MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002488	TCGATT	2	12	60245	60256	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15836671
1002	NC_002488	GC	3	6	60289	60294	0 %	0 %	50 %	50 %	15836671
1003	NC_002488	GACT	2	8	60334	60341	25 %	25 %	25 %	25 %	15836671
1004	NC_002488	TGC	2	6	60355	60360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836671
1005	NC_002488	CAG	3	9	60428	60436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836671
1006	NC_002488	T	6	6	61096	61101	0 %	100 %	0 %	0 %	15836672
1007	NC_002488	TCC	2	6	61149	61154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836672
1008	NC_002488	CTA	2	6	61185	61190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836672
1009	NC_002488	GT	3	6	61398	61403	0 %	50 %	50 %	0 %	15836673
1010	NC_002488	GTT	2	6	61446	61451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836673
1011	NC_002488	GAT	2	6	61497	61502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836673
1012	NC_002488	GTC	3	9	61680	61688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836673
1013	NC_002488	GGT	2	6	61722	61727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836673
1014	NC_002488	GTAG	2	8	61841	61848	25 %	25 %	50 %	0 %	15836673
1015	NC_002488	ACG	2	6	61894	61899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836673
1016	NC_002488	GTG	2	6	61985	61990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836673
1017	NC_002488	TCGG	2	8	62049	62056	0 %	25 %	50 %	25 %	15836673
1018	NC_002488	TGA	2	6	62066	62071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836673
1019	NC_002488	AGT	2	6	62103	62108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836673
1020	NC_002488	CCA	2	6	62124	62129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836673
1021	NC_002488	CCG	2	6	62140	62145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836673
1022	NC_002488	CCA	2	6	62163	62168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836673
1023	NC_002488	AAG	2	6	62188	62193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836673
1024	NC_002488	CGC	2	6	62207	62212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836673
1025	NC_002488	TAG	2	6	62256	62261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836673
1026	NC_002488	AGT	2	6	62430	62435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836674
1027	NC_002488	GC	3	6	62476	62481	0 %	0 %	50 %	50 %	15836674
1028	NC_002488	T	6	6	62515	62520	0 %	100 %	0 %	0 %	15836674
1029	NC_002488	ATTTC	2	10	62539	62548	20 %	60 %	0 %	20 %	15836674
1030	NC_002488	CT	3	6	62607	62612	0 %	50 %	0 %	50 %	15836674
1031	NC_002488	GTT	2	6	62622	62627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836674
1032	NC_002488	GGGTGT	2	12	62644	62655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836674
1033	NC_002488	TTGC	2	8	62718	62725	0 %	50 %	25 %	25 %	15836674
1034	NC_002488	ATG	2	6	62774	62779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836674
1035	NC_002488	GAT	2	6	64268	64273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836675
1036	NC_002488	TGC	2	6	64283	64288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836675
1037	NC_002488	CATC	2	8	64320	64327	25 %	25 %	0 %	50 %	15836675
1038	NC_002488	GTC	2	6	71935	71940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1039	NC_002488	GCATC	2	10	71948	71957	20 %	20 %	20 %	40 %	15836676
1040	NC_002488	ACT	2	6	71958	71963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836676
1041	NC_002488	GT	3	6	71964	71969	0 %	50 %	50 %	0 %	15836676
1042	NC_002488	TCA	2	6	72016	72021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836676
1043	NC_002488	CGT	2	6	72111	72116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1044	NC_002488	CGC	2	6	72138	72143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836676
1045	NC_002488	AAG	2	6	72163	72168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836676
1046	NC_002488	GTCGGT	2	12	72306	72317	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15836676
1047	NC_002488	TGC	2	6	72326	72331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1048	NC_002488	TC	3	6	72384	72389	0 %	50 %	0 %	50 %	15836676
1049	NC_002488	TCC	2	6	72427	72432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836676
1050	NC_002488	GGA	2	6	72450	72455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836676
1051	NC_002488	TTGT	2	8	72513	72520	0 %	75 %	25 %	0 %	15836676
1052	NC_002488	GTC	2	6	72526	72531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836676
1053	NC_002488	CCT	2	6	72560	72565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836676
1054	NC_002488	ACC	2	6	72573	72578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836676
1055	NC_002488	ACT	2	6	72591	72596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836676
1056	NC_002488	A	6	6	72851	72856	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1057	NC_002488	CAT	2	6	72872	72877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836677
1058	NC_002488	GCCA	2	8	72913	72920	25 %	0 %	25 %	50 %	15836677
1059	NC_002488	AAC	2	6	72939	72944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1060	NC_002488	CAA	2	6	72989	72994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1061	NC_002488	TC	3	6	73011	73016	0 %	50 %	0 %	50 %	15836677
