MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002488	GTG	2	6	30078	30083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
502	NC_002488	GTG	2	6	30087	30092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
503	NC_002488	GTG	2	6	30096	30101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
504	NC_002488	GTG	3	9	30105	30113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
505	NC_002488	GGTGTG	2	12	30137	30148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836637
506	NC_002488	ACGGT	2	10	30207	30216	20 %	20 %	40 %	20 %	15836637
507	NC_002488	CGT	2	6	30219	30224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836637
508	NC_002488	GT	3	6	30261	30266	0 %	50 %	50 %	0 %	15836637
509	NC_002488	ATG	2	6	30308	30313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836638
510	NC_002488	A	6	6	30334	30339	100 %	0 %	0 %	0 %	15836638
511	NC_002488	TGA	2	6	30365	30370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836638
512	NC_002488	TGG	2	6	30374	30379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836638
513	NC_002488	ACA	3	9	30468	30476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836638
514	NC_002488	TTA	2	6	30495	30500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836638
515	NC_002488	CACGCT	2	12	30660	30671	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15836638
516	NC_002488	GTT	2	6	30707	30712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836638
517	NC_002488	AGTG	2	8	31174	31181	25 %	25 %	50 %	0 %	15836639
518	NC_002488	CTG	2	6	31209	31214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836639
519	NC_002488	CAC	2	6	31252	31257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836639
520	NC_002488	AGC	2	6	31282	31287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836639
521	NC_002488	GTT	2	6	31305	31310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836639
522	NC_002488	CGGCG	2	10	31374	31383	0 %	0 %	60 %	40 %	15836639
523	NC_002488	TGC	3	9	31387	31395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836639
524	NC_002488	CAC	2	6	31416	31421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836639
525	NC_002488	GGC	2	6	31438	31443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836639
526	NC_002488	CGC	2	6	31570	31575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836639
527	NC_002488	CAT	2	6	31579	31584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836639
528	NC_002488	GCCA	2	8	31593	31600	25 %	0 %	25 %	50 %	15836639
529	NC_002488	GAC	2	6	31635	31640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836639
530	NC_002488	GAA	2	6	31672	31677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836639
531	NC_002488	CGA	2	6	31686	31691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836639
532	NC_002488	GTC	2	6	31717	31722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836639
533	NC_002488	CAA	2	6	31750	31755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836639
534	NC_002488	TAA	2	6	31870	31875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836639
535	NC_002488	TCA	2	6	31887	31892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836639
536	NC_002488	GTT	2	6	32690	32695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836640
537	NC_002488	CGT	2	6	32710	32715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836640
538	NC_002488	TGAT	2	8	32777	32784	25 %	50 %	25 %	0 %	15836640
539	NC_002488	CAA	2	6	33101	33106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836641
540	NC_002488	CAG	2	6	33171	33176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836641
541	NC_002488	CG	3	6	33208	33213	0 %	0 %	50 %	50 %	15836641
542	NC_002488	CA	3	6	33254	33259	50 %	0 %	0 %	50 %	15836641
543	NC_002488	TTG	2	6	33264	33269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836641
544	NC_002488	TTG	2	6	33288	33293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836641
545	NC_002488	CTG	2	6	33352	33357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836641
546	NC_002488	ACC	2	6	33418	33423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836641
547	NC_002488	GCT	2	6	33438	33443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836641
548	NC_002488	TGG	2	6	33508	33513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836641
549	NC_002488	CAG	2	6	33590	33595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836641
550	NC_002488	AGC	2	6	33607	33612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836641
551	NC_002488	TTG	2	6	33613	33618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836641
552	NC_002488	TGC	2	6	33640	33645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836641
553	NC_002488	GAA	2	6	33720	33725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836641
554	NC_002488	G	6	6	33792	33797	0 %	0 %	100 %	0 %	15836641
555	NC_002488	TAT	2	6	33857	33862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836641
556	NC_002488	TGCG	2	8	33988	33995	0 %	25 %	50 %	25 %	15836641
557	NC_002488	CGA	2	6	34109	34114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836641
558	NC_002488	AGT	2	6	34134	34139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836641
559	NC_002488	TG	3	6	34149	34154	0 %	50 %	50 %	0 %	15836641
560	NC_002488	CAT	2	6	34292	34297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836642
561	NC_002488	CTG	2	6	34307	34312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836642
