MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017562	GC	3	6	184222	184227	0 %	0 %	50 %	50 %	386083283
4002	NC_017562	AAG	2	6	184248	184253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083283
4003	NC_017562	GTACT	2	10	184281	184290	20 %	40 %	20 %	20 %	386083283
4004	NC_017562	GCGAT	2	10	184325	184334	20 %	20 %	40 %	20 %	386083283
4005	NC_017562	CGG	2	6	184395	184400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083283
4006	NC_017562	CAC	2	6	184485	184490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083283
4007	NC_017562	ACAA	2	8	184526	184533	75 %	0 %	0 %	25 %	386083283
4008	NC_017562	CAC	2	6	184629	184634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083283
4009	NC_017562	CAA	2	6	184656	184661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083283
4010	NC_017562	ACG	2	6	184702	184707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083283
4011	NC_017562	GCTG	2	8	184756	184763	0 %	25 %	50 %	25 %	386083283
4012	NC_017562	CAC	2	6	184833	184838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083283
4013	NC_017562	CGCA	2	8	184844	184851	25 %	0 %	25 %	50 %	386083283
4014	NC_017562	CCAG	2	8	184958	184965	25 %	0 %	25 %	50 %	386083283
4015	NC_017562	ACC	2	6	185032	185037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083283
4016	NC_017562	TCG	2	6	185063	185068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083283
4017	NC_017562	TCCA	2	8	185251	185258	25 %	25 %	0 %	50 %	386083283
4018	NC_017562	GCT	2	6	185330	185335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083283
4019	NC_017562	TCC	2	6	185348	185353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083283
4020	NC_017562	ACGTG	2	10	185374	185383	20 %	20 %	40 %	20 %	386083283
4021	NC_017562	GCA	2	6	185396	185401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083283
4022	NC_017562	GA	3	6	185418	185423	50 %	0 %	50 %	0 %	386083283
4023	NC_017562	TTC	2	6	185516	185521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083283
4024	NC_017562	CGA	2	6	185531	185536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017562	CCG	2	6	185546	185551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_017562	CAT	2	6	185595	185600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017562	CGA	2	6	185876	185881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083285
4028	NC_017562	CG	3	6	185960	185965	0 %	0 %	50 %	50 %	386083285
4029	NC_017562	ACG	2	6	186010	186015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083285
4030	NC_017562	ACT	2	6	186263	186268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083285
4031	NC_017562	CCT	2	6	186294	186299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083285
4032	NC_017562	CCT	2	6	186306	186311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083285
4033	NC_017562	TTG	2	6	186367	186372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083285
4034	NC_017562	CTG	2	6	186418	186423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083285
4035	NC_017562	CCA	3	9	186498	186506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083285
4036	NC_017562	GTA	2	6	186538	186543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083285
4037	NC_017562	CAAT	2	8	186609	186616	50 %	25 %	0 %	25 %	386083285
4038	NC_017562	CAGA	2	8	186675	186682	50 %	0 %	25 %	25 %	386083285
4039	NC_017562	CAG	2	6	186693	186698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083285
4040	NC_017562	TCA	2	6	186763	186768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017562	CCAG	2	8	186852	186859	25 %	0 %	25 %	50 %	386083286
4042	NC_017562	CCA	2	6	186891	186896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083286
4043	NC_017562	ATA	2	6	186919	186924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083286
4044	NC_017562	CGG	2	6	186943	186948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083286
4045	NC_017562	GCA	2	6	187014	187019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083286
4046	NC_017562	ACG	2	6	187088	187093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083286
4047	NC_017562	CG	3	6	187092	187097	0 %	0 %	50 %	50 %	386083286
4048	NC_017562	C	6	6	187110	187115	0 %	0 %	0 %	100 %	386083286
4049	NC_017562	AGCA	2	8	187118	187125	50 %	0 %	25 %	25 %	386083286
4050	NC_017562	GTAA	2	8	187208	187215	50 %	25 %	25 %	0 %	386083286
4051	NC_017562	CAC	2	6	187268	187273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083286
4052	NC_017562	GATCA	2	10	187340	187349	40 %	20 %	20 %	20 %	386083286
4053	NC_017562	GCA	2	6	187350	187355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083286
4054	NC_017562	GAG	2	6	187359	187364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083286
4055	NC_017562	AAC	2	6	187377	187382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083286
4056	NC_017562	CGC	2	6	187457	187462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083286
4057	NC_017562	GCCA	2	8	187477	187484	25 %	0 %	25 %	50 %	386083286
4058	NC_017562	CCA	2	6	187528	187533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083286
4059	NC_017562	GCTT	2	8	187557	187564	0 %	50 %	25 %	25 %	386083286
