MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw58

Total Repeats: 1192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020817	CGT	2	6	25581	25586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265518
502	NC_020817	GC	3	6	25602	25607	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
503	NC_020817	GGC	2	6	25608	25613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265518
504	NC_020817	CG	3	6	25614	25619	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
505	NC_020817	TGG	2	6	25639	25644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265518
506	NC_020817	G	7	7	25647	25653	0 %	0 %	100 %	0 %	471265518
507	NC_020817	CCG	2	6	25801	25806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265518
508	NC_020817	CCG	2	6	25859	25864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265518
509	NC_020817	GCC	2	6	25886	25891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265518
510	NC_020817	CGAA	2	8	25982	25989	50 %	0 %	25 %	25 %	471265518
511	NC_020817	CGA	2	6	26107	26112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_020817	GGA	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265519
513	NC_020817	T	7	7	26219	26225	0 %	100 %	0 %	0 %	471265519
514	NC_020817	CCAT	2	8	26276	26283	25 %	25 %	0 %	50 %	471265519
515	NC_020817	CG	3	6	26291	26296	0 %	0 %	50 %	50 %	471265519
516	NC_020817	CGG	2	6	26326	26331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265519
517	NC_020817	AAAG	2	8	26362	26369	75 %	0 %	25 %	0 %	471265519
518	NC_020817	ACT	2	6	26400	26405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265519
519	NC_020817	CAC	2	6	26485	26490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265519
520	NC_020817	CGGT	2	8	26507	26514	0 %	25 %	50 %	25 %	471265519
521	NC_020817	CTG	2	6	26592	26597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265519
522	NC_020817	GGC	2	6	26647	26652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265519
523	NC_020817	CGC	2	6	26655	26660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265519
524	NC_020817	CGC	2	6	26716	26721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_020817	GCG	2	6	26737	26742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020817	GC	3	6	26811	26816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_020817	GCT	2	6	26821	26826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020817	GCC	2	6	26889	26894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_020817	GCCG	2	8	26973	26980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_020817	TGGC	2	8	27151	27158	0 %	25 %	50 %	25 %	471265520
531	NC_020817	TGC	2	6	27211	27216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265520
532	NC_020817	GC	3	6	27269	27274	0 %	0 %	50 %	50 %	471265520
533	NC_020817	CGG	2	6	27431	27436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265520
534	NC_020817	CGA	2	6	27443	27448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265520
535	NC_020817	CGT	2	6	27478	27483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265520
536	NC_020817	GGC	2	6	27604	27609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265521
537	NC_020817	CTG	2	6	27617	27622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265521
538	NC_020817	GCGA	2	8	27662	27669	25 %	0 %	50 %	25 %	471265521
539	NC_020817	GATC	2	8	27718	27725	25 %	25 %	25 %	25 %	471265521
540	NC_020817	CAGG	2	8	27733	27740	25 %	0 %	50 %	25 %	471265521
541	NC_020817	TCG	2	6	27741	27746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265521
542	NC_020817	CGG	2	6	27801	27806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265521
543	NC_020817	GGC	2	6	27810	27815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265521
544	NC_020817	GTCT	2	8	27856	27863	0 %	50 %	25 %	25 %	471265521
545	NC_020817	GCA	2	6	27913	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265521
546	NC_020817	CTT	2	6	27962	27967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020817	CGC	2	6	28019	28024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_020817	CGC	2	6	28071	28076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_020817	TGG	2	6	28196	28201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265522
550	NC_020817	CTG	2	6	28293	28298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265522
551	NC_020817	CGG	2	6	28307	28312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265522
552	NC_020817	TGA	2	6	28313	28318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265522
553	NC_020817	GCG	3	9	28348	28356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265522
554	NC_020817	GC	3	6	28412	28417	0 %	0 %	50 %	50 %	471265522
555	NC_020817	GCC	2	6	28436	28441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265522
556	NC_020817	GTG	3	9	28450	28458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265522
557	NC_020817	CGAA	2	8	28476	28483	50 %	0 %	25 %	25 %	471265522
558	NC_020817	GC	3	6	28505	28510	0 %	0 %	50 %	50 %	471265522
559	NC_020817	GCC	2	6	28556	28561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265522
560	NC_020817	GCGCA	2	10	28674	28683	20 %	0 %	40 %	40 %	471265522
561	NC_020817	CCG	2	6	28709	28714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265522
562	NC_020817	TCCG	2	8	28769	28776	0 %	25 %	25 %	50 %	471265522
563	NC_020817	CGAC	2	8	28834	28841	25 %	0 %	25 %	50 %	471265522
564	NC_020817	AT	3	6	28875	28880	50 %	50 %	0 %	0 %	471265522
565	NC_020817	AG	3	6	28924	28929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020817	TCA	2	6	28958	28963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_020817	TGCC	2	8	28988	28995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_020817	CTT	2	6	29088	29093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020817	GCC	2	6	29137	29142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_020817	TC	3	6	29254	29259	0 %	50 %	0 %	50 %	471265523
571	NC_020817	TATG	2	8	29290	29297	25 %	50 %	25 %	0 %	471265523
572	NC_020817	GCG	2	6	29384	29389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265523
573	NC_020817	TGC	2	6	29398	29403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265523
