MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017271	TCG	2	6	217772	217777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425877
5502	NC_017271	GCGCC	2	10	217803	217812	0 %	0 %	40 %	60 %	384425877
5503	NC_017271	TGC	2	6	217842	217847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425877
5504	NC_017271	GCGG	2	8	217896	217903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_017271	CAG	2	6	217954	217959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017271	TGCAG	2	10	218018	218027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5507	NC_017271	TGCC	2	8	218044	218051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_017271	TGCA	2	8	218089	218096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_017271	ACC	3	9	218149	218157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425878
5510	NC_017271	CGG	2	6	218158	218163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5511	NC_017271	GCT	2	6	218175	218180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5512	NC_017271	GGC	2	6	218181	218186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5513	NC_017271	GTGCCG	2	12	218189	218200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425878
5514	NC_017271	CGG	2	6	218210	218215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5515	NC_017271	GCC	2	6	218235	218240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425878
5516	NC_017271	CGA	2	6	218376	218381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5517	NC_017271	CTA	2	6	218382	218387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425878
5518	NC_017271	GTT	2	6	218400	218405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425878
5519	NC_017271	CGGCC	2	10	218466	218475	0 %	0 %	40 %	60 %	384425878
5520	NC_017271	CAG	2	6	218482	218487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5521	NC_017271	ACG	2	6	218522	218527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5522	NC_017271	GAC	2	6	218560	218565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5523	NC_017271	GC	3	6	218618	218623	0 %	0 %	50 %	50 %	384425878
5524	NC_017271	GTG	2	6	218665	218670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5525	NC_017271	GC	4	8	218681	218688	0 %	0 %	50 %	50 %	384425878
5526	NC_017271	TGGCC	2	10	218733	218742	0 %	20 %	40 %	40 %	384425878
5527	NC_017271	GAC	2	6	218788	218793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5528	NC_017271	GTG	2	6	218797	218802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5529	NC_017271	GGCT	2	8	218845	218852	0 %	25 %	50 %	25 %	384425878
5530	NC_017271	CGGT	2	8	218867	218874	0 %	25 %	50 %	25 %	384425878
5531	NC_017271	CCG	2	6	218879	218884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425878
5532	NC_017271	CGC	2	6	218910	218915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425878
5533	NC_017271	GTG	2	6	218994	218999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5534	NC_017271	CG	3	6	219002	219007	0 %	0 %	50 %	50 %	384425878
5535	NC_017271	GCCAC	2	10	219008	219017	20 %	0 %	20 %	60 %	384425878
5536	NC_017271	TGG	2	6	219020	219025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5537	NC_017271	TGG	2	6	219043	219048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5538	NC_017271	CCG	2	6	219122	219127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425878
5539	NC_017271	CGG	2	6	219147	219152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5540	NC_017271	CGG	3	9	219194	219202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5541	NC_017271	GAC	2	6	219232	219237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5542	NC_017271	GC	3	6	219298	219303	0 %	0 %	50 %	50 %	384425878
5543	NC_017271	GCG	2	6	219306	219311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5544	NC_017271	GCG	2	6	219377	219382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5545	NC_017271	GGC	2	6	219439	219444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425878
5546	NC_017271	CTG	2	6	219448	219453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5547	NC_017271	TCG	2	6	219473	219478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425878
5548	NC_017271	CCG	2	6	219491	219496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425878
5549	NC_017271	GAA	2	6	219523	219528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425878
5550	NC_017271	CG	3	6	219541	219546	0 %	0 %	50 %	50 %	384425878
5551	NC_017271	CGCCTG	2	12	219568	219579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384425878
5552	NC_017271	GTG	2	6	219595	219600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5553	NC_017271	TTCG	2	8	219612	219619	0 %	50 %	25 %	25 %	384425878
5554	NC_017271	GCAT	2	8	219668	219675	25 %	25 %	25 %	25 %	384425878
5555	NC_017271	CGC	2	6	219720	219725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425878
5556	NC_017271	AGG	2	6	219728	219733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425878
5557	NC_017271	GTG	2	6	219739	219744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425878
5558	NC_017271	CG	3	6	219763	219768	0 %	0 %	50 %	50 %	384425878
5559	NC_017271	GCA	2	6	219824	219829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017271	ACG	2	6	219909	219914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_017271	CG	3	6	219932	219937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_017271	TGCT	2	8	219962	219969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_017271	CGTG	2	8	219997	220004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_017271	A	6	6	220006	220011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017271	GGC	2	6	220034	220039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_017271	GCA	2	6	220046	220051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425879
