MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017267	GCA	2	6	66889	66894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417134
1502	NC_017267	CAC	2	6	66922	66927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417134
1503	NC_017267	GCC	2	6	66965	66970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417134
1504	NC_017267	GC	3	6	66988	66993	0 %	0 %	50 %	50 %	384417134
1505	NC_017267	GAT	2	6	67054	67059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417134
1506	NC_017267	GGC	2	6	67118	67123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417134
1507	NC_017267	TGC	2	6	67131	67136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417134
1508	NC_017267	CAG	2	6	67223	67228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417134
1509	NC_017267	CGC	2	6	67395	67400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417134
1510	NC_017267	GTC	2	6	67525	67530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017267	GCG	2	6	67572	67577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017267	CAG	2	6	67581	67586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017267	CTT	2	6	67666	67671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417135
1514	NC_017267	GAT	2	6	67690	67695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417135
1515	NC_017267	GC	3	6	67786	67791	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1516	NC_017267	CG	3	6	67796	67801	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1517	NC_017267	GCCGGT	2	12	67841	67852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384417136
1518	NC_017267	GCCG	2	8	67862	67869	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1519	NC_017267	TGT	2	6	67902	67907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417136
1520	NC_017267	CGA	2	6	67933	67938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417136
1521	NC_017267	TGG	2	6	67944	67949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417136
1522	NC_017267	GCA	2	6	67975	67980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417136
1523	NC_017267	CCTGC	2	10	68011	68020	0 %	20 %	20 %	60 %	384417136
1524	NC_017267	CG	3	6	68045	68050	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1525	NC_017267	CCA	2	6	68088	68093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417136
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1527	NC_017267	CCG	2	6	68127	68132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417136
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1530	NC_017267	TGG	2	6	68226	68231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417136
1531	NC_017267	CGG	2	6	68232	68237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417136
1532	NC_017267	GC	3	6	68242	68247	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1533	NC_017267	GCG	2	6	68293	68298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417136
1534	NC_017267	CGG	2	6	68305	68310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417136
1535	NC_017267	AGCC	2	8	68413	68420	25 %	0 %	25 %	50 %	384417136
1536	NC_017267	CGGCGC	2	12	68427	68438	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1537	NC_017267	GGCAAG	2	12	68546	68557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384417136
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1539	NC_017267	GC	4	8	68628	68635	0 %	0 %	50 %	50 %	384417136
1540	NC_017267	GGT	3	9	68731	68739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417136
1541	NC_017267	ATC	2	6	68786	68791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417136
1542	NC_017267	AGC	2	6	68823	68828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417136
1543	NC_017267	GCTG	2	8	68832	68839	0 %	25 %	50 %	25 %	384417136
1544	NC_017267	GCG	2	6	68951	68956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417136
1545	NC_017267	ACA	2	6	68961	68966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417136
1546	NC_017267	TGC	2	6	68976	68981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417136
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1549	NC_017267	AC	3	6	69081	69086	50 %	0 %	0 %	50 %	384417136
1550	NC_017267	GGTT	2	8	69096	69103	0 %	50 %	50 %	0 %	384417136
1551	NC_017267	GT	3	6	69106	69111	0 %	50 %	50 %	0 %	384417136
1552	NC_017267	ACT	2	6	69133	69138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017267	GCC	2	6	69275	69280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_017267	TGCC	2	8	69288	69295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_017267	TTCG	2	8	69306	69313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_017267	CGC	2	6	69399	69404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_017267	CAC	2	6	69415	69420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017267	GCT	2	6	69466	69471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017267	GCTG	2	8	69519	69526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_017267	TTC	2	6	69545	69550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017267	GGT	2	6	69559	69564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017267	CGTGC	2	10	69577	69586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1563	NC_017267	GGGCA	2	10	69622	69631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_017267	GC	3	6	69682	69687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_017267	GC	4	8	69704	69711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_017267	ACG	2	6	69731	69736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017267	GC	3	6	69766	69771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_017267	GCT	2	6	69774	69779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_017267	ATGTGA	2	12	69785	69796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017267	ACG	2	6	69888	69893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_017267	ACG	2	6	69912	69917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_017267	TGCAC	2	10	69999	70008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1573	NC_017267	GCT	2	6	70044	70049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_017267	GGT	2	6	70083	70088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017267	GCAC	2	8	70191	70198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_017267	GCG	2	6	70205	70210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017267	GCT	2	6	70236	70241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_017267	CATG	2	8	70304	70311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_017267	CCG	2	6	70438	70443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1598	NC_017267	AGT	2	6	71525	71530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017267	GCC	2	6	71535	71540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_017267	CG	3	6	71630	71635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_017267	TGG	2	6	71683	71688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017267	GCT	2	6	71714	71719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1604	NC_017267	TGC	2	6	71740	71745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_017267	GCC	2	6	71848	71853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_017267	GCG	2	6	71969	71974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017267	AAG	2	6	71976	71981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017267	GC	3	6	72046	72051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_017267	CGT	2	6	72074	72079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017267	AAC	2	6	72095	72100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_017267	CTT	2	6	72124	72129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017267	GCC	2	6	72196	72201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1617	NC_017267	GCA	2	6	72224	72229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417138
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1619	NC_017267	GCACGC	2	12	72409	72420	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417138
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1623	NC_017267	GCA	2	6	72551	72556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417138
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1625	NC_017267	TGCAC	2	10	72596	72605	20 %	20 %	20 %	40 %	384417138
1626	NC_017267	GTG	2	6	72606	72611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417138
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1628	NC_017267	CG	3	6	72701	72706	0 %	0 %	50 %	50 %	384417138
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1883	NC_017267	CGC	2	6	83311	83316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417146
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1994	NC_017267	GGC	2	6	87646	87651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1995	NC_017267	TGC	2	6	87687	87692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1996	NC_017267	AATCCG	2	12	87757	87768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1998	NC_017267	T	8	8	87939	87946	0 %	100 %	0 %	0 %	384417152
1999	NC_017267	GCG	2	6	87981	87986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417152
2000	NC_017267	AGT	2	6	88153	88158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417152

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