MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017267	CTG	2	6	45569	45574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417113
1002	NC_017267	CCT	2	6	45600	45605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384417113
1003	NC_017267	TGCA	2	8	45647	45654	25 %	25 %	25 %	25 %	384417113
1004	NC_017267	CGT	2	6	45655	45660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417113
1005	NC_017267	AACTC	2	10	45699	45708	40 %	20 %	0 %	40 %	384417113
1006	NC_017267	TTGA	2	8	45718	45725	25 %	50 %	25 %	0 %	384417113
1007	NC_017267	ATC	2	6	45727	45732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417113
1008	NC_017267	ATC	2	6	45743	45748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417113
1009	NC_017267	ACG	2	6	45779	45784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417113
1010	NC_017267	GCA	2	6	45897	45902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417113
1011	NC_017267	CGG	2	6	45918	45923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417113
1012	NC_017267	CAC	2	6	45952	45957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417113
1013	NC_017267	CACC	2	8	45984	45991	25 %	0 %	0 %	75 %	384417113
1014	NC_017267	AGC	2	6	46061	46066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417113
1015	NC_017267	GAA	2	6	46081	46086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417113
1016	NC_017267	TCGA	2	8	46167	46174	25 %	25 %	25 %	25 %	384417114
1017	NC_017267	T	6	6	46178	46183	0 %	100 %	0 %	0 %	384417114
1018	NC_017267	CTG	2	6	46245	46250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417114
1019	NC_017267	CACC	2	8	46328	46335	25 %	0 %	0 %	75 %	384417114
1020	NC_017267	ATC	2	6	46339	46344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417114
1021	NC_017267	AGCGCC	2	12	46347	46358	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384417114
1022	NC_017267	CG	3	6	46656	46661	0 %	0 %	50 %	50 %	384417114
1023	NC_017267	TTCT	2	8	46662	46669	0 %	75 %	0 %	25 %	384417114
1024	NC_017267	CG	3	6	46682	46687	0 %	0 %	50 %	50 %	384417114
1025	NC_017267	CTG	2	6	46761	46766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417114
1026	NC_017267	AAG	2	6	46767	46772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417114
1027	NC_017267	GCAG	2	8	46783	46790	25 %	0 %	50 %	25 %	384417114
1028	NC_017267	GCTC	2	8	46793	46800	0 %	25 %	25 %	50 %	384417114
1029	NC_017267	ACCG	2	8	46805	46812	25 %	0 %	25 %	50 %	384417114
1030	NC_017267	CAGCC	2	10	46822	46831	20 %	0 %	20 %	60 %	384417114
1031	NC_017267	CCTC	2	8	46879	46886	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1032	NC_017267	TGA	2	6	46933	46938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017267	CG	3	6	46940	46945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_017267	CGG	2	6	47013	47018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417115
1035	NC_017267	AGT	2	6	47027	47032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417115
1036	NC_017267	CAT	2	6	47046	47051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417115
1037	NC_017267	TCGA	2	8	47183	47190	25 %	25 %	25 %	25 %	384417115
1038	NC_017267	CGC	2	6	47210	47215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417115
1039	NC_017267	GCATT	2	10	47240	47249	20 %	40 %	20 %	20 %	384417115
1040	NC_017267	GCA	2	6	47414	47419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417116
1041	NC_017267	GCC	2	6	47478	47483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417116
1042	NC_017267	ACA	2	6	47578	47583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417116
1043	NC_017267	GCT	2	6	47606	47611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417116
1044	NC_017267	CTG	2	6	47622	47627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417116
1045	NC_017267	GTC	2	6	47875	47880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417116
1046	NC_017267	GC	3	6	47885	47890	0 %	0 %	50 %	50 %	384417116
1047	NC_017267	GGC	2	6	47921	47926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417116
1048	NC_017267	ACGC	2	8	48067	48074	25 %	0 %	25 %	50 %	384417116
1049	NC_017267	GTG	2	6	48084	48089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417116
1050	NC_017267	CCG	2	6	48188	48193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417116
1051	NC_017267	GCC	2	6	48228	48233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417116
1052	NC_017267	GCC	2	6	48237	48242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417116
1053	NC_017267	GTGC	2	8	48298	48305	0 %	25 %	50 %	25 %	384417116
1054	NC_017267	ACC	2	6	48382	48387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_017267	CAA	2	6	48397	48402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017267	GCA	2	6	48414	48419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017267	GCC	2	6	48446	48451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
1058	NC_017267	GGC	2	6	48517	48522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417117
1059	NC_017267	TGT	2	6	48564	48569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417117
1060	NC_017267	GCC	2	6	48610	48615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
1061	NC_017267	GCG	2	6	48637	48642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417117
1062	NC_017267	TCA	2	6	48645	48650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417117
1063	NC_017267	CCG	2	6	48663	48668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
1064	NC_017267	TGCGG	2	10	48752	48761	0 %	20 %	60 %	20 %	384417117
1065	NC_017267	GCGCA	2	10	48850	48859	20 %	0 %	40 %	40 %	384417117
1066	NC_017267	GC	3	6	48863	48868	0 %	0 %	50 %	50 %	384417117
1067	NC_017267	GGT	2	6	48880	48885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417117
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1069	NC_017267	GCC	2	6	48943	48948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
1070	NC_017267	GCG	2	6	48999	49004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417117
1071	NC_017267	GGT	2	6	49009	49014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417117
1072	NC_017267	CAG	2	6	49027	49032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417117
1073	NC_017267	CCG	2	6	49041	49046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
1074	NC_017267	GCA	2	6	49071	49076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417117
1075	NC_017267	CCG	2	6	49112	49117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
1076	NC_017267	CGC	3	9	49128	49136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417117
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1081	NC_017267	AC	3	6	49378	49383	50 %	0 %	0 %	50 %	384417117
1082	NC_017267	AGT	2	6	49389	49394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417117
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1084	NC_017267	GC	3	6	49425	49430	0 %	0 %	50 %	50 %	384417117
1085	NC_017267	CGG	2	6	49464	49469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417117
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1091	NC_017267	GC	3	6	49696	49701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_017267	GCA	2	6	49726	49731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017267	C	7	7	49769	49775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1094	NC_017267	GCC	2	6	49779	49784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_017267	CCG	2	6	49847	49852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417119
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1099	NC_017267	GCC	2	6	50020	50025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417119
1100	NC_017267	AAG	2	6	50143	50148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417119
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1109	NC_017267	CTT	2	6	50655	50660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417119
1110	NC_017267	CAA	2	6	50679	50684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417119
1111	NC_017267	GGCTG	2	10	50747	50756	0 %	20 %	60 %	20 %	384417119
1112	NC_017267	TGG	2	6	50761	50766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417119
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1115	NC_017267	ACGC	2	8	50861	50868	25 %	0 %	25 %	50 %	384417119
1116	NC_017267	GCG	2	6	50887	50892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017267	AG	3	6	50898	50903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017267	T	7	7	50929	50935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017267	CGC	2	6	50985	50990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1121	NC_017267	CG	3	6	51025	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017267	CCAGCG	2	12	51031	51042	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_017267	TTC	2	6	51063	51068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017267	GAT	2	6	51141	51146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017267	CG	3	6	51163	51168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_017267	GAC	2	6	51181	51186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1128	NC_017267	ACGCA	2	10	51340	51349	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1500	NC_017267	GCG	2	6	66769	66774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417134

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