562	NC_002488	GAC	2	6	34408	34413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836642
563	NC_002488	GTG	2	6	34417	34422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836642
564	NC_002488	TTGCG	2	10	34781	34790	0 %	40 %	40 %	20 %	15836643
565	NC_002488	TGC	2	6	34794	34799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836643
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568	NC_002488	GTA	3	9	35124	35132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836644
569	NC_002488	TGG	2	6	35155	35160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836644
570	NC_002488	TTA	2	6	35183	35188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836644
571	NC_002488	GAT	2	6	35200	35205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836644
572	NC_002488	ATG	3	9	35222	35230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836644
573	NC_002488	ACG	2	6	35270	35275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836644
574	NC_002488	CTG	2	6	35292	35297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836644
575	NC_002488	GTG	2	6	35370	35375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836644
576	NC_002488	AAT	2	6	35377	35382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836644
577	NC_002488	TGC	2	6	35416	35421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836644
578	NC_002488	CAC	2	6	35428	35433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836644
579	NC_002488	ATT	2	6	35822	35827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836645
580	NC_002488	GTA	2	6	35847	35852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836645
581	NC_002488	T	7	7	35903	35909	0 %	100 %	0 %	0 %	15836645
582	NC_002488	AAC	2	6	36006	36011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836645
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585	NC_002488	TGT	2	6	36085	36090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836645
586	NC_002488	ACT	2	6	36094	36099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836645
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588	NC_002488	GATC	2	8	36214	36221	25 %	25 %	25 %	25 %	15836646
589	NC_002488	TG	3	6	36263	36268	0 %	50 %	50 %	0 %	15836646
590	NC_002488	TTG	2	6	36269	36274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836646
591	NC_002488	AG	3	6	36290	36295	50 %	0 %	50 %	0 %	15836646
592	NC_002488	GTT	2	6	36384	36389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836646
593	NC_002488	TGA	2	6	36444	36449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836646
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596	NC_002488	GC	3	6	36505	36510	0 %	0 %	50 %	50 %	15836647
597	NC_002488	CGA	2	6	36544	36549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836647
598	NC_002488	AGCCAT	2	12	36567	36578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15836647
599	NC_002488	GGT	2	6	36620	36625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836647
600	NC_002488	GTTGGT	2	12	36641	36652	0 %	50 %	50 %	0 %	15836647
601	NC_002488	TG	3	6	36661	36666	0 %	50 %	50 %	0 %	15836647
602	NC_002488	GCAG	2	8	36680	36687	25 %	0 %	50 %	25 %	15836647
603	NC_002488	TGTTTG	2	12	36727	36738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836647
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605	NC_002488	GGTG	2	8	36808	36815	0 %	25 %	75 %	0 %	15836647
606	NC_002488	CAGG	2	8	36823	36830	25 %	0 %	50 %	25 %	15836647
607	NC_002488	TCA	2	6	36880	36885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836647
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609	NC_002488	TGG	2	6	37004	37009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836647
610	NC_002488	CCG	2	6	37032	37037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836647
611	NC_002488	GCC	2	6	37050	37055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836647
612	NC_002488	ACA	2	6	37069	37074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836647
613	NC_002488	TGC	2	6	37081	37086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836647
614	NC_002488	GTT	2	6	37142	37147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836647
615	NC_002488	TTG	2	6	37236	37241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836647
616	NC_002488	GTTTG	2	10	37254	37263	0 %	60 %	40 %	0 %	15836647
617	NC_002488	GTT	2	6	37289	37294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836647
618	NC_002488	TTCT	2	8	37299	37306	0 %	75 %	0 %	25 %	15836647
619	NC_002488	TGGG	2	8	37399	37406	0 %	25 %	75 %	0 %	15836647
620	NC_002488	CAG	3	9	37407	37415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836647
621	NC_002488	TGG	2	6	37416	37421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836647
622	NC_002488	GTTG	2	8	37559	37566	0 %	50 %	50 %	0 %	15836647
623	NC_002488	GGGT	2	8	37583	37590	0 %	25 %	75 %	0 %	15836647
624	NC_002488	CGG	2	6	37618	37623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836647
625	NC_002488	TTG	3	9	37677	37685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836647
626	NC_002488	GCT	2	6	37686	37691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836647
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628	NC_002488	TGC	2	6	37709	37714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836647
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