MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017271	CGTG	2	8	117953	117960	0 %	25 %	50 %	25 %	384425802
3002	NC_017271	GAT	2	6	117984	117989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425802
3003	NC_017271	CGG	2	6	118022	118027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425802
3004	NC_017271	ACC	2	6	118039	118044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425802
3005	NC_017271	CCA	2	6	118100	118105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425802
3006	NC_017271	GCC	2	6	118126	118131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425802
3007	NC_017271	GGCC	2	8	118226	118233	0 %	0 %	50 %	50 %	384425802
3008	NC_017271	GCT	2	6	118235	118240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3009	NC_017271	GCA	2	6	118281	118286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3010	NC_017271	GCA	3	9	118292	118300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3011	NC_017271	TGGC	2	8	118360	118367	0 %	25 %	50 %	25 %	384425802
3012	NC_017271	CCA	2	6	118388	118393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425802
3013	NC_017271	GCCG	2	8	118401	118408	0 %	0 %	50 %	50 %	384425802
3014	NC_017271	CG	3	6	118419	118424	0 %	0 %	50 %	50 %	384425802
3015	NC_017271	TGG	2	6	118457	118462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425802
3016	NC_017271	GCA	2	6	118469	118474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3017	NC_017271	CTT	2	6	118476	118481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425802
3018	NC_017271	CCA	2	6	118516	118521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425802
3019	NC_017271	CCA	2	6	118553	118558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425802
3020	NC_017271	CAG	2	6	118578	118583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3021	NC_017271	GGC	2	6	118605	118610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425802
3022	NC_017271	CG	3	6	118634	118639	0 %	0 %	50 %	50 %	384425802
3023	NC_017271	GCT	3	9	118658	118666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3024	NC_017271	TCT	2	6	118670	118675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425802
3025	NC_017271	GC	3	6	118681	118686	0 %	0 %	50 %	50 %	384425802
3026	NC_017271	TCG	2	6	118708	118713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425802
3027	NC_017271	TTG	2	6	118741	118746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425802
3028	NC_017271	GGC	2	6	118748	118753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425802
3029	NC_017271	AAG	2	6	118819	118824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425802
3030	NC_017271	GGA	2	6	118843	118848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017271	GCC	2	6	119008	119013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425803
3032	NC_017271	AGCG	2	8	119031	119038	25 %	0 %	50 %	25 %	384425803
3033	NC_017271	CGT	2	6	119039	119044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3034	NC_017271	CCG	2	6	119071	119076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425803
3035	NC_017271	CCG	2	6	119090	119095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425803
3036	NC_017271	CG	4	8	119109	119116	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3037	NC_017271	GAC	2	6	119128	119133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3038	NC_017271	GGT	2	6	119157	119162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425803
3039	NC_017271	GGC	2	6	119163	119168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3040	NC_017271	GAC	2	6	119173	119178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3041	NC_017271	CCG	2	6	119181	119186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425803
3042	NC_017271	GC	3	6	119189	119194	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3043	NC_017271	CTG	2	6	119206	119211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3044	NC_017271	TGG	2	6	119228	119233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425803
3045	NC_017271	CG	3	6	119234	119239	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3046	NC_017271	GC	3	6	119290	119295	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3047	NC_017271	GCG	2	6	119312	119317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3048	NC_017271	CTG	2	6	119323	119328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3049	NC_017271	GGCCAG	2	12	119359	119370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384425803
3050	NC_017271	GC	3	6	119393	119398	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3051	NC_017271	TGC	2	6	119411	119416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3052	NC_017271	CTC	2	6	119445	119450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425803
3053	NC_017271	CGG	2	6	119451	119456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3054	NC_017271	TGC	2	6	119459	119464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3055	NC_017271	CGA	2	6	119490	119495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3056	NC_017271	GGC	2	6	119501	119506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3057	NC_017271	GCA	2	6	119522	119527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3058	NC_017271	CAG	2	6	119563	119568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3059	NC_017271	GGTGC	2	10	119569	119578	0 %	20 %	60 %	20 %	384425803
3060	NC_017271	CGG	2	6	119892	119897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3061	NC_017271	CAGCG	2	10	119899	119908	20 %	0 %	40 %	40 %	384425803
3062	NC_017271	CGGG	2	8	119960	119967	0 %	0 %	75 %	25 %	384425803
3063	NC_017271	GGC	2	6	120035	120040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3064	NC_017271	CGCCAG	2	12	120073	120084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384425803
3065	NC_017271	CACCG	2	10	120085	120094	20 %	0 %	20 %	60 %	384425803
3066	NC_017271	TCG	2	6	120107	120112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3067	NC_017271	CAC	2	6	120114	120119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425803
3068	NC_017271	GC	3	6	120134	120139	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3069	NC_017271	TGG	2	6	120193	120198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425803
3070	NC_017271	GCT	2	6	120222	120227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3071	NC_017271	TTCCG	2	10	120253	120262	0 %	40 %	20 %	40 %	384425803
3072	NC_017271	TCG	2	6	120275	120280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3073	NC_017271	GAC	2	6	120292	120297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3074	NC_017271	CGGC	2	8	120300	120307	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3075	NC_017271	CCA	2	6	120320	120325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425803
