MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017271	CAG	2	6	58962	58967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425750
1502	NC_017271	GGCG	2	8	58988	58995	0 %	0 %	75 %	25 %	384425750
1503	NC_017271	AGC	2	6	59077	59082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425750
1504	NC_017271	TGC	2	6	59114	59119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017271	GT	3	6	59120	59125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017271	ACTC	2	8	59194	59201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_017271	CG	3	6	59243	59248	0 %	0 %	50 %	50 %	384425751
1508	NC_017271	TGC	2	6	59288	59293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1509	NC_017271	GCG	2	6	59317	59322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425751
1510	NC_017271	GCA	2	6	59326	59331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1511	NC_017271	CTGCCG	2	12	59345	59356	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384425751
1512	NC_017271	GCAC	2	8	59371	59378	25 %	0 %	25 %	50 %	384425751
1513	NC_017271	GTGC	2	8	59386	59393	0 %	25 %	50 %	25 %	384425751
1514	NC_017271	CCCG	2	8	59462	59469	0 %	0 %	25 %	75 %	384425751
1515	NC_017271	CAA	2	6	59471	59476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425751
1516	NC_017271	GCG	2	6	59477	59482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425751
1517	NC_017271	CACG	2	8	59487	59494	25 %	0 %	25 %	50 %	384425751
1518	NC_017271	CATG	2	8	59562	59569	25 %	25 %	25 %	25 %	384425751
1519	NC_017271	GAT	2	6	59578	59583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425751
1520	NC_017271	GC	3	6	59589	59594	0 %	0 %	50 %	50 %	384425751
1521	NC_017271	GGC	2	6	59641	59646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425751
1522	NC_017271	GTG	2	6	59656	59661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425751
1523	NC_017271	TGCA	2	8	59687	59694	25 %	25 %	25 %	25 %	384425751
1524	NC_017271	AGGC	2	8	59751	59758	25 %	0 %	50 %	25 %	384425751
1525	NC_017271	AGC	2	6	59765	59770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1526	NC_017271	GCC	2	6	59794	59799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425751
1527	NC_017271	GCT	2	6	59821	59826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1528	NC_017271	GCA	2	6	59892	59897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1529	NC_017271	GCA	2	6	59910	59915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1530	NC_017271	GCA	2	6	59918	59923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1531	NC_017271	CAG	2	6	59929	59934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1532	NC_017271	GCA	2	6	59973	59978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1533	NC_017271	GGCC	2	8	59979	59986	0 %	0 %	50 %	50 %	384425751
1534	NC_017271	AGC	2	6	59993	59998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425751
1535	NC_017271	AGGCGC	2	12	60023	60034	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384425751
1536	NC_017271	CGC	2	6	60092	60097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_017271	GGC	2	6	60132	60137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_017271	GGC	2	6	60171	60176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425752
1539	NC_017271	GC	4	8	60190	60197	0 %	0 %	50 %	50 %	384425752
1540	NC_017271	CGTG	2	8	60200	60207	0 %	25 %	50 %	25 %	384425752
1541	NC_017271	GGC	3	9	60212	60220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425752
1542	NC_017271	CGG	2	6	60241	60246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425752
1543	NC_017271	GCC	2	6	60310	60315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425752
1544	NC_017271	GAC	2	6	60330	60335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425752
1545	NC_017271	GTG	3	9	60369	60377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425752
1546	NC_017271	CCG	2	6	60382	60387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425752
1547	NC_017271	GC	3	6	60417	60422	0 %	0 %	50 %	50 %	384425752
1548	NC_017271	GCA	2	6	60512	60517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425752
1549	NC_017271	CTG	2	6	60585	60590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425752
1550	NC_017271	CGC	2	6	60646	60651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425752
1551	NC_017271	GC	3	6	60668	60673	0 %	0 %	50 %	50 %	384425752
1552	NC_017271	GGT	2	6	60703	60708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425752
1553	NC_017271	GTG	2	6	60732	60737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425752
1554	NC_017271	GCCGC	2	10	60744	60753	0 %	0 %	40 %	60 %	384425752
1555	NC_017271	CCGCG	2	10	60860	60869	0 %	0 %	40 %	60 %	384425752
1556	NC_017271	CGC	2	6	60899	60904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425752
1557	NC_017271	GC	3	6	60945	60950	0 %	0 %	50 %	50 %	384425752
1558	NC_017271	GCT	2	6	60959	60964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425752
1559	NC_017271	GCG	2	6	61030	61035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425752
1560	NC_017271	GCCA	2	8	61045	61052	25 %	0 %	25 %	50 %	384425752
1561	NC_017271	TGC	2	6	61084	61089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425752
1562	NC_017271	CCTG	2	8	61105	61112	0 %	25 %	25 %	50 %	384425752
1563	NC_017271	CGC	2	6	61139	61144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425752
1564	NC_017271	CGC	2	6	61217	61222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425752
