MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 130605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020815	CGC	2	6	40930	40935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_020815	GC	3	6	40937	40942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_020815	CGC	2	6	40957	40962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_020815	GGA	2	6	40965	40970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020815	GAC	2	6	40983	40988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_020815	CG	4	8	41176	41183	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1007	NC_020815	GC	3	6	41195	41200	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1008	NC_020815	GTC	2	6	41240	41245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1009	NC_020815	CCG	2	6	41335	41340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1010	NC_020815	CGCCTT	2	12	41344	41355	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	471265603
1011	NC_020815	CTG	2	6	41360	41365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1012	NC_020815	GCC	2	6	41510	41515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1013	NC_020815	GGCC	2	8	41527	41534	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1014	NC_020815	GCG	2	6	41588	41593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265603
1015	NC_020815	TTG	2	6	41625	41630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265603
1016	NC_020815	CGC	2	6	41656	41661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1017	NC_020815	GATA	2	8	41697	41704	50 %	25 %	25 %	0 %	471265603
1018	NC_020815	GCA	2	6	41770	41775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1019	NC_020815	ACC	2	6	41826	41831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265603
1020	NC_020815	CCACG	2	10	41846	41855	20 %	0 %	20 %	60 %	471265603
1021	NC_020815	TGGTC	2	10	41938	41947	0 %	40 %	40 %	20 %	471265603
1022	NC_020815	GGT	2	6	41948	41953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265603
1023	NC_020815	GCC	2	6	42050	42055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1024	NC_020815	GTA	2	6	42110	42115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265603
1025	NC_020815	TGA	2	6	42151	42156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265603
1026	NC_020815	GCC	2	6	42218	42223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1027	NC_020815	GCC	2	6	42236	42241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1028	NC_020815	CAC	2	6	42254	42259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265603
1029	NC_020815	TGT	2	6	42277	42282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265603
1030	NC_020815	GC	5	10	42366	42375	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1031	NC_020815	GCC	2	6	42419	42424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1032	NC_020815	CCAGCC	2	12	42428	42439	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	471265603
1033	NC_020815	CGC	2	6	42487	42492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1034	NC_020815	GGT	2	6	42512	42517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265603
1035	NC_020815	CG	4	8	42550	42557	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1036	NC_020815	CAG	2	6	42617	42622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1037	NC_020815	GC	3	6	42671	42676	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1038	NC_020815	A	6	6	42681	42686	100 %	0 %	0 %	0 %	471265603
1039	NC_020815	CAC	2	6	42716	42721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265603
1040	NC_020815	GTT	2	6	42722	42727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265603
1041	NC_020815	GGT	2	6	42797	42802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265603
1042	NC_020815	TGT	2	6	42844	42849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265603
1043	NC_020815	CTGAT	2	10	42945	42954	20 %	40 %	20 %	20 %	471265603
1044	NC_020815	GC	3	6	42974	42979	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1045	NC_020815	CAG	2	6	42980	42985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1046	NC_020815	GGC	2	6	42989	42994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265603
1047	NC_020815	GGT	2	6	43010	43015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265603
1048	NC_020815	GCC	3	9	43064	43072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1049	NC_020815	CGC	2	6	43085	43090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1050	NC_020815	GGTT	2	8	43092	43099	0 %	50 %	50 %	0 %	471265603
1051	NC_020815	TGGC	2	8	43102	43109	0 %	25 %	50 %	25 %	471265603
1052	NC_020815	TGCC	2	8	43111	43118	0 %	25 %	25 %	50 %	471265603
1053	NC_020815	GGC	2	6	43119	43124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265603
1054	NC_020815	TG	3	6	43137	43142	0 %	50 %	50 %	0 %	471265603
1055	NC_020815	TGC	2	6	43198	43203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1056	NC_020815	T	6	6	43285	43290	0 %	100 %	0 %	0 %	471265603
1057	NC_020815	CG	3	6	43356	43361	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1058	NC_020815	CCA	2	6	43372	43377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265603
