MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017271	CGC	2	6	19429	19434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425708
502	NC_017271	GCT	2	6	19456	19461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425708
503	NC_017271	CGC	2	6	19487	19492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425708
504	NC_017271	GTC	2	6	19496	19501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425708
505	NC_017271	TCG	2	6	19515	19520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425708
506	NC_017271	TGC	2	6	19578	19583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017271	TG	3	6	19591	19596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017271	GAT	2	6	19634	19639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017271	CGC	2	6	19640	19645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017271	ACG	2	6	19654	19659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017271	GTG	2	6	19688	19693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017271	CGG	2	6	19704	19709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017271	CGA	2	6	19724	19729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017271	CATG	2	8	19731	19738	25 %	25 %	25 %	25 %	384425709
515	NC_017271	CGA	2	6	19741	19746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425709
516	NC_017271	CGG	2	6	19828	19833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425709
517	NC_017271	CGTG	2	8	19914	19921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
518	NC_017271	GC	3	6	19927	19932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017271	GCC	2	6	19966	19971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017271	CCATG	2	10	20112	20121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
521	NC_017271	CAA	2	6	20136	20141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017271	A	6	6	20140	20145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017271	CCG	2	6	20148	20153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017271	GCA	2	6	20177	20182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017271	GCG	2	6	20183	20188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017271	GTG	3	9	20269	20277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425710
527	NC_017271	CTG	2	6	20331	20336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425710
528	NC_017271	GACG	2	8	20338	20345	25 %	0 %	50 %	25 %	384425710
529	NC_017271	CGG	2	6	20408	20413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425710
530	NC_017271	ACGCC	2	10	20432	20441	20 %	0 %	20 %	60 %	384425710
531	NC_017271	GGT	2	6	20496	20501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425710
532	NC_017271	GCG	2	6	20704	20709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425710
533	NC_017271	GCGGCA	2	12	20719	20730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384425710
534	NC_017271	TCG	2	6	20815	20820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425710
535	NC_017271	GCC	2	6	20832	20837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425710
536	NC_017271	CG	3	6	20920	20925	0 %	0 %	50 %	50 %	384425710
537	NC_017271	TGC	2	6	20933	20938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425710
538	NC_017271	CGT	2	6	21017	21022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425710
539	NC_017271	TGT	3	9	21149	21157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425710
540	NC_017271	CGC	2	6	21215	21220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425710
541	NC_017271	CCG	2	6	21226	21231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425710
542	NC_017271	GCC	2	6	21258	21263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425710
543	NC_017271	GGC	2	6	21317	21322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425710
544	NC_017271	GCCG	2	8	21339	21346	0 %	0 %	50 %	50 %	384425710
545	NC_017271	GTT	2	6	21348	21353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425710
546	NC_017271	GAT	2	6	21357	21362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425710
547	NC_017271	CGT	2	6	21368	21373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425710
548	NC_017271	GGC	2	6	21441	21446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425710
549	NC_017271	CAG	2	6	21492	21497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425710
550	NC_017271	GTT	2	6	21533	21538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425711
551	NC_017271	GC	3	6	21606	21611	0 %	0 %	50 %	50 %	384425711
552	NC_017271	C	9	9	21618	21626	0 %	0 %	0 %	100 %	384425711
553	NC_017271	ACG	2	6	21632	21637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425711
554	NC_017271	ACG	2	6	21655	21660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425711
555	NC_017271	GGGT	2	8	21709	21716	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017271	CCGCG	2	10	21781	21790	0 %	0 %	40 %	60 %	384425712
557	NC_017271	GCT	2	6	21803	21808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
558	NC_017271	CTGG	2	8	21821	21828	0 %	25 %	50 %	25 %	384425712
559	NC_017271	GCC	2	6	21847	21852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425712
560	NC_017271	GC	3	6	21861	21866	0 %	0 %	50 %	50 %	384425712
561	NC_017271	GC	3	6	21889	21894	0 %	0 %	50 %	50 %	384425712
562	NC_017271	GCG	2	6	21901	21906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425712
563	NC_017271	TGG	2	6	21924	21929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425712
564	NC_017271	TGC	2	6	21952	21957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
565	NC_017271	CTG	2	6	21999	22004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
566	NC_017271	CTG	2	6	22020	22025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
