MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 130605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020815	CAGG	2	8	180718	180725	25 %	0 %	50 %	25 %	471265703
4502	NC_020815	GAT	2	6	180771	180776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265703
4503	NC_020815	CG	3	6	180791	180796	0 %	0 %	50 %	50 %	471265703
4504	NC_020815	CAG	2	6	180813	180818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265703
4505	NC_020815	ACC	2	6	180859	180864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265703
4506	NC_020815	TGCA	2	8	180876	180883	25 %	25 %	25 %	25 %	471265703
4507	NC_020815	CAT	2	6	180903	180908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265703
4508	NC_020815	GCA	2	6	180992	180997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265703
4509	NC_020815	CGA	2	6	181055	181060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265703
4510	NC_020815	CATC	3	12	181101	181112	25 %	25 %	0 %	50 %	471265703
4511	NC_020815	GTG	2	6	181253	181258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265704
4512	NC_020815	GCG	3	9	181280	181288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265704
4513	NC_020815	AGC	2	6	181341	181346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4514	NC_020815	GGC	2	6	181379	181384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265704
4515	NC_020815	CG	3	6	181465	181470	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4516	NC_020815	CG	3	6	181472	181477	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4517	NC_020815	GC	4	8	181490	181497	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4518	NC_020815	GCG	2	6	181507	181512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265704
4519	NC_020815	TGG	2	6	181539	181544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265704
4520	NC_020815	GGCA	2	8	181555	181562	25 %	0 %	50 %	25 %	471265704
4521	NC_020815	GGC	2	6	181573	181578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265704
4522	NC_020815	GC	3	6	181582	181587	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4523	NC_020815	CG	3	6	181613	181618	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4524	NC_020815	CGC	2	6	181661	181666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265704
4525	NC_020815	GCTGGC	2	12	181720	181731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	471265704
4526	NC_020815	GC	3	6	181738	181743	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4527	NC_020815	GCA	2	6	181774	181779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4528	NC_020815	GCCG	2	8	181781	181788	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4529	NC_020815	GC	4	8	181814	181821	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4530	NC_020815	TGCGCA	2	12	181852	181863	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4531	NC_020815	GGT	2	6	181882	181887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265704
4532	NC_020815	TGCGC	2	10	181951	181960	0 %	20 %	40 %	40 %	471265704
4533	NC_020815	TGC	2	6	181983	181988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4534	NC_020815	CGA	3	9	182002	182010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4535	NC_020815	CGC	3	9	182095	182103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265704
4536	NC_020815	GC	5	10	182116	182125	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4537	NC_020815	AGC	2	6	182130	182135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4538	NC_020815	ACC	2	6	182145	182150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265704
4539	NC_020815	GCC	3	9	182158	182166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265704
4540	NC_020815	GCG	2	6	182181	182186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265704
4541	NC_020815	CGTG	2	8	182197	182204	0 %	25 %	50 %	25 %	471265704
4542	NC_020815	CTG	3	9	182207	182215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4543	NC_020815	CG	3	6	182241	182246	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4544	NC_020815	GCGCC	2	10	182263	182272	0 %	0 %	40 %	60 %	471265704
4545	NC_020815	CTG	2	6	182276	182281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4546	NC_020815	GAG	2	6	182282	182287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265704
4547	NC_020815	GCT	2	6	182305	182310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265704
4548	NC_020815	GGGC	2	8	182428	182435	0 %	0 %	75 %	25 %	471265704
4549	NC_020815	GCC	2	6	182467	182472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265704
4550	NC_020815	CG	3	6	182483	182488	0 %	0 %	50 %	50 %	471265704
4551	NC_020815	TGA	2	6	182510	182515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265704
4552	NC_020815	GCT	2	6	182558	182563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265705
4553	NC_020815	ACTGG	2	10	182567	182576	20 %	20 %	40 %	20 %	471265705
4554	NC_020815	CCCG	2	8	182607	182614	0 %	0 %	25 %	75 %	471265705
4555	NC_020815	CAC	2	6	182615	182620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265705
4556	NC_020815	GCG	2	6	182628	182633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265705
4557	NC_020815	GCTG	2	8	182638	182645	0 %	25 %	50 %	25 %	471265705
4558	NC_020815	CTG	3	9	182643	182651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265705
4559	NC_020815	GGT	2	6	182666	182671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265705
4560	NC_020815	TGT	2	6	182689	182694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265705
4561	NC_020815	AAC	3	9	182761	182769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265705