5567	NC_017271	TTGCC	2	10	220062	220071	0 %	40 %	20 %	40 %	384425879
5568	NC_017271	CCG	2	6	220080	220085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425879
5569	NC_017271	TGC	2	6	220147	220152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425879
5570	NC_017271	CGC	2	6	220196	220201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425879
5571	NC_017271	CCA	2	6	220204	220209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425879
5572	NC_017271	CACT	2	8	220245	220252	25 %	25 %	0 %	50 %	384425880
5573	NC_017271	GCG	2	6	220287	220292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425880
5574	NC_017271	GC	3	6	220398	220403	0 %	0 %	50 %	50 %	384425880
5575	NC_017271	GC	3	6	220418	220423	0 %	0 %	50 %	50 %	384425880
5576	NC_017271	CGGT	2	8	220426	220433	0 %	25 %	50 %	25 %	384425880
5577	NC_017271	ACC	2	6	220441	220446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425880
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5579	NC_017271	GC	3	6	220551	220556	0 %	0 %	50 %	50 %	384425880
5580	NC_017271	CGCA	2	8	220557	220564	25 %	0 %	25 %	50 %	384425880
5581	NC_017271	GGT	3	9	220599	220607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425880
5582	NC_017271	GAA	3	9	220608	220616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425880
5583	NC_017271	GCG	2	6	220639	220644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425880
5584	NC_017271	TCCA	2	8	220662	220669	25 %	25 %	0 %	50 %	384425880
5585	NC_017271	CG	3	6	220721	220726	0 %	0 %	50 %	50 %	384425880
5586	NC_017271	TGC	2	6	220741	220746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425880
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5588	NC_017271	CCA	2	6	220781	220786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425880
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5590	NC_017271	CTG	2	6	220847	220852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_017271	CAG	2	6	220884	220889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425881
5592	NC_017271	GC	3	6	220921	220926	0 %	0 %	50 %	50 %	384425881
5593	NC_017271	CGC	2	6	220951	220956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425881
5594	NC_017271	GC	3	6	221021	221026	0 %	0 %	50 %	50 %	384425881
5595	NC_017271	TCG	2	6	221050	221055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425881
5596	NC_017271	GC	3	6	221115	221120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_017271	CTG	2	6	221146	221151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_017271	AAC	2	6	221188	221193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_017271	CAC	2	6	221195	221200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_017271	GAG	2	6	221229	221234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_017271	GCAAGC	2	12	221275	221286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425882
5602	NC_017271	GGT	2	6	221324	221329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425882
5603	NC_017271	GCA	2	6	221336	221341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425882
5604	NC_017271	CGC	2	6	221359	221364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425882
5605	NC_017271	GGCC	2	8	221379	221386	0 %	0 %	50 %	50 %	384425882
5606	NC_017271	CGA	2	6	221410	221415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425882
5607	NC_017271	TGC	2	6	221431	221436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425882
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5612	NC_017271	GC	3	6	221625	221630	0 %	0 %	50 %	50 %	384425882
5613	NC_017271	TCG	2	6	221659	221664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425882
5614	NC_017271	AAG	2	6	221739	221744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425882
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5622	NC_017271	CAA	2	6	221993	221998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425882
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5624	NC_017271	GAA	2	6	222125	222130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425882
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5991	NC_017271	GCC	2	6	236586	236591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425895
5992	NC_017271	GCAC	2	8	236616	236623	25 %	0 %	25 %	50 %	384425895
5993	NC_017271	ACCAGC	2	12	236694	236705	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384425895
5994	NC_017271	CCG	2	6	236735	236740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425895
5995	NC_017271	CTT	2	6	236741	236746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425895
5996	NC_017271	CAG	2	6	236852	236857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895
5997	NC_017271	GGT	2	6	236861	236866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425895
5998	NC_017271	GCA	2	6	236893	236898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895
5999	NC_017271	CGC	2	6	236922	236927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425895
6000	NC_017271	CGA	3	9	237008	237016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425895

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