567	NC_017271	GCCG	2	8	22037	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	384425712
568	NC_017271	GGC	2	6	22063	22068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425712
569	NC_017271	TGC	2	6	22072	22077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
570	NC_017271	CTG	2	6	22083	22088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
571	NC_017271	GGC	2	6	22089	22094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425712
572	NC_017271	GGC	2	6	22109	22114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425712
573	NC_017271	ATC	2	6	22146	22151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425712
574	NC_017271	CGGTG	2	10	22160	22169	0 %	20 %	60 %	20 %	384425712
575	NC_017271	GTG	2	6	22221	22226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425712
576	NC_017271	ATTC	2	8	22250	22257	25 %	50 %	0 %	25 %	384425712
577	NC_017271	TTG	2	6	22272	22277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425712
578	NC_017271	TGC	2	6	22294	22299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425712
579	NC_017271	GGT	2	6	22301	22306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425712
580	NC_017271	CGGCC	2	10	22319	22328	0 %	0 %	40 %	60 %	384425712
581	NC_017271	TGG	2	6	22336	22341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425712
582	NC_017271	GC	3	6	22397	22402	0 %	0 %	50 %	50 %	384425712
583	NC_017271	CG	3	6	22409	22414	0 %	0 %	50 %	50 %	384425712
584	NC_017271	GCCCT	2	10	22444	22453	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
585	NC_017271	CGC	2	6	22465	22470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017271	TGG	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425713
587	NC_017271	TGC	2	6	22661	22666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425713
588	NC_017271	AAG	2	6	22708	22713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425713
589	NC_017271	CCA	2	6	22736	22741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425713
590	NC_017271	GGT	2	6	22752	22757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425713
591	NC_017271	GC	3	6	22829	22834	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
592	NC_017271	CCTGC	2	10	22835	22844	0 %	20 %	20 %	60 %	384425714
593	NC_017271	GC	3	6	22882	22887	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
594	NC_017271	TGG	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425714
595	NC_017271	GCG	2	6	22982	22987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425714
596	NC_017271	ATGTGG	2	12	23035	23046	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384425714
597	NC_017271	GCCG	2	8	23102	23109	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
598	NC_017271	GC	3	6	23162	23167	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
599	NC_017271	CGGG	2	8	23282	23289	0 %	0 %	75 %	25 %	384425714
600	NC_017271	GC	3	6	23332	23337	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
601	NC_017271	GGC	2	6	23339	23344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425714
602	NC_017271	GC	3	6	23343	23348	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
603	NC_017271	GC	3	6	23425	23430	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
604	NC_017271	CTG	2	6	23460	23465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425714
605	NC_017271	GCCG	2	8	23547	23554	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
606	NC_017271	CGC	2	6	23564	23569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425714
607	NC_017271	GC	3	6	23604	23609	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
608	NC_017271	GCT	2	6	23615	23620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425714
609	NC_017271	CG	3	6	23629	23634	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
610	NC_017271	CGC	2	6	23644	23649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425714
611	NC_017271	GCT	2	6	23721	23726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425714
612	NC_017271	GTTGC	2	10	23794	23803	0 %	40 %	40 %	20 %	384425715
613	NC_017271	TGC	3	9	23808	23816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425715
614	NC_017271	TCA	2	6	23853	23858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425715
615	NC_017271	GCA	2	6	23893	23898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425715
616	NC_017271	CGT	2	6	23934	23939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017271	CCG	2	6	24049	24054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425716
618	NC_017271	TGG	2	6	24058	24063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425716
619	NC_017271	TGC	3	9	24116	24124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425716
620	NC_017271	CG	3	6	24152	24157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017271	GTGC	2	8	24165	24172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
622	NC_017271	GGT	2	6	24193	24198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017271	AGC	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017271	TGA	2	6	24260	24265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017271	GTG	2	6	24267	24272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017271	GCT	2	6	24350	24355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017271	AGTG	2	8	24435	24442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017271	ACC	2	6	24459	24464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_017271	AG	3	6	24489	24494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017271	AAC	2	6	24592	24597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017271	TGC	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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