MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 46937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002488	GAA	2	6	322689	322694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836912
5002	NC_002488	TGC	2	6	322700	322705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836912
5003	NC_002488	GAT	2	6	322721	322726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836912
5004	NC_002488	GTT	2	6	322778	322783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836912
5005	NC_002488	CGG	2	6	322920	322925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836913
5006	NC_002488	GTG	3	9	323012	323020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836913
5007	NC_002488	AT	3	6	323076	323081	50 %	50 %	0 %	0 %	15836913
5008	NC_002488	GTG	2	6	323155	323160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836913
5009	NC_002488	CCA	2	6	323229	323234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836913
5010	NC_002488	AC	3	6	323276	323281	50 %	0 %	0 %	50 %	15836913
5011	NC_002488	GATATC	2	12	323320	323331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15836913
5012	NC_002488	TGGTGC	2	12	323343	323354	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15836913
5013	NC_002488	AAG	2	6	323401	323406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836913
5014	NC_002488	C	6	6	323425	323430	0 %	0 %	0 %	100 %	15836913
5015	NC_002488	CAA	2	6	323472	323477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836913
5016	NC_002488	GCCA	2	8	323499	323506	25 %	0 %	25 %	50 %	15836913
5017	NC_002488	TCT	2	6	323570	323575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836913
5018	NC_002488	GTGC	2	8	323586	323593	0 %	25 %	50 %	25 %	15836913
5019	NC_002488	CAC	2	6	323625	323630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15836913
5020	NC_002488	TGA	2	6	323634	323639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836913
5021	NC_002488	G	6	6	323697	323702	0 %	0 %	100 %	0 %	15836913
5022	NC_002488	AC	3	6	323759	323764	50 %	0 %	0 %	50 %	15836913
5023	NC_002488	G	7	7	323793	323799	0 %	0 %	100 %	0 %	15836913
5024	NC_002488	TGA	2	6	323811	323816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836913
5025	NC_002488	TGT	2	6	323824	323829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836913
5026	NC_002488	TGCC	2	8	323838	323845	0 %	25 %	25 %	50 %	15836913
5027	NC_002488	T	6	6	323857	323862	0 %	100 %	0 %	0 %	15836913
5028	NC_002488	CCGTG	2	10	323890	323899	0 %	20 %	40 %	40 %	15836913
5029	NC_002488	GGCCA	2	10	323944	323953	20 %	0 %	40 %	40 %	15836913
5030	NC_002488	GGA	2	6	323958	323963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836913
5031	NC_002488	AGT	2	6	323979	323984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836913
5032	NC_002488	TAC	2	6	324082	324087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836913
5033	NC_002488	GGTC	2	8	324097	324104	0 %	25 %	50 %	25 %	15836913
5034	NC_002488	ATT	2	6	324228	324233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836914
5035	NC_002488	TGTCGA	2	12	324320	324331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15836914
5036	NC_002488	AGCGT	2	10	324421	324430	20 %	20 %	40 %	20 %	15836914
5037	NC_002488	TCA	2	6	324445	324450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836914
5038	NC_002488	ATC	2	6	324451	324456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836914
5039	NC_002488	GCGAGT	2	12	324487	324498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15836914
5040	NC_002488	TG	3	6	324627	324632	0 %	50 %	50 %	0 %	15836914
5041	NC_002488	GTAT	2	8	324673	324680	25 %	50 %	25 %	0 %	15836914
5042	NC_002488	GA	3	6	324685	324690	50 %	0 %	50 %	0 %	15836914
5043	NC_002488	TTA	2	6	324724	324729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836914
5044	NC_002488	TG	3	6	324755	324760	0 %	50 %	50 %	0 %	15836914
5045	NC_002488	CGGT	2	8	324763	324770	0 %	25 %	50 %	25 %	15836914
5046	NC_002488	CGATG	2	10	324845	324854	20 %	20 %	40 %	20 %	15836914
5047	NC_002488	TACG	2	8	324895	324902	25 %	25 %	25 %	25 %	15836914
5048	NC_002488	GTTG	2	8	324934	324941	0 %	50 %	50 %	0 %	15836914
5049	NC_002488	TGATCG	2	12	324944	324955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15836914
5050	NC_002488	CGG	2	6	324979	324984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836914
5051	NC_002488	AAG	2	6	325005	325010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836914
5052	NC_002488	GT	3	6	325048	325053	0 %	50 %	50 %	0 %	15836914
5053	NC_002488	CCGCTG	2	12	325054	325065	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15836914
5054	NC_002488	CGAA	2	8	325123	325130	50 %	0 %	25 %	25 %	15836914
5055	NC_002488	TTG	2	6	325140	325145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836914
