MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC47

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020798	GCGTGC	2	12	4611	4622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470464933
2	NC_020798	GCAGCC	2	12	5977	5988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470464935
3	NC_020798	AGAGCA	2	12	10731	10742	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020798	ATATTT	2	12	13738	13749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020798	TCGGCG	2	12	16573	16584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470464947
6	NC_020798	CATCGG	2	12	16775	16786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470464947
7	NC_020798	AAATCG	2	12	17083	17094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470464947
8	NC_020798	CTTGCC	2	12	18279	18290	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470464947
9	NC_020798	CGCGAG	2	12	22375	22386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470464950
10	NC_020798	CGCCAT	2	12	22601	22612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470464951
11	NC_020798	CCGTCT	2	12	24614	24625	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470464954
12	NC_020798	TCACCG	2	12	25506	25517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470464955
13	NC_020798	CTTGGC	3	18	29114	29131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464960
14	NC_020798	TCGGTG	2	12	29361	29372	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470464960
15	NC_020798	CCTCGA	2	12	30397	30408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470464960
16	NC_020798	TCTCGG	2	12	32795	32806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470464962
17	NC_020798	GCGAAC	2	12	33068	33079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020798	CTGCGC	2	12	37353	37364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470464970
19	NC_020798	TGATCC	2	12	44331	44342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470464977
20	NC_020798	AGCGTC	2	12	44629	44640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470464978

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.