MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017271	CGCC	2	8	179488	179495	0 %	0 %	25 %	75 %	384425850
4502	NC_017271	GCG	3	9	179529	179537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4503	NC_017271	ACC	2	6	179578	179583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425850
4504	NC_017271	TCA	2	6	179588	179593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425850
4505	NC_017271	GGC	2	6	179599	179604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4506	NC_017271	GCA	2	6	179621	179626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4507	NC_017271	GATG	2	8	179675	179682	25 %	25 %	50 %	0 %	384425850
4508	NC_017271	TCGC	2	8	179683	179690	0 %	25 %	25 %	50 %	384425850
4509	NC_017271	GC	3	6	179689	179694	0 %	0 %	50 %	50 %	384425850
4510	NC_017271	GCA	2	6	179711	179716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4511	NC_017271	CGA	2	6	179723	179728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4512	NC_017271	TCG	2	6	179746	179751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4513	NC_017271	CCA	2	6	179780	179785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425850
4514	NC_017271	GC	3	6	179826	179831	0 %	0 %	50 %	50 %	384425850
4515	NC_017271	CG	3	6	179839	179844	0 %	0 %	50 %	50 %	384425850
4516	NC_017271	GAA	2	6	179868	179873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425850
4517	NC_017271	CGG	2	6	179929	179934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4518	NC_017271	TGC	2	6	179941	179946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4519	NC_017271	GCCA	2	8	179953	179960	25 %	0 %	25 %	50 %	384425850
4520	NC_017271	CCAGCG	2	12	179963	179974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384425850
4521	NC_017271	TGG	2	6	179981	179986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425850
4522	NC_017271	CCA	2	6	179987	179992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425850
4523	NC_017271	GGC	2	6	180032	180037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4524	NC_017271	GCCA	2	8	180127	180134	25 %	0 %	25 %	50 %	384425850
4525	NC_017271	CCGG	2	8	180163	180170	0 %	0 %	50 %	50 %	384425850
4526	NC_017271	GCG	2	6	180178	180183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4527	NC_017271	CAG	2	6	180201	180206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4528	NC_017271	CGG	3	9	180242	180250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4529	NC_017271	CAC	2	6	180279	180284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425850
4530	NC_017271	CAG	2	6	180297	180302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425850
4531	NC_017271	CGG	2	6	180305	180310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425850
4532	NC_017271	CG	3	6	180335	180340	0 %	0 %	50 %	50 %	384425850
4533	NC_017271	CTG	2	6	180387	180392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017271	GCG	2	6	180402	180407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_017271	TGC	2	6	180472	180477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_017271	TG	3	6	180556	180561	0 %	50 %	50 %	0 %	384425851
4537	NC_017271	GC	4	8	180621	180628	0 %	0 %	50 %	50 %	384425851
4538	NC_017271	CTA	2	6	180720	180725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425851
4539	NC_017271	ACA	2	6	180758	180763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425851
4540	NC_017271	GCTGG	2	10	180873	180882	0 %	20 %	60 %	20 %	384425851
4541	NC_017271	CAG	2	6	180928	180933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425851
4542	NC_017271	TGG	2	6	181184	181189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425851
4543	NC_017271	CTGC	2	8	181204	181211	0 %	25 %	25 %	50 %	384425851
4544	NC_017271	GCCA	2	8	181231	181238	25 %	0 %	25 %	50 %	384425851
4545	NC_017271	CTG	2	6	181249	181254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425851
4546	NC_017271	GC	3	6	181258	181263	0 %	0 %	50 %	50 %	384425851
4547	NC_017271	GTGC	2	8	181306	181313	0 %	25 %	50 %	25 %	384425851
4548	NC_017271	CTA	2	6	181338	181343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425851
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4551	NC_017271	CTG	2	6	181699	181704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425852
4552	NC_017271	GAG	2	6	181720	181725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425852
4553	NC_017271	CTT	2	6	181761	181766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425852
4554	NC_017271	GCG	2	6	181796	181801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425852
4555	NC_017271	TGC	3	9	181856	181864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425852
4556	NC_017271	AGC	2	6	181880	181885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425852
4557	NC_017271	CCG	2	6	182069	182074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425852
4558	NC_017271	CTG	2	6	182077	182082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425852
4559	NC_017271	GCC	2	6	182107	182112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425852
4560	NC_017271	GC	3	6	182141	182146	0 %	0 %	50 %	50 %	384425852
4561	NC_017271	CG	3	6	182160	182165	0 %	0 %	50 %	50 %	384425852
4562	NC_017271	TGT	2	6	182186	182191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425852
4563	NC_017271	GCT	2	6	182217	182222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425852
4564	NC_017271	GCG	2	6	182231	182236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425852
4565	NC_017271	CATG	2	8	182262	182269	25 %	25 %	25 %	25 %	384425852
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4570	NC_017271	GC	3	6	182356	182361	0 %	0 %	50 %	50 %	384425852
4571	NC_017271	GAA	2	6	182368	182373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425852
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4573	NC_017271	CAGG	2	8	182388	182395	25 %	0 %	50 %	25 %	384425852
4574	NC_017271	CGG	2	6	182397	182402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425852
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4581	NC_017271	TTC	3	9	182680	182688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425852
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4583	NC_017271	GCCG	2	8	182920	182927	0 %	0 %	50 %	50 %	384425852
4584	NC_017271	CGA	2	6	182976	182981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425852
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4592	NC_017271	GCTG	2	8	183537	183544	0 %	25 %	50 %	25 %	384425852
4593	NC_017271	CAA	2	6	183549	183554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425852
4594	NC_017271	CGA	3	9	183582	183590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425852
4595	NC_017271	GCT	2	6	183615	183620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425852
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4597	NC_017271	CGCC	2	8	183717	183724	0 %	0 %	25 %	75 %	384425852
4598	NC_017271	GC	3	6	183727	183732	0 %	0 %	50 %	50 %	384425852
4599	NC_017271	TTC	2	6	183754	183759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425852
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4602	NC_017271	AAG	2	6	183820	183825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425852
4603	NC_017271	GCC	2	6	183850	183855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425852
4604	NC_017271	CG	4	8	183884	183891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_017271	GCT	2	6	183966	183971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_017271	CAG	2	6	184011	184016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_017271	CAG	2	6	184032	184037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017271	ATGT	2	8	184114	184121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017271	ATG	2	6	184124	184129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017271	AC	3	6	184144	184149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_017271	TCC	2	6	184198	184203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_017271	ATTC	2	8	184224	184231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4613	NC_017271	CGA	3	9	184329	184337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425853
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4616	NC_017271	CG	3	6	184448	184453	0 %	0 %	50 %	50 %	384425853
4617	NC_017271	TTA	2	6	184473	184478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425853
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4620	NC_017271	CG	3	6	184505	184510	0 %	0 %	50 %	50 %	384425853
4621	NC_017271	GTG	2	6	184528	184533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425853
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4623	NC_017271	CG	3	6	184643	184648	0 %	0 %	50 %	50 %	384425853
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4992	NC_017271	TGC	2	6	199814	199819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425863
4993	NC_017271	GAC	2	6	199825	199830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425863
4994	NC_017271	GCTTGC	2	12	199869	199880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425863
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4996	NC_017271	GAG	2	6	200009	200014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_017271	CG	3	6	200042	200047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4998	NC_017271	GC	3	6	200051	200056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4999	NC_017271	C	6	6	200253	200258	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5000	NC_017271	CTG	3	9	200301	200309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425864

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