MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017271	AC	3	6	39882	39887	50 %	0 %	0 %	50 %	384425731
1002	NC_017271	TGG	2	6	39914	39919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425731
1003	NC_017271	GCG	2	6	39931	39936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425731
1004	NC_017271	GAT	2	6	39942	39947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425731
1005	NC_017271	GCTT	2	8	40165	40172	0 %	50 %	25 %	25 %	384425732
1006	NC_017271	CGA	2	6	40231	40236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425732
1007	NC_017271	CGG	3	9	40294	40302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425732
1008	NC_017271	CGC	2	6	40306	40311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425732
1009	NC_017271	GGC	2	6	40345	40350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1010	NC_017271	CCAG	2	8	40362	40369	25 %	0 %	25 %	50 %	384425733
1011	NC_017271	TCG	2	6	40394	40399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1012	NC_017271	CTG	2	6	40405	40410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1013	NC_017271	TGC	2	6	40419	40424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1014	NC_017271	GGC	2	6	40440	40445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1015	NC_017271	CGG	2	6	40488	40493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1016	NC_017271	AGGCC	2	10	40563	40572	20 %	0 %	40 %	40 %	384425733
1017	NC_017271	CAGCAC	2	12	40612	40623	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384425733
1018	NC_017271	GCA	2	6	40645	40650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1019	NC_017271	CCA	2	6	40668	40673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425733
1020	NC_017271	CG	3	6	40714	40719	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1021	NC_017271	CGC	2	6	40737	40742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1022	NC_017271	CAGG	2	8	40756	40763	25 %	0 %	50 %	25 %	384425733
1023	NC_017271	GC	3	6	40786	40791	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1024	NC_017271	GTG	2	6	40809	40814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425733
1025	NC_017271	CAC	2	6	40819	40824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425733
1026	NC_017271	GCCG	2	8	40827	40834	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1027	NC_017271	TCCAGC	2	12	40874	40885	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384425733
1028	NC_017271	GC	4	8	41005	41012	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1029	NC_017271	CGGT	2	8	41021	41028	0 %	25 %	50 %	25 %	384425733
1030	NC_017271	CGC	2	6	41052	41057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1031	NC_017271	TTG	2	6	41063	41068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425733
1032	NC_017271	CGT	2	6	41154	41159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1033	NC_017271	CAG	2	6	41230	41235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1034	NC_017271	ACGC	2	8	41266	41273	25 %	0 %	25 %	50 %	384425733
1035	NC_017271	CTT	2	6	41298	41303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425733
1036	NC_017271	CAG	2	6	41308	41313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1037	NC_017271	GAA	2	6	41317	41322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425733
1038	NC_017271	AGT	2	6	41352	41357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425733
1039	NC_017271	CG	3	6	41359	41364	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1040	NC_017271	GTT	2	6	41401	41406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425733
1041	NC_017271	ATC	2	6	41444	41449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425733
1042	NC_017271	GCCGAA	2	12	41458	41469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1043	NC_017271	GCC	2	6	41521	41526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1044	NC_017271	CCA	2	6	41565	41570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425733
1045	NC_017271	GCC	2	6	41650	41655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1046	NC_017271	CGG	2	6	41703	41708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1047	NC_017271	CCA	2	6	41733	41738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425733
1048	NC_017271	TCGA	2	8	41804	41811	25 %	25 %	25 %	25 %	384425733
1049	NC_017271	GCG	3	9	41826	41834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1050	NC_017271	GCC	2	6	41911	41916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1051	NC_017271	GCA	2	6	41952	41957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1052	NC_017271	CGC	2	6	42057	42062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1053	NC_017271	TGC	2	6	42075	42080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1054	NC_017271	GCCC	2	8	42081	42088	0 %	0 %	25 %	75 %	384425733
1055	NC_017271	CGG	2	6	42153	42158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1056	NC_017271	GCA	2	6	42171	42176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1057	NC_017271	CGG	2	6	42180	42185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
1058	NC_017271	GGGGTG	2	12	42206	42217	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384425733
1059	NC_017271	GC	3	6	42221	42226	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1060	NC_017271	GC	3	6	42320	42325	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1061	NC_017271	CGC	2	6	42366	42371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1062	NC_017271	GCC	2	6	42391	42396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425733
1063	NC_017271	GC	4	8	42425	42432	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1064	NC_017271	GC	3	6	42484	42489	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1065	NC_017271	CCA	2	6	42513	42518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425733
1066	NC_017271	CGA	2	6	42534	42539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
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1072	NC_017271	GCAG	2	8	42753	42760	25 %	0 %	50 %	25 %	384425733
1073	NC_017271	CG	4	8	42777	42784	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1074	NC_017271	GAT	2	6	42796	42801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425733
1075	NC_017271	CGCAG	2	10	42813	42822	20 %	0 %	40 %	40 %	384425733
1076	NC_017271	TGA	2	6	42839	42844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425733
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1081	NC_017271	GC	3	6	43024	43029	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1082	NC_017271	CAG	2	6	43048	43053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
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1089	NC_017271	CCT	2	6	43302	43307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425733
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1092	NC_017271	CTG	2	6	43456	43461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425733
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1095	NC_017271	GATC	2	8	43539	43546	25 %	25 %	25 %	25 %	384425733
1096	NC_017271	CAT	2	6	43549	43554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425733
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1100	NC_017271	GCCG	2	8	43726	43733	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1101	NC_017271	CGG	2	6	43819	43824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
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1106	NC_017271	TGG	2	6	44076	44081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425733
1107	NC_017271	GAC	2	6	44111	44116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1108	NC_017271	CGCTG	2	10	44121	44130	0 %	20 %	40 %	40 %	384425733
1109	NC_017271	GCA	2	6	44163	44168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1110	NC_017271	GTG	2	6	44204	44209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425733
1111	NC_017271	CGGCG	2	10	44244	44253	0 %	0 %	60 %	40 %	384425733
1112	NC_017271	GC	3	6	44254	44259	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1113	NC_017271	CAC	2	6	44380	44385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425733
1114	NC_017271	GC	3	6	44446	44451	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1115	NC_017271	GCCG	2	8	44485	44492	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1116	NC_017271	CAG	2	6	44563	44568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425733
1117	NC_017271	CATC	2	8	44573	44580	25 %	25 %	0 %	50 %	384425733
1118	NC_017271	CGG	2	6	44595	44600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425733
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1123	NC_017271	CG	4	8	44718	44725	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
1124	NC_017271	TGT	2	6	44727	44732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425733
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1126	NC_017271	G	6	6	44766	44771	0 %	0 %	100 %	0 %	384425733
1127	NC_017271	CGA	2	6	44805	44810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017271	ATC	2	6	44853	44858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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