MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017562	A	6	6	159240	159245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017562	A	7	7	159268	159274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017562	GCG	2	6	159313	159318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_017562	GCT	2	6	159341	159346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083250
3505	NC_017562	GGC	2	6	159408	159413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083250
3506	NC_017562	CTGC	2	8	159430	159437	0 %	25 %	25 %	50 %	386083250
3507	NC_017562	G	6	6	159463	159468	0 %	0 %	100 %	0 %	386083250
3508	NC_017562	G	6	6	159530	159535	0 %	0 %	100 %	0 %	386083250
3509	NC_017562	TCA	2	6	159587	159592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083250
3510	NC_017562	GAC	2	6	159650	159655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083250
3511	NC_017562	GCA	2	6	159731	159736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083250
3512	NC_017562	CAC	2	6	159764	159769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083250
3513	NC_017562	A	6	6	159820	159825	100 %	0 %	0 %	0 %	386083250
3514	NC_017562	GGT	2	6	159830	159835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083250
3515	NC_017562	GTT	2	6	159879	159884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083250
3516	NC_017562	AT	3	6	159886	159891	50 %	50 %	0 %	0 %	386083250
3517	NC_017562	CGG	2	6	159945	159950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083250
3518	NC_017562	AGC	2	6	159994	159999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083250
3519	NC_017562	GCA	2	6	160030	160035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083250
3520	NC_017562	CAA	2	6	160043	160048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083250
3521	NC_017562	AT	3	6	160071	160076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017562	ATC	2	6	160089	160094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_017562	A	7	7	160236	160242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017562	GT	3	6	160369	160374	0 %	50 %	50 %	0 %	386083251
3525	NC_017562	CTG	2	6	160385	160390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083251
3526	NC_017562	GCG	2	6	160433	160438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083251
3527	NC_017562	GCA	2	6	160545	160550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083251
3528	NC_017562	TGT	2	6	160571	160576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083251
3529	NC_017562	CGGA	2	8	160590	160597	25 %	0 %	50 %	25 %	386083251
3530	NC_017562	TGGC	2	8	160647	160654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_017562	TG	3	6	160720	160725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017562	CAT	2	6	160729	160734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_017562	CGC	2	6	160782	160787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083252
3534	NC_017562	GCT	2	6	160825	160830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3535	NC_017562	GAC	2	6	160831	160836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3536	NC_017562	GTT	2	6	160839	160844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083252
3537	NC_017562	A	6	6	160905	160910	100 %	0 %	0 %	0 %	386083252
3538	NC_017562	GGT	2	6	160938	160943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083252
3539	NC_017562	CGAAGC	2	12	160971	160982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3540	NC_017562	CTG	3	9	160984	160992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3541	NC_017562	TGC	2	6	161036	161041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3542	NC_017562	GAC	2	6	161044	161049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3543	NC_017562	CTG	2	6	161068	161073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3544	NC_017562	GT	3	6	161222	161227	0 %	50 %	50 %	0 %	386083252
3545	NC_017562	CA	3	6	161298	161303	50 %	0 %	0 %	50 %	386083252
3546	NC_017562	AGA	2	6	161370	161375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083252
3547	NC_017562	CG	3	6	161427	161432	0 %	0 %	50 %	50 %	386083252
3548	NC_017562	GCA	2	6	161459	161464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3549	NC_017562	GGAC	2	8	161484	161491	25 %	0 %	50 %	25 %	386083252
3550	NC_017562	CTG	2	6	161548	161553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3551	NC_017562	GAA	2	6	161614	161619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083252
3552	NC_017562	TC	3	6	161648	161653	0 %	50 %	0 %	50 %	386083252
3553	NC_017562	TAC	2	6	161656	161661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083252
3554	NC_017562	CTG	2	6	161689	161694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3555	NC_017562	CA	3	6	161713	161718	50 %	0 %	0 %	50 %	386083252
3556	NC_017562	GTG	2	6	161780	161785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083252
3557	NC_017562	CGTA	2	8	161811	161818	25 %	25 %	25 %	25 %	386083252
3558	NC_017562	CCT	2	6	161969	161974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083252
3559	NC_017562	GTG	2	6	161977	161982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083252
3560	NC_017562	ACA	2	6	162023	162028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083252
3561	NC_017562	GAC	2	6	162049	162054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3562	NC_017562	GCA	2	6	162058	162063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3563	NC_017562	CCG	2	6	162090	162095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083252
3564	NC_017562	GAA	2	6	162103	162108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083252
3565	NC_017562	GGT	2	6	162148	162153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083252
3566	NC_017562	TGC	2	6	162209	162214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3567	NC_017562	TGGA	2	8	162272	162279	25 %	25 %	50 %	0 %	386083252
3568	NC_017562	AGC	2	6	162297	162302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3569	NC_017562	CAG	2	6	162325	162330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3570	NC_017562	A	6	6	162383	162388	100 %	0 %	0 %	0 %	386083252
3571	NC_017562	AGA	2	6	162408	162413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083252
3572	NC_017562	CGC	3	9	162433	162441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083252
3573	NC_017562	TCT	2	6	162447	162452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083252
3574	NC_017562	TGG	2	6	162462	162467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083252
3575	NC_017562	GCT	2	6	162484	162489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083252
3576	NC_017562	ATG	2	6	162575	162580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083252
3577	NC_017562	GCT	2	6	162632	162637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083253
3578	NC_017562	TGA	2	6	162646	162651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083253
3579	NC_017562	TCTA	2	8	162673	162680	25 %	50 %	0 %	25 %	386083253