4060	NC_017562	CAG	2	6	187603	187608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083286
4061	NC_017562	GGC	2	6	187619	187624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083286
4062	NC_017562	AAC	2	6	187638	187643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083286
4063	NC_017562	CAC	2	6	187660	187665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083286
4064	NC_017562	AAC	2	6	187708	187713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083286
4065	NC_017562	CATTC	2	10	187795	187804	20 %	40 %	0 %	40 %	386083286
4066	NC_017562	AGAA	2	8	187898	187905	75 %	0 %	25 %	0 %	386083286
4067	NC_017562	TTTATT	2	12	187906	187917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017562	GCA	2	6	187928	187933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017562	AACAT	2	10	187944	187953	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4070	NC_017562	ACC	2	6	187997	188002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_017562	A	7	7	188067	188073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017562	CTAAA	2	10	188075	188084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4073	NC_017562	CAAA	2	8	188159	188166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_017562	GCAA	2	8	188250	188257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_017562	AG	3	6	188271	188276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017562	AAC	2	6	188297	188302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_017562	TAAA	2	8	188313	188320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017562	CCT	2	6	188375	188380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_017562	TA	3	6	188391	188396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017562	TC	3	6	188402	188407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_017562	A	6	6	188433	188438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017562	GCA	2	6	188439	188444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017562	TCC	2	6	188445	188450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_017562	ATG	2	6	188453	188458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017562	CGC	2	6	188482	188487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_017562	CATC	2	8	188501	188508	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_017562	CCGTA	2	10	188570	188579	20 %	20 %	20 %	40 %	386083287
4088	NC_017562	CAAG	2	8	188630	188637	50 %	0 %	25 %	25 %	386083287
4089	NC_017562	CAT	3	9	188707	188715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083287
4090	NC_017562	CCG	2	6	188788	188793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083287
4091	NC_017562	AAC	2	6	188796	188801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4092	NC_017562	TAC	2	6	188811	188816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083287
4093	NC_017562	AAC	2	6	188833	188838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4094	NC_017562	TAC	2	6	188875	188880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083287
4095	NC_017562	AC	3	6	188884	188889	50 %	0 %	0 %	50 %	386083287
4096	NC_017562	GCA	2	6	188895	188900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083287
4097	NC_017562	AC	3	6	189016	189021	50 %	0 %	0 %	50 %	386083287
4098	NC_017562	A	7	7	189026	189032	100 %	0 %	0 %	0 %	386083287
4099	NC_017562	A	6	6	189043	189048	100 %	0 %	0 %	0 %	386083287
4100	NC_017562	AGC	2	6	189193	189198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083287
4101	NC_017562	CAC	2	6	189200	189205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083287
4102	NC_017562	ACA	2	6	189206	189211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4103	NC_017562	GCT	2	6	189276	189281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083287
4104	NC_017562	ACA	2	6	189288	189293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4105	NC_017562	CAA	3	9	189301	189309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4106	NC_017562	AAC	2	6	189338	189343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4107	NC_017562	CAA	2	6	189355	189360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083287
4108	NC_017562	GTG	3	9	189486	189494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083287
4109	NC_017562	GTG	2	6	189537	189542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083287
4110	NC_017562	CA	3	6	189582	189587	50 %	0 %	0 %	50 %	386083287
4111	NC_017562	GAA	2	6	189614	189619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083287
4112	NC_017562	ACG	2	6	189627	189632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083287
4113	NC_017562	CGC	2	6	189633	189638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083287
4114	NC_017562	GAT	2	6	189668	189673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083287
4115	NC_017562	AC	3	6	189686	189691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_017562	AAC	2	6	189747	189752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083288
4117	NC_017562	CCAAA	2	10	189757	189766	60 %	0 %	0 %	40 %	386083288
