_002488	TAC	2	6	108374	108379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836715
1607	NC_002488	GCC	2	6	108401	108406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836715
1608	NC_002488	AGA	2	6	108415	108420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836715
1609	NC_002488	GCT	2	6	108425	108430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836715
1610	NC_002488	TGG	2	6	108907	108912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836716
1611	NC_002488	AGA	2	6	108932	108937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836716
1612	NC_002488	GCT	2	6	108969	108974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836716
1613	NC_002488	AAT	2	6	109128	109133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836716
1614	NC_002488	CAT	2	6	109184	109189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836716
1615	NC_002488	TCA	2	6	109207	109212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836716
1616	NC_002488	GC	3	6	109272	109277	0 %	0 %	50 %	50 %	15836716
1617	NC_002488	AACG	2	8	109383	109390	50 %	0 %	25 %	25 %	15836716
1618	NC_002488	GTC	2	6	109468	109473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836716
1619	NC_002488	CCA	2	6	109544	109549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836716
1620	NC_002488	TG	3	6	109829	109834	0 %	50 %	50 %	0 %	15836717
1621	NC_002488	TGT	2	6	109871	109876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836717
1622	NC_002488	GCGTTT	2	12	110039	110050	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15836718
1623	NC_002488	GAT	2	6	110052	110057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836718
1624	NC_002488	AATGC	2	10	110123	110132	40 %	20 %	20 %	20 %	15836718
1625	NC_002488	GCA	2	6	110140	110145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836718
1626	NC_002488	TGC	2	6	110176	110181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836718
1627	NC_002488	CG	3	6	110475	110480	0 %	0 %	50 %	50 %	161378154
1628	NC_002488	GAA	2	6	110619	110624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161378154
1629	NC_002488	GTC	2	6	110755	110760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161378154
1630	NC_002488	ACG	2	6	110775	110780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378154
1631	NC_002488	TGG	2	6	110919	110924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161378154
1632	NC_002488	GCG	2	6	110926	110931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161378154
1633	NC_002488	TGG	2	6	110934	110939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161378154
1634	NC_002488	AGCC	2	8	110958	110965	25 %	0 %	25 %	50 %	161378154
1635	NC_002488	CAT	2	6	110970	110975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161378154
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1638	NC_002488	CGT	2	6	111135	111140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161378154
1639	NC_002488	CAAG	2	8	111201	111208	50 %	0 %	25 %	25 %	161378154
1640	NC_002488	CGA	2	6	111210	111215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161378154
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1642	NC_002488	TTG	2	6	111247	111252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161378154
1643	NC_002488	TGAT	2	8	111264	111271	25 %	50 %	25 %	0 %	161378154
1644	NC_002488	AAG	2	6	111324	111329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836720
1645	NC_002488	GTTG	2	8	111407	111414	0 %	50 %	50 %	0 %	15836720
1646	NC_002488	CGG	2	6	111431	111436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836720
1647	NC_002488	ACC	2	6	111465	111470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836720
1648	NC_002488	AGC	2	6	111486	111491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836720
1649	NC_002488	TAC	2	6	111526	111531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836720
1650	NC_002488	CGG	2	6	111555	111560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836720
1651	NC_002488	GTCA	2	8	111588	111595	25 %	25 %	25 %	25 %	15836720
1652	NC_002488	AGC	2	6	111619	111624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836720
1653	NC_002488	TGACC	2	10	111727	111736	20 %	20 %	20 %	40 %	15836721
1654	NC_002488	TGATC	2	10	111739	111748	20 %	40 %	20 %	20 %	15836721
1655	NC_002488	AGA	2	6	111769	111774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836721
1656	NC_002488	CA	3	6	111868	111873	50 %	0 %	0 %	50 %	15836721
1657	NC_002488	GTGCTA	2	12	111890	111901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15836721
1658	NC_002488	TCCC	2	8	111921	111928	0 %	25 %	0 %	75 %	15836721
1659	NC_002488	TGC	2	6	112039	112044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836721
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1662	NC_002488	ATTG	2	8	112175	112182	25 %	50 %	25 %	0 %	15836721
1663	NC_002488	CTG	2	6	112226	112231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836721
1664	NC_002488	CGT	2	6	112241	112246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836721
1665	NC_002488	TGA	2	6	112378	112383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836721
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1668	NC_002488	TCGCA	2	10	112615	112624	20 %	20 %	20 %	40 %	15836721
1669	NC_002488	GAA	2	6	112661	112666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836721
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1674	NC_002488	TTGC	2	8	112829	112836	0 %	50 %	25 %	25 %	15836721
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1737	NC_002488	TGG	2	6	117271	117276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836726
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1742	NC_002488	GT	3	6	117648	117653	0 %	50 %	50 %	0 %	15836726
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1744	NC_002488	CG	3	6	117711	117716	0 %	0 %	50 %	50 %	15836726
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1865	NC_002488	CTCCCA	2	12	125528	125539	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15836732
1866	NC_002488	ACTG	2	8	125557	125564	25 %	25 %	25 %	25 %	15836732
1867	NC_002488	CCT	2	6	125677	125682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836732
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1869	NC_002488	CGG	2	6	125775	125780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836732
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1992	NC_002488	GTC	2	6	132305	132310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836739
1993	NC_002488	GGC	2	6	132321	132326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836739
1994	NC_002488	CCG	2	6	132345	132350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836739
1995	NC_002488	CAG	2	6	132484	132489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836739
1996	NC_002488	CAA	2	6	132501	132506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836739
1997	NC_002488	TGG	2	6	132520	132525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836739
1998	NC_002488	CCAG	2	8	132543	132550	25 %	0 %	25 %	50 %	15836739
1999	NC_002488	ACG	2	6	132604	132609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836739
2000	NC_002488	AGG	2	6	132638	132643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836739

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