4562	NC_020815	CAG	2	6	182810	182815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265705
4563	NC_020815	GTG	2	6	182823	182828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265705
4564	NC_020815	CGA	2	6	182888	182893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265705
4565	NC_020815	TAC	2	6	182961	182966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265705
4566	NC_020815	CGA	2	6	182975	182980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265705
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4569	NC_020815	GCGT	2	8	183031	183038	0 %	25 %	50 %	25 %	471265705
4570	NC_020815	TGC	2	6	183046	183051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265705
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4572	NC_020815	TGG	2	6	183280	183285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265705
4573	NC_020815	GGT	2	6	183302	183307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265705
4574	NC_020815	ATC	2	6	183310	183315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265705
4575	NC_020815	TGC	2	6	183415	183420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265705
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4577	NC_020815	GGCGC	2	10	183482	183491	0 %	0 %	60 %	40 %	471265705
4578	NC_020815	GGT	2	6	183494	183499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265705
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4580	NC_020815	CGC	2	6	183554	183559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265705
4581	NC_020815	CAA	2	6	183599	183604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265705
4582	NC_020815	AGG	2	6	183628	183633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265705
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4587	NC_020815	GCC	3	9	183883	183891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265705
4588	NC_020815	GC	4	8	183964	183971	0 %	0 %	50 %	50 %	471265706
4589	NC_020815	GGC	2	6	184031	184036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265706
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4592	NC_020815	GC	3	6	184118	184123	0 %	0 %	50 %	50 %	471265706
4593	NC_020815	GGC	2	6	184150	184155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265706
4594	NC_020815	GCGAC	2	10	184174	184183	20 %	0 %	40 %	40 %	471265706
4595	NC_020815	ATGA	2	8	184204	184211	50 %	25 %	25 %	0 %	471265706
4596	NC_020815	TGG	2	6	184271	184276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265707
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4599	NC_020815	CGC	2	6	184398	184403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265707
4600	NC_020815	TGG	2	6	184418	184423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265707
4601	NC_020815	TCG	2	6	184439	184444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265707
4602	NC_020815	TGCG	2	8	184451	184458	0 %	25 %	50 %	25 %	471265707
4603	NC_020815	CTG	2	6	184464	184469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265707
4604	NC_020815	CG	4	8	184554	184561	0 %	0 %	50 %	50 %	471265707
4605	NC_020815	GCCGAT	2	12	184615	184626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	471265707
4606	NC_020815	GC	3	6	184628	184633	0 %	0 %	50 %	50 %	471265707
4607	NC_020815	CGA	2	6	184644	184649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265707
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4609	NC_020815	GTG	2	6	184675	184680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265707
4610	NC_020815	CGC	2	6	184776	184781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265707
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4612	NC_020815	TCG	2	6	184808	184813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265707
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4617	NC_020815	TGCG	2	8	184970	184977	0 %	25 %	50 %	25 %	471265707
4618	NC_020815	GCA	2	6	184995	185000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265707
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4622	NC_020815	GC	5	10	185190	185199	0 %	0 %	50 %	50 %	471265707
4623	NC_020815	CG	4	8	185218	185225	0 %	0 %	50 %	50 %	471265707
4624	NC_020815	CAGG	2	8	185242	185249	25 %	0 %	50 %	25 %	471265707
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4871	NC_020815	GC	3	6	195518	195523	0 %	0 %	50 %	50 %	471265717
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4990	NC_020815	ATC	2	6	199865	199870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265719
4991	NC_020815	TGC	2	6	199878	199883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265719
4992	NC_020815	CGT	2	6	199884	199889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265719
4993	NC_020815	GC	3	6	199924	199929	0 %	0 %	50 %	50 %	471265719
4994	NC_020815	TGC	2	6	199946	199951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265719
4995	NC_020815	CTG	2	6	199963	199968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265719
4996	NC_020815	GAT	2	6	200004	200009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265719
4997	NC_020815	CTG	2	6	200074	200079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265719
4998	NC_020815	CGG	2	6	200139	200144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265719
4999	NC_020815	AGG	2	6	200183	200188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471265719
5000	NC_020815	CAC	2	6	200216	200221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265719

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