MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002488	AAC	2	6	349927	349932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836941
5502	NC_002488	GGT	2	6	349990	349995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836941
5503	NC_002488	ATTG	2	8	350035	350042	25 %	50 %	25 %	0 %	15836941
5504	NC_002488	TGG	2	6	350163	350168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836941
5505	NC_002488	CTT	2	6	350214	350219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836941
5506	NC_002488	ATAG	2	8	350712	350719	50 %	25 %	25 %	0 %	15836942
5507	NC_002488	CAAT	2	8	350733	350740	50 %	25 %	0 %	25 %	15836942
5508	NC_002488	AGG	2	6	350830	350835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836942
5509	NC_002488	ATTGT	2	10	350838	350847	20 %	60 %	20 %	0 %	15836942
5510	NC_002488	TGC	2	6	350897	350902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836942
5511	NC_002488	TA	3	6	350938	350943	50 %	50 %	0 %	0 %	15836942
5512	NC_002488	CATT	2	8	351133	351140	25 %	50 %	0 %	25 %	15836942
5513	NC_002488	TA	3	6	351342	351347	50 %	50 %	0 %	0 %	15836943
5514	NC_002488	T	6	6	351348	351353	0 %	100 %	0 %	0 %	15836943
5515	NC_002488	ATT	2	6	351358	351363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836943
5516	NC_002488	TAT	3	9	351370	351378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836943
5517	NC_002488	GTA	2	6	351392	351397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836943
5518	NC_002488	CATGA	2	10	351593	351602	40 %	20 %	20 %	20 %	15836944
5519	NC_002488	AAAG	2	8	351605	351612	75 %	0 %	25 %	0 %	15836944
5520	NC_002488	TGGT	2	8	351668	351675	0 %	50 %	50 %	0 %	15836944
5521	NC_002488	TGG	2	6	351680	351685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836944
5522	NC_002488	TA	3	6	351686	351691	50 %	50 %	0 %	0 %	15836944
5523	NC_002488	TAT	2	6	351712	351717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836944
5524	NC_002488	CGG	2	6	352124	352129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836945
5525	NC_002488	TTC	2	6	352130	352135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836945
5526	NC_002488	CTG	2	6	352143	352148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5527	NC_002488	TTTG	2	8	352153	352160	0 %	75 %	25 %	0 %	15836945
5528	NC_002488	CTT	2	6	352270	352275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836945
5529	NC_002488	AGC	2	6	352282	352287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5530	NC_002488	GCCA	2	8	352309	352316	25 %	0 %	25 %	50 %	15836945
5531	NC_002488	CCT	2	6	352359	352364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836945
5532	NC_002488	CATC	2	8	352451	352458	25 %	25 %	0 %	50 %	15836945
5533	NC_002488	GTC	2	6	352498	352503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5534	NC_002488	CTCCAT	2	12	352515	352526	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15836945
5535	NC_002488	GGCGGT	3	18	352556	352573	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15836945
5536	NC_002488	GGT	2	6	352592	352597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836945
5537	NC_002488	ACGC	2	8	352708	352715	25 %	0 %	25 %	50 %	15836945
5538	NC_002488	CAC	2	6	352731	352736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836945
5539	NC_002488	GCT	2	6	352768	352773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5540	NC_002488	AGC	2	6	352804	352809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5541	NC_002488	GCC	2	6	352813	352818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836945
5542	NC_002488	AAC	2	6	352895	352900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836945
5543	NC_002488	CGA	2	6	352940	352945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5544	NC_002488	TTG	2	6	352985	352990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836945
5545	NC_002488	TCGA	2	8	353027	353034	25 %	25 %	25 %	25 %	15836945
5546	NC_002488	TGA	2	6	353046	353051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836945
5547	NC_002488	A	6	6	353072	353077	100 %	0 %	0 %	0 %	15836945
5548	NC_002488	GAC	2	6	353094	353099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5549	NC_002488	ACC	2	6	353139	353144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836945
5550	NC_002488	GAT	2	6	353176	353181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836945
5551	NC_002488	ACC	2	6	353188	353193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836945
5552	NC_002488	CAG	2	6	353194	353199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5553	NC_002488	GCA	2	6	353201	353206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836945
5554	NC_002488	A	6	6	353252	353257	100 %	0 %	0 %	0 %	15836945
5555	NC_002488	TGT	2	6	353268	353273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836945
5556	NC_002488	CTC	2	6	353411	353416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836946
5557	NC_002488	ATA	2	6	353436	353441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15836946
5558	NC_002488	T	6	6	353554	353559	0 %	100 %	0 %	0 %	15836947
5559	NC_002488	TTTGCA	2	12	354294	354305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15836948
5560	NC_002488	TGAC	2	8	354359	354366	25 %	25 %	25 %	25 %	15836948
5561	NC_002488	AAGTG	2	10	354368	354377	40 %	20 %	40 %	0 %	15836948
5562	NC_002488	CGCA	2	8	355204	355211	25 %	0 %	25 %	50 %	15836949
5563	NC_002488	TGC	2	6	355213	355218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836949
5564	NC_002488	AAC	3	9	355495	355503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836949
5565	NC_002488	TCCA	2	8	355588	355595	25 %	25 %	0 %	50 %	15836949
