MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	CCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017561	TGG	2	6	152	157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017561	ACG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017561	CGC	2	6	275	280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017561	GTT	2	6	302	307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017561	GCG	3	9	360	368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017561	GCT	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017561	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017561	TTC	2	6	420	425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017561	GTT	2	6	427	432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017561	CAG	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017561	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017561	GTT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017561	TCT	2	6	592	597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017561	GGT	2	6	657	662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017561	CGT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017561	CCG	2	6	827	832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
18	NC_017561	CCA	2	6	902	907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
19	NC_017561	CGC	2	6	924	929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
20	NC_017561	GAC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
21	NC_017561	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
22	NC_017561	TGA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
23	NC_017561	CTT	2	6	1424	1429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085389
24	NC_017561	ATC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
25	NC_017561	CAT	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
26	NC_017561	CGT	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
27	NC_017561	TCG	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
28	NC_017561	CAG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
29	NC_017561	TGT	2	6	1688	1693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085389
30	NC_017561	ATG	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
31	NC_017561	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
32	NC_017561	AGC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
33	NC_017561	AAG	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085389
34	NC_017561	CTG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
35	NC_017561	GCT	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
36	NC_017561	ATG	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
37	NC_017561	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
38	NC_017561	CAG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
39	NC_017561	CCT	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085389
40	NC_017561	ACC	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
41	NC_017561	GAA	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085389
42	NC_017561	ATC	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
43	NC_017561	GTA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
44	NC_017561	CGC	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
45	NC_017561	GCA	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
46	NC_017561	ATG	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
47	NC_017561	CTT	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085389
48	NC_017561	GCG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085389
49	NC_017561	GAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085390
50	NC_017561	AAC	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085390
51	NC_017561	GTC	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085390
52	NC_017561	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085390
53	NC_017561	TCA	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
54	NC_017561	CGT	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085390
55	NC_017561	GCC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085390
56	NC_017561	TCA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
57	NC_017561	GCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085390
58	NC_017561	CTT	2	6	3746	3751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085390
59	NC_017561	CAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
60	NC_017561	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085390
61	NC_017561	CCA	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
62	NC_017561	ACC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
63	NC_017561	ATG	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085391
64	NC_017561	GTT	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085391
65	NC_017561	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
66	NC_017561	GCT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
67	NC_017561	GCC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085391
68	NC_017561	TGC	3	9	4717	4725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
69	NC_017561	GAA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085391
70	NC_017561	GTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085391
71	NC_017561	TGC	3	9	4858	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
72	NC_017561	GCA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085391
73	NC_017561	GCA	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085391
74	NC_017561	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
75	NC_017561	TTC	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
76	NC_017561	CTT	3	9	4989	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
77	NC_017561	ATT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085391
78	NC_017561	CCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
79	NC_017561	CAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085392
80	NC_017561	GAA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
81	NC_017561	GAA	2	6	5516	5521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
82	NC_017561	TCG	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085392
83	NC_017561	GCG	2	6	5580	5585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085392
84	NC_017561	CAC	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085392
85	NC_017561	GCA	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085392
86	NC_017561	TCT	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085392
87	NC_017561	TGT	2	6	5848	5853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085392
88	NC_017561	CAA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085392
89	NC_017561	AGA	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
90	NC_017561	TTG	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085392
91	NC_017561	TGC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085393
92	NC_017561	TCA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085393
93	NC_017561	AGT	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085393
94	NC_017561	TTG	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085393
95	NC_017561	ACT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085393
96	NC_017561	AGT	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085393
97	NC_017561	CCA	2	6	6603	6608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085393
98	NC_017561	GCT	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085393
