MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017271	CGG	2	6	237056	237061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425895
6003	NC_017271	ACC	3	9	237084	237092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425895
6004	NC_017271	CGG	2	6	237170	237175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425895
6005	NC_017271	CAGC	2	8	237251	237258	25 %	0 %	25 %	50 %	384425895
6006	NC_017271	GCT	2	6	237308	237313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425895
6007	NC_017271	ACG	2	6	237316	237321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895
6008	NC_017271	GC	3	6	237336	237341	0 %	0 %	50 %	50 %	384425895
6009	NC_017271	GC	3	6	237361	237366	0 %	0 %	50 %	50 %	384425895
6010	NC_017271	ACG	2	6	237412	237417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895
6011	NC_017271	ACG	2	6	237430	237435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895
6012	NC_017271	CTGGC	2	10	237441	237450	0 %	20 %	40 %	40 %	384425895
6013	NC_017271	CAA	2	6	237531	237536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425895
6014	NC_017271	AGC	2	6	237547	237552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895
6015	NC_017271	GCC	2	6	237610	237615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
6016	NC_017271	GCT	2	6	237618	237623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
6017	NC_017271	CTG	2	6	237631	237636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
6018	NC_017271	GCC	2	6	237652	237657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
6019	NC_017271	GCG	2	6	237719	237724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6020	NC_017271	CTG	2	6	237726	237731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
6021	NC_017271	GGC	2	6	237756	237761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6022	NC_017271	CG	4	8	237819	237826	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
6023	NC_017271	GATG	2	8	237843	237850	25 %	25 %	50 %	0 %	384425896
6024	NC_017271	GC	4	8	237866	237873	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
6025	NC_017271	CCCA	2	8	237907	237914	25 %	0 %	0 %	75 %	384425896
6026	NC_017271	TGC	2	6	237923	237928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
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6028	NC_017271	GGC	2	6	237960	237965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6029	NC_017271	CCAGGC	2	12	237972	237983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384425896
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6031	NC_017271	TGG	2	6	238010	238015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425896
6032	NC_017271	CACC	2	8	238028	238035	25 %	0 %	0 %	75 %	384425896
6033	NC_017271	GGC	2	6	238070	238075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6034	NC_017271	CGG	2	6	238083	238088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6035	NC_017271	TGC	2	6	238103	238108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
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6038	NC_017271	CAC	2	6	238200	238205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425896
6039	NC_017271	CGTG	2	8	238212	238219	0 %	25 %	50 %	25 %	384425896
6040	NC_017271	GC	3	6	238223	238228	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
6041	NC_017271	ACT	2	6	238250	238255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425896
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6043	NC_017271	CTG	2	6	238279	238284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
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6046	NC_017271	GCCG	2	8	238345	238352	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
6047	NC_017271	CGG	3	9	238361	238369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
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6051	NC_017271	CG	3	6	238511	238516	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
6052	NC_017271	AGCC	2	8	238518	238525	25 %	0 %	25 %	50 %	384425896
6053	NC_017271	GCC	2	6	238528	238533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425896
6054	NC_017271	TGG	3	9	238598	238606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425896
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6057	NC_017271	GCG	2	6	238687	238692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6058	NC_017271	GGC	2	6	238708	238713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425896
6059	NC_017271	GC	4	8	238749	238756	0 %	0 %	50 %	50 %	384425896
6060	NC_017271	CTG	2	6	238832	238837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425896
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6062	NC_017271	GCC	2	6	238883	238888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_017271	CACG	2	8	238917	238924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_017271	GCCG	2	8	238990	238997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_017271	AAAG	2	8	239046	239053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017271	CG	3	6	239054	239059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_017271	GCC	2	6	239073	239078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_017271	TGC	2	6	239090	239095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_017271	CG	3	6	239153	239158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_017271	GC	3	6	239210	239215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_017271	TGC	2	6	239246	239251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425897
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6084	NC_017271	TGC	2	6	239616	239621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425897
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6093	NC_017271	CACG	2	8	239968	239975	25 %	0 %	25 %	50 %	384425897
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6103	NC_017271	TGA	2	6	240401	240406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425898
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6118	NC_017271	GCT	2	6	241074	241079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425898
6119	NC_017271	GATT	2	8	241098	241105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_017271	CCCA	2	8	241117	241124	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6121	NC_017271	GC	3	6	241239	241244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_017271	CTG	2	6	241274	241279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425899
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6124	NC_017271	CTG	2	6	241287	241292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425899
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6143	NC_017271	GC	3	6	242252	242257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6229	NC_017271	GCCG	2	8	245311	245318	0 %	0 %	50 %	50 %	384425901
6230	NC_017271	TGA	2	6	245349	245354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425901
6231	NC_017271	GCGGTG	3	18	245394	245411	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384425901
6232	NC_017271	GGA	2	6	245417	245422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425901
6233	NC_017271	GGT	2	6	245429	245434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425901
6234	NC_017271	GGC	2	6	245438	245443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425901
6235	NC_017271	GAC	2	6	245506	245511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6236	NC_017271	AAG	2	6	245521	245526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425902
6237	NC_017271	GCTG	2	8	245558	245565	0 %	25 %	50 %	25 %	384425902
6238	NC_017271	CCA	2	6	245566	245571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425902
6239	NC_017271	GC	3	6	245577	245582	0 %	0 %	50 %	50 %	384425902
6240	NC_017271	GCG	2	6	245598	245603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425902
6241	NC_017271	GC	3	6	245627	245632	0 %	0 %	50 %	50 %	384425902
6242	NC_017271	GC	3	6	245640	245645	0 %	0 %	50 %	50 %	384425902
6243	NC_017271	CGG	2	6	245672	245677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425902
6244	NC_017271	GCA	2	6	245693	245698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425902
6245	NC_017271	GCA	2	6	245705	245710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425902
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6493	NC_017271	TGC	2	6	254873	254878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425912
6494	NC_017271	TGC	3	9	254898	254906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425912
6495	NC_017271	CCA	2	6	254930	254935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425912
6496	NC_017271	GCA	2	6	254964	254969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425912
6497	NC_017271	ACGC	2	8	254975	254982	25 %	0 %	25 %	50 %	384425912
6498	NC_017271	CAG	2	6	254983	254988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425912
6499	NC_017271	GCC	2	6	254995	255000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425912
6500	NC_017271	GGT	2	6	255072	255077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425912

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