1565	NC_017271	CG	3	6	61269	61274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_017271	ACG	2	6	61414	61419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1567	NC_017271	CAC	2	6	61421	61426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425753
1568	NC_017271	CGC	2	6	61436	61441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425753
1569	NC_017271	GCA	2	6	61449	61454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1570	NC_017271	CG	3	6	61544	61549	0 %	0 %	50 %	50 %	384425753
1571	NC_017271	CGGC	2	8	61582	61589	0 %	0 %	50 %	50 %	384425753
1572	NC_017271	AGC	2	6	61590	61595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1573	NC_017271	CAG	2	6	61601	61606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1574	NC_017271	TGC	2	6	61615	61620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1575	NC_017271	CGA	2	6	61642	61647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1576	NC_017271	GC	3	6	61677	61682	0 %	0 %	50 %	50 %	384425753
1577	NC_017271	CGC	2	6	61783	61788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425753
1578	NC_017271	CAG	2	6	61790	61795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1579	NC_017271	CTG	2	6	61809	61814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1580	NC_017271	GGC	2	6	61815	61820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425753
1581	NC_017271	AGC	2	6	61821	61826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1582	NC_017271	TTG	2	6	61833	61838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425753
1583	NC_017271	GCT	2	6	61846	61851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1584	NC_017271	GATA	2	8	61864	61871	50 %	25 %	25 %	0 %	384425753
1585	NC_017271	CGA	2	6	61924	61929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1586	NC_017271	TGT	2	6	61997	62002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425753
1587	NC_017271	CAA	2	6	62057	62062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425753
1588	NC_017271	GCG	2	6	62063	62068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425753
1589	NC_017271	CTG	2	6	62070	62075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425753
1590	NC_017271	TGG	2	6	62120	62125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017271	CACC	2	8	62140	62147	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1592	NC_017271	GCT	2	6	62153	62158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_017271	CAGCC	2	10	62189	62198	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1594	NC_017271	ATGCG	2	10	62232	62241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1595	NC_017271	ACTG	2	8	62284	62291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_017271	CGA	2	6	62301	62306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_017271	CAC	2	6	62427	62432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_017271	CG	3	6	62486	62491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_017271	CCG	2	6	62511	62516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425754
1600	NC_017271	CAC	2	6	62584	62589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425754
1601	NC_017271	TGG	2	6	62594	62599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425754
1602	NC_017271	GC	4	8	62626	62633	0 %	0 %	50 %	50 %	384425754
1603	NC_017271	GCC	2	6	62635	62640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425754
1604	NC_017271	CGGC	2	8	62661	62668	0 %	0 %	50 %	50 %	384425754
1605	NC_017271	GTC	2	6	62686	62691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425754
1606	NC_017271	CAC	2	6	62698	62703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425754
1607	NC_017271	TGG	2	6	62724	62729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425754
1608	NC_017271	GCG	3	9	62761	62769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425754
1609	NC_017271	CGC	2	6	62814	62819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425754
1610	NC_017271	CGT	2	6	62856	62861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425754
1611	NC_017271	AGC	2	6	62862	62867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425754
1612	NC_017271	CGG	2	6	62937	62942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425754
1613	NC_017271	CAT	2	6	62953	62958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425754
1614	NC_017271	ACGC	2	8	62965	62972	25 %	0 %	25 %	50 %	384425754
1615	NC_017271	CG	3	6	62985	62990	0 %	0 %	50 %	50 %	384425754
1616	NC_017271	GTGCCG	2	12	63035	63046	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425754
1617	NC_017271	GGT	2	6	63058	63063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425754
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1619	NC_017271	CAG	2	6	63079	63084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425754
1620	NC_017271	CG	3	6	63138	63143	0 %	0 %	50 %	50 %	384425754
1621	NC_017271	TCG	2	6	63194	63199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425754
1622	NC_017271	GCAC	2	8	63227	63234	25 %	0 %	25 %	50 %	384425754
1623	NC_017271	TGG	2	6	63240	63245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425754
1624	NC_017271	CG	3	6	63253	63258	0 %	0 %	50 %	50 %	384425754
1625	NC_017271	ATC	2	6	63272	63277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425754
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1627	NC_017271	GCT	2	6	63323	63328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425754
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1752	NC_017271	GCCA	2	8	67724	67731	25 %	0 %	25 %	50 %	384425756
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