MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis Xac29-1 plasmid pXAC64

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020797	GCCT	2	8	199	206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020797	GATC	2	8	839	846	25 %	25 %	25 %	25 %	470464774
3	NC_020797	TACG	2	8	1992	1999	25 %	25 %	25 %	25 %	470464776
4	NC_020797	CGCC	2	8	2327	2334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_020797	CTCG	2	8	2599	2606	0 %	25 %	25 %	50 %	470464777
6	NC_020797	CGGC	2	8	2702	2709	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
7	NC_020797	GCCG	2	8	2776	2783	0 %	0 %	50 %	50 %	470464777
8	NC_020797	CCGC	2	8	2865	2872	0 %	0 %	25 %	75 %	470464777
9	NC_020797	CGCC	2	8	3309	3316	0 %	0 %	25 %	75 %	470464778
10	NC_020797	GAAC	2	8	3494	3501	50 %	0 %	25 %	25 %	470464778
11	NC_020797	GAAT	2	8	5136	5143	50 %	25 %	25 %	0 %	470464780
12	NC_020797	GCGA	2	8	5184	5191	25 %	0 %	50 %	25 %	470464780
13	NC_020797	GCTG	2	8	5406	5413	0 %	25 %	50 %	25 %	470464780
14	NC_020797	TCCT	2	8	5428	5435	0 %	50 %	0 %	50 %	470464780
15	NC_020797	GCCA	2	8	5606	5613	25 %	0 %	25 %	50 %	470464780
16	NC_020797	GGCC	2	8	6027	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
17	NC_020797	CCGG	2	8	6519	6526	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
18	NC_020797	CCAG	2	8	7113	7120	25 %	0 %	25 %	50 %	470464781
19	NC_020797	CGGT	2	8	7166	7173	0 %	25 %	50 %	25 %	470464781
20	NC_020797	CTGG	2	8	7696	7703	0 %	25 %	50 %	25 %	470464781
21	NC_020797	CGGC	2	8	7790	7797	0 %	0 %	50 %	50 %	470464781
22	NC_020797	ATCG	2	8	8176	8183	25 %	25 %	25 %	25 %	470464781
23	NC_020797	GCCC	2	8	8923	8930	0 %	0 %	25 %	75 %	470464782
24	NC_020797	GCAG	2	8	9100	9107	25 %	0 %	50 %	25 %	470464782
25	NC_020797	TGGC	2	8	9244	9251	0 %	25 %	50 %	25 %	470464782
26	NC_020797	GGCG	2	8	9274	9281	0 %	0 %	75 %	25 %	470464782
27	NC_020797	TCCG	2	8	10446	10453	0 %	25 %	25 %	50 %	470464783
28	NC_020797	CGCC	2	8	10590	10597	0 %	0 %	25 %	75 %	470464783
29	NC_020797	GCTC	2	8	10712	10719	0 %	25 %	25 %	50 %	470464783
30	NC_020797	GGCG	2	8	10767	10774	0 %	0 %	75 %	25 %	470464783
31	NC_020797	GGCA	2	8	11418	11425	25 %	0 %	50 %	25 %	470464783
32	NC_020797	ACGG	2	8	11939	11946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020797	GGCA	2	8	12027	12034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020797	CGCC	2	8	13131	13138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_020797	GAGC	2	8	13196	13203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020797	GCGT	2	8	13411	13418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020797	TTCG	2	8	14006	14013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020797	GCCG	2	8	14439	14446	0 %	0 %	50 %	50 %	470464785
39	NC_020797	ACGC	2	8	14460	14467	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
40	NC_020797	CAGC	2	8	14475	14482	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
41	NC_020797	GTTC	2	8	14509	14516	0 %	50 %	25 %	25 %	470464785
42	NC_020797	GCCA	2	8	15394	15401	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
43	NC_020797	GCCA	2	8	15496	15503	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
44	NC_020797	GCCA	2	8	15700	15707	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
45	NC_020797	GCCA	2	8	16312	16319	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
46	NC_020797	GCCA	2	8	16414	16421	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
47	NC_020797	GCCA	2	8	16516	16523	25 %	0 %	25 %	50 %	470464785
