MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	GAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076360
2	NC_017555	ACA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076360
3	NC_017555	CGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
4	NC_017555	GGC	2	6	146	151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
5	NC_017555	GAC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
6	NC_017555	GCT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
7	NC_017555	GC	5	10	308	317	0 %	0 %	50 %	50 %	386076360
8	NC_017555	CGGC	2	8	361	368	0 %	0 %	50 %	50 %	386076360
9	NC_017555	GTC	2	6	396	401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
10	NC_017555	GATC	2	8	431	438	25 %	25 %	25 %	25 %	386076360
11	NC_017555	CGG	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
12	NC_017555	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076360
13	NC_017555	GAT	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
14	NC_017555	TGG	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
15	NC_017555	ATC	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
16	NC_017555	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
17	NC_017555	GAT	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
18	NC_017555	CAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
19	NC_017555	GCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076361
20	NC_017555	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
21	NC_017555	GAC	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
22	NC_017555	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
23	NC_017555	ATTC	2	8	1317	1324	25 %	50 %	0 %	25 %	386076361
24	NC_017555	CA	3	6	1379	1384	50 %	0 %	0 %	50 %	386076361
25	NC_017555	TTC	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076361
26	NC_017555	GAA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
27	NC_017555	AAC	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
28	NC_017555	AGC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
29	NC_017555	CAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
30	NC_017555	GGT	2	6	1579	1584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
31	NC_017555	GC	3	6	1679	1684	0 %	0 %	50 %	50 %	386076361
32	NC_017555	GGT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
33	NC_017555	AAG	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
34	NC_017555	GTC	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076361
35	NC_017555	CGA	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
36	NC_017555	AGCC	2	8	1812	1819	25 %	0 %	25 %	50 %	386076361
37	NC_017555	TGC	2	6	1878	1883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017555	ATGT	2	8	1950	1957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017555	T	7	7	1978	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017555	T	6	6	2017	2022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017555	ACTGC	2	10	2072	2081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017555	TCT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017555	GCT	3	9	2136	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017555	GAA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017555	TCC	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076362
46	NC_017555	CTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076362
47	NC_017555	AGC	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
48	NC_017555	ACGTG	2	10	2382	2391	20 %	20 %	40 %	20 %	386076362
49	NC_017555	AGC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
50	NC_017555	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076362
51	NC_017555	TCG	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
52	NC_017555	CGAA	2	8	2727	2734	50 %	0 %	25 %	25 %	386076362
53	NC_017555	TTTTC	2	10	2761	2770	0 %	80 %	0 %	20 %	386076362
54	NC_017555	CAG	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
55	NC_017555	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	386076362
56	NC_017555	GTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
57	NC_017555	GGTC	2	8	2867	2874	0 %	25 %	50 %	25 %	386076362
58	NC_017555	T	6	6	2888	2893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017555	GCC	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017555	TTTC	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017555	TTC	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017555	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017555	GTA	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017555	GCA	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017555	TGC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017555	TCGT	2	8	3144	3151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017555	CGA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017555	TTA	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017555	A	6	6	3193	3198	100 %	0 %	0 %	0 %	386076363
70	NC_017555	GCT	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076363
71	NC_017555	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076363
72	NC_017555	C	6	6	3321	3326	0 %	0 %	0 %	100 %	386076363
73	NC_017555	ACGT	2	8	3377	3384	25 %	25 %	25 %	25 %	386076363
74	NC_017555	CCTA	2	8	3464	3471	25 %	25 %	0 %	50 %	386076363
75	NC_017555	CG	5	10	3579	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	386076363
76	NC_017555	G	6	6	3710	3715	0 %	0 %	100 %	0 %	386076363
77	NC_017555	CGG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017555	GC	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017555	GC	4	8	3823	3830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017555	GCA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017555	GGC	2	6	3942	3947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
82	NC_017555	A	6	6	4046	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	386076364
83	NC_017555	GCCG	2	8	4081	4088	0 %	0 %	50 %	50 %	386076364
84	NC_017555	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
85	NC_017555	GAA	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
86	NC_017555	ATG	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076364
87	NC_017555	GACC	2	8	4186	4193	25 %	0 %	25 %	50 %	386076364
88	NC_017555	C	6	6	4204	4209	0 %	0 %	0 %	100 %	386076364
89	NC_017555	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
90	NC_017555	GTC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
91	NC_017555	TCG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
92	NC_017555	TCG	2	6	4534	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
93	NC_017555	GCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
94	NC_017555	CAAG	2	8	4666	4673	50 %	0 %	25 %	25 %	386076364
95	NC_017555	GCG	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
96	NC_017555	CAG	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076364
97	NC_017555	ACCG	2	8	4715	4722	25 %	0 %	25 %	50 %	386076364
98	NC_017555	GC	6	12	4742	4753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017555	CTA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017555	GAAA	2	8	4796	4803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017555	GCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076365
102	NC_017555	GC	3	6	4880	4885	0 %	0 %	50 %	50 %	386076365
103	NC_017555	GCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
104	NC_017555	GCG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
105	NC_017555	GCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
106	NC_017555	TGG	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076365
107	NC_017555	GCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
108	NC_017555	CGT	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
109	NC_017555	CGG	3	9	5124	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
110	NC_017555	CGCTT	2	10	5147	5156	0 %	40 %	20 %	40 %	386076365
111	NC_017555	GCG	2	6	5183	5188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
112	NC_017555	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
113	NC_017555	GCT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
114	NC_017555	GCC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
115	NC_017555	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
116	NC_017555	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076365
117	NC_017555	GCT	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
118	NC_017555	GCC	3	9	5611	5619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
