MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017271	GGCC	2	8	137397	137404	0 %	0 %	50 %	50 %	384425822
3502	NC_017271	GAA	2	6	137427	137432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425822
3503	NC_017271	TGAAC	2	10	137468	137477	40 %	20 %	20 %	20 %	384425822
3504	NC_017271	GGCG	2	8	137488	137495	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_017271	CCA	2	6	137644	137649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425823
3506	NC_017271	CACC	2	8	137662	137669	25 %	0 %	0 %	75 %	384425823
3507	NC_017271	CGCGC	2	10	137697	137706	0 %	0 %	40 %	60 %	384425823
3508	NC_017271	AGCG	2	8	137723	137730	25 %	0 %	50 %	25 %	384425823
3509	NC_017271	GGC	2	6	137773	137778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_017271	GC	3	6	137829	137834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_017271	CGG	2	6	137866	137871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017271	GGC	2	6	137879	137884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_017271	CGAGCC	2	12	137923	137934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_017271	GC	3	6	137964	137969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_017271	GCA	2	6	138085	138090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_017271	CGG	2	6	138135	138140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_017271	CGGC	2	8	138161	138168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_017271	CGA	2	6	138266	138271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425824
3519	NC_017271	GAA	2	6	138279	138284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425824
3520	NC_017271	CGT	2	6	138338	138343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425824
3521	NC_017271	CTGA	2	8	138351	138358	25 %	25 %	25 %	25 %	384425824
3522	NC_017271	TGTCC	2	10	138580	138589	0 %	40 %	20 %	40 %	384425825
3523	NC_017271	CGG	2	6	138670	138675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425825
3524	NC_017271	GC	3	6	138785	138790	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3525	NC_017271	CGG	3	9	138805	138813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425825
3526	NC_017271	GTT	2	6	138817	138822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425825
3527	NC_017271	GTG	3	9	138934	138942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425825
3528	NC_017271	CG	4	8	138943	138950	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3529	NC_017271	GAT	2	6	138968	138973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425825
3530	NC_017271	GCA	2	6	139015	139020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425825
3531	NC_017271	CTG	2	6	139034	139039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
3532	NC_017271	GCT	2	6	139051	139056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
3533	NC_017271	GCG	2	6	139059	139064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425825
3534	NC_017271	CGC	2	6	139128	139133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425825
3535	NC_017271	GCC	2	6	139158	139163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425825
3536	NC_017271	GCA	2	6	139171	139176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3538	NC_017271	TGC	2	6	139200	139205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
3539	NC_017271	CGCCAG	2	12	139226	139237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384425825
3540	NC_017271	AGCC	2	8	139258	139265	25 %	0 %	25 %	50 %	384425825
3541	NC_017271	GCC	3	9	139270	139278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425825
3542	NC_017271	CCA	2	6	139303	139308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425825
3543	NC_017271	GCA	2	6	139315	139320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425825
3544	NC_017271	CGGC	2	8	139348	139355	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3545	NC_017271	CAG	2	6	139358	139363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3547	NC_017271	GTT	2	6	139535	139540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425825
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3549	NC_017271	TCGC	2	8	139602	139609	0 %	25 %	25 %	50 %	384425825
3550	NC_017271	GC	3	6	139634	139639	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3551	NC_017271	TTG	2	6	139653	139658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425825
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3553	NC_017271	CGG	2	6	139747	139752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425825
3554	NC_017271	GCG	2	6	139758	139763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425825
3555	NC_017271	TCA	2	6	139804	139809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425825
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3558	NC_017271	GC	3	6	139902	139907	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3559	NC_017271	GTT	2	6	139987	139992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425825
3560	NC_017271	TCG	2	6	139998	140003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3562	NC_017271	TGC	2	6	140022	140027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3564	NC_017271	CCAGC	2	10	140042	140051	20 %	0 %	20 %	60 %	384425825
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3569	NC_017271	GCGCC	2	10	140180	140189	0 %	0 %	40 %	60 %	384425825
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3574	NC_017271	GC	3	6	140331	140336	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3575	NC_017271	GCA	2	6	140347	140352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3578	NC_017271	CCA	2	6	140431	140436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425825
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3581	NC_017271	CG	3	6	140484	140489	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3582	NC_017271	CCG	2	6	140494	140499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425825
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3584	NC_017271	GC	3	6	140602	140607	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3585	NC_017271	CCCA	2	8	140615	140622	25 %	0 %	0 %	75 %	384425825
3586	NC_017271	TCG	2	6	140655	140660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3592	NC_017271	GCA	2	6	140737	140742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3613	NC_017271	GC	4	8	141415	141422	0 %	0 %	50 %	50 %	384425825
3614	NC_017271	GAA	2	6	141461	141466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425825
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3617	NC_017271	GTC	2	6	141635	141640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425825
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3621	NC_017271	CAT	2	6	141779	141784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425825
3622	NC_017271	CGCT	2	8	141894	141901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3624	NC_017271	CGCGG	2	10	142043	142052	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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3872	NC_017271	CCG	2	6	152461	152466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425831
3873	NC_017271	CGG	2	6	152516	152521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425831
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3906	NC_017271	GCCG	2	8	153799	153806	0 %	0 %	50 %	50 %	384425832
3907	NC_017271	GGC	2	6	153808	153813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425832
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3920	NC_017271	CCG	3	9	154224	154232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425833
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3923	NC_017271	ACA	2	6	154281	154286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425833
3924	NC_017271	GCC	3	9	154355	154363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425833
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3937	NC_017271	TCGCT	2	10	154695	154704	0 %	40 %	20 %	40 %	384425833
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3943	NC_017271	CGA	2	6	154843	154848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425833
3944	NC_017271	CCCA	2	8	154850	154857	25 %	0 %	0 %	75 %	384425833
3945	NC_017271	TCG	2	6	154881	154886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425833
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3947	NC_017271	TGGCA	2	10	155018	155027	20 %	20 %	40 %	20 %	384425833
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3953	NC_017271	TTG	2	6	155194	155199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3957	NC_017271	GC	3	6	155599	155604	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
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3980	NC_017271	GTG	2	6	156340	156345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425834
3981	NC_017271	CGG	2	6	156375	156380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425834
3982	NC_017271	GC	3	6	156470	156475	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
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3988	NC_017271	ACG	2	6	156746	156751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425834
3989	NC_017271	CCAC	2	8	156797	156804	25 %	0 %	0 %	75 %	384425834
3990	NC_017271	GCA	2	6	156809	156814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425834
3991	NC_017271	CG	4	8	156852	156859	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
3992	NC_017271	CGGTCG	2	12	156875	156886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425834
3993	NC_017271	CGC	3	9	156963	156971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425834
3994	NC_017271	AC	3	6	156992	156997	50 %	0 %	0 %	50 %	384425834
3995	NC_017271	CG	3	6	157031	157036	0 %	0 %	50 %	50 %	384425834
3996	NC_017271	GAA	2	6	157105	157110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425834
3997	NC_017271	CAC	2	6	157113	157118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425834
3998	NC_017271	GCT	2	6	157131	157136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425834
3999	NC_017271	CTG	2	6	157168	157173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425834
4000	NC_017271	GCC	2	6	157199	157204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425834

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