5056	NC_002488	ATC	2	6	325183	325188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836914
5057	NC_002488	GTC	2	6	325272	325277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836914
5058	NC_002488	GTT	2	6	325310	325315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836914
5059	NC_002488	TCC	2	6	325421	325426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836914
5060	NC_002488	GCG	2	6	325455	325460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836914
5061	NC_002488	GCG	2	6	325470	325475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836914
5062	NC_002488	GTG	2	6	325491	325496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836914
5063	NC_002488	GCGG	2	8	325544	325551	0 %	0 %	75 %	25 %	15836914
5064	NC_002488	GCG	2	6	325581	325586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836914
5065	NC_002488	GT	3	6	325636	325641	0 %	50 %	50 %	0 %	15836914
5066	NC_002488	TGC	3	9	325658	325666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836914
5067	NC_002488	TGT	2	6	325696	325701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836914
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5069	NC_002488	GGT	2	6	325769	325774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836914
5070	NC_002488	TTA	2	6	325839	325844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836914
5071	NC_002488	GGC	2	6	325889	325894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836914
5072	NC_002488	GGC	2	6	325902	325907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836914
5073	NC_002488	TGC	2	6	325942	325947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836914
5074	NC_002488	GGTTTT	2	12	325977	325988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836914
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5076	NC_002488	TGCG	2	8	326005	326012	0 %	25 %	50 %	25 %	15836914
5077	NC_002488	AGG	2	6	326068	326073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15836914
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5079	NC_002488	CGT	2	6	326117	326122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836914
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5081	NC_002488	GCT	2	6	326130	326135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836914
5082	NC_002488	GCT	2	6	326241	326246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836914
5083	NC_002488	GTG	2	6	326265	326270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836914
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5085	NC_002488	TGTGG	2	10	326503	326512	0 %	40 %	60 %	0 %	161378174
5086	NC_002488	ATGT	2	8	326555	326562	25 %	50 %	25 %	0 %	161378174
5087	NC_002488	GTT	2	6	326665	326670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161378174
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5089	NC_002488	CGT	2	6	326701	326706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161378174
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5091	NC_002488	TTG	2	6	326759	326764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161378174
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5094	NC_002488	GCTTT	2	10	326886	326895	0 %	60 %	20 %	20 %	161378174
5095	NC_002488	TGA	2	6	326904	326909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161378174
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5099	NC_002488	T	7	7	327126	327132	0 %	100 %	0 %	0 %	161378174
5100	NC_002488	T	7	7	327180	327186	0 %	100 %	0 %	0 %	161378174
5101	NC_002488	GGTT	2	8	327194	327201	0 %	50 %	50 %	0 %	161378174
5102	NC_002488	TTGA	2	8	327242	327249	25 %	50 %	25 %	0 %	161378174
5103	NC_002488	GGT	2	6	327263	327268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161378174
5104	NC_002488	T	6	6	327296	327301	0 %	100 %	0 %	0 %	161378174
5105	NC_002488	TG	3	6	327397	327402	0 %	50 %	50 %	0 %	161378174
5106	NC_002488	TGA	2	6	327459	327464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836916
5107	NC_002488	CTG	2	6	327491	327496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836916
5108	NC_002488	TGCA	2	8	327609	327616	25 %	25 %	25 %	25 %	15836916
5109	NC_002488	TTGC	2	8	327651	327658	0 %	50 %	25 %	25 %	15836916
5110	NC_002488	CGT	2	6	327728	327733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836916
5111	NC_002488	AG	3	6	327787	327792	50 %	0 %	50 %	0 %	15836916
5112	NC_002488	CGT	2	6	327920	327925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836916
5113	NC_002488	ATG	2	6	327954	327959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836917
5114	NC_002488	CGCTGT	2	12	327992	328003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836917