119	NC_017555	GCCT	2	8	5677	5684	0 %	25 %	25 %	50 %	386076365
120	NC_017555	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076365
121	NC_017555	TAAA	2	8	5773	5780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017555	CAAA	2	8	5781	5788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017555	TAA	2	6	5790	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017555	GGT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017555	CAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017555	CG	3	6	5962	5967	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
127	NC_017555	CGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
128	NC_017555	CGGC	2	8	6055	6062	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
129	NC_017555	GC	3	6	6061	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
130	NC_017555	TGCGC	2	10	6097	6106	0 %	20 %	40 %	40 %	386076366
131	NC_017555	TG	3	6	6124	6129	0 %	50 %	50 %	0 %	386076366
132	NC_017555	CGCT	2	8	6149	6156	0 %	25 %	25 %	50 %	386076366
133	NC_017555	TTGG	2	8	6164	6171	0 %	50 %	50 %	0 %	386076366
134	NC_017555	ACG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
135	NC_017555	CGGC	2	8	6243	6250	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
136	NC_017555	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076366
137	NC_017555	CG	4	8	6315	6322	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
138	NC_017555	CG	4	8	6338	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
139	NC_017555	TGC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076366
140	NC_017555	GACG	2	8	6433	6440	25 %	0 %	50 %	25 %	386076366
141	NC_017555	CGA	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
142	NC_017555	CG	3	6	6517	6522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017555	CAT	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017555	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
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146	NC_017555	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
147	NC_017555	GAAG	2	8	6667	6674	50 %	0 %	50 %	0 %	386076367
148	NC_017555	GC	3	6	6676	6681	0 %	0 %	50 %	50 %	386076367
149	NC_017555	GCGG	2	8	6763	6770	0 %	0 %	75 %	25 %	386076367
150	NC_017555	GAT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
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152	NC_017555	GA	3	6	6823	6828	50 %	0 %	50 %	0 %	386076367
153	NC_017555	GCG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076367
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158	NC_017555	CAT	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017555	CGG	2	6	7104	7109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017555	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_017555	AGC	3	9	7182	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017555	GTC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017555	CTG	2	6	7249	7254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017555	GGA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017555	AGC	3	9	7343	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
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182	NC_017555	TCT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
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185	NC_017555	AGC	2	6	8055	8060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_017555	TCA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076370
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239	NC_017555	GCT	2	6	10483	10488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076374
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246	NC_017555	CG	3	6	10875	10880	0 %	0 %	50 %	50 %	386076374
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248	NC_017555	GGT	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076374
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251	NC_017555	TGG	2	6	11075	11080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076374
252	NC_017555	CTT	2	6	11100	11105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076374
253	NC_017555	GGT	2	6	11109	11114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076374
254	NC_017555	GAT	2	6	11229	11234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076374
255	NC_017555	TGA	2	6	11291	11296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076374
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257	NC_017555	GTC	3	9	11475	11483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076375
258	NC_017555	CG	3	6	11498	11503	0 %	0 %	50 %	50 %	386076375
259	NC_017555	GTC	2	6	11568	11573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076375
260	NC_017555	T	6	6	11640	11645	0 %	100 %	0 %	0 %	386076375
261	NC_017555	TCTT	2	8	11647	11654	0 %	75 %	0 %	25 %	386076375
262	NC_017555	AGC	2	6	11706	11711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076375
263	NC_017555	GCA	2	6	11714	11719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076375
264	NC_017555	GAT	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076375
265	NC_017555	CTT	2	6	11825	11830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076375
266	NC_017555	GCA	2	6	11834	11839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076375
267	NC_017555	GCG	2	6	11847	11852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076375
268	NC_017555	ACC	2	6	11874	11879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076375
269	NC_017555	TGC	2	6	11899	11904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076375
270	NC_017555	GACTTC	2	12	11905	11916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386076375
271	NC_017555	TTCG	2	8	11952	11959	0 %	50 %	25 %	25 %	386076375
272	NC_017555	GTT	2	6	11966	11971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076375
273	NC_017555	CGCAG	2	10	11994	12003	20 %	0 %	40 %	40 %	386076375
274	NC_017555	ATG	3	9	12067	12075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076375
275	NC_017555	TGT	2	6	12086	12091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076375
276	NC_017555	GCC	2	6	12093	12098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076375
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278	NC_017555	ATC	3	9	12157	12165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076375
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284	NC_017555	CGC	2	6	12338	12343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076375
285	NC_017555	GAT	2	6	12501	12506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076375
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289	NC_017555	TCT	2	6	12692	12697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076375
290	NC_017555	TCG	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076375
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292	NC_017555	ACG	2	6	12862	12867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076375
293	NC_017555	GCG	3	9	12923	12931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076375
294	NC_017555	ATG	2	6	12964	12969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076375
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299	NC_017555	GCG	2	6	13202	13207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076375
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372	NC_017555	TTGT	2	8	16121	16128	0 %	75 %	25 %	0 %	386076378
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380	NC_017555	CAG	2	6	16565	16570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076379
381	NC_017555	GGCC	2	8	16613	16620	0 %	0 %	50 %	50 %	386076379
382	NC_017555	GCG	2	6	16629	16634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076379
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387	NC_017555	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	386076379
388	NC_017555	AGT	2	6	16910	16915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076379
389	NC_017555	TTC	2	6	16920	16925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076379
390	NC_017555	GTC	2	6	17047	17052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076379
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392	NC_017555	CGG	2	6	17078	17083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076379
393	NC_017555	G	7	7	17082	17088	0 %	0 %	100 %	0 %	386076379
394	NC_017555	CCA	2	6	17129	17134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076379
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