48	NC_020797	GCCT	2	8	16825	16832	0 %	25 %	25 %	50 %	470464785
49	NC_020797	CCCA	2	8	16988	16995	25 %	0 %	0 %	75 %	470464785
50	NC_020797	TGCA	2	8	17207	17214	25 %	25 %	25 %	25 %	470464785
51	NC_020797	GTAA	2	8	17630	17637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020797	GCGG	2	8	18291	18298	0 %	0 %	75 %	25 %	470464786
53	NC_020797	TGAG	2	8	18422	18429	25 %	25 %	50 %	0 %	470464786
54	NC_020797	CAGC	2	8	18969	18976	25 %	0 %	25 %	50 %	470464786
55	NC_020797	GCTT	2	8	19451	19458	0 %	50 %	25 %	25 %	470464787
56	NC_020797	TCAT	2	8	19601	19608	25 %	50 %	0 %	25 %	470464787
57	NC_020797	GTCA	2	8	20469	20476	25 %	25 %	25 %	25 %	470464789
58	NC_020797	ACCG	2	8	20502	20509	25 %	0 %	25 %	50 %	470464789
59	NC_020797	TTGC	2	8	20607	20614	0 %	50 %	25 %	25 %	470464789
60	NC_020797	CTAT	2	8	20837	20844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020797	AGCA	3	12	20978	20989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020797	GGTA	2	8	21152	21159	25 %	25 %	50 %	0 %	470464790
63	NC_020797	GCCA	2	8	21246	21253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020797	GTCG	2	8	21463	21470	0 %	25 %	50 %	25 %	470464791
65	NC_020797	GCCG	2	8	22071	22078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020797	GGAC	2	8	22091	22098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020797	GCCC	2	8	22178	22185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_020797	CAGC	2	8	22255	22262	25 %	0 %	25 %	50 %	470464793
69	NC_020797	TGCT	2	8	22493	22500	0 %	50 %	25 %	25 %	470464793
70	NC_020797	CCGA	2	8	24262	24269	25 %	0 %	25 %	50 %	470464796
71	NC_020797	GCCG	2	8	24416	24423	0 %	0 %	50 %	50 %	470464796
72	NC_020797	GCTG	2	8	24449	24456	0 %	25 %	50 %	25 %	470464796
73	NC_020797	TGCC	2	8	25775	25782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020797	GGCT	2	8	26575	26582	0 %	25 %	50 %	25 %	470464800
75	NC_020797	GTCG	2	8	26973	26980	0 %	25 %	50 %	25 %	470464800
76	NC_020797	TCGT	2	8	27664	27671	0 %	50 %	25 %	25 %	470464800
77	NC_020797	GCCG	2	8	27672	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	470464800
78	NC_020797	GCGA	2	8	27838	27845	25 %	0 %	50 %	25 %	470464800
79	NC_020797	CGGC	2	8	28276	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
80	NC_020797	CGAC	2	8	28320	28327	25 %	0 %	25 %	50 %	470464801
81	NC_020797	AGGC	2	8	29010	29017	25 %	0 %	50 %	25 %	470464801
82	NC_020797	TCGC	2	8	30086	30093	0 %	25 %	25 %	50 %	470464801
83	NC_020797	CCGA	2	8	30125	30132	25 %	0 %	25 %	50 %	470464801
84	NC_020797	CGGC	3	12	30658	30669	0 %	0 %	50 %	50 %	470464801
85	NC_020797	ACCT	2	8	31213	31220	25 %	25 %	0 %	50 %	470464802
86	NC_020797	CCAT	2	8	31468	31475	25 %	25 %	0 %	50 %	470464803
87	NC_020797	GCGA	2	8	32517	32524	25 %	0 %	50 %	25 %	470464805
88	NC_020797	CTCG	2	8	32913	32920	0 %	25 %	25 %	50 %	470464806
89	NC_020797	CGAC	2	8	33012	33019	25 %	0 %	25 %	50 %	470464806
90	NC_020797	TCCG	2	8	33037	33044	0 %	25 %	25 %	50 %	470464806
91	NC_020797	GGCA	2	8	33139	33146	25 %	0 %	50 %	25 %	470464806
92	NC_020797	CAGC	2	8	33612	33619	25 %	0 %	25 %	50 %	470464806
93	NC_020797	CGGC	2	8	33868	33875	0 %	0 %	50 %	50 %	470464807
94	NC_020797	CGCA	2	8	34065	34072	25 %	0 %	25 %	50 %	470464807
95	NC_020797	TCTT	2	8	34611	34618	0 %	75 %	0 %	25 %	470464807
96	NC_020797	GCCG	2	8	34845	34852	0 %	0 %	50 %	50 %	470464808
97	NC_020797	CCGG	2	8	35123	35130	0 %	0 %	50 %	50 %	470464808
98	NC_020797	CGCC	2	8	35495	35502	0 %	0 %	25 %	75 %	470464808
99	NC_020797	GTTT	2	8	35939	35946	0 %	75 %	25 %	0 %	470464808