5115	NC_002488	TCA	2	6	328021	328026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836917
5116	NC_002488	TTGT	2	8	328167	328174	0 %	75 %	25 %	0 %	15836917
5117	NC_002488	TGA	2	6	328177	328182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836917
5118	NC_002488	TGG	2	6	328246	328251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836917
5119	NC_002488	TGG	2	6	328273	328278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836917
5120	NC_002488	TGC	3	9	328328	328336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836917
5121	NC_002488	GCT	2	6	328341	328346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836917
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5123	NC_002488	GAA	2	6	328554	328559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15836917
5124	NC_002488	CAA	2	6	328592	328597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836917
5125	NC_002488	TCT	2	6	328636	328641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836918
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5127	NC_002488	TGT	2	6	328734	328739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836918
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5129	NC_002488	TGC	3	9	328825	328833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15836918
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5132	NC_002488	TG	3	6	329043	329048	0 %	50 %	50 %	0 %	15836919
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5137	NC_002488	T	6	6	329295	329300	0 %	100 %	0 %	0 %	15836919
5138	NC_002488	TC	3	6	329308	329313	0 %	50 %	0 %	50 %	15836919
5139	NC_002488	TGA	2	6	329341	329346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15836919
5140	NC_002488	CAA	2	6	329348	329353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15836919
5141	NC_002488	GTT	2	6	329363	329368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836919
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5143	NC_002488	ATT	2	6	329536	329541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836919
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5148	NC_002488	TTTG	2	8	329674	329681	0 %	75 %	25 %	0 %	15836919
5149	NC_002488	GTT	2	6	329828	329833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836919
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5151	NC_002488	GTT	2	6	329864	329869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836919
5152	NC_002488	GTG	2	6	329934	329939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836919
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5154	NC_002488	CGG	2	6	330001	330006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836919
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5159	NC_002488	GGGC	2	8	330110	330117	0 %	0 %	75 %	25 %	15836919
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5163	NC_002488	CGG	2	6	330290	330295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15836919
5164	NC_002488	TTG	2	6	330327	330332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15836919
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5215	NC_002488	TTGAT	2	10	332539	332548	20 %	60 %	20 %	0 %	15836920
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5217	NC_002488	ACT	2	6	332571	332576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836920
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5231	NC_002488	TTGTT	2	10	333365	333374	0 %	80 %	20 %	0 %	15836921
5232	NC_002488	GCA	2	6	333397	333402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836921
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5240	NC_002488	GAC	2	6	333718	333723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836921
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5242	NC_002488	TCC	2	6	333798	333803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15836921
5243	NC_002488	CTT	2	6	333804	333809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15836921
5244	NC_002488	G	6	6	333852	333857	0 %	0 %	100 %	0 %	15836921
5245	NC_002488	TAT	2	6	333910	333915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15836921
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5494	NC_002488	GTG	2	6	349415	349420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836941
5495	NC_002488	CTCGT	2	10	349433	349442	0 %	40 %	20 %	40 %	15836941
5496	NC_002488	ACT	2	6	349453	349458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15836941
5497	NC_002488	TGGC	2	8	349548	349555	0 %	25 %	50 %	25 %	15836941
5498	NC_002488	GTG	2	6	349715	349720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15836941
5499	NC_002488	CAG	2	6	349735	349740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15836941
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