MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 117050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017267	GTA	2	6	538300	538305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417555
13003	NC_017267	GC	3	6	538403	538408	0 %	0 %	50 %	50 %	384417555
13004	NC_017267	CG	3	6	538416	538421	0 %	0 %	50 %	50 %	384417555
13005	NC_017267	GCC	2	6	538491	538496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417555
13006	NC_017267	CGG	2	6	538557	538562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417556
13007	NC_017267	GCA	2	6	538597	538602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417556
13008	NC_017267	GCGCC	2	10	538603	538612	0 %	0 %	40 %	60 %	384417556
13009	NC_017267	CATTG	2	10	538642	538651	20 %	40 %	20 %	20 %	384417556
13010	NC_017267	CA	4	8	538708	538715	50 %	0 %	0 %	50 %	384417557
13011	NC_017267	GCT	2	6	538740	538745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417557
13012	NC_017267	GTG	2	6	538750	538755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417557
13013	NC_017267	TC	3	6	538778	538783	0 %	50 %	0 %	50 %	384417557
13014	NC_017267	GC	3	6	538868	538873	0 %	0 %	50 %	50 %	384417557
13015	NC_017267	CGC	2	6	538878	538883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417557
13016	NC_017267	GATG	2	8	538965	538972	25 %	25 %	50 %	0 %	384417557
13017	NC_017267	CG	3	6	539007	539012	0 %	0 %	50 %	50 %	384417557
13018	NC_017267	GC	3	6	539021	539026	0 %	0 %	50 %	50 %	384417557
13019	NC_017267	TGG	2	6	539033	539038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417557
13020	NC_017267	GCAGT	2	10	539039	539048	20 %	20 %	40 %	20 %	384417557
13021	NC_017267	GCGT	2	8	539067	539074	0 %	25 %	50 %	25 %	384417557
13022	NC_017267	CAA	2	6	539085	539090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417557
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13030	NC_017267	CGC	2	6	539270	539275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417557
13031	NC_017267	TTC	2	6	539290	539295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_017267	CAC	2	6	539305	539310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13033	NC_017267	TGA	3	9	539413	539421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417558
13034	NC_017267	ACG	2	6	539443	539448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417558
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13038	NC_017267	TTC	2	6	539616	539621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417558
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13040	NC_017267	CG	3	6	539650	539655	0 %	0 %	50 %	50 %	384417558
13041	NC_017267	CTGG	2	8	539669	539676	0 %	25 %	50 %	25 %	384417558
13042	NC_017267	GCG	2	6	539677	539682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417558
13043	NC_017267	TGA	2	6	539695	539700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417558
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13052	NC_017267	CTT	2	6	540011	540016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417558
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13054	NC_017267	TGC	2	6	540046	540051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417558
13055	NC_017267	CAT	2	6	540059	540064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417558
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13060	NC_017267	CTGTTC	2	12	540177	540188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384417558
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13062	NC_017267	CGC	2	6	540402	540407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417559
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13103	NC_017267	GTT	2	6	541960	541965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417562
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13107	NC_017267	GGCG	2	8	542158	542165	0 %	0 %	75 %	25 %	384417562
13108	NC_017267	GTGCTG	2	12	542180	542191	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384417562
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13121	NC_017267	GTG	2	6	542704	542709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417562
13122	NC_017267	GCC	2	6	542710	542715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417562
13123	NC_017267	GGC	2	6	542771	542776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417562
13124	NC_017267	GGCGC	2	10	542786	542795	0 %	0 %	60 %	40 %	384417562
13125	NC_017267	TGG	2	6	542852	542857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417562
13126	NC_017267	CTGGC	2	10	542858	542867	0 %	20 %	40 %	40 %	384417562
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13140	NC_017267	TGG	2	6	543380	543385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417563
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13156	NC_017267	CAA	2	6	544015	544020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13160	NC_017267	TCCG	2	8	544185	544192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13161	NC_017267	GCT	2	6	544206	544211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13213	NC_017267	AGCG	2	8	545960	545967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13214	NC_017267	GC	3	6	545971	545976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13215	NC_017267	ACGT	2	8	545985	545992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13216	NC_017267	CTG	2	6	546042	546047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13230	NC_017267	GCA	2	6	546588	546593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417565
13231	NC_017267	CAG	2	6	546682	546687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417565
13232	NC_017267	CG	3	6	546729	546734	0 %	0 %	50 %	50 %	384417565
13233	NC_017267	GC	3	6	546777	546782	0 %	0 %	50 %	50 %	384417565
13234	NC_017267	GTG	2	6	546834	546839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417565
13235	NC_017267	AGC	2	6	546854	546859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417565
13236	NC_017267	GC	3	6	546912	546917	0 %	0 %	50 %	50 %	384417565
13237	NC_017267	CG	3	6	546933	546938	0 %	0 %	50 %	50 %	384417565
13238	NC_017267	CG	3	6	546944	546949	0 %	0 %	50 %	50 %	384417565
13239	NC_017267	GAA	2	6	546958	546963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417565
13240	NC_017267	CAGCG	2	10	546964	546973	20 %	0 %	40 %	40 %	384417565
13241	NC_017267	CCAA	2	8	547092	547099	50 %	0 %	0 %	50 %	384417565
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13243	NC_017267	GTT	2	6	547163	547168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13361	NC_017267	GGC	2	6	551270	551275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13364	NC_017267	GGTGA	2	10	551510	551519	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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13367	NC_017267	GATT	2	8	551603	551610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13368	NC_017267	GCCA	2	8	551612	551619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13369	NC_017267	GCA	2	6	551663	551668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13370	NC_017267	CCAT	2	8	551699	551706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13371	NC_017267	GAAG	2	8	551794	551801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13372	NC_017267	CGA	2	6	551802	551807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13374	NC_017267	CGA	2	6	551862	551867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13376	NC_017267	CGA	2	6	551891	551896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13388	NC_017267	TGC	2	6	552307	552312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417569
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13490	NC_017267	TGC	2	6	556418	556423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417573
13491	NC_017267	GAA	2	6	556428	556433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417573
13492	NC_017267	ACA	2	6	556481	556486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417573
13493	NC_017267	GCT	2	6	556493	556498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417573
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