MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 130605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020815	GCA	2	6	237300	237305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265745
6002	NC_020815	GC	3	6	237317	237322	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
6003	NC_020815	TCA	2	6	237473	237478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265745
6004	NC_020815	GC	3	6	237508	237513	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
6005	NC_020815	CAG	2	6	237565	237570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265745
6006	NC_020815	GCG	2	6	237600	237605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265745
6007	NC_020815	CTG	2	6	237634	237639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265745
6008	NC_020815	CG	3	6	237723	237728	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
6009	NC_020815	CGA	2	6	237801	237806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265745
6010	NC_020815	GC	3	6	237855	237860	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
6011	NC_020815	CGC	2	6	237942	237947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
6012	NC_020815	GGCC	2	8	237961	237968	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
6013	NC_020815	GCTGGA	2	12	237981	237992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	471265745
6014	NC_020815	CGC	2	6	238020	238025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
6015	NC_020815	GCC	2	6	238031	238036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
6016	NC_020815	GCC	2	6	238057	238062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
6017	NC_020815	GC	4	8	238136	238143	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
6018	NC_020815	GACG	2	8	238153	238160	25 %	0 %	50 %	25 %	471265745
6019	NC_020815	CGA	2	6	238161	238166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265745
6020	NC_020815	CCA	2	6	238222	238227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265746
6021	NC_020815	CGC	2	6	238243	238248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265746
6022	NC_020815	GGC	2	6	238334	238339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6023	NC_020815	CGG	2	6	238355	238360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6024	NC_020815	TCG	2	6	238366	238371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6025	NC_020815	CGGCAC	2	12	238373	238384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471265746
6026	NC_020815	CCT	2	6	238426	238431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265746
6027	NC_020815	TCGGC	2	10	238465	238474	0 %	20 %	40 %	40 %	471265746
6028	NC_020815	CGA	2	6	238477	238482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6029	NC_020815	ACC	2	6	238503	238508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265746
6030	NC_020815	GGT	2	6	238511	238516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265746
6031	NC_020815	G	6	6	238532	238537	0 %	0 %	100 %	0 %	471265746
6032	NC_020815	CA	3	6	238544	238549	50 %	0 %	0 %	50 %	471265746
6033	NC_020815	TGC	2	6	238606	238611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6034	NC_020815	TGG	2	6	238645	238650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265746
6035	NC_020815	CGG	2	6	238709	238714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6036	NC_020815	GCG	2	6	238755	238760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6037	NC_020815	CGG	2	6	238781	238786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6038	NC_020815	CACCGC	2	12	238811	238822	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	471265746
6039	NC_020815	GCG	2	6	238873	238878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6040	NC_020815	GC	3	6	238954	238959	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6041	NC_020815	GGC	2	6	238962	238967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6042	NC_020815	GC	4	8	238983	238990	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6043	NC_020815	TCGA	2	8	239005	239012	25 %	25 %	25 %	25 %	471265746
6044	NC_020815	TCA	2	6	239014	239019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265746
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6046	NC_020815	CGT	2	6	239041	239046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6047	NC_020815	CGG	3	9	239114	239122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6048	NC_020815	CAG	2	6	239175	239180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
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6051	NC_020815	CGG	2	6	239255	239260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6052	NC_020815	GGC	2	6	239280	239285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6053	NC_020815	CCAG	2	8	239347	239354	25 %	0 %	25 %	50 %	471265746
6054	NC_020815	CGG	2	6	239390	239395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6055	NC_020815	GGCA	2	8	239450	239457	25 %	0 %	50 %	25 %	471265746
6056	NC_020815	TC	3	6	239459	239464	0 %	50 %	0 %	50 %	471265746
6057	NC_020815	GC	3	6	239494	239499	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6058	NC_020815	GCG	2	6	239578	239583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
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6061	NC_020815	GGA	2	6	239614	239619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265746
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6065	NC_020815	TGC	2	6	239702	239707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265746
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6122	NC_020815	GGC	2	6	241896	241901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6123	NC_020815	ACG	2	6	241920	241925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
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6125	NC_020815	ACC	2	6	241963	241968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265746
6126	NC_020815	CGA	2	6	241994	241999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
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6128	NC_020815	CG	3	6	242048	242053	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6129	NC_020815	AGC	2	6	242070	242075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
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6142	NC_020815	TGG	2	6	242509	242514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265746
6143	NC_020815	GCA	2	6	242563	242568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
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6149	NC_020815	CGG	2	6	242771	242776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
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6191	NC_020815	GCG	2	6	244375	244380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6192	NC_020815	AGC	2	6	244431	244436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6193	NC_020815	GC	3	6	244469	244474	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6194	NC_020815	TCAGC	2	10	244478	244487	20 %	20 %	20 %	40 %	471265746
6195	NC_020815	GCC	2	6	244494	244499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265746
6196	NC_020815	GC	3	6	244555	244560	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6197	NC_020815	CGG	2	6	244613	244618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
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6200	NC_020815	CGG	2	6	244670	244675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
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6202	NC_020815	GC	3	6	244715	244720	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6203	NC_020815	CCG	2	6	244735	244740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265746
6204	NC_020815	CGGC	2	8	244786	244793	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6205	NC_020815	TCG	2	6	244828	244833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6206	NC_020815	GCTTCA	2	12	244843	244854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	471265746
