MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 52261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_017562	CGT	2	6	2454169	2454174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51502	NC_017562	AGC	2	6	2454180	2454185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51503	NC_017562	CAA	2	6	2454188	2454193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085253
51504	NC_017562	AAT	2	6	2454299	2454304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085253
51505	NC_017562	CT	3	6	2454307	2454312	0 %	50 %	0 %	50 %	386085253
51506	NC_017562	CCA	2	6	2454321	2454326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085253
51507	NC_017562	AC	3	6	2454356	2454361	50 %	0 %	0 %	50 %	386085253
51508	NC_017562	TGC	2	6	2454373	2454378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51509	NC_017562	CCAC	2	8	2454400	2454407	25 %	0 %	0 %	75 %	386085253
51510	NC_017562	GCA	2	6	2454457	2454462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51511	NC_017562	GAC	2	6	2454471	2454476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51512	NC_017562	TCA	2	6	2454488	2454493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085253
51513	NC_017562	CTG	2	6	2454519	2454524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51514	NC_017562	CAC	2	6	2454530	2454535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085253
51515	NC_017562	GCG	2	6	2454540	2454545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085253
51516	NC_017562	GCG	2	6	2454591	2454596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085253
51517	NC_017562	AGA	2	6	2454602	2454607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085253
51518	NC_017562	CA	3	6	2454632	2454637	50 %	0 %	0 %	50 %	386085253
51519	NC_017562	GCA	2	6	2454640	2454645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51520	NC_017562	CTC	2	6	2454654	2454659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085253
51521	NC_017562	TTC	2	6	2454672	2454677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085253
51522	NC_017562	CAA	2	6	2454765	2454770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085253
51523	NC_017562	TCC	2	6	2454781	2454786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085253
51524	NC_017562	CAA	2	6	2454801	2454806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085253
51525	NC_017562	ACC	3	9	2454864	2454872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085253
51526	NC_017562	AGCA	2	8	2454952	2454959	50 %	0 %	25 %	25 %	386085253
51527	NC_017562	CCA	2	6	2454979	2454984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085253
51528	NC_017562	CAC	2	6	2455305	2455310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085253
51529	NC_017562	CTC	2	6	2455339	2455344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085253
51530	NC_017562	TCG	2	6	2455415	2455420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085253
51531	NC_017562	ACCA	2	8	2455488	2455495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51532	NC_017562	AC	3	6	2455544	2455549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51533	NC_017562	CGCAT	2	10	2455659	2455668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51534	NC_017562	TCA	2	6	2455704	2455709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51535	NC_017562	AAT	2	6	2455724	2455729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51536	NC_017562	CA	3	6	2455739	2455744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51537	NC_017562	ACTA	2	8	2455777	2455784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51538	NC_017562	A	6	6	2455790	2455795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51539	NC_017562	CTA	2	6	2455827	2455832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51540	NC_017562	TGC	2	6	2455882	2455887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51541	NC_017562	CTCC	2	8	2455913	2455920	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51542	NC_017562	CA	3	6	2455941	2455946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51543	NC_017562	CTGT	2	8	2455967	2455974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51544	NC_017562	ACGC	2	8	2455985	2455992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51545	NC_017562	AAC	2	6	2455993	2455998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51546	NC_017562	CTC	2	6	2456011	2456016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51547	NC_017562	CA	3	6	2456043	2456048	50 %	0 %	0 %	50 %	386085254
51548	NC_017562	ATG	2	6	2456074	2456079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085254
51549	NC_017562	TGGA	2	8	2456089	2456096	25 %	25 %	50 %	0 %	386085254
51550	NC_017562	AGATT	2	10	2456101	2456110	40 %	40 %	20 %	0 %	386085254
51551	NC_017562	CA	3	6	2456129	2456134	50 %	0 %	0 %	50 %	386085254
