MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017562	CGCAGG	2	12	48680	48691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386083155
1002	NC_017562	CAA	2	6	48703	48708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083155
1003	NC_017562	CAA	2	6	48725	48730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083155
1004	NC_017562	AAC	2	6	48741	48746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083155
1005	NC_017562	CAA	2	6	48830	48835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083155
1006	NC_017562	TAAA	2	8	48842	48849	75 %	25 %	0 %	0 %	386083155
1007	NC_017562	TGC	2	6	48904	48909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083155
1008	NC_017562	A	7	7	48911	48917	100 %	0 %	0 %	0 %	386083155
1009	NC_017562	A	6	6	49021	49026	100 %	0 %	0 %	0 %	386083155
1010	NC_017562	TAT	2	6	49048	49053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083155
1011	NC_017562	ACC	2	6	49071	49076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083155
1012	NC_017562	ATC	2	6	49104	49109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083155
1013	NC_017562	CCA	2	6	49159	49164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083156
1014	NC_017562	A	12	12	49171	49182	100 %	0 %	0 %	0 %	386083156
1015	NC_017562	TAA	2	6	49183	49188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083156
1016	NC_017562	CGA	2	6	49190	49195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083156
1017	NC_017562	ACA	2	6	49230	49235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083156
1018	NC_017562	A	6	6	49246	49251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017562	ATCTC	2	10	49262	49271	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_017562	CAT	2	6	49317	49322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017562	A	6	6	49328	49333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017562	AAC	2	6	49340	49345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017562	ACTC	2	8	49354	49361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_017562	AC	3	6	49377	49382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_017562	CACT	2	8	49388	49395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017562	CAA	2	6	49476	49481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017562	CAC	3	9	49491	49499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_017562	TACC	2	8	49507	49514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_017562	AC	3	6	49515	49520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_017562	ACA	2	6	49544	49549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017562	CAT	2	6	49555	49560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017562	ACACA	2	10	49564	49573	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1033	NC_017562	ACA	2	6	49596	49601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017562	CCT	2	6	49646	49651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_017562	A	6	6	49682	49687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017562	ATT	2	6	49742	49747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017562	AC	3	6	49762	49767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_017562	CAA	2	6	49811	49816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017562	TGC	2	6	49883	49888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017562	CAT	2	6	49889	49894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017562	CA	3	6	49903	49908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_017562	CCT	2	6	49974	49979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017562	A	6	6	49990	49995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017562	CCCA	2	8	50071	50078	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1045	NC_017562	TCA	2	6	50105	50110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017562	CGC	2	6	50118	50123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017562	GGTA	2	8	50144	50151	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017562	TAA	2	6	50172	50177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017562	CTG	2	6	50204	50209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017562	A	7	7	50243	50249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017562	ATT	2	6	50257	50262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017562	TTTA	2	8	50286	50293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017562	T	7	7	50323	50329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017562	TAA	2	6	50331	50336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017562	TAAA	2	8	50398	50405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017562	CAA	2	6	50412	50417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017562	AATGA	2	10	50420	50429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017562	CAT	2	6	50436	50441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017562	AC	3	6	50453	50458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_017562	TAA	2	6	50473	50478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083157
1061	NC_017562	TCTCCT	2	12	50491	50502	0 %	50 %	0 %	50 %	386083157
1062	NC_017562	GGT	2	6	50616	50621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083157
1063	NC_017562	CTA	2	6	50681	50686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083157
1064	NC_017562	T	6	6	50701	50706	0 %	100 %	0 %	0 %	386083157
1065	NC_017562	TTC	2	6	50709	50714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083157
1066	NC_017562	T	6	6	50731	50736	0 %	100 %	0 %	0 %	386083157
1067	NC_017562	TCT	2	6	50758	50763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083157
1068	NC_017562	ATCT	2	8	50814	50821	25 %	50 %	0 %	25 %	386083157
