MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017562	CCG	2	6	113232	113237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083213
2502	NC_017562	GTTG	2	8	113243	113250	0 %	50 %	50 %	0 %	386083213
2503	NC_017562	ATCA	2	8	113260	113267	50 %	25 %	0 %	25 %	386083213
2504	NC_017562	GC	3	6	113280	113285	0 %	0 %	50 %	50 %	386083213
2505	NC_017562	AC	3	6	113295	113300	50 %	0 %	0 %	50 %	386083213
2506	NC_017562	GGCTTC	2	12	113483	113494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083213
2507	NC_017562	TGC	2	6	113514	113519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083213
2508	NC_017562	TCA	2	6	113568	113573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083213
2509	NC_017562	ACG	2	6	113610	113615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083213
2510	NC_017562	ATCA	2	8	113657	113664	50 %	25 %	0 %	25 %	386083213
2511	NC_017562	GAG	2	6	113747	113752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083213
2512	NC_017562	CTT	2	6	113839	113844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083213
2513	NC_017562	AGTC	2	8	113856	113863	25 %	25 %	25 %	25 %	386083213
2514	NC_017562	CTT	2	6	113893	113898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083213
2515	NC_017562	AGGA	2	8	113907	113914	50 %	0 %	50 %	0 %	386083213
2516	NC_017562	AC	3	6	113931	113936	50 %	0 %	0 %	50 %	386083213
2517	NC_017562	TCA	2	6	113983	113988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083213
2518	NC_017562	GCCGTG	2	12	113997	114008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386083213
2519	NC_017562	A	6	6	114018	114023	100 %	0 %	0 %	0 %	386083213
2520	NC_017562	ATC	2	6	114086	114091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083213
2521	NC_017562	A	6	6	114118	114123	100 %	0 %	0 %	0 %	386083213
2522	NC_017562	A	6	6	114164	114169	100 %	0 %	0 %	0 %	386083213
2523	NC_017562	AGAA	2	8	114183	114190	75 %	0 %	25 %	0 %	386083213
2524	NC_017562	A	6	6	114194	114199	100 %	0 %	0 %	0 %	386083213
2525	NC_017562	AAG	2	6	114234	114239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083213
2526	NC_017562	TAC	2	6	114252	114257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083213
2527	NC_017562	AATA	2	8	114266	114273	75 %	25 %	0 %	0 %	386083213
2528	NC_017562	ATGAC	2	10	114305	114314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2529	NC_017562	ACTT	2	8	114336	114343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_017562	ATC	2	6	114396	114401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083214
2531	NC_017562	TAG	2	6	114403	114408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083214
2532	NC_017562	CAT	2	6	114428	114433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083214
2533	NC_017562	GCTT	2	8	114484	114491	0 %	50 %	25 %	25 %	386083214
2534	NC_017562	CCG	2	6	114501	114506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083214
2535	NC_017562	ACT	2	6	114514	114519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083214
2536	NC_017562	T	6	6	114528	114533	0 %	100 %	0 %	0 %	386083214
2537	NC_017562	AGC	2	6	114542	114547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083214
2538	NC_017562	ATG	2	6	114603	114608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083214
2539	NC_017562	CACCAA	2	12	114674	114685	50 %	0 %	0 %	50 %	386083214
2540	NC_017562	AACCG	2	10	114703	114712	40 %	0 %	20 %	40 %	386083214
2541	NC_017562	ACC	2	6	114734	114739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083214
2542	NC_017562	TCG	2	6	114901	114906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083214
2543	NC_017562	CA	3	6	114925	114930	50 %	0 %	0 %	50 %	386083214
2544	NC_017562	AATC	2	8	114940	114947	50 %	25 %	0 %	25 %	386083214
2545	NC_017562	GAA	2	6	114960	114965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083214
2546	NC_017562	TCC	2	6	114986	114991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083214
2547	NC_017562	ACA	2	6	115024	115029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083214
2548	NC_017562	CAG	2	6	115037	115042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083214
2549	NC_017562	CAGAA	2	10	115069	115078	60 %	0 %	20 %	20 %	386083214
2550	NC_017562	TGAA	2	8	115173	115180	50 %	25 %	25 %	0 %	386083214
2551	NC_017562	TTA	2	6	115188	115193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_017562	ACGC	2	8	115213	115220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_017562	ATC	2	6	115259	115264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_017562	T	6	6	115268	115273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_017562	TAC	2	6	115316	115321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_017562	A	6	6	115349	115354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017562	ATCC	2	8	115377	115384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_017562	A	6	6	115460	115465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017562	TCC	2	6	115502	115507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_017562	CTG	3	9	115634	115642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083215
2561	NC_017562	GCAC	2	8	115823	115830	25 %	0 %	25 %	50 %	386083215
2562	NC_017562	GGA	2	6	115880	115885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083215
2563	NC_017562	CCG	2	6	115888	115893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083215
2564	NC_017562	GCG	2	6	116109	116114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083215
2565	NC_017562	GAGT	2	8	116136	116143	25 %	25 %	50 %	0 %	386083215
2566	NC_017562	CGAAGG	2	12	116173	116184	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386083215
