MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 130605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020815	GCA	2	6	219785	219790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265734
5502	NC_020815	TCGGC	2	10	219808	219817	0 %	20 %	40 %	40 %	471265734
5503	NC_020815	CGCTGC	2	12	219857	219868	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471265734
5504	NC_020815	GC	3	6	219871	219876	0 %	0 %	50 %	50 %	471265734
5505	NC_020815	CG	3	6	219920	219925	0 %	0 %	50 %	50 %	471265734
5506	NC_020815	GC	3	6	219983	219988	0 %	0 %	50 %	50 %	471265734
5507	NC_020815	TGC	2	6	220036	220041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265734
5508	NC_020815	CG	3	6	220082	220087	0 %	0 %	50 %	50 %	471265734
5509	NC_020815	CGCA	3	12	220126	220137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_020815	GCC	2	6	220171	220176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_020815	CAT	2	6	220268	220273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265735
5512	NC_020815	CTG	3	9	220299	220307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5513	NC_020815	TGG	2	6	220465	220470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265735
5514	NC_020815	GC	3	6	220477	220482	0 %	0 %	50 %	50 %	471265735
5515	NC_020815	GGT	2	6	220535	220540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265735
5516	NC_020815	GCT	2	6	220553	220558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5517	NC_020815	TATC	2	8	220580	220587	25 %	50 %	0 %	25 %	471265735
5518	NC_020815	GCA	3	9	220649	220657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5519	NC_020815	GC	3	6	220663	220668	0 %	0 %	50 %	50 %	471265735
5520	NC_020815	TCA	2	6	220720	220725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265735
5521	NC_020815	GCT	2	6	220730	220735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5522	NC_020815	CTA	3	9	220751	220759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265735
5523	NC_020815	GCC	2	6	220853	220858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265735
5524	NC_020815	CGA	2	6	220865	220870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5525	NC_020815	GGT	2	6	220889	220894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265735
5526	NC_020815	GC	3	6	220911	220916	0 %	0 %	50 %	50 %	471265735
5527	NC_020815	CCAG	2	8	220927	220934	25 %	0 %	25 %	50 %	471265735
5528	NC_020815	GCA	2	6	220939	220944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5529	NC_020815	GCC	2	6	220980	220985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265735
5530	NC_020815	GCG	2	6	220999	221004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5531	NC_020815	GC	3	6	221117	221122	0 %	0 %	50 %	50 %	471265735
5532	NC_020815	CCA	3	9	221134	221142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265735
5533	NC_020815	CAC	2	6	221234	221239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265735
5534	NC_020815	GCG	2	6	221263	221268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5535	NC_020815	GCC	2	6	221270	221275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265735
5536	NC_020815	CAG	2	6	221282	221287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5537	NC_020815	CGG	2	6	221365	221370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5538	NC_020815	CGA	2	6	221387	221392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5539	NC_020815	GGGC	2	8	221500	221507	0 %	0 %	75 %	25 %	471265735
5540	NC_020815	GTG	3	9	221550	221558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265735
5541	NC_020815	CCGC	2	8	221582	221589	0 %	0 %	25 %	75 %	471265735
5542	NC_020815	GCC	2	6	221624	221629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265735
5543	NC_020815	ACA	2	6	221644	221649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265735
5544	NC_020815	GCG	2	6	221659	221664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5545	NC_020815	GCAGCC	2	12	221668	221679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471265735
5546	NC_020815	GGC	2	6	221685	221690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5547	NC_020815	AGA	2	6	221735	221740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265735
5548	NC_020815	TGCG	2	8	221749	221756	0 %	25 %	50 %	25 %	471265735
5549	NC_020815	GAA	2	6	221772	221777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265735
5550	NC_020815	GCA	2	6	221780	221785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5551	NC_020815	GC	3	6	221842	221847	0 %	0 %	50 %	50 %	471265735
5552	NC_020815	AAG	2	6	221880	221885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265735
5553	NC_020815	CTG	3	9	221886	221894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265735
5554	NC_020815	GC	4	8	221929	221936	0 %	0 %	50 %	50 %	471265735
5555	NC_020815	TGA	2	6	221941	221946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265735
5556	NC_020815	TGGC	2	8	222079	222086	0 %	25 %	50 %	25 %	471265735
5557	NC_020815	CGG	2	6	222110	222115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5558	NC_020815	CGG	3	9	222197	222205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265735
5559	NC_020815	GC	3	6	222225	222230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_020815	GC	3	6	222285	222290	0 %	0 %	50 %	50 %	471265736
5561	NC_020815	CGC	2	6	222309	222314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265736
5562	NC_020815	GCG	2	6	222317	222322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265736
5563	NC_020815	GC	3	6	222327	222332	0 %	0 %	50 %	50 %	471265736
5564	NC_020815	GCT	2	6	222367	222372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265736
5565	NC_020815	CG	3	6	222373	222378	0 %	0 %	50 %	50 %	471265736
5566	NC_020815	CTG	2	6	222380	222385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265736
5567	NC_020815	TGCG	2	8	222419	222426	0 %	25 %	50 %	25 %	471265736