1069	NC_017562	TAGT	2	8	50932	50939	25 %	50 %	25 %	0 %	386083158
1070	NC_017562	GAA	3	9	50946	50954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386083158
1071	NC_017562	ACGC	2	8	51082	51089	25 %	0 %	25 %	50 %	386083158
1072	NC_017562	TTA	2	6	51117	51122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083158
1073	NC_017562	T	6	6	51183	51188	0 %	100 %	0 %	0 %	386083158
1074	NC_017562	TTTA	2	8	51271	51278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017562	GAT	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017562	TAAA	2	8	51369	51376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017562	CAT	2	6	51407	51412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017562	AC	3	6	51424	51429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_017562	TAA	2	6	51444	51449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386083159
1080	NC_017562	TCTCCT	2	12	51462	51473	0 %	50 %	0 %	50 %	386083159
1081	NC_017562	CGG	2	6	51493	51498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083159
1082	NC_017562	A	6	6	51512	51517	100 %	0 %	0 %	0 %	386083159
1083	NC_017562	CCA	2	6	51583	51588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083159
1084	NC_017562	TTC	2	6	51590	51595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083159
1085	NC_017562	T	6	6	51681	51686	0 %	100 %	0 %	0 %	386083159
1086	NC_017562	TTC	2	6	51689	51694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083159
1087	NC_017562	TGA	2	6	51714	51719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083159
1088	NC_017562	TCC	2	6	51736	51741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386083159
1089	NC_017562	TCCA	2	8	51758	51765	25 %	25 %	0 %	50 %	386083159
1090	NC_017562	C	7	7	51769	51775	0 %	0 %	0 %	100 %	386083159
1091	NC_017562	ATC	2	6	51791	51796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083159
1092	NC_017562	TCA	2	6	51819	51824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017562	ATT	2	6	51883	51888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083160
1094	NC_017562	CCTT	2	8	51989	51996	0 %	50 %	0 %	50 %	386083160
1095	NC_017562	TCT	2	6	51999	52004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083160
1096	NC_017562	TTA	2	6	52097	52102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386083160
1097	NC_017562	CAA	2	6	52155	52160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386083160
1098	NC_017562	ATTC	2	8	52164	52171	25 %	50 %	0 %	25 %	386083160
1099	NC_017562	CAT	2	6	52203	52208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386083160
1100	NC_017562	T	6	6	52283	52288	0 %	100 %	0 %	0 %	386083160
1101	NC_017562	CTT	2	6	52302	52307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083160
1102	NC_017562	CCG	2	6	52352	52357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386083160
1103	NC_017562	T	6	6	52452	52457	0 %	100 %	0 %	0 %	386083160
1104	NC_017562	GGC	2	6	52552	52557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1105	NC_017562	GTT	2	6	52558	52563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083160
1106	NC_017562	GGCG	2	8	52575	52582	0 %	0 %	75 %	25 %	386083160
1107	NC_017562	GCG	3	9	52580	52588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1108	NC_017562	CTG	2	6	52589	52594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386083160
1109	NC_017562	CGG	2	6	52596	52601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1110	NC_017562	CGG	3	9	52611	52619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1111	NC_017562	CCA	2	6	52632	52637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083160
1112	NC_017562	GTT	2	6	52662	52667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083160
1113	NC_017562	TTC	2	6	52669	52674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386083160
1114	NC_017562	TGA	2	6	52725	52730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083160
1115	NC_017562	CGG	3	9	52734	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1116	NC_017562	CAC	2	6	52743	52748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083160
1117	NC_017562	CAC	2	6	52761	52766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386083160
1118	NC_017562	GCG	2	6	52781	52786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1119	NC_017562	AGG	2	6	52802	52807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386083160
1120	NC_017562	GCGG	2	8	52822	52829	0 %	0 %	75 %	25 %	386083160
1121	NC_017562	GCG	2	6	52898	52903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083160
1122	NC_017562	GCA	2	6	52908	52913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386083160
1123	NC_017562	GGCCG	2	10	52921	52930	0 %	0 %	60 %	40 %	386083161
1124	NC_017562	TTG	2	6	52936	52941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083161
1125	NC_017562	CGG	2	6	52944	52949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386083161
1126	NC_017562	GGT	2	6	52999	53004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386083161
1127	NC_017562	GTT	2	6	53005	53010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083161
1128	NC_017562	GTT	2	6	53019	53024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386083161
1129	NC_017562	GCG	2	6	53030	53035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017562	TTTA	2	8	53102	53109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017562	ATG	2	6	53133	53138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017562	TGG	2	6	53141	53146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017562	GCC	2	6	53187	53192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1500	NC_017562	TGA	2	6	64735	64740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386083171

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