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6208	NC_020815	CTG	3	9	244869	244877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6209	NC_020815	GCA	2	6	244891	244896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6210	NC_020815	CG	3	6	244965	244970	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6211	NC_020815	CGGCAC	2	12	244982	244993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471265746
6212	NC_020815	GCC	2	6	244998	245003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265746
6213	NC_020815	GCA	2	6	245021	245026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6214	NC_020815	ACCGGC	2	12	245043	245054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471265746
6215	NC_020815	GGC	2	6	245066	245071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6216	NC_020815	GC	3	6	245077	245082	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6217	NC_020815	CGG	2	6	245104	245109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265746
6218	NC_020815	CGGC	2	8	245224	245231	0 %	0 %	50 %	50 %	471265746
6219	NC_020815	CGA	2	6	245282	245287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6220	NC_020815	CAG	2	6	245289	245294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265746
6221	NC_020815	CTGC	2	8	245344	245351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6222	NC_020815	CGC	2	6	245352	245357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6223	NC_020815	CGG	2	6	245364	245369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6224	NC_020815	GAC	2	6	245398	245403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6225	NC_020815	CTG	2	6	245419	245424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6226	NC_020815	CGA	2	6	245436	245441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6227	NC_020815	CCGGA	2	10	245450	245459	20 %	0 %	40 %	40 %	471265747
6228	NC_020815	CGG	2	6	245501	245506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265747
6229	NC_020815	GC	4	8	245517	245524	0 %	0 %	50 %	50 %	471265747
6230	NC_020815	CGC	2	6	245541	245546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265747
6231	NC_020815	GAA	2	6	245548	245553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265747
6232	NC_020815	GGCGCT	2	12	245574	245585	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471265747
6233	NC_020815	GCC	2	6	245635	245640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265747
6234	NC_020815	CTGCGC	2	12	245644	245655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471265747
6235	NC_020815	CGA	3	9	245742	245750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6236	NC_020815	CGACC	2	10	245754	245763	20 %	0 %	20 %	60 %	471265747
6237	NC_020815	GGTC	2	8	245781	245788	0 %	25 %	50 %	25 %	471265747
6238	NC_020815	GC	3	6	245813	245818	0 %	0 %	50 %	50 %	471265747
6239	NC_020815	GC	3	6	245820	245825	0 %	0 %	50 %	50 %	471265747
6240	NC_020815	CGC	2	6	245843	245848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265747
6241	NC_020815	GCA	2	6	245891	245896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6242	NC_020815	CTG	2	6	245946	245951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6243	NC_020815	GC	4	8	246016	246023	0 %	0 %	50 %	50 %	471265747
6244	NC_020815	GCT	2	6	246033	246038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265747
6245	NC_020815	CCG	2	6	246056	246061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265747
6246	NC_020815	GACC	2	8	246084	246091	25 %	0 %	25 %	50 %	471265747
6247	NC_020815	TGC	2	6	246113	246118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265747
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6255	NC_020815	CGA	2	6	246393	246398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265747
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6257	NC_020815	GCCGT	2	10	246550	246559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6258	NC_020815	AGC	2	6	246568	246573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6262	NC_020815	TCAG	2	8	246622	246629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6263	NC_020815	CGC	2	6	246646	246651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6281	NC_020815	CGA	2	6	247448	247453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265749
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6332	NC_020815	CAT	2	6	249704	249709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265749
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6341	NC_020815	CTG	2	6	249862	249867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265749
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6344	NC_020815	AAT	2	6	249970	249975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6345	NC_020815	GAAT	2	8	250013	250020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6346	NC_020815	T	7	7	250038	250044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6347	NC_020815	TGT	2	6	250079	250084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6348	NC_020815	TC	3	6	250120	250125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6349	NC_020815	CTC	2	6	250157	250162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6350	NC_020815	CCG	2	6	250185	250190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6351	NC_020815	T	6	6	250213	250218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6352	NC_020815	ATG	2	6	250234	250239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6353	NC_020815	GC	3	6	250290	250295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6354	NC_020815	CG	4	8	250397	250404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6355	NC_020815	TGC	2	6	250420	250425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6356	NC_020815	CGG	2	6	250428	250433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6357	NC_020815	CG	3	6	250477	250482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6358	NC_020815	GTT	2	6	250503	250508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6359	NC_020815	GC	3	6	250529	250534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6360	NC_020815	TTGCG	2	10	250601	250610	0 %	40 %	40 %	20 %	471265750
6361	NC_020815	GCG	2	6	250625	250630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265750
6362	NC_020815	CGG	2	6	250638	250643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265750
6363	NC_020815	TCGA	2	8	250667	250674	25 %	25 %	25 %	25 %	471265750
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6365	NC_020815	GAC	2	6	250757	250762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6489	NC_020815	CG	4	8	256262	256269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6490	NC_020815	GCCGC	2	10	256326	256335	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6491	NC_020815	CCG	2	6	256407	256412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6492	NC_020815	GAT	3	9	256421	256429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_020815	TGCCG	2	10	256430	256439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6494	NC_020815	GC	4	8	256446	256453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6495	NC_020815	C	6	6	256474	256479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6496	NC_020815	GGC	2	6	256492	256497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6497	NC_020815	CAG	2	6	256538	256543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_020815	GGC	2	6	256551	256556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_020815	GC	3	6	256564	256569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6500	NC_020815	GCCT	2	8	256597	256604	0 %	25 %	25 %	50 %	471265755

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