MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020801	GC	3	6	801	806	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
2	NC_020801	GC	3	6	986	991	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
3	NC_020801	CG	3	6	1058	1063	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
4	NC_020801	CG	5	10	1923	1932	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
5	NC_020801	CG	3	6	2012	2017	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
6	NC_020801	GC	3	6	2022	2027	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
7	NC_020801	GC	3	6	2148	2153	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
8	NC_020801	CG	3	6	2183	2188	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
9	NC_020801	GC	3	6	2363	2368	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
10	NC_020801	GC	3	6	2861	2866	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
11	NC_020801	GC	3	6	3654	3659	0 %	0 %	50 %	50 %	470474284
12	NC_020801	TG	3	6	3709	3714	0 %	50 %	50 %	0 %	470474284
13	NC_020801	GC	3	6	3944	3949	0 %	0 %	50 %	50 %	470474285
14	NC_020801	GC	3	6	4273	4278	0 %	0 %	50 %	50 %	470474286
15	NC_020801	CT	3	6	4405	4410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020801	GC	3	6	4629	4634	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
17	NC_020801	CG	3	6	4642	4647	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
18	NC_020801	CG	3	6	4733	4738	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
19	NC_020801	CG	3	6	5000	5005	0 %	0 %	50 %	50 %	470474287
20	NC_020801	AG	3	6	5495	5500	50 %	0 %	50 %	0 %	470474287
21	NC_020801	GT	3	6	8182	8187	0 %	50 %	50 %	0 %	470474288
22	NC_020801	GT	3	6	8278	8283	0 %	50 %	50 %	0 %	470474288
23	NC_020801	GC	3	6	8450	8455	0 %	0 %	50 %	50 %	470474288
24	NC_020801	CG	3	6	8462	8467	0 %	0 %	50 %	50 %	470474288
25	NC_020801	GC	3	6	10005	10010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020801	GC	3	6	10065	10070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020801	GC	3	6	10165	10170	0 %	0 %	50 %	50 %	470474290
28	NC_020801	TA	3	6	10575	10580	50 %	50 %	0 %	0 %	470474291
29	NC_020801	GC	3	6	10684	10689	0 %	0 %	50 %	50 %	470474291
30	NC_020801	CG	3	6	11099	11104	0 %	0 %	50 %	50 %	470474292
31	NC_020801	GC	3	6	11393	11398	0 %	0 %	50 %	50 %	470474292
32	NC_020801	CG	3	6	11501	11506	0 %	0 %	50 %	50 %	470474292
33	NC_020801	TG	3	6	11619	11624	0 %	50 %	50 %	0 %	470474292
34	NC_020801	TG	3	6	11891	11896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020801	GC	3	6	12464	12469	0 %	0 %	50 %	50 %	470474293
36	NC_020801	GC	3	6	12982	12987	0 %	0 %	50 %	50 %	470474293
37	NC_020801	GC	3	6	13650	13655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020801	CT	3	6	13748	13753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020801	GC	3	6	15440	15445	0 %	0 %	50 %	50 %	470474296
40	NC_020801	GC	3	6	15533	15538	0 %	0 %	50 %	50 %	470474296
41	NC_020801	TC	3	6	16560	16565	0 %	50 %	0 %	50 %	470474298
42	NC_020801	GC	3	6	16956	16961	0 %	0 %	50 %	50 %	470474299
43	NC_020801	CG	3	6	17784	17789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020801	GC	3	6	17790	17795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020801	GC	3	6	18305	18310	0 %	0 %	50 %	50 %	470474302
46	NC_020801	CA	3	6	18832	18837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020801	GC	3	6	20464	20469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020801	GC	3	6	20974	20979	0 %	0 %	50 %	50 %	470474305
49	NC_020801	TA	5	10	21460	21469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020801	TA	3	6	21476	21481	50 %	50 %	0 %	0 %	470474307
51	NC_020801	TA	5	10	21695	21704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020801	GT	3	6	21810	21815	0 %	50 %	50 %	0 %	470474308
53	NC_020801	TA	5	10	22750	22759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020801	TA	5	10	22770	22779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020801	GA	3	6	23219	23224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020801	GC	3	6	23406	23411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020801	CG	3	6	23594	23599	0 %	0 %	50 %	50 %	470474311
58	NC_020801	GC	3	6	24739	24744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020801	GT	3	6	27672	27677	0 %	50 %	50 %	0 %	470474312
60	NC_020801	GT	3	6	27768	27773	0 %	50 %	50 %	0 %	470474312
61	NC_020801	GC	3	6	27940	27945	0 %	0 %	50 %	50 %	470474312
62	NC_020801	CG	3	6	27952	27957	0 %	0 %	50 %	50 %	470474312
63	NC_020801	CG	3	6	29297	29302	0 %	0 %	50 %	50 %	470474315
64	NC_020801	GC	5	10	30172	30181	0 %	0 %	50 %	50 %	470474317
65	NC_020801	TA	3	6	30716	30721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020801	GT	3	6	30917	30922	0 %	50 %	50 %	0 %	470474319
67	NC_020801	CT	3	6	31113	31118	0 %	50 %	0 %	50 %	470474319
68	NC_020801	GC	3	6	31254	31259	0 %	0 %	50 %	50 %	470474319
69	NC_020801	CG	3	6	31740	31745	0 %	0 %	50 %	50 %	470474320

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.