3076	NC_017271	CGA	2	6	120357	120362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3077	NC_017271	CGG	2	6	120435	120440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3078	NC_017271	GCG	2	6	120466	120471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3079	NC_017271	GCG	2	6	120520	120525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3080	NC_017271	CGA	3	9	120555	120563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3081	NC_017271	GCA	2	6	120593	120598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3082	NC_017271	GAGCT	2	10	120637	120646	20 %	20 %	40 %	20 %	384425803
3083	NC_017271	GCA	2	6	120648	120653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3084	NC_017271	CAG	2	6	120670	120675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3085	NC_017271	CACCG	2	10	120756	120765	20 %	0 %	20 %	60 %	384425803
3086	NC_017271	GCG	2	6	120773	120778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425803
3087	NC_017271	CG	3	6	120777	120782	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3088	NC_017271	GCA	2	6	120801	120806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3089	NC_017271	CGC	2	6	120849	120854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425803
3090	NC_017271	GGT	2	6	120861	120866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425803
3091	NC_017271	GC	3	6	120903	120908	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3092	NC_017271	ACC	2	6	120952	120957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425803
3093	NC_017271	CG	3	6	121006	121011	0 %	0 %	50 %	50 %	384425803
3094	NC_017271	ACG	2	6	121034	121039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425803
3095	NC_017271	CCCGG	2	10	121060	121069	0 %	0 %	40 %	60 %	384425803
3096	NC_017271	GC	3	6	121145	121150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_017271	GC	3	6	121165	121170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_017271	CG	3	6	121172	121177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_017271	CG	4	8	121207	121214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_017271	GT	3	6	121243	121248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017271	GCC	2	6	121254	121259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_017271	ATTG	2	8	121278	121285	25 %	50 %	25 %	0 %	384425804
3103	NC_017271	ACA	2	6	121317	121322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425804
3104	NC_017271	CG	3	6	121329	121334	0 %	0 %	50 %	50 %	384425804
3105	NC_017271	GC	3	6	121338	121343	0 %	0 %	50 %	50 %	384425804
3106	NC_017271	ACTG	2	8	121352	121359	25 %	25 %	25 %	25 %	384425804
3107	NC_017271	TCG	2	6	121392	121397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425805
3108	NC_017271	CTG	2	6	121424	121429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425805
3109	NC_017271	GTA	2	6	121529	121534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425805
3110	NC_017271	CGC	2	6	121546	121551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425805
3111	NC_017271	CAG	2	6	121577	121582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425805
3112	NC_017271	GC	4	8	121626	121633	0 %	0 %	50 %	50 %	384425805
3113	NC_017271	GC	3	6	121648	121653	0 %	0 %	50 %	50 %	384425805
3114	NC_017271	GGCA	2	8	121690	121697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_017271	TGCA	2	8	121701	121708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_017271	CG	4	8	121731	121738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_017271	AGC	2	6	121914	121919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425806
3118	NC_017271	CAC	2	6	121941	121946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425806
3119	NC_017271	CCG	2	6	121991	121996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_017271	CGA	2	6	122051	122056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425807
3121	NC_017271	GC	3	6	122090	122095	0 %	0 %	50 %	50 %	384425807
3122	NC_017271	CCG	2	6	122156	122161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425807
3123	NC_017271	AGC	2	6	122201	122206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425807
3124	NC_017271	GCC	2	6	122233	122238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425807
3125	NC_017271	CTG	2	6	122299	122304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425807
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3127	NC_017271	CGG	2	6	122474	122479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425807
3128	NC_017271	CGCA	2	8	122543	122550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_017271	ATG	2	6	122651	122656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017271	CG	3	6	122674	122679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_017271	C	6	6	122723	122728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3132	NC_017271	CTTC	2	8	122752	122759	0 %	50 %	0 %	50 %	384425808
3133	NC_017271	CGG	2	6	122820	122825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425808
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3235	NC_017271	GCCG	2	8	126838	126845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3236	NC_017271	CGC	2	6	126850	126855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3237	NC_017271	GTG	2	6	126884	126889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_017271	GGA	2	6	127016	127021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425813
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3240	NC_017271	GGC	2	6	127133	127138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425813
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3243	NC_017271	GC	3	6	127353	127358	0 %	0 %	50 %	50 %	384425813
3244	NC_017271	CGT	2	6	127374	127379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425813
3245	NC_017271	ACGC	2	8	127382	127389	25 %	0 %	25 %	50 %	384425813
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3372	NC_017271	CGTG	2	8	132348	132355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3377	NC_017271	GCA	2	6	132479	132484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425816
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3381	NC_017271	TGG	2	6	132601	132606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425816
3382	NC_017271	GC	3	6	132639	132644	0 %	0 %	50 %	50 %	384425816
3383	NC_017271	GCC	2	6	132678	132683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425816
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3385	NC_017271	ACA	2	6	132788	132793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425816
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3397	NC_017271	TGC	2	6	133367	133372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425818
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3497	NC_017271	GGC	2	6	137208	137213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425822
3498	NC_017271	GCC	2	6	137221	137226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425822
3499	NC_017271	CGCCTG	2	12	137230	137241	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384425822
3500	NC_017271	AG	3	6	137324	137329	50 %	0 %	50 %	0 %	384425822

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