2567	NC_017562	GCC	2	6	116297	116302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083216
2568	NC_017562	ATC	2	6	116425	116430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083216
2569	NC_017562	GCTC	2	8	116504	116511	0 %	25 %	25 %	50 %	386083216
2570	NC_017562	GCA	2	6	116524	116529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083216
2571	NC_017562	CA	3	6	116547	116552	50 %	0 %	0 %	50 %	386083216
2572	NC_017562	GAA	2	6	116560	116565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083216
2573	NC_017562	TCA	2	6	116618	116623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083216
2574	NC_017562	CA	4	8	116670	116677	50 %	0 %	0 %	50 %	386083216
2575	NC_017562	ACCG	2	8	116809	116816	25 %	0 %	25 %	50 %	386083216
2576	NC_017562	ACC	2	6	116893	116898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083216
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2579	NC_017562	CCAAA	2	10	117057	117066	60 %	0 %	0 %	40 %	386083216
2580	NC_017562	AAT	2	6	117109	117114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083216
2581	NC_017562	AGC	2	6	117117	117122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083216
2582	NC_017562	CAA	2	6	117156	117161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_017562	ACA	2	6	117162	117167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_017562	TCA	2	6	117190	117195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2586	NC_017562	A	6	6	117482	117487	100 %	0 %	0 %	0 %	386083217
2587	NC_017562	GCCAC	2	10	117658	117667	20 %	0 %	20 %	60 %	386083217
2588	NC_017562	CGC	2	6	117832	117837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083217
2589	NC_017562	ACA	2	6	117888	117893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083217
2590	NC_017562	GCGAC	2	10	117901	117910	20 %	0 %	40 %	40 %	386083217
2591	NC_017562	TGGC	2	8	117972	117979	0 %	25 %	50 %	25 %	386083217
2592	NC_017562	CGC	2	6	117983	117988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083217
2593	NC_017562	ACC	2	6	118011	118016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083217
2594	NC_017562	GCGGCC	2	12	118020	118031	0 %	0 %	50 %	50 %	386083217
2595	NC_017562	GCA	2	6	118133	118138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_017562	CA	3	6	118149	118154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_017562	ACC	2	6	118155	118160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_017562	TCG	2	6	118196	118201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_017562	AGA	2	6	118216	118221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_017562	GAAACA	2	12	118223	118234	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2601	NC_017562	CAGCG	2	10	118301	118310	20 %	0 %	40 %	40 %	386083218
2602	NC_017562	AC	3	6	118312	118317	50 %	0 %	0 %	50 %	386083218
2603	NC_017562	TGC	2	6	118365	118370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2604	NC_017562	CAG	2	6	118591	118596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2605	NC_017562	CGGA	2	8	118687	118694	25 %	0 %	50 %	25 %	386083218
2606	NC_017562	ACC	2	6	118695	118700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2607	NC_017562	CAT	2	6	118805	118810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083218
2608	NC_017562	ACGCA	2	10	118818	118827	40 %	0 %	20 %	40 %	386083218
2609	NC_017562	ACCA	2	8	118871	118878	50 %	0 %	0 %	50 %	386083218
2610	NC_017562	CAC	2	6	118879	118884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2611	NC_017562	GCAAC	2	10	118918	118927	40 %	0 %	20 %	40 %	386083218
2612	NC_017562	CCA	2	6	118978	118983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083218
2613	NC_017562	GCC	2	6	119013	119018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083218
2614	NC_017562	TGC	2	6	119031	119036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2615	NC_017562	CA	3	6	119155	119160	50 %	0 %	0 %	50 %	386083218
2616	NC_017562	CACT	2	8	119163	119170	25 %	25 %	0 %	50 %	386083218
2617	NC_017562	CTT	2	6	119192	119197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083218
2618	NC_017562	CAGC	2	8	119269	119276	25 %	0 %	25 %	50 %	386083218
2619	NC_017562	CCCTT	2	10	119283	119292	0 %	40 %	0 %	60 %	386083218
2620	NC_017562	CAA	2	6	119309	119314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083218
2621	NC_017562	AAG	2	6	119354	119359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083218
2622	NC_017562	AAC	2	6	119415	119420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083218
2623	NC_017562	CTC	2	6	119450	119455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083218
2624	NC_017562	ACG	2	6	119459	119464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083218
2625	NC_017562	A	6	6	119466	119471	100 %	0 %	0 %	0 %	386083218
2626	NC_017562	TGC	2	6	119542	119547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083218
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2628	NC_017562	AAG	2	6	119624	119629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083218
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2654	NC_017562	TCC	2	6	120692	120697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2736	NC_017562	A	8	8	124366	124373	100 %	0 %	0 %	0 %	386083222
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2742	NC_017562	CGCCC	2	10	124583	124592	0 %	0 %	20 %	80 %	386083222
2743	NC_017562	GCA	2	6	124628	124633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083222
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2746	NC_017562	TACT	2	8	124732	124739	25 %	50 %	0 %	25 %	386083222
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