51552	NC_017562	GAAC	2	8	2456232	2456239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51553	NC_017562	A	6	6	2456241	2456246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51554	NC_017562	ATG	2	6	2456260	2456265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51555	NC_017562	AGC	3	9	2456282	2456290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51556	NC_017562	AAC	2	6	2456294	2456299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51557	NC_017562	TCA	2	6	2456302	2456307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51558	NC_017562	GCAACG	2	12	2456326	2456337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51559	NC_017562	TCA	2	6	2456353	2456358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51560	NC_017562	CA	3	6	2456363	2456368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51561	NC_017562	AC	3	6	2456383	2456388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51562	NC_017562	AAAC	2	8	2456406	2456413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51563	NC_017562	A	6	6	2456517	2456522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51564	NC_017562	CAA	2	6	2456538	2456543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51565	NC_017562	ACT	2	6	2456735	2456740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51566	NC_017562	GAC	2	6	2456826	2456831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51567	NC_017562	AC	3	6	2456830	2456835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51568	NC_017562	CTG	2	6	2456850	2456855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51569	NC_017562	AATCG	2	10	2456879	2456888	40 %	20 %	20 %	20 %	386085255
51570	NC_017562	TGGCAA	2	12	2456929	2456940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386085255
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51572	NC_017562	CA	3	6	2457016	2457021	50 %	0 %	0 %	50 %	386085255
51573	NC_017562	CAACC	2	10	2457146	2457155	40 %	0 %	0 %	60 %	386085255
51574	NC_017562	CAA	2	6	2457157	2457162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085255
51575	NC_017562	TAT	2	6	2457249	2457254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085255
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51577	NC_017562	CGT	2	6	2457347	2457352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085255
51578	NC_017562	TGC	2	6	2457356	2457361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085255
51579	NC_017562	CGC	2	6	2457393	2457398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085255
51580	NC_017562	GAAT	2	8	2457415	2457422	50 %	25 %	25 %	0 %	386085255
51581	NC_017562	CGT	3	9	2457506	2457514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085255
51582	NC_017562	CAAA	2	8	2457515	2457522	75 %	0 %	0 %	25 %	386085255
51583	NC_017562	GCC	2	6	2457543	2457548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085255
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51587	NC_017562	AC	4	8	2457752	2457759	50 %	0 %	0 %	50 %	386085255
51588	NC_017562	GCT	2	6	2457872	2457877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085255
51589	NC_017562	ACA	2	6	2457914	2457919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085255
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51591	NC_017562	GCTA	2	8	2457965	2457972	25 %	25 %	25 %	25 %	386085255
51592	NC_017562	CAA	2	6	2457979	2457984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085255
51593	NC_017562	CGAAT	2	10	2457986	2457995	40 %	20 %	20 %	20 %	386085255
51594	NC_017562	CAC	4	12	2458024	2458035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085255
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51596	NC_017562	CA	3	6	2458268	2458273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51597	NC_017562	AAC	2	6	2458372	2458377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085256
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51602	NC_017562	CAA	2	6	2458590	2458595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085256
51603	NC_017562	GCA	2	6	2458657	2458662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085256
51604	NC_017562	AC	3	6	2458697	2458702	50 %	0 %	0 %	50 %	386085256
51605	NC_017562	AGTCG	2	10	2458722	2458731	20 %	20 %	40 %	20 %	386085256
51606	NC_017562	AC	3	6	2458781	2458786	50 %	0 %	0 %	50 %	386085256
51607	NC_017562	TGA	2	6	2458795	2458800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085256
51608	NC_017562	CTC	2	6	2458824	2458829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085256
51609	NC_017562	CAG	2	6	2458886	2458891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085256
51610	NC_017562	CAGC	2	8	2458955	2458962	25 %	0 %	25 %	50 %	386085256
51611	NC_017562	GAA	2	6	2459041	2459046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085256
51612	NC_017562	TTG	2	6	2459158	2459163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085256
51613	NC_017562	CAT	2	6	2459165	2459170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085256
51614	NC_017562	AC	4	8	2459228	2459235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51615	NC_017562	GTAA	2	8	2459281	2459288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51616	NC_017562	AGTA	2	8	2459306	2459313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51617	NC_017562	TCA	2	6	2459331	2459336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51618	NC_017562	ACC	2	6	2459381	2459386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51619	NC_017562	AGTACG	2	12	2459391	2459402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51620	NC_017562	AAC	2	6	2459506	2459511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51621	NC_017562	AATTT	2	10	2459535	2459544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51623	NC_017562	ATT	2	6	2459607	2459612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51643	NC_017562	AAG	2	6	2460536	2460541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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