1059	NC_020815	CGC	2	6	43387	43392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265603
1060	NC_020815	GGTG	2	8	43409	43416	0 %	25 %	75 %	0 %	471265603
1061	NC_020815	GAA	2	6	43439	43444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265603
1062	NC_020815	GGTTCT	2	12	43477	43488	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	471265603
1063	NC_020815	CG	3	6	43600	43605	0 %	0 %	50 %	50 %	471265603
1064	NC_020815	CCGA	2	8	43698	43705	25 %	0 %	25 %	50 %	471265603
1065	NC_020815	CGG	2	6	43834	43839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265603
1066	NC_020815	GGC	2	6	43850	43855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265603
1067	NC_020815	CAG	2	6	43871	43876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265603
1068	NC_020815	TTC	2	6	43920	43925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265603
1069	NC_020815	TCCCT	2	10	43933	43942	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1070	NC_020815	GCGCG	2	10	43997	44006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1071	NC_020815	GACG	2	8	44026	44033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_020815	GCC	2	6	44113	44118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_020815	TGC	2	6	44167	44172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020815	ATC	2	6	44217	44222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265604
1075	NC_020815	GTGCAG	2	12	44243	44254	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471265604
1076	NC_020815	GAA	2	6	44273	44278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265604
1077	NC_020815	CCGG	2	8	44295	44302	0 %	0 %	50 %	50 %	471265604
1078	NC_020815	GATG	2	8	44308	44315	25 %	25 %	50 %	0 %	471265604
1079	NC_020815	CATG	2	8	44316	44323	25 %	25 %	25 %	25 %	471265604
1080	NC_020815	CAC	2	6	44324	44329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265604
1081	NC_020815	GCC	2	6	44339	44344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265604
1082	NC_020815	GC	3	6	44346	44351	0 %	0 %	50 %	50 %	471265604
1083	NC_020815	CG	3	6	44370	44375	0 %	0 %	50 %	50 %	471265604
1084	NC_020815	TGC	2	6	44453	44458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265604
1085	NC_020815	GCC	2	6	44461	44466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265604
1086	NC_020815	ACC	2	6	44467	44472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265604
1087	NC_020815	GGC	2	6	44577	44582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265604
1088	NC_020815	CTG	2	6	44596	44601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265604
1089	NC_020815	GCGGT	2	10	44606	44615	0 %	20 %	60 %	20 %	471265604
1090	NC_020815	CGGCT	2	10	44635	44644	0 %	20 %	40 %	40 %	471265604
1091	NC_020815	GGC	2	6	44673	44678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265604
1092	NC_020815	CCA	2	6	44696	44701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265604
1093	NC_020815	GTG	2	6	44704	44709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265604
1094	NC_020815	GGC	2	6	44904	44909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265604
1095	NC_020815	GTG	2	6	44952	44957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265604
1096	NC_020815	CCCG	2	8	44970	44977	0 %	0 %	25 %	75 %	471265604
1097	NC_020815	CAA	2	6	44980	44985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265604
1098	NC_020815	TGC	2	6	45068	45073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265604
1099	NC_020815	TCA	2	6	45110	45115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265604
1100	NC_020815	TGG	2	6	45127	45132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265604
1101	NC_020815	TTC	2	6	45133	45138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265604
1102	NC_020815	CTG	2	6	45184	45189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265604
1103	NC_020815	GCA	2	6	45236	45241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265604
1104	NC_020815	CGG	2	6	45246	45251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265604
1105	NC_020815	CG	3	6	45273	45278	0 %	0 %	50 %	50 %	471265604
1106	NC_020815	CGCA	2	8	45297	45304	25 %	0 %	25 %	50 %	471265604
1107	NC_020815	GGT	2	6	45333	45338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265604
1108	NC_020815	TGGC	2	8	45373	45380	0 %	25 %	50 %	25 %	471265604
1109	NC_020815	CCG	2	6	45404	45409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265604
1110	NC_020815	GGT	2	6	45480	45485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265604
1111	NC_020815	CGG	2	6	45492	45497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265604
1112	NC_020815	CGGTG	2	10	45504	45513	0 %	20 %	60 %	20 %	471265604
1113	NC_020815	GGC	2	6	45514	45519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265604
1114	NC_020815	CTG	2	6	45604	45609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265604
1115	NC_020815	TGCC	2	8	45659	45666	0 %	25 %	25 %	50 %	471265604
1116	NC_020815	GC	3	6	45709	45714	0 %	0 %	50 %	50 %	471265605
1117	NC_020815	GGC	2	6	45736	45741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265605
1118	NC_020815	CAC	2	6	45768	45773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265605