3580	NC_017562	GATG	2	8	162747	162754	25 %	25 %	50 %	0 %	386083253
3581	NC_017562	CGT	2	6	162762	162767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083253
3582	NC_017562	TGG	2	6	162823	162828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083253
3583	NC_017562	ATT	2	6	162836	162841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083253
3584	NC_017562	GCA	2	6	162885	162890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083253
3585	NC_017562	GAC	2	6	162992	162997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083253
3586	NC_017562	GAA	2	6	163046	163051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083253
3587	NC_017562	GC	3	6	163401	163406	0 %	0 %	50 %	50 %	386083254
3588	NC_017562	CAA	2	6	163435	163440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083254
3589	NC_017562	GTC	2	6	163454	163459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083254
3590	NC_017562	C	8	8	163478	163485	0 %	0 %	0 %	100 %	386083254
3591	NC_017562	TCA	2	6	163707	163712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_017562	C	6	6	163772	163777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3593	NC_017562	A	7	7	163832	163838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017562	AACT	2	8	163843	163850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_017562	CAT	2	6	163901	163906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_017562	CATTA	2	10	163940	163949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3597	NC_017562	AGA	2	6	164013	164018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083255
3598	NC_017562	GCTT	2	8	164056	164063	0 %	50 %	25 %	25 %	386083255
3599	NC_017562	CGC	2	6	164135	164140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083255
3600	NC_017562	CCA	2	6	164165	164170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083255
3601	NC_017562	GCA	2	6	164224	164229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083255
3602	NC_017562	CAAC	2	8	164383	164390	50 %	0 %	0 %	50 %	386083255
3603	NC_017562	GA	4	8	164397	164404	50 %	0 %	50 %	0 %	386083255
3604	NC_017562	AACTAA	2	12	164452	164463	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3605	NC_017562	ATG	2	6	164477	164482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017562	ATT	2	6	164535	164540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017562	GTC	2	6	164566	164571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017562	CCG	2	6	164606	164611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_017562	TTGG	2	8	164703	164710	0 %	50 %	50 %	0 %	386083256
3610	NC_017562	CCA	2	6	164871	164876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083256
3611	NC_017562	GCT	2	6	164903	164908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083256
3612	NC_017562	CAAC	2	8	165089	165096	50 %	0 %	0 %	50 %	386083256
3613	NC_017562	AAAG	2	8	165109	165116	75 %	0 %	25 %	0 %	386083256
3614	NC_017562	TGC	2	6	165225	165230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_017562	CAGA	2	8	165243	165250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_017562	AC	3	6	165267	165272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_017562	ATG	2	6	165337	165342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017562	GA	3	6	165343	165348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017562	GAT	2	6	165367	165372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017562	ATA	2	6	165430	165435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017562	AAC	2	6	165705	165710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_017562	CCCCA	2	10	165722	165731	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3623	NC_017562	CGA	2	6	165803	165808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083257
3624	NC_017562	TCA	2	6	165972	165977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083257
3625	NC_017562	CGC	2	6	166018	166023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083257
3626	NC_017562	ACA	2	6	166051	166056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083257
3627	NC_017562	CA	3	6	166129	166134	50 %	0 %	0 %	50 %	386083257
3628	NC_017562	ATC	2	6	166148	166153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083257
3629	NC_017562	CAT	2	6	166237	166242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083257
3630	NC_017562	ATG	2	6	166256	166261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083257
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3644	NC_017562	CTCCA	2	10	166850	166859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3645	NC_017562	ACAG	2	8	166866	166873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3646	NC_017562	CA	3	6	166936	166941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3647	NC_017562	TAC	2	6	166959	166964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3650	NC_017562	GAA	2	6	167047	167052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3664	NC_017562	TTCCA	2	10	167808	167817	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3665	NC_017562	AG	3	6	167961	167966	50 %	0 %	50 %	0 %	386083259
3666	NC_017562	TGC	2	6	168002	168007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083259
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3717	NC_017562	ACCG	2	8	170193	170200	25 %	0 %	25 %	50 %	386083262
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3720	NC_017562	T	6	6	170241	170246	0 %	100 %	0 %	0 %	386083262
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3731	NC_017562	CGA	2	6	170776	170781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083263
3732	NC_017562	TCT	2	6	170890	170895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083263
3733	NC_017562	CGG	2	6	170927	170932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083263
3734	NC_017562	ATCA	2	8	170936	170943	50 %	25 %	0 %	25 %	386083263
3735	NC_017562	ATC	2	6	171021	171026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083263
3736	NC_017562	ATCA	2	8	171038	171045	50 %	25 %	0 %	25 %	386083263
3737	NC_017562	TCAA	2	8	171090	171097	50 %	25 %	0 %	25 %	386083263
3738	NC_017562	CAG	2	6	171173	171178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083263
3739	NC_017562	GCAAC	2	10	171202	171211	40 %	0 %	20 %	40 %	386083263
3740	NC_017562	AACC	2	8	171259	171266	50 %	0 %	0 %	50 %	386083263
3741	NC_017562	ACGC	2	8	171278	171285	25 %	0 %	25 %	50 %	386083263
3742	NC_017562	GA	4	8	171295	171302	50 %	0 %	50 %	0 %	386083263
3743	NC_017562	GGC	2	6	171319	171324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083263
3744	NC_017562	GCA	2	6	171360	171365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083263
3745	NC_017562	GC	3	6	171369	171374	0 %	0 %	50 %	50 %	386083263
3746	NC_017562	GGT	2	6	171380	171385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083263
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3749	NC_017562	CAC	2	6	171457	171462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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