MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC33

Total Repeats: 692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020801	AGG	2	6	22409	22414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474308
502	NC_020801	GCATGA	2	12	22420	22431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470474308
503	NC_020801	GCC	2	6	22460	22465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474309
504	NC_020801	TGG	2	6	22522	22527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474309
505	NC_020801	CTG	2	6	22531	22536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474309
506	NC_020801	CGC	2	6	22561	22566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474309
507	NC_020801	GCT	2	6	22569	22574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474309
508	NC_020801	A	6	6	22609	22614	100 %	0 %	0 %	0 %	470474309
509	NC_020801	GCG	2	6	22649	22654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474309
510	NC_020801	GGC	2	6	22683	22688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474309
511	NC_020801	TA	5	10	22750	22759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020801	TA	5	10	22770	22779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020801	CGA	2	6	22813	22818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020801	TTG	2	6	22859	22864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020801	ATG	2	6	22890	22895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474310
516	NC_020801	GAC	2	6	22898	22903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474310
517	NC_020801	CGC	2	6	22946	22951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474310
518	NC_020801	CCG	2	6	22963	22968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474310
519	NC_020801	GAAT	2	8	23017	23024	50 %	25 %	25 %	0 %	470474310
520	NC_020801	GGC	2	6	23049	23054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474310
521	NC_020801	CAAG	2	8	23168	23175	50 %	0 %	25 %	25 %	470474310
522	NC_020801	CGA	2	6	23195	23200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474310
523	NC_020801	GA	3	6	23219	23224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020801	CAG	2	6	23235	23240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020801	CAGGG	2	10	23300	23309	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
526	NC_020801	GC	3	6	23406	23411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_020801	TGA	2	6	23440	23445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020801	CAG	2	6	23489	23494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474311
529	NC_020801	GAC	2	6	23566	23571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474311
530	NC_020801	CG	3	6	23594	23599	0 %	0 %	50 %	50 %	470474311
531	NC_020801	GCTG	2	8	23651	23658	0 %	25 %	50 %	25 %	470474311
532	NC_020801	TCGACC	2	12	23663	23674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470474311
533	NC_020801	GAT	2	6	23685	23690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474311
534	NC_020801	GGA	2	6	23694	23699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474311
535	NC_020801	CTA	2	6	23760	23765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474311
536	NC_020801	GCC	2	6	23794	23799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474311
537	NC_020801	GCA	2	6	23801	23806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474311
538	NC_020801	TGG	2	6	23911	23916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474311
539	NC_020801	CGA	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474311
540	NC_020801	GAGCGC	2	12	24091	24102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470474311
541	NC_020801	GCT	2	6	24126	24131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474311
542	NC_020801	CTCA	2	8	24198	24205	25 %	25 %	0 %	50 %	470474311
543	NC_020801	CGC	3	9	24324	24332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474311
544	NC_020801	ACG	2	6	24341	24346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474311
545	NC_020801	CGC	2	6	24378	24383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474311
546	NC_020801	TGC	2	6	24392	24397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474311
547	NC_020801	GAA	2	6	24487	24492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470474311
548	NC_020801	G	6	6	24522	24527	0 %	0 %	100 %	0 %	470474311
549	NC_020801	TGC	2	6	24606	24611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474311
550	NC_020801	TCT	2	6	24631	24636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474311
551	NC_020801	GC	3	6	24739	24744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_020801	CAG	2	6	24748	24753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020801	GCA	2	6	24820	24825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020801	GGC	2	6	24839	24844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_020801	A	6	6	24949	24954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020801	TTAC	2	8	24990	24997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_020801	CTC	2	6	25071	25076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470474312
558	NC_020801	ATC	2	6	25095	25100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474312
559	NC_020801	GCC	2	6	25194	25199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
560	NC_020801	CGATC	2	10	25315	25324	20 %	20 %	20 %	40 %	470474312
561	NC_020801	GCT	2	6	25338	25343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474312
562	NC_020801	TGGGC	2	10	25371	25380	0 %	20 %	60 %	20 %	470474312
563	NC_020801	ATGC	2	8	25412	25419	25 %	25 %	25 %	25 %	470474312
564	NC_020801	GGA	2	6	25487	25492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470474312
565	NC_020801	G	6	6	25516	25521	0 %	0 %	100 %	0 %	470474312
566	NC_020801	AAC	2	6	25576	25581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474312
567	NC_020801	TCA	2	6	25615	25620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474312
568	NC_020801	TGGG	2	8	25632	25639	0 %	25 %	75 %	0 %	470474312
569	NC_020801	A	6	6	25651	25656	100 %	0 %	0 %	0 %	470474312
570	NC_020801	CCG	2	6	25789	25794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
571	NC_020801	AGGC	2	8	25795	25802	25 %	0 %	50 %	25 %	470474312
572	NC_020801	CGA	2	6	25808	25813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474312
573	NC_020801	GGT	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474312
574	NC_020801	CAA	2	6	25865	25870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470474312
575	NC_020801	GCC	3	9	25890	25898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
576	NC_020801	CCA	2	6	25913	25918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
577	NC_020801	GCC	2	6	25992	25997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
578	NC_020801	TGGC	2	8	26002	26009	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
579	NC_020801	CCA	2	6	26015	26020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
580	NC_020801	CCA	2	6	26095	26100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
581	NC_020801	CCA	2	6	26117	26122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