100	NC_020797	CTTG	2	8	36618	36625	0 %	50 %	25 %	25 %	470464809
101	NC_020797	CTGC	2	8	36911	36918	0 %	25 %	25 %	50 %	470464810
102	NC_020797	GCCG	2	8	36996	37003	0 %	0 %	50 %	50 %	470464810
103	NC_020797	GCGA	2	8	37470	37477	25 %	0 %	50 %	25 %	470464811
104	NC_020797	ACAA	2	8	37876	37883	75 %	0 %	0 %	25 %	470464811
105	NC_020797	AGCC	2	8	38058	38065	25 %	0 %	25 %	50 %	470464811
106	NC_020797	CGGC	2	8	38535	38542	0 %	0 %	50 %	50 %	470464812
107	NC_020797	CGGT	2	8	41236	41243	0 %	25 %	50 %	25 %	470464815
108	NC_020797	CCAG	2	8	43892	43899	25 %	0 %	25 %	50 %	470464820
109	NC_020797	CTTC	2	8	44065	44072	0 %	50 %	0 %	50 %	470464821
110	NC_020797	CGCA	2	8	44639	44646	25 %	0 %	25 %	50 %	470464822
111	NC_020797	ATAA	2	8	44994	45001	75 %	25 %	0 %	0 %	470464823
112	NC_020797	CTGT	2	8	45097	45104	0 %	50 %	25 %	25 %	470464824
113	NC_020797	TGCT	2	8	45206	45213	0 %	50 %	25 %	25 %	470464824
114	NC_020797	GGCT	2	8	45374	45381	0 %	25 %	50 %	25 %	470464824
115	NC_020797	CCGT	2	8	45555	45562	0 %	25 %	25 %	50 %	470464824
116	NC_020797	CGGC	2	8	45865	45872	0 %	0 %	50 %	50 %	470464824
117	NC_020797	GTTG	2	8	46157	46164	0 %	50 %	50 %	0 %	470464825
118	NC_020797	TGCG	2	8	46169	46176	0 %	25 %	50 %	25 %	470464825
119	NC_020797	ACGC	2	8	46216	46223	25 %	0 %	25 %	50 %	470464825
120	NC_020797	TGGG	2	8	46487	46494	0 %	25 %	75 %	0 %	470464825
121	NC_020797	TGGC	2	8	46672	46679	0 %	25 %	50 %	25 %	470464825
122	NC_020797	TGAG	2	8	46880	46887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020797	ACGG	2	8	47362	47369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020797	CCGG	2	8	47864	47871	0 %	0 %	50 %	50 %	470464826
125	NC_020797	TCCT	2	8	48899	48906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020797	CCGG	2	8	48998	49005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020797	ATCT	2	8	49168	49175	25 %	50 %	0 %	25 %	470464827
128	NC_020797	TCGT	2	8	49332	49339	0 %	50 %	25 %	25 %	470464827
129	NC_020797	CGGC	2	8	49357	49364	0 %	0 %	50 %	50 %	470464827
130	NC_020797	CTGA	2	8	49369	49376	25 %	25 %	25 %	25 %	470464827
131	NC_020797	CGGC	2	8	49487	49494	0 %	0 %	50 %	50 %	470464827
132	NC_020797	GGCG	2	8	49639	49646	0 %	0 %	75 %	25 %	470464827
133	NC_020797	CGTT	2	8	49906	49913	0 %	50 %	25 %	25 %	470464827
134	NC_020797	GGTC	2	8	50075	50082	0 %	25 %	50 %	25 %	470464827
135	NC_020797	CGGC	2	8	50264	50271	0 %	0 %	50 %	50 %	470464827
136	NC_020797	ACAT	2	8	50948	50955	50 %	25 %	0 %	25 %	470464829
137	NC_020797	GTCG	2	8	51405	51412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020797	GACG	2	8	51468	51475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020797	TTCG	2	8	51763	51770	0 %	50 %	25 %	25 %	470464831
140	NC_020797	CGGG	2	8	51799	51806	0 %	0 %	75 %	25 %	470464831
141	NC_020797	AGAC	2	8	52329	52336	50 %	0 %	25 %	25 %	470464832
142	NC_020797	CCTG	2	8	52452	52459	0 %	25 %	25 %	50 %	470464832
143	NC_020797	GATC	2	8	52467	52474	25 %	25 %	25 %	25 %	470464832
144	NC_020797	TCGC	2	8	52523	52530	0 %	25 %	25 %	50 %	470464832
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149	NC_020797	TTCG	2	8	54202	54209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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180	NC_020797	GTCG	2	8	63642	63649	0 %	25 %	50 %	25 %	470464840
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182	NC_020797	TCGA	2	8	63865	63872	25 %	25 %	25 %	25 %	470464840

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.