MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017271	GCT	2	6	200330	200335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5002	NC_017271	GTG	2	6	200348	200353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5003	NC_017271	CCGC	2	8	200363	200370	0 %	0 %	25 %	75 %	384425864
5004	NC_017271	CGGC	2	8	200394	200401	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5005	NC_017271	CTGGCG	2	12	200412	200423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425864
5006	NC_017271	TCG	2	6	200433	200438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5007	NC_017271	CGG	2	6	200464	200469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5008	NC_017271	GCT	2	6	200510	200515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5009	NC_017271	TGC	2	6	200518	200523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5010	NC_017271	TGGC	2	8	200528	200535	0 %	25 %	50 %	25 %	384425864
5011	NC_017271	CAT	2	6	200537	200542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425864
5012	NC_017271	GGC	2	6	200630	200635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5013	NC_017271	TGG	2	6	200638	200643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5014	NC_017271	CAG	2	6	200729	200734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5015	NC_017271	GTT	2	6	200789	200794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425864
5016	NC_017271	CAC	2	6	200838	200843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425864
5017	NC_017271	ATG	2	6	200847	200852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425864
5018	NC_017271	TGG	2	6	200884	200889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5019	NC_017271	TGGCTG	2	12	200916	200927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384425864
5020	NC_017271	GC	3	6	200958	200963	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5021	NC_017271	GTG	2	6	201027	201032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5022	NC_017271	TGCC	2	8	201033	201040	0 %	25 %	25 %	50 %	384425864
5023	NC_017271	GGT	2	6	201059	201064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5024	NC_017271	CCG	2	6	201089	201094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5025	NC_017271	CG	4	8	201093	201100	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5026	NC_017271	ATC	2	6	201126	201131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425864
5027	NC_017271	TGG	2	6	201139	201144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5028	NC_017271	GGT	2	6	201191	201196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5029	NC_017271	GAC	2	6	201198	201203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5030	NC_017271	GGT	2	6	201206	201211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5031	NC_017271	TGG	2	6	201253	201258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5032	NC_017271	CCA	2	6	201319	201324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425864
5033	NC_017271	TGC	3	9	201352	201360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5034	NC_017271	GCA	2	6	201367	201372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5035	NC_017271	CG	4	8	201380	201387	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5036	NC_017271	CCG	2	6	201416	201421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5037	NC_017271	ACC	2	6	201460	201465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425864
5038	NC_017271	GCC	2	6	201492	201497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5039	NC_017271	CGG	2	6	201517	201522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5040	NC_017271	CGG	2	6	201548	201553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5041	NC_017271	GGCGC	2	10	201562	201571	0 %	0 %	60 %	40 %	384425864
5042	NC_017271	GCT	3	9	201629	201637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5043	NC_017271	GCCG	2	8	201638	201645	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5044	NC_017271	CG	3	6	201649	201654	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5045	NC_017271	GGCT	2	8	201657	201664	0 %	25 %	50 %	25 %	384425864
5046	NC_017271	TGG	2	6	201679	201684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5047	NC_017271	GGCT	2	8	201702	201709	0 %	25 %	50 %	25 %	384425864
5048	NC_017271	GCA	2	6	201716	201721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5049	NC_017271	GCT	2	6	201773	201778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5050	NC_017271	ATG	2	6	201795	201800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425864
5051	NC_017271	GTG	2	6	201801	201806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5052	NC_017271	GC	3	6	201810	201815	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5053	NC_017271	GC	3	6	201842	201847	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5054	NC_017271	CGGC	2	8	201876	201883	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5055	NC_017271	TGGCC	2	10	201897	201906	0 %	20 %	40 %	40 %	384425864
5056	NC_017271	GTG	2	6	201945	201950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5057	NC_017271	CCG	2	6	202018	202023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5058	NC_017271	CTG	2	6	202059	202064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5059	NC_017271	CG	3	6	202088	202093	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5060	NC_017271	GGT	2	6	202142	202147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
5061	NC_017271	CGA	2	6	202157	202162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5062	NC_017271	GGCC	2	8	202163	202170	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5063	NC_017271	TC	3	6	202196	202201	0 %	50 %	0 %	50 %	384425864
5064	NC_017271	CAC	2	6	202202	202207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425864
5065	NC_017271	CGC	2	6	202272	202277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5066	NC_017271	CAG	2	6	202281	202286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5067	NC_017271	GCC	2	6	202321	202326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5068	NC_017271	GCG	2	6	202360	202365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5069	NC_017271	GGGCGA	2	12	202370	202381	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384425864
5070	NC_017271	CCG	2	6	202400	202405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5071	NC_017271	GC	3	6	202418	202423	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5072	NC_017271	CGC	2	6	202429	202434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5073	NC_017271	CGG	3	9	202496	202504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5074	NC_017271	GC	3	6	202541	202546	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5075	NC_017271	GC	4	8	202550	202557	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5076	NC_017271	CG	3	6	202603	202608	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5077	NC_017271	GCA	2	6	202622	202627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425864
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5080	NC_017271	TGC	2	6	202666	202671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
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5087	NC_017271	GGC	2	6	202904	202909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
5088	NC_017271	GGCTGC	2	12	202918	202929	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384425864
5089	NC_017271	CG	3	6	202941	202946	0 %	0 %	50 %	50 %	384425864
5090	NC_017271	CCG	2	6	202964	202969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425864
5091	NC_017271	CTG	2	6	202971	202976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864
5092	NC_017271	TGCGC	2	10	203006	203015	0 %	20 %	40 %	40 %	384425864
5093	NC_017271	GCGCGG	2	12	203048	203059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425864
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5105	NC_017271	TGG	2	6	203506	203511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425864
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5117	NC_017271	GTC	2	6	203911	203916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_017271	CAC	2	6	203976	203981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017271	GC	3	6	204012	204017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_017271	CG	4	8	204019	204026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_017271	CG	3	6	204070	204075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5124	NC_017271	GAGT	2	8	204091	204098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_017271	AGC	2	6	208430	208435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425868
5248	NC_017271	CGCGG	2	10	208516	208525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5250	NC_017271	CAA	2	6	208561	208566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_017271	GT	3	6	208569	208574	0 %	50 %	50 %	0 %	384425869
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5352	NC_017271	CG	3	6	212224	212229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5353	NC_017271	CAAC	2	8	212240	212247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5399	NC_017271	CACC	2	8	213948	213955	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5402	NC_017271	AAC	2	6	214119	214124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5403	NC_017271	CGA	2	6	214137	214142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5494	NC_017271	GCA	2	6	217455	217460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425877
5495	NC_017271	CG	3	6	217510	217515	0 %	0 %	50 %	50 %	384425877
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5497	NC_017271	CGT	2	6	217596	217601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425877
5498	NC_017271	CG	4	8	217642	217649	0 %	0 %	50 %	50 %	384425877
5499	NC_017271	GC	3	6	217675	217680	0 %	0 %	50 %	50 %	384425877
5500	NC_017271	GTA	2	6	217699	217704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425877

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