582	NC_020801	CCA	2	6	26197	26202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
583	NC_020801	CCA	2	6	26219	26224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
584	NC_020801	CCA	2	6	26299	26304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
585	NC_020801	CCA	2	6	26321	26326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
586	NC_020801	CCA	2	6	26401	26406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
587	NC_020801	CCA	2	6	26423	26428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
588	NC_020801	CCA	2	6	26525	26530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
589	NC_020801	CCA	2	6	26636	26641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
590	NC_020801	CCA	2	6	26738	26743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
591	NC_020801	GCC	2	6	26817	26822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
592	NC_020801	TGGC	2	8	26827	26834	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
593	NC_020801	CCA	2	6	26840	26845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
594	NC_020801	CCA	2	6	26942	26947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
595	NC_020801	CCA	2	6	27022	27027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
596	NC_020801	CCA	2	6	27044	27049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
597	NC_020801	GCC	2	6	27123	27128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
598	NC_020801	TGGC	2	8	27133	27140	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
599	NC_020801	CCA	2	6	27146	27151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
600	NC_020801	CCA	2	6	27226	27231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
601	NC_020801	CCA	2	6	27248	27253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
602	NC_020801	GCC	2	6	27327	27332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
603	NC_020801	TGGC	2	8	27337	27344	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
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606	NC_020801	CCA	2	6	27452	27457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470474312
607	NC_020801	G	6	6	27479	27484	0 %	0 %	100 %	0 %	470474312
608	NC_020801	CGC	2	6	27533	27538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474312
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610	NC_020801	GT	3	6	27768	27773	0 %	50 %	50 %	0 %	470474312
611	NC_020801	GTG	2	6	27798	27803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474312
612	NC_020801	CGAA	2	8	27816	27823	50 %	0 %	25 %	25 %	470474312
613	NC_020801	TCT	2	6	27836	27841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474312
614	NC_020801	TGC	2	6	27847	27852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470474312
615	NC_020801	GCGT	2	8	27866	27873	0 %	25 %	50 %	25 %	470474312
616	NC_020801	CGGC	2	8	27887	27894	0 %	0 %	50 %	50 %	470474312
617	NC_020801	GCA	2	6	27913	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474312
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619	NC_020801	GC	3	6	27940	27945	0 %	0 %	50 %	50 %	470474312
620	NC_020801	GGC	2	6	27946	27951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474312
621	NC_020801	CG	3	6	27952	27957	0 %	0 %	50 %	50 %	470474312
622	NC_020801	TGG	2	6	27977	27982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470474312
623	NC_020801	G	7	7	27985	27991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020801	CCG	2	6	28139	28144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_020801	CCG	2	6	28197	28202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020801	GCC	2	6	28224	28229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_020801	CGAA	2	8	28320	28327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
628	NC_020801	CGA	2	6	28445	28450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020801	GGA	2	6	28493	28498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020801	T	6	6	28557	28562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020801	CGA	2	6	28888	28893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474314
632	NC_020801	TGGC	2	8	28928	28935	0 %	25 %	50 %	25 %	470474314
633	NC_020801	ACT	2	6	28941	28946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470474314
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639	NC_020801	CGA	2	6	29183	29188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474315
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642	NC_020801	CG	3	6	29297	29302	0 %	0 %	50 %	50 %	470474315
643	NC_020801	TCT	2	6	29330	29335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470474315
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650	NC_020801	TCC	2	6	29838	29843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_020801	GCA	2	6	29861	29866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_020801	TCG	2	6	29885	29890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_020801	AGC	3	9	29899	29907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_020801	GAT	2	6	29952	29957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
655	NC_020801	AAG	2	6	30012	30017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
656	NC_020801	CGC	2	6	30029	30034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
657	NC_020801	CGC	2	6	30040	30045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_020801	GC	5	10	30172	30181	0 %	0 %	50 %	50 %	470474317
659	NC_020801	GCA	2	6	30306	30311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474317
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661	NC_020801	CGC	2	6	30423	30428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474317
662	NC_020801	CAG	2	6	30438	30443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474318
663	NC_020801	CGG	2	6	30497	30502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470474318
664	NC_020801	CAG	2	6	30519	30524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474318
665	NC_020801	GTA	2	6	30537	30542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470474318
666	NC_020801	GCCAA	2	10	30586	30595	40 %	0 %	20 %	40 %	470474318
667	NC_020801	ACGCAG	2	12	30609	30620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470474318
668	NC_020801	GGCG	2	8	30633	30640	0 %	0 %	75 %	25 %	470474318
669	NC_020801	TA	3	6	30716	30721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
670	NC_020801	CTG	2	6	30758	30763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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674	NC_020801	CT	3	6	31113	31118	0 %	50 %	0 %	50 %	470474319
675	NC_020801	CTCA	2	8	31143	31150	25 %	25 %	0 %	50 %	470474319
676	NC_020801	CGCT	2	8	31171	31178	0 %	25 %	25 %	50 %	470474319
677	NC_020801	GC	3	6	31254	31259	0 %	0 %	50 %	50 %	470474319
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689	NC_020801	GCC	2	6	31729	31734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470474320
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691	NC_020801	TCG	2	6	31766	31771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
692	NC_020801	CCG	2	6	31772	31777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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