574	NC_020817	GCA	2	6	29496	29501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265523
575	NC_020817	CGC	2	6	29540	29545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265523
576	NC_020817	GTT	2	6	29556	29561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265523
577	NC_020817	GCCGA	2	10	29733	29742	20 %	0 %	40 %	40 %	471265524
578	NC_020817	GCGCC	2	10	29795	29804	0 %	0 %	40 %	60 %	471265524
579	NC_020817	GCCG	2	8	29975	29982	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
580	NC_020817	ATC	2	6	29997	30002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265525
581	NC_020817	GGC	2	6	30006	30011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265525
582	NC_020817	CGA	2	6	30092	30097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
583	NC_020817	CTA	2	6	30104	30109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265525
584	NC_020817	CGA	2	6	30140	30145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
585	NC_020817	GACC	2	8	30164	30171	25 %	0 %	25 %	50 %	471265525
586	NC_020817	AGC	2	6	30193	30198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
587	NC_020817	CGT	2	6	30230	30235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265525
588	NC_020817	AAG	2	6	30292	30297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265525
589	NC_020817	CGT	2	6	30308	30313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265525
590	NC_020817	AACG	2	8	30333	30340	50 %	0 %	25 %	25 %	471265525
591	NC_020817	CCG	2	6	30362	30367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265525
592	NC_020817	GAA	2	6	30372	30377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265525
593	NC_020817	GGC	2	6	30383	30388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265525
594	NC_020817	GAC	2	6	30426	30431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
595	NC_020817	CAA	2	6	30473	30478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265525
596	NC_020817	GCA	2	6	30567	30572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
597	NC_020817	CGAGCG	2	12	30590	30601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	471265525
598	NC_020817	ACA	2	6	30626	30631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265525
599	NC_020817	GAT	2	6	30659	30664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265525
600	NC_020817	GCCGA	2	10	30673	30682	20 %	0 %	40 %	40 %	471265525
601	NC_020817	GC	3	6	30714	30719	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
602	NC_020817	GCA	2	6	30731	30736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
603	NC_020817	GCCG	2	8	30752	30759	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
604	NC_020817	CGGC	2	8	30779	30786	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
605	NC_020817	GC	3	6	30800	30805	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
606	NC_020817	CGA	2	6	30848	30853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265525
607	NC_020817	CAGT	2	8	30867	30874	25 %	25 %	25 %	25 %	471265525
608	NC_020817	GCCG	2	8	30882	30889	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
609	NC_020817	ACGA	2	8	30907	30914	50 %	0 %	25 %	25 %	471265525
610	NC_020817	CCG	2	6	30932	30937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265525
611	NC_020817	GCT	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265525
612	NC_020817	AGAT	2	8	31071	31078	50 %	25 %	25 %	0 %	471265525
613	NC_020817	GCG	2	6	31083	31088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_020817	GCC	2	6	31100	31105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_020817	A	6	6	31233	31238	100 %	0 %	0 %	0 %	471265526
616	NC_020817	CCGG	2	8	31241	31248	0 %	0 %	50 %	50 %	471265526
617	NC_020817	TCA	2	6	31279	31284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265526
618	NC_020817	AGC	2	6	31310	31315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265526
619	NC_020817	AGGA	2	8	31340	31347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020817	GAA	2	6	31358	31363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265527
621	NC_020817	CAC	2	6	31428	31433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265527
622	NC_020817	CCA	2	6	31452	31457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265527
623	NC_020817	CTACC	2	10	31505	31514	20 %	20 %	0 %	60 %	471265527
624	NC_020817	CCG	2	6	31551	31556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265527
625	NC_020817	C	6	6	31592	31597	0 %	0 %	0 %	100 %	471265527
626	NC_020817	GGC	2	6	31637	31642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265527
627	NC_020817	CG	4	8	31703	31710	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
628	NC_020817	GAC	3	9	31761	31769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265527
629	NC_020817	GCG	2	6	31852	31857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265527
630	NC_020817	TTG	2	6	31867	31872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265527
631	NC_020817	CAA	2	6	31908	31913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265527
632	NC_020817	GGC	2	6	32052	32057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265527
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636	NC_020817	GC	3	6	32291	32296	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
637	NC_020817	GCATC	2	10	32360	32369	20 %	20 %	20 %	40 %	471265527
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643	NC_020817	C	6	6	32695	32700	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
644	NC_020817	C	7	7	32775	32781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
645	NC_020817	TA	4	8	32815	32822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_020817	CCG	2	6	32908	32913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265528
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753	NC_020817	ACC	2	6	38327	38332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265537
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886	NC_020817	TGC	2	6	43954	43959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265545
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