99	NC_017561	CAG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017561	CCT	2	6	6872	6877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017561	GCC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017561	TGG	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017561	ATG	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017561	CCA	2	6	7221	7226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017561	CCA	2	6	7230	7235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017561	CCA	2	6	7299	7304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017561	AGT	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017561	AGC	2	6	7518	7523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017561	AAT	2	6	7539	7544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017561	CGG	2	6	7688	7693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017561	TTG	2	6	7717	7722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017561	TGT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085394
113	NC_017561	CAA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085394
114	NC_017561	GAT	2	6	8028	8033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085394
115	NC_017561	CGG	2	6	8077	8082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017561	TAG	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085395
117	NC_017561	CTG	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085395
118	NC_017561	TGA	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085395
119	NC_017561	AAC	2	6	8401	8406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085396
120	NC_017561	CTC	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085396
121	NC_017561	CGG	2	6	8443	8448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085396
122	NC_017561	GCC	2	6	8565	8570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085396
123	NC_017561	TGC	2	6	8725	8730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085396
124	NC_017561	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085396
125	NC_017561	TGC	2	6	8883	8888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085396
126	NC_017561	CTG	2	6	8903	8908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085396
127	NC_017561	TTC	2	6	9039	9044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085396
128	NC_017561	GCA	2	6	9197	9202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017561	GTG	2	6	9374	9379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017561	GCA	2	6	9426	9431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017561	ATG	2	6	9485	9490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017561	CGA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017561	CCA	2	6	9596	9601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017561	CCA	2	6	9669	9674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017561	GTT	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017561	CGC	2	6	10026	10031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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138	NC_017561	AGT	2	6	10235	10240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017561	AGT	2	6	10250	10255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017561	TGG	2	6	10448	10453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_017561	GTT	2	6	10771	10776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_017561	GGA	2	6	18926	18931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386085410
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262	NC_017561	TCT	2	6	18947	18952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085410
263	NC_017561	TGC	2	6	19180	19185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085411
264	NC_017561	TGG	2	6	19240	19245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085411
265	NC_017561	GTA	2	6	19275	19280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085411
266	NC_017561	TGG	2	6	19312	19317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085411
267	NC_017561	GTT	2	6	19327	19332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085411
268	NC_017561	AAG	2	6	19455	19460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017561	CCA	2	6	19550	19555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085412
270	NC_017561	TGC	2	6	19763	19768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085412
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272	NC_017561	CAT	2	6	19808	19813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085412
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275	NC_017561	AAT	2	6	20075	20080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085413
276	NC_017561	ACC	2	6	20255	20260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085413
277	NC_017561	CAA	2	6	20371	20376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085413
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279	NC_017561	TGT	2	6	20463	20468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017561	TGA	2	6	20570	20575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017561	ACC	2	6	20594	20599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_017561	TTA	2	6	20628	20633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017561	ATT	2	6	20661	20666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017561	TCA	2	6	20691	20696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_017561	CTT	3	9	20755	20763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_017561	TCT	2	6	20799	20804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085414
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291	NC_017561	TTC	2	6	20968	20973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085414
292	NC_017561	TGT	2	6	20987	20992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017561	ATT	2	6	21029	21034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017561	AGT	2	6	21062	21067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017561	TGA	2	6	21073	21078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017561	TGT	2	6	21134	21139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017561	AGT	2	6	21237	21242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017561	TTG	2	6	21284	21289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017561	ACC	2	6	21391	21396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085415
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302	NC_017561	TTC	2	6	21613	21618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085415
303	NC_017561	TAC	2	6	21626	21631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085415
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306	NC_017561	TTA	2	6	21937	21942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017561	CAT	2	6	21949	21954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085416
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311	NC_017561	CTT	2	6	22358	22363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085417
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323	NC_017561	GCA	2	6	23288	23293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085417
324	NC_017561	GGA	2	6	23324	23329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
325	NC_017561	CAT	2	6	23368	23373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085418
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351	NC_017561	TGG	2	6	25027	25032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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358	NC_017561	TGA	2	6	25513	25518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
359	NC_017561	TGG	2	6	25791	25796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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361	NC_017561	CCA	2	6	26085	26090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
362	NC_017561	TGG	2	6	26112	26117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.