1119	NC_020815	GC	3	6	45813	45818	0 %	0 %	50 %	50 %	471265605
1120	NC_020815	CGG	2	6	45868	45873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265605
1121	NC_020815	CAG	2	6	45995	46000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265605
1122	NC_020815	CGGC	2	8	46022	46029	0 %	0 %	50 %	50 %	471265605
1123	NC_020815	GCC	2	6	46061	46066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265605
1124	NC_020815	CTG	2	6	46094	46099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265605
1125	NC_020815	GGT	2	6	46102	46107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265605
1126	NC_020815	CGG	3	9	46147	46155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265605
1127	NC_020815	G	6	6	46174	46179	0 %	0 %	100 %	0 %	471265605
1128	NC_020815	GC	3	6	46226	46231	0 %	0 %	50 %	50 %	471265605
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1252	NC_020815	TGC	2	6	51220	51225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1253	NC_020815	ATC	2	6	51238	51243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265609
1254	NC_020815	GCG	2	6	51306	51311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1255	NC_020815	GC	5	10	51315	51324	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1256	NC_020815	GC	3	6	51326	51331	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1257	NC_020815	TGCA	2	8	51337	51344	25 %	25 %	25 %	25 %	471265609
1258	NC_020815	CCG	2	6	51406	51411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1259	NC_020815	GTC	2	6	51420	51425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1260	NC_020815	GCC	2	6	51494	51499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1261	NC_020815	CAG	2	6	51545	51550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
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1263	NC_020815	GC	3	6	51613	51618	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1264	NC_020815	GGC	2	6	51636	51641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1265	NC_020815	CGG	2	6	51646	51651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1266	NC_020815	CTG	2	6	51906	51911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1267	NC_020815	CGA	2	6	51974	51979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
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1270	NC_020815	AGCG	2	8	52119	52126	25 %	0 %	50 %	25 %	471265609
1271	NC_020815	GCCGC	2	10	52141	52150	0 %	0 %	40 %	60 %	471265609
1272	NC_020815	GC	3	6	52149	52154	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1273	NC_020815	TCA	2	6	52210	52215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265609
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1275	NC_020815	TGG	2	6	52300	52305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265609
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1277	NC_020815	CGTG	2	8	52388	52395	0 %	25 %	50 %	25 %	471265609
1278	NC_020815	CGC	2	6	52612	52617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265610
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1280	NC_020815	TGG	2	6	52728	52733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265610
1281	NC_020815	TGA	2	6	52767	52772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265610
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1283	NC_020815	CGT	2	6	52793	52798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265610
1284	NC_020815	GGTC	2	8	52864	52871	0 %	25 %	50 %	25 %	471265610
1285	NC_020815	TTC	2	6	52907	52912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265610
1286	NC_020815	ACC	2	6	52913	52918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265610
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1291	NC_020815	GCCTTC	2	12	53111	53122	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	471265610
1292	NC_020815	CTA	2	6	53152	53157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265610
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1304	NC_020815	GAC	2	6	53737	53742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1305	NC_020815	GC	3	6	53838	53843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1306	NC_020815	CAT	2	6	53889	53894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1332	NC_020815	GCTGC	2	10	55040	55049	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1342	NC_020815	CTG	2	6	55334	55339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1343	NC_020815	ATC	2	6	55398	55403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1345	NC_020815	TGC	2	6	55484	55489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1370	NC_020815	CG	3	6	56611	56616	0 %	0 %	50 %	50 %	471265613
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1375	NC_020815	ACC	2	6	56799	56804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265613
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1381	NC_020815	GTG	2	6	57152	57157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265614
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1500	NC_020815	CGTG	2	8	61725	61732	0 %	25 %	50 %	25 %	471265618

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