5566	NC_002488	AT	3	6	355653	355658	50 %	50 %	0 %	0 %	15836949
5567	NC_002488	CAG	2	6	355693	355698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836949
5568	NC_002488	CAG	2	6	355738	355743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836949
5569	NC_002488	GCGGCA	2	12	355814	355825	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15836949
5570	NC_002488	ACGC	2	8	355845	355852	25 %	0 %	25 %	50 %	15836949
5571	NC_002488	TTGTGG	2	12	355867	355878	0 %	50 %	50 %	0 %	15836949
5572	NC_002488	CGA	2	6	355899	355904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836949
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5574	NC_002488	TTC	2	6	355964	355969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836949
5575	NC_002488	CGA	2	6	356016	356021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836949
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5577	NC_002488	TGG	2	6	356128	356133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836949
5578	NC_002488	A	6	6	356136	356141	100 %	0 %	0 %	0 %	15836949
5579	NC_002488	TTG	2	6	356161	356166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836949
5580	NC_002488	TTG	2	6	356174	356179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836949
5581	NC_002488	ATC	2	6	356209	356214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836949
5582	NC_002488	AGC	2	6	356219	356224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836949
5583	NC_002488	CGA	2	6	356226	356231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836949
5584	NC_002488	GCC	2	6	356263	356268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836949
5585	NC_002488	CAC	2	6	356283	356288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836949
5586	NC_002488	GGCA	2	8	356340	356347	25 %	0 %	50 %	25 %	15836949
5587	NC_002488	GTC	2	6	356419	356424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836949
5588	NC_002488	GGC	2	6	356436	356441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836949
5589	NC_002488	AGT	2	6	356491	356496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836949
5590	NC_002488	CCA	2	6	356899	356904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836950
5591	NC_002488	GGGGA	2	10	356930	356939	20 %	0 %	80 %	0 %	15836950
5592	NC_002488	CAT	2	6	356949	356954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836950
5593	NC_002488	CTT	2	6	356966	356971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836950
5594	NC_002488	TCA	2	6	357129	357134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836951
5595	NC_002488	TCA	2	6	357152	357157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836951
5596	NC_002488	AAG	2	6	357210	357215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836951
5597	NC_002488	T	6	6	357237	357242	0 %	100 %	0 %	0 %	15836952
5598	NC_002488	TGAT	2	8	357284	357291	25 %	50 %	25 %	0 %	15836952
5599	NC_002488	ATTG	2	8	357434	357441	25 %	50 %	25 %	0 %	15836953
5600	NC_002488	TGC	2	6	357450	357455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836953
5601	NC_002488	AC	4	8	357488	357495	50 %	0 %	0 %	50 %	15836953
5602	NC_002488	GAT	2	6	357496	357501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836953
5603	NC_002488	CAGA	2	8	357881	357888	50 %	0 %	25 %	25 %	15836954
5604	NC_002488	CGC	2	6	357892	357897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836954
5605	NC_002488	GCT	2	6	357953	357958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836954
5606	NC_002488	CTGTGG	2	12	358065	358076	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15836954
5607	NC_002488	GCG	2	6	358121	358126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836954
5608	NC_002488	CGC	2	6	358174	358179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15836954
5609	NC_002488	TGG	2	6	358206	358211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836954
5610	NC_002488	AGC	2	6	358258	358263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836954
5611	NC_002488	TGT	2	6	358284	358289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836954
5612	NC_002488	TGATCA	2	12	358314	358325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15836954
5613	NC_002488	GC	3	6	358362	358367	0 %	0 %	50 %	50 %	15836954
5614	NC_002488	TGGCA	2	10	358438	358447	20 %	20 %	40 %	20 %	15836954
5615	NC_002488	TGA	2	6	358449	358454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836954
5616	NC_002488	TGCAT	2	10	358483	358492	20 %	40 %	20 %	20 %	15836954
5617	NC_002488	CAT	2	6	358507	358512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836954
5618	NC_002488	CAAC	2	8	358528	358535	50 %	0 %	0 %	50 %	15836954
5619	NC_002488	GCA	2	6	358606	358611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836954
5620	NC_002488	ACA	2	6	358650	358655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836954
5621	NC_002488	ACG	2	6	358662	358667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836954
5622	NC_002488	GATG	2	8	358690	358697	25 %	25 %	50 %	0 %	15836954
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5624	NC_002488	GC	3	6	358968	358973	0 %	0 %	50 %	50 %	15836954
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5996	NC_002488	TGA	2	6	380765	380770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836973
5997	NC_002488	TGC	2	6	380837	380842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836973
5998	NC_002488	GTGGC	2	10	380851	380860	0 %	20 %	60 %	20 %	15836973
5999	NC_002488	CG	3	6	380869	380874	0 %	0 %	50 %	50 %	15836973
6000	NC_002488	GAT	2	6	380988	380993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836973

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