1062	NC_002488	ACAA	2	8	73017	73024	75 %	0 %	0 %	25 %	15836677
1063	NC_002488	AACC	2	8	73060	73067	50 %	0 %	0 %	50 %	15836677
1064	NC_002488	AGC	2	6	73083	73088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836677
1065	NC_002488	TCAG	2	8	73098	73105	25 %	25 %	25 %	25 %	15836677
1066	NC_002488	CGG	2	6	73106	73111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836677
1067	NC_002488	CAC	2	6	73117	73122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836677
1068	NC_002488	GTG	2	6	73127	73132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836677
1069	NC_002488	CAT	2	6	73172	73177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836677
1070	NC_002488	TGC	2	6	73187	73192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836677
1071	NC_002488	GTGA	2	8	73267	73274	25 %	25 %	50 %	0 %	15836677
1072	NC_002488	AGCA	2	8	73292	73299	50 %	0 %	25 %	25 %	15836677
1073	NC_002488	TCCCCA	2	12	73336	73347	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15836677
1074	NC_002488	TAAA	2	8	73357	73364	75 %	25 %	0 %	0 %	15836677
1075	NC_002488	A	6	6	73385	73390	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1076	NC_002488	A	8	8	73408	73415	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1077	NC_002488	A	6	6	73452	73457	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1078	NC_002488	ACC	2	6	73463	73468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836677
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1081	NC_002488	A	6	6	73563	73568	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1082	NC_002488	A	8	8	73574	73581	100 %	0 %	0 %	0 %	15836677
1083	NC_002488	AAC	2	6	73586	73591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1084	NC_002488	AAC	2	6	73596	73601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836677
1085	NC_002488	TTGA	2	8	73842	73849	25 %	50 %	25 %	0 %	15836678
1086	NC_002488	CGG	2	6	73990	73995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836678
1087	NC_002488	TGGT	2	8	74038	74045	0 %	50 %	50 %	0 %	15836678
1088	NC_002488	AAG	2	6	74076	74081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836678
1089	NC_002488	TGG	2	6	74089	74094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836678
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1091	NC_002488	TGC	2	6	74210	74215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1092	NC_002488	AAG	2	6	74229	74234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836678
1093	NC_002488	TTG	2	6	74239	74244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836678
1094	NC_002488	CTG	2	6	74263	74268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1095	NC_002488	GAT	2	6	74291	74296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1096	NC_002488	TTGT	2	8	74343	74350	0 %	75 %	25 %	0 %	15836678
1097	NC_002488	GCT	2	6	74376	74381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1098	NC_002488	GGT	2	6	74460	74465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836678
1099	NC_002488	TTG	2	6	74506	74511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836678
1100	NC_002488	TCCA	2	8	74545	74552	25 %	25 %	0 %	50 %	15836678
1101	NC_002488	TGC	2	6	74558	74563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1102	NC_002488	TTG	2	6	74599	74604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836678
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1105	NC_002488	GGGA	2	8	74723	74730	25 %	0 %	75 %	0 %	15836678
1106	NC_002488	ATC	2	6	74776	74781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836678
1107	NC_002488	AGC	2	6	74785	74790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1108	NC_002488	GAAG	2	8	74801	74808	50 %	0 %	50 %	0 %	15836678
1109	NC_002488	CGT	2	6	74853	74858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836678
1110	NC_002488	TGA	2	6	74938	74943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1111	NC_002488	ATG	2	6	74967	74972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1112	NC_002488	TGG	3	9	74984	74992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836678
1113	NC_002488	ATG	2	6	75015	75020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1114	NC_002488	GGT	2	6	75030	75035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836678
1115	NC_002488	TGA	2	6	75057	75062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836678
1116	NC_002488	GTAC	2	8	75435	75442	25 %	25 %	25 %	25 %	15836679
1117	NC_002488	TATC	2	8	75463	75470	25 %	50 %	0 %	25 %	15836679
1118	NC_002488	TGT	2	6	75494	75499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836679
1119	NC_002488	TTG	2	6	75545	75550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836679
1120	NC_002488	TAC	2	6	75617	75622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836679
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1122	NC_002488	TGC	2	6	75889	75894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836680
1123	NC_002488	GC	3	6	75928	75933	0 %	0 %	50 %	50 %	15836680
1124	NC_002488	GCA	2	6	76001	76006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836680
1125	NC_002488	TTG	2	6	76097	76102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836680
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1255	NC_002488	CT	3	6	86821	86826	0 %	50 %	0 %	50 %	15836691
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