5568	NC_020815	TCG	2	6	222505	222510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265736
5569	NC_020815	CGC	2	6	222511	222516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265736
5570	NC_020815	CGG	2	6	222535	222540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265736
5571	NC_020815	TGGC	2	8	222560	222567	0 %	25 %	50 %	25 %	471265736
5572	NC_020815	GGC	3	9	222565	222573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265736
5573	NC_020815	CGG	2	6	222586	222591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265736
5574	NC_020815	GCC	2	6	222601	222606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265736
5575	NC_020815	GCC	2	6	222625	222630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265736
5576	NC_020815	GC	4	8	222647	222654	0 %	0 %	50 %	50 %	471265736
5577	NC_020815	GCC	3	9	222659	222667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265736
5578	NC_020815	CG	4	8	222682	222689	0 %	0 %	50 %	50 %	471265736
5579	NC_020815	GCG	2	6	222709	222714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265736
5580	NC_020815	GCT	2	6	222742	222747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265736
5581	NC_020815	GCC	2	6	222771	222776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_020815	CGGG	2	8	222788	222795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_020815	CG	3	6	222851	222856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_020815	GC	3	6	222901	222906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_020815	CGG	2	6	222921	222926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_020815	CTGC	2	8	222946	222953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_020815	CCG	2	6	222996	223001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_020815	CGG	2	6	223016	223021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_020815	CGG	2	6	223085	223090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265737
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5591	NC_020815	CGG	2	6	223142	223147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265737
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5593	NC_020815	CGCA	2	8	223203	223210	25 %	0 %	25 %	50 %	471265737
5594	NC_020815	GGT	2	6	223214	223219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265737
5595	NC_020815	GCA	2	6	223255	223260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265737
5596	NC_020815	GCTG	2	8	223373	223380	0 %	25 %	50 %	25 %	471265737
5597	NC_020815	CGCCGG	2	12	223390	223401	0 %	0 %	50 %	50 %	471265737
5598	NC_020815	GAC	2	6	223428	223433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265737
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5602	NC_020815	GTT	2	6	223544	223549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265737
5603	NC_020815	CTG	3	9	223557	223565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265737
5604	NC_020815	GCG	2	6	223567	223572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265737
5605	NC_020815	GCCA	2	8	223662	223669	25 %	0 %	25 %	50 %	471265737
5606	NC_020815	GC	4	8	223701	223708	0 %	0 %	50 %	50 %	471265737
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5610	NC_020815	CGG	2	6	223846	223851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265737
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5613	NC_020815	TGC	2	6	223915	223920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265737
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5623	NC_020815	CG	3	6	224318	224323	0 %	0 %	50 %	50 %	471265737
5624	NC_020815	GC	3	6	224343	224348	0 %	0 %	50 %	50 %	471265737
5625	NC_020815	CGG	2	6	224361	224366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265737
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5632	NC_020815	GCTG	2	8	224576	224583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5633	NC_020815	GTC	2	6	224592	224597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5869	NC_020815	CCG	2	6	232332	232337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265742
5870	NC_020815	TCG	2	6	232338	232343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265742
5871	NC_020815	TGCA	2	8	232362	232369	25 %	25 %	25 %	25 %	471265743
5872	NC_020815	GC	3	6	232457	232462	0 %	0 %	50 %	50 %	471265743
5873	NC_020815	CGA	2	6	232532	232537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265743
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5984	NC_020815	CGG	2	6	236543	236548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265745
5985	NC_020815	CCGA	2	8	236593	236600	25 %	0 %	25 %	50 %	471265745
5986	NC_020815	GCT	2	6	236608	236613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265745
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5988	NC_020815	GGACC	2	10	236646	236655	20 %	0 %	40 %	40 %	471265745
5989	NC_020815	CCCGC	2	10	236727	236736	0 %	0 %	20 %	80 %	471265745
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5991	NC_020815	GCC	2	6	237017	237022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
5992	NC_020815	CGC	2	6	237045	237050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
5993	NC_020815	TGT	2	6	237053	237058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265745
5994	NC_020815	GC	3	6	237061	237066	0 %	0 %	50 %	50 %	471265745
5995	NC_020815	GTGTCG	2	12	237079	237090	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	471265745
5996	NC_020815	GAAG	2	8	237111	237118	50 %	0 %	50 %	0 %	471265745
5997	NC_020815	GTG	2	6	237130	237135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265745
5998	NC_020815	GCC	2	6	237151	237156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745
5999	NC_020815	CAA	2	6	237183	237188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265745
6000	NC_020815	CGC	2	6	237270	237275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265745

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