4118	NC_017562	TAA	2	6	189830	189835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083288
4119	NC_017562	CAT	2	6	189896	189901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083288
4120	NC_017562	GCA	2	6	189922	189927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083288
4121	NC_017562	CTT	2	6	189955	189960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083288
4122	NC_017562	GCA	2	6	189975	189980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083288
4123	NC_017562	GCT	2	6	190069	190074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083288
4124	NC_017562	TAA	2	6	190130	190135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083288
4125	NC_017562	GAT	2	6	190181	190186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083288
4126	NC_017562	CAG	2	6	190243	190248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083288
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4130	NC_017562	CAA	2	6	190322	190327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083288
4131	NC_017562	GATC	2	8	190393	190400	25 %	25 %	25 %	25 %	386083288
4132	NC_017562	GCA	2	6	190417	190422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083288
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4134	NC_017562	CCA	2	6	190513	190518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083288
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4136	NC_017562	CTG	2	6	190583	190588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083288
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4157	NC_017562	CG	3	6	191333	191338	0 %	0 %	50 %	50 %	386083289
4158	NC_017562	GCAT	2	8	191359	191366	25 %	25 %	25 %	25 %	386083289
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4171	NC_017562	A	6	6	191940	191945	100 %	0 %	0 %	0 %	386083290
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4199	NC_017562	TGA	2	6	193274	193279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4210	NC_017562	GGCAC	2	10	194315	194324	20 %	0 %	40 %	40 %	386083292
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4233	NC_017562	ACACC	2	10	195457	195466	40 %	0 %	0 %	60 %	386083293
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4238	NC_017562	CAA	2	6	195727	195732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4239	NC_017562	CAC	2	6	195781	195786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083294
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4243	NC_017562	ACC	2	6	196001	196006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083294
4244	NC_017562	AGA	2	6	196018	196023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083294
4245	NC_017562	ATT	2	6	196121	196126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083294
4246	NC_017562	A	7	7	196138	196144	100 %	0 %	0 %	0 %	386083294
4247	NC_017562	CAA	2	6	196199	196204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083295
4248	NC_017562	CGC	2	6	196205	196210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083295
4249	NC_017562	A	6	6	196265	196270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_017562	TAG	2	6	196345	196350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_017562	AG	3	6	196391	196396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017562	ATTG	2	8	196424	196431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_017562	GT	3	6	196469	196474	0 %	50 %	50 %	0 %	386083296
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4262	NC_017562	ACC	2	6	196961	196966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083296
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4269	NC_017562	CAGG	2	8	197401	197408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4270	NC_017562	TCC	2	6	197592	197597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4362	NC_017562	CAACCC	2	12	202647	202658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4363	NC_017562	GCC	2	6	202671	202676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4364	NC_017562	CCAT	2	8	202687	202694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4365	NC_017562	TCA	2	6	202702	202707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4369	NC_017562	CAA	2	6	203136	203141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083300
4370	NC_017562	GCACA	2	10	203175	203184	40 %	0 %	20 %	40 %	386083300
4371	NC_017562	GTG	2	6	203185	203190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083300
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4373	NC_017562	GC	3	6	203337	203342	0 %	0 %	50 %	50 %	386083300
4374	NC_017562	CCA	2	6	203470	203475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083300
4375	NC_017562	CGA	2	6	203494	203499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083300
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4377	NC_017562	CCCGC	2	10	203573	203582	0 %	0 %	20 %	80 %	386083300
4378	NC_017562	GCG	2	6	203591	203596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083300
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4498	NC